MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 39256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_009332	GTATT	2	10	637895	637904	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_009332	TCA	2	6	637910	637915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13503	NC_009332	GAG	2	6	637957	637962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_009332	TCAG	2	8	638038	638045	25 %	25 %	25 %	25 %	139473469
13505	NC_009332	T	6	6	638053	638058	0 %	100 %	0 %	0 %	139473469
13506	NC_009332	TGG	2	6	638162	638167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473469
13507	NC_009332	CTA	2	6	638213	638218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473469
13508	NC_009332	ACT	2	6	638253	638258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473469
13509	NC_009332	ATT	2	6	638266	638271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473469
13510	NC_009332	TCATT	2	10	638273	638282	20 %	60 %	0 %	20 %	139473469
13511	NC_009332	AGC	2	6	638352	638357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473469
13512	NC_009332	ATT	2	6	638458	638463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473469
13513	NC_009332	GGT	2	6	638523	638528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473469
13514	NC_009332	TGG	2	6	638561	638566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473469
13515	NC_009332	TAC	2	6	638575	638580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473469
13516	NC_009332	AGG	2	6	638640	638645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139473469
13517	NC_009332	TGA	2	6	638653	638658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473469
13518	NC_009332	TAT	2	6	638666	638671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473470
13519	NC_009332	TAT	2	6	638694	638699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473470
13520	NC_009332	ATT	2	6	638760	638765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473470
13521	NC_009332	TTCTGG	2	12	638771	638782	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	139473470
13522	NC_009332	AAG	2	6	638868	638873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473470
13523	NC_009332	A	6	6	638896	638901	100 %	0 %	0 %	0 %	139473470
13524	NC_009332	CAG	2	6	638916	638921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473470
13525	NC_009332	TTG	2	6	639024	639029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473470
13526	NC_009332	TGG	2	6	639080	639085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473470
13527	NC_009332	GATTGC	2	12	639098	639109	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	139473470
13528	NC_009332	TGA	2	6	639146	639151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473470
13529	NC_009332	TGG	2	6	639178	639183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473470
13530	NC_009332	AAG	2	6	639265	639270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473470
13531	NC_009332	ATGG	2	8	639291	639298	25 %	25 %	50 %	0 %	139473470
13532	NC_009332	GAA	2	6	639312	639317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473470
13533	NC_009332	AGA	2	6	639350	639355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473470
13534	NC_009332	T	6	6	639368	639373	0 %	100 %	0 %	0 %	139473470
13535	NC_009332	GAGTA	2	10	639374	639383	40 %	20 %	40 %	0 %	139473470
13536	NC_009332	CTTTT	2	10	639474	639483	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13537	NC_009332	TAAAA	2	10	639487	639496	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_009332	ATT	2	6	639509	639514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_009332	AGA	2	6	639520	639525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_009332	TGA	2	6	639576	639581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473471
13541	NC_009332	TG	3	6	639628	639633	0 %	50 %	50 %	0 %	139473471
13542	NC_009332	AATC	2	8	639676	639683	50 %	25 %	0 %	25 %	139473471
13543	NC_009332	TTA	2	6	639689	639694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473471
13544	NC_009332	TTA	2	6	639718	639723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473471
13545	NC_009332	ATT	2	6	639783	639788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473471
13546	NC_009332	ATG	2	6	639827	639832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473471
13547	NC_009332	AGC	2	6	639864	639869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473471
13548	NC_009332	A	8	8	639880	639887	100 %	0 %	0 %	0 %	139473471
13549	NC_009332	TACC	2	8	639903	639910	25 %	25 %	0 %	50 %	139473471
13550	NC_009332	CTA	2	6	639981	639986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473471
13551	NC_009332	GGT	2	6	640046	640051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473471
13552	NC_009332	GAT	2	6	640069	640074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473471
13553	NC_009332	TGA	2	6	640131	640136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473471
13554	NC_009332	AAC	2	6	640145	640150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473471
13555	NC_009332	AGC	2	6	640176	640181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473471
13556	NC_009332	T	6	6	640236	640241	0 %	100 %	0 %	0 %	139473471
13557	NC_009332	T	6	6	640317	640322	0 %	100 %	0 %	0 %	139473471
13558	NC_009332	GA	3	6	640338	640343	50 %	0 %	50 %	0 %	139473471
13559	NC_009332	TAA	2	6	640425	640430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473471
13560	NC_009332	AAG	2	6	640454	640459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473471
13561	NC_009332	TGC	2	6	640485	640490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473471
13562	NC_009332	GGAT	2	8	640513	640520	25 %	25 %	50 %	0 %	139473471
13563	NC_009332	TAG	2	6	640541	640546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473471
13564	NC_009332	CTT	2	6	640547	640552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473471
13565	NC_009332	T	6	6	640551	640556	0 %	100 %	0 %	0 %	139473471
13566	NC_009332	CAA	3	9	640603	640611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473471
13567	NC_009332	ATG	2	6	640622	640627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473471
13568	NC_009332	GGA	2	6	640642	640647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139473471
13569	NC_009332	GCT	2	6	640657	640662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473471
13570	NC_009332	TTA	2	6	640745	640750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473471
13571	NC_009332	AG	3	6	640827	640832	50 %	0 %	50 %	0 %	139473471
13572	NC_009332	TAT	2	6	640842	640847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473471
13573	NC_009332	AAC	2	6	640886	640891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473471
13574	NC_009332	TGAT	2	8	641060	641067	25 %	50 %	25 %	0 %	139473472
13575	NC_009332	AGC	2	6	641080	641085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473472
13576	NC_009332	CTT	2	6	641088	641093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473472
13577	NC_009332	GTT	2	6	641102	641107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473472
13578	NC_009332	CT	3	6	641163	641168	0 %	50 %	0 %	50 %	139473472
13579	NC_009332	TAG	2	6	641192	641197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473472
13580	NC_009332	TGA	2	6	641345	641350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473472
13581	NC_009332	GTT	2	6	641463	641468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473472
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13583	NC_009332	ATG	2	6	641572	641577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473472
13584	NC_009332	ATC	2	6	641630	641635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473472
13585	NC_009332	G	6	6	641832	641837	0 %	0 %	100 %	0 %	139473472
13586	NC_009332	TAA	2	6	641942	641947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473472
13587	NC_009332	T	6	6	642011	642016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13588	NC_009332	CAA	2	6	642055	642060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13589	NC_009332	ATT	2	6	642080	642085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13590	NC_009332	A	6	6	642092	642097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13591	NC_009332	TTTA	2	8	642107	642114	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13592	NC_009332	ATT	2	6	642116	642121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13593	NC_009332	T	7	7	642161	642167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13594	NC_009332	AAT	2	6	642247	642252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473473
13595	NC_009332	TGA	2	6	642261	642266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473473
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13597	NC_009332	CAG	2	6	642347	642352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473473
13598	NC_009332	TGGT	2	8	642401	642408	0 %	50 %	50 %	0 %	139473473
13599	NC_009332	GCA	2	6	642412	642417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473473
13600	NC_009332	TAT	2	6	642435	642440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473473
13601	NC_009332	GTTA	2	8	642478	642485	25 %	50 %	25 %	0 %	139473473
13602	NC_009332	TAT	2	6	642531	642536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473473
13603	NC_009332	AAG	2	6	642689	642694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473473
13604	NC_009332	CAAA	2	8	642768	642775	75 %	0 %	0 %	25 %	139473473
13605	NC_009332	TGA	2	6	642819	642824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473473
13606	NC_009332	GAA	2	6	642832	642837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473473
13607	NC_009332	A	6	6	642844	642849	100 %	0 %	0 %	0 %	139473473
13608	NC_009332	AGTC	2	8	642890	642897	25 %	25 %	25 %	25 %	139473473
13609	NC_009332	AGT	2	6	642900	642905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473473
13610	NC_009332	CGC	2	6	642958	642963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	139473473
13611	NC_009332	GGCAA	2	10	643360	643369	40 %	0 %	40 %	20 %	139473473
13612	NC_009332	ATG	2	6	643376	643381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473473
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13614	NC_009332	ATG	2	6	643477	643482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473473
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13617	NC_009332	CAGA	2	8	643644	643651	50 %	0 %	25 %	25 %	139473473
13618	NC_009332	AGACA	2	10	643683	643692	60 %	0 %	20 %	20 %	139473473
13619	NC_009332	GAT	2	6	643753	643758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473473
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13993	NC_009332	AGA	2	6	659483	659488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473496
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13995	NC_009332	AACA	2	8	659515	659522	75 %	0 %	0 %	25 %	139473497
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