MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 39256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_009332	GCT	2	6	541403	541408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_009332	AAG	2	6	541506	541511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_009332	CAG	2	6	541676	541681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_009332	CAA	2	6	541854	541859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11505	NC_009332	GGA	2	6	542042	542047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_009332	TGA	2	6	542113	542118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_009332	CAA	4	12	542180	542191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11508	NC_009332	A	6	6	542239	542244	100 %	0 %	0 %	0 %	139473384
11509	NC_009332	ATT	2	6	542266	542271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473384
11510	NC_009332	TA	3	6	542396	542401	50 %	50 %	0 %	0 %	139473384
11511	NC_009332	GAC	2	6	542408	542413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473384
11512	NC_009332	AGG	2	6	542534	542539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139473384
11513	NC_009332	CTT	2	6	542571	542576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473384
11514	NC_009332	TGG	2	6	542631	542636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473384
11515	NC_009332	ATA	2	6	542810	542815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473384
11516	NC_009332	AGAAC	2	10	542821	542830	60 %	0 %	20 %	20 %	139473384
11517	NC_009332	AAAAT	2	10	542861	542870	80 %	20 %	0 %	0 %	139473384
11518	NC_009332	G	6	6	542912	542917	0 %	0 %	100 %	0 %	139473384
11519	NC_009332	TAC	2	6	543154	543159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473385
11520	NC_009332	CA	3	6	543209	543214	50 %	0 %	0 %	50 %	139473385
11521	NC_009332	GAA	2	6	543281	543286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473385
11522	NC_009332	TGA	2	6	543299	543304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473385
11523	NC_009332	GTG	2	6	543379	543384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473385
11524	NC_009332	AGG	2	6	543389	543394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139473385
11525	NC_009332	GGT	2	6	543423	543428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473385
11526	NC_009332	ATC	2	6	543453	543458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473385
11527	NC_009332	GCAA	2	8	543463	543470	50 %	0 %	25 %	25 %	139473385
11528	NC_009332	AGA	2	6	543524	543529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473385
11529	NC_009332	CTAT	2	8	543559	543566	25 %	50 %	0 %	25 %	139473385
11530	NC_009332	GAA	2	6	543648	543653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473385
11531	NC_009332	A	6	6	543765	543770	100 %	0 %	0 %	0 %	139473385
11532	NC_009332	GAA	2	6	543783	543788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473385
11533	NC_009332	ATA	2	6	543820	543825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473385
11534	NC_009332	GGA	2	6	543908	543913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139473385
11535	NC_009332	TAT	2	6	543942	543947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473385
11536	NC_009332	AGT	2	6	543980	543985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473385
11537	NC_009332	CA	3	6	544020	544025	50 %	0 %	0 %	50 %	139473385
11538	NC_009332	TCAA	2	8	544046	544053	50 %	25 %	0 %	25 %	139473385
11539	NC_009332	TGG	2	6	544070	544075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473385
11540	NC_009332	AAT	2	6	544104	544109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473385
11541	NC_009332	AAC	2	6	544125	544130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473385
11542	NC_009332	ACT	2	6	544234	544239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473385
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11544	NC_009332	A	6	6	544374	544379	100 %	0 %	0 %	0 %	139473385
11545	NC_009332	GAA	2	6	544386	544391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473385
11546	NC_009332	A	7	7	544470	544476	100 %	0 %	0 %	0 %	139473385
11547	NC_009332	TGA	2	6	544496	544501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473385
11548	NC_009332	TGA	2	6	544526	544531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473385
11549	NC_009332	CGAG	2	8	544555	544562	25 %	0 %	50 %	25 %	139473385
11550	NC_009332	AAC	2	6	544593	544598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473385
11551	NC_009332	TTGG	2	8	544626	544633	0 %	50 %	50 %	0 %	139473385
11552	NC_009332	ATG	2	6	544657	544662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473385
11553	NC_009332	TGG	2	6	544691	544696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473385
11554	NC_009332	AAC	2	6	544782	544787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473385
11555	NC_009332	AGTTA	2	10	544793	544802	40 %	40 %	20 %	0 %	139473385
11556	NC_009332	A	6	6	545061	545066	100 %	0 %	0 %	0 %	139473385
11557	NC_009332	GAA	2	6	545114	545119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473386
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11561	NC_009332	GGC	2	6	545375	545380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	139473386
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11563	NC_009332	AGG	2	6	545443	545448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139473386
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11565	NC_009332	TCAA	2	8	545559	545566	50 %	25 %	0 %	25 %	139473386
11566	NC_009332	ACC	2	6	545630	545635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139473386
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11569	NC_009332	CTG	2	6	545829	545834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473386
11570	NC_009332	TGA	2	6	545902	545907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473386
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11574	NC_009332	AGG	2	6	546079	546084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_009332	GAC	2	6	546176	546181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11577	NC_009332	GAG	2	6	546249	546254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_009332	CTA	2	6	546261	546266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11580	NC_009332	TAC	2	6	546416	546421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11581	NC_009332	TCA	2	6	546507	546512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11582	NC_009332	CAA	2	6	546711	546716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11583	NC_009332	GTA	2	6	546779	546784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11585	NC_009332	GACAG	2	10	546877	546886	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11586	NC_009332	GCA	2	6	546903	546908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11587	NC_009332	AG	3	6	546915	546920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_009332	CGT	2	6	546928	546933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11590	NC_009332	TAT	2	6	547086	547091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_009332	GGC	2	6	547135	547140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11592	NC_009332	ATT	2	6	547303	547308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_009332	GCT	2	6	547324	547329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11594	NC_009332	AGT	2	6	547357	547362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_009332	GCTAT	2	10	547403	547412	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11596	NC_009332	TCA	2	6	547436	547441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11597	NC_009332	GAC	2	6	547549	547554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11599	NC_009332	ATGA	2	8	547837	547844	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_009332	GTA	2	6	547858	547863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_009332	GTT	2	6	547874	547879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_009332	AAT	2	6	547951	547956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_009332	CAA	2	6	547962	547967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11604	NC_009332	A	6	6	548000	548005	100 %	0 %	0 %	0 %	139473387
11605	NC_009332	CAAAAT	2	12	548039	548050	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	139473387
11606	NC_009332	GCT	2	6	548084	548089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473387
11607	NC_009332	AGT	2	6	548096	548101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473387
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11982	NC_009332	A	6	6	565503	565508	100 %	0 %	0 %	0 %	139473402
11983	NC_009332	CTAGCC	2	12	565530	565541	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	139473402
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11988	NC_009332	A	6	6	565752	565757	100 %	0 %	0 %	0 %	139473402
11989	NC_009332	AGA	2	6	565784	565789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473402
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