MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 39256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009332	AG	3	6	258573	258578	50 %	0 %	50 %	0 %	139473111
5502	NC_009332	TAT	2	6	258652	258657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_009332	T	6	6	258678	258683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_009332	A	6	6	258714	258719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_009332	A	7	7	258724	258730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_009332	A	7	7	258733	258739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_009332	TAA	2	6	258772	258777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_009332	AG	3	6	258785	258790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_009332	AC	3	6	258800	258805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5510	NC_009332	A	6	6	258812	258817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_009332	AGT	2	6	258826	258831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_009332	AAG	2	6	258861	258866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_009332	AAAT	2	8	258961	258968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_009332	AG	3	6	259012	259017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_009332	GGC	2	6	259044	259049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_009332	ACCT	2	8	259135	259142	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5517	NC_009332	AG	3	6	259187	259192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_009332	CGA	2	6	259289	259294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_009332	GCA	2	6	259363	259368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_009332	CGC	2	6	259410	259415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_009332	GTGA	2	8	259416	259423	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_009332	TGT	2	6	259449	259454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_009332	AGA	2	6	259458	259463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_009332	ATG	2	6	259464	259469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_009332	CCA	2	6	259485	259490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5526	NC_009332	TAAC	2	8	259499	259506	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5527	NC_009332	CAG	2	6	259532	259537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_009332	AGCG	2	8	259587	259594	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5529	NC_009332	T	6	6	259602	259607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_009332	AT	3	6	259716	259721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_009332	GGA	2	6	259722	259727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_009332	CT	3	6	259747	259752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5533	NC_009332	GAA	2	6	259986	259991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_009332	GGT	2	6	260060	260065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_009332	GTC	2	6	260074	260079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_009332	TCGTG	2	10	260083	260092	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5537	NC_009332	CAT	2	6	260142	260147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_009332	TAA	2	6	260177	260182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_009332	GGA	2	6	260186	260191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_009332	ATC	2	6	260210	260215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_009332	AC	3	6	260237	260242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5542	NC_009332	TGGT	2	8	260252	260259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_009332	CGC	2	6	260376	260381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5544	NC_009332	AC	3	6	260406	260411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5545	NC_009332	CAC	2	6	260421	260426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5546	NC_009332	AGCC	2	8	260469	260476	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5547	NC_009332	GAT	2	6	260492	260497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5549	NC_009332	AGG	2	6	260647	260652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_009332	CTA	2	6	260693	260698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_009332	TG	3	6	260761	260766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_009332	CA	3	6	260772	260777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5553	NC_009332	AGCG	2	8	260815	260822	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5554	NC_009332	TA	3	6	260836	260841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_009332	ATT	2	6	260935	260940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_009332	TAA	2	6	260941	260946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_009332	A	7	7	260959	260965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_009332	TAA	2	6	260972	260977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_009332	GTTAA	2	10	260979	260988	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_009332	GAA	2	6	261025	261030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_009332	ACG	2	6	261042	261047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_009332	GTAA	2	8	261065	261072	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_009332	ACTA	2	8	261107	261114	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5564	NC_009332	GAAG	2	8	261147	261154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_009332	TAG	2	6	261213	261218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5569	NC_009332	AG	3	6	261329	261334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_009332	GGA	2	6	261417	261422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_009332	CT	3	6	261443	261448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5572	NC_009332	GGGAG	2	10	261498	261507	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_009332	ACA	2	6	261535	261540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_009332	ATG	2	6	261602	261607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5582	NC_009332	TG	3	6	262211	262216	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_009332	AAG	2	6	262217	262222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_009332	GAG	2	6	262232	262237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_009332	GA	3	6	262362	262367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_009332	TA	3	6	262416	262421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_009332	CTAA	2	8	262443	262450	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5588	NC_009332	TAG	2	6	262545	262550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_009332	GA	3	6	262658	262663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_009332	CT	3	6	262773	262778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5591	NC_009332	GAT	2	6	262791	262796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5595	NC_009332	TAGG	2	8	263098	263105	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5599	NC_009332	TTGG	2	8	263281	263288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_009332	AATC	2	8	263290	263297	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5601	NC_009332	GGT	2	6	263376	263381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_009332	TCG	2	6	263491	263496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_009332	CGT	2	6	263571	263576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_009332	AGGGA	2	10	263709	263718	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_009332	C	6	6	263747	263752	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5606	NC_009332	GA	3	6	263795	263800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5617	NC_009332	T	7	7	264350	264356	0 %	100 %	0 %	0 %	139473112
5618	NC_009332	AAAAG	2	10	264385	264394	80 %	0 %	20 %	0 %	139473112
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5624	NC_009332	GAA	2	6	264564	264569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473112
5625	NC_009332	TTA	2	6	264621	264626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473112
5626	NC_009332	GAC	2	6	264723	264728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473112
5627	NC_009332	TAGC	2	8	264751	264758	25 %	25 %	25 %	25 %	139473112
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5629	NC_009332	A	6	6	264925	264930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_009332	GA	4	8	264932	264939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_009332	GGA	2	6	264944	264949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5632	NC_009332	TAG	2	6	264978	264983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5633	NC_009332	TTTG	2	8	265012	265019	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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