MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 39256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009332	ATG	2	6	209263	209268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473068
4502	NC_009332	GCT	2	6	209292	209297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473068
4503	NC_009332	ATC	2	6	209325	209330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473068
4504	NC_009332	CAA	2	6	209366	209371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473068
4505	NC_009332	TCG	2	6	209372	209377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473068
4506	NC_009332	GTT	2	6	209456	209461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473068
4507	NC_009332	A	6	6	209492	209497	100 %	0 %	0 %	0 %	139473068
4508	NC_009332	TTGA	2	8	209550	209557	25 %	50 %	25 %	0 %	139473068
4509	NC_009332	AGTC	2	8	209717	209724	25 %	25 %	25 %	25 %	139473068
4510	NC_009332	TAGT	2	8	209756	209763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_009332	T	6	6	209778	209783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_009332	GTTT	2	8	209801	209808	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_009332	TTG	2	6	209827	209832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_009332	AGA	2	6	209876	209881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_009332	GA	4	8	209913	209920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_009332	AAAT	2	8	209937	209944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_009332	GAG	2	6	210035	210040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_009332	CGT	2	6	210080	210085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473069
4519	NC_009332	TGCT	2	8	210138	210145	0 %	50 %	25 %	25 %	139473069
4520	NC_009332	CGT	3	9	210149	210157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473069
4521	NC_009332	TAT	2	6	210171	210176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473069
4522	NC_009332	A	6	6	210189	210194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_009332	T	6	6	210233	210238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_009332	CTT	2	6	210292	210297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_009332	TGT	2	6	210301	210306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_009332	ATA	2	6	210324	210329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_009332	ATA	2	6	210334	210339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_009332	A	6	6	210341	210346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_009332	T	6	6	210391	210396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_009332	TAA	2	6	210401	210406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_009332	TTA	2	6	210424	210429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_009332	ACCA	2	8	210469	210476	50 %	0 %	0 %	50 %	139473070
4533	NC_009332	TAT	2	6	210565	210570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473070
4534	NC_009332	CTG	2	6	210575	210580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473070
4535	NC_009332	GCT	2	6	210587	210592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473070
4536	NC_009332	AAG	2	6	210594	210599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473070
4537	NC_009332	ATC	2	6	210680	210685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473070
4538	NC_009332	A	6	6	210686	210691	100 %	0 %	0 %	0 %	139473070
4539	NC_009332	CGC	2	6	210699	210704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	139473070
4540	NC_009332	TTA	2	6	210714	210719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473070
4541	NC_009332	ATG	2	6	210801	210806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473070
4542	NC_009332	TGA	2	6	210886	210891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473070
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4544	NC_009332	ATTC	2	8	211040	211047	25 %	50 %	0 %	25 %	139473070
4545	NC_009332	AGA	2	6	211051	211056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473070
4546	NC_009332	TTG	3	9	211092	211100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473070
4547	NC_009332	AC	3	6	211183	211188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4548	NC_009332	A	7	7	211192	211198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_009332	GAA	2	6	211219	211224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473071
4550	NC_009332	AGC	2	6	211267	211272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473071
4551	NC_009332	GCG	2	6	211275	211280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	139473071
4552	NC_009332	TGG	2	6	211340	211345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473071
4553	NC_009332	GAA	2	6	211399	211404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473071
4554	NC_009332	ATTG	2	8	211405	211412	25 %	50 %	25 %	0 %	139473071
4555	NC_009332	AGA	2	6	211600	211605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473071
4556	NC_009332	A	7	7	211712	211718	100 %	0 %	0 %	0 %	139473071
4557	NC_009332	ACA	2	6	211763	211768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473071
4558	NC_009332	GAT	2	6	211769	211774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473071
4559	NC_009332	TTCT	2	8	211822	211829	0 %	75 %	0 %	25 %	139473071
4560	NC_009332	GGT	2	6	211844	211849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473071
4561	NC_009332	CTT	2	6	211867	211872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473071
4562	NC_009332	GAT	2	6	211928	211933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473071
4563	NC_009332	ATG	2	6	211988	211993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473071
4564	NC_009332	ACG	2	6	212007	212012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473071
4565	NC_009332	TCCCAT	2	12	212133	212144	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	139473071
4566	NC_009332	GAT	2	6	212147	212152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473071
4567	NC_009332	TAA	2	6	212197	212202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473071
4568	NC_009332	TGA	2	6	212254	212259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473071
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4571	NC_009332	A	7	7	212348	212354	100 %	0 %	0 %	0 %	139473071
4572	NC_009332	TAC	2	6	212384	212389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473071
4573	NC_009332	TGA	2	6	212458	212463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473071
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4575	NC_009332	A	7	7	212516	212522	100 %	0 %	0 %	0 %	139473071
4576	NC_009332	CTT	2	6	212548	212553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_009332	CCTTT	2	10	212589	212598	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4578	NC_009332	T	7	7	212596	212602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_009332	GA	3	6	212605	212610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_009332	GA	4	8	212658	212665	50 %	0 %	50 %	0 %	139473072
4581	NC_009332	CTCAT	2	10	212668	212677	20 %	40 %	0 %	40 %	139473072
4582	NC_009332	GAT	2	6	212730	212735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473072
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4587	NC_009332	ATT	2	6	212857	212862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473072
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4590	NC_009332	GGC	2	6	212907	212912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	139473072
4591	NC_009332	CGTT	2	8	212941	212948	0 %	50 %	25 %	25 %	139473072
4592	NC_009332	TTTC	2	8	212961	212968	0 %	75 %	0 %	25 %	139473072
4593	NC_009332	TGT	2	6	212973	212978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473072
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4595	NC_009332	TTATT	2	10	213128	213137	20 %	80 %	0 %	0 %	139473072
4596	NC_009332	TAT	2	6	213159	213164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473072
4597	NC_009332	TA	3	6	213167	213172	50 %	50 %	0 %	0 %	139473072
4598	NC_009332	TCT	2	6	213270	213275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473072
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4600	NC_009332	TA	3	6	213287	213292	50 %	50 %	0 %	0 %	139473072
4601	NC_009332	AAC	2	6	213303	213308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473072
4602	NC_009332	TTCC	2	8	213315	213322	0 %	50 %	0 %	50 %	139473072
4603	NC_009332	ATT	2	6	213365	213370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473072
4604	NC_009332	CT	3	6	213415	213420	0 %	50 %	0 %	50 %	139473072
4605	NC_009332	ATC	2	6	213472	213477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473072
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4607	NC_009332	AGG	2	6	213521	213526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139473072
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4609	NC_009332	CTA	2	6	213695	213700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473073
4610	NC_009332	TGGC	2	8	213809	213816	0 %	25 %	50 %	25 %	139473073
4611	NC_009332	A	6	6	213829	213834	100 %	0 %	0 %	0 %	139473073
4612	NC_009332	TGC	2	6	213873	213878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473073
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4615	NC_009332	ATT	2	6	214160	214165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473073
4616	NC_009332	CTA	2	6	214244	214249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473073
4617	NC_009332	TCTT	2	8	214304	214311	0 %	75 %	0 %	25 %	139473073
4618	NC_009332	TAAA	2	8	214368	214375	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_009332	TTA	2	6	214406	214411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_009332	CATA	2	8	214421	214428	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4621	NC_009332	TTTG	2	8	214484	214491	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_009332	A	6	6	214531	214536	100 %	0 %	0 %	0 %	139473074
4623	NC_009332	GCA	2	6	214591	214596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473074
4624	NC_009332	TTGTC	2	10	214628	214637	0 %	60 %	20 %	20 %	139473074
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4626	NC_009332	TAC	2	6	214728	214733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473074
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4745	NC_009332	GTTCA	2	10	220688	220697	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4746	NC_009332	T	7	7	220751	220757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4993	NC_009332	AAG	2	6	232989	232994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4996	NC_009332	TA	3	6	233044	233049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4997	NC_009332	GTT	2	6	233066	233071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4998	NC_009332	TAGG	2	8	233102	233109	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4999	NC_009332	ATA	2	6	233125	233130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5000	NC_009332	AGG	2	6	233148	233153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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