MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 93132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_009092	CAA	2	6	1020843	1020848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511833
21003	NC_009092	GGC	2	6	1020882	1020887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511833
21004	NC_009092	GGC	2	6	1020951	1020956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511833
21005	NC_009092	AGA	2	6	1020971	1020976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511833
21006	NC_009092	CAGA	2	8	1020991	1020998	50 %	0 %	25 %	25 %	127511833
21007	NC_009092	CAC	2	6	1021002	1021007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511833
21008	NC_009092	TGCC	2	8	1021017	1021024	0 %	25 %	25 %	50 %	127511833
21009	NC_009092	TCA	2	6	1021079	1021084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511833
21010	NC_009092	CATG	2	8	1021134	1021141	25 %	25 %	25 %	25 %	127511833
21011	NC_009092	CGA	2	6	1021158	1021163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511833
21012	NC_009092	TGA	2	6	1021184	1021189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511833
21013	NC_009092	TCCTTC	2	12	1021282	1021293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21014	NC_009092	TCG	2	6	1021324	1021329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21015	NC_009092	T	6	6	1021449	1021454	0 %	100 %	0 %	0 %	127511834
21016	NC_009092	TCG	2	6	1021508	1021513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511834
21017	NC_009092	GCC	2	6	1021538	1021543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511834
21018	NC_009092	GC	3	6	1021569	1021574	0 %	0 %	50 %	50 %	127511834
21019	NC_009092	CGC	2	6	1021623	1021628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511834
21020	NC_009092	CCGA	2	8	1021648	1021655	25 %	0 %	25 %	50 %	127511834
21021	NC_009092	AG	3	6	1021695	1021700	50 %	0 %	50 %	0 %	127511834
21022	NC_009092	GC	3	6	1021702	1021707	0 %	0 %	50 %	50 %	127511834
21023	NC_009092	TGC	2	6	1021739	1021744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511834
21024	NC_009092	GCC	2	6	1021753	1021758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511834
21025	NC_009092	CGG	2	6	1021779	1021784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511834
21026	NC_009092	TGA	2	6	1021814	1021819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511834
21027	NC_009092	ACC	2	6	1021821	1021826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511834
21028	NC_009092	CCA	2	6	1021835	1021840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511834
21029	NC_009092	GGC	2	6	1021869	1021874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511834
21030	NC_009092	GC	3	6	1021976	1021981	0 %	0 %	50 %	50 %	127511834
21031	NC_009092	GCC	2	6	1021996	1022001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511834
21032	NC_009092	GCC	2	6	1022008	1022013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511834
21033	NC_009092	CAG	2	6	1022017	1022022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511834
21034	NC_009092	TGCCGC	2	12	1022024	1022035	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	127511834
21035	NC_009092	GCC	2	6	1022098	1022103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511834
21036	NC_009092	CTG	2	6	1022155	1022160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511834
21037	NC_009092	GTC	2	6	1022177	1022182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511834
21038	NC_009092	GGC	2	6	1022184	1022189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511834
21039	NC_009092	TCT	2	6	1022219	1022224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511834
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21041	NC_009092	TGC	2	6	1022327	1022332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511834
21042	NC_009092	ATC	2	6	1022347	1022352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511834
21043	NC_009092	TGA	2	6	1022363	1022368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511834
21044	NC_009092	TAAT	2	8	1022381	1022388	50 %	50 %	0 %	0 %	127511834
21045	NC_009092	GC	3	6	1022407	1022412	0 %	0 %	50 %	50 %	127511834
21046	NC_009092	CGC	2	6	1022415	1022420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511834
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21050	NC_009092	CCCG	2	8	1022487	1022494	0 %	0 %	25 %	75 %	127511834
21051	NC_009092	CT	3	6	1022568	1022573	0 %	50 %	0 %	50 %	127511834
21052	NC_009092	GC	3	6	1022629	1022634	0 %	0 %	50 %	50 %	127511834
21053	NC_009092	CAG	2	6	1022635	1022640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511834
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21055	NC_009092	TGG	2	6	1022705	1022710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511834
21056	NC_009092	CTG	2	6	1022797	1022802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511834
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21065	NC_009092	TAT	2	6	1023268	1023273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127511834
21066	NC_009092	GAG	2	6	1023358	1023363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511834
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21082	NC_009092	GTG	3	9	1024002	1024010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511835
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21087	NC_009092	GAT	2	6	1024133	1024138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511835
21088	NC_009092	GATG	2	8	1024148	1024155	25 %	25 %	50 %	0 %	127511835
21089	NC_009092	AGG	2	6	1024219	1024224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511835
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21099	NC_009092	TCAG	2	8	1024549	1024556	25 %	25 %	25 %	25 %	127511835
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21101	NC_009092	GGC	2	6	1024626	1024631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511835
21102	NC_009092	AGCA	2	8	1024677	1024684	50 %	0 %	25 %	25 %	127511835
21103	NC_009092	GCT	2	6	1024748	1024753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511835
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21105	NC_009092	GCG	2	6	1024854	1024859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21106	NC_009092	GCTTA	2	10	1024880	1024889	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21107	NC_009092	CTT	2	6	1024926	1024931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21108	NC_009092	C	6	6	1024977	1024982	0 %	0 %	0 %	100 %	127511836
21109	NC_009092	CACAG	2	10	1025006	1025015	40 %	0 %	20 %	40 %	127511836
21110	NC_009092	TGG	2	6	1025148	1025153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511836
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21113	NC_009092	A	6	6	1025484	1025489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21114	NC_009092	AC	3	6	1025516	1025521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21115	NC_009092	CA	3	6	1025532	1025537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21116	NC_009092	CAG	2	6	1025587	1025592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21117	NC_009092	CTG	2	6	1025611	1025616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21118	NC_009092	T	7	7	1025618	1025624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21119	NC_009092	TGA	2	6	1025729	1025734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21120	NC_009092	TTA	2	6	1025805	1025810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21121	NC_009092	TGT	2	6	1025861	1025866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21122	NC_009092	CCG	2	6	1025941	1025946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21123	NC_009092	CAT	2	6	1025972	1025977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21124	NC_009092	GCGA	2	8	1025983	1025990	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21125	NC_009092	GAC	2	6	1026060	1026065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511837
21126	NC_009092	CTT	2	6	1026093	1026098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511837
21127	NC_009092	TCT	2	6	1026131	1026136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511837
21128	NC_009092	GGT	2	6	1026139	1026144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511837
21129	NC_009092	TGG	2	6	1026158	1026163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511837
21130	NC_009092	ATG	2	6	1026166	1026171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511837
21131	NC_009092	CCT	2	6	1026212	1026217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511837
21132	NC_009092	TGC	2	6	1026254	1026259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511837
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21135	NC_009092	GAT	2	6	1026453	1026458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511837
21136	NC_009092	TCT	2	6	1026476	1026481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511837
21137	NC_009092	GCG	2	6	1026482	1026487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511837
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21141	NC_009092	ATCAGG	2	12	1026787	1026798	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	127511838
21142	NC_009092	ATC	2	6	1026817	1026822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511838
21143	NC_009092	ATC	2	6	1026889	1026894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511838
21144	NC_009092	TCC	2	6	1026913	1026918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511838
21145	NC_009092	ACC	2	6	1026919	1026924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511838
21146	NC_009092	TCT	3	9	1026929	1026937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511838
21147	NC_009092	G	6	6	1026939	1026944	0 %	0 %	100 %	0 %	127511838
21148	NC_009092	CAG	2	6	1026963	1026968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511838
21149	NC_009092	CTG	2	6	1027020	1027025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511838
21150	NC_009092	TCCAGC	2	12	1027096	1027107	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	127511838
21151	NC_009092	GCT	2	6	1027193	1027198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511838
21152	NC_009092	GCGAG	2	10	1027280	1027289	20 %	0 %	60 %	20 %	127511838
21153	NC_009092	GTC	2	6	1027314	1027319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511838
21154	NC_009092	ATC	2	6	1027338	1027343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511838
21155	NC_009092	ATC	2	6	1027375	1027380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511838
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21158	NC_009092	TCG	2	6	1027645	1027650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511838
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21162	NC_009092	GCT	2	6	1027807	1027812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511839
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21166	NC_009092	CGA	2	6	1027993	1027998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511839
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21178	NC_009092	GT	3	6	1028884	1028889	0 %	50 %	50 %	0 %	127511840
21179	NC_009092	GTG	2	6	1028913	1028918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511840
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21189	NC_009092	TTG	2	6	1029442	1029447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511840
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21194	NC_009092	GC	3	6	1029726	1029731	0 %	0 %	50 %	50 %	127511840
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21196	NC_009092	TGA	2	6	1029862	1029867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511840
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21217	NC_009092	CTTG	2	8	1030775	1030782	0 %	50 %	25 %	25 %	127511840
21218	NC_009092	GTC	2	6	1030809	1030814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511840
21219	NC_009092	CTG	2	6	1030826	1030831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511840
21220	NC_009092	T	6	6	1030916	1030921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21221	NC_009092	GGT	2	6	1030983	1030988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21222	NC_009092	CGG	2	6	1031037	1031042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511841
21223	NC_009092	GC	3	6	1031047	1031052	0 %	0 %	50 %	50 %	127511841
21224	NC_009092	TCA	2	6	1031241	1031246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511841
21225	NC_009092	GCT	2	6	1031294	1031299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511841
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21227	NC_009092	GCT	2	6	1031395	1031400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511841
21228	NC_009092	ACC	3	9	1031441	1031449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511841
21229	NC_009092	GGC	2	6	1031465	1031470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511841
21230	NC_009092	CTTG	2	8	1031501	1031508	0 %	50 %	25 %	25 %	127511841
21231	NC_009092	AGC	2	6	1031525	1031530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511841
21232	NC_009092	ATG	2	6	1031547	1031552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511841
21233	NC_009092	AAAT	2	8	1031617	1031624	75 %	25 %	0 %	0 %	127511841
21234	NC_009092	CGA	2	6	1031650	1031655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511841
21235	NC_009092	ATC	2	6	1031670	1031675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511841
21236	NC_009092	TTG	2	6	1031724	1031729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21237	NC_009092	ATA	2	6	1031760	1031765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21238	NC_009092	TAA	2	6	1031804	1031809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21239	NC_009092	GCA	2	6	1031859	1031864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511842
21240	NC_009092	GCC	2	6	1031904	1031909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511842
21241	NC_009092	CAG	3	9	1031913	1031921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511842
21242	NC_009092	GTC	2	6	1031946	1031951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511842
21243	NC_009092	GCT	2	6	1031969	1031974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511842
21244	NC_009092	GTTC	2	8	1032008	1032015	0 %	50 %	25 %	25 %	127511842
21245	NC_009092	CGG	2	6	1032038	1032043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511842
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21250	NC_009092	CAG	2	6	1032177	1032182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511842
21251	NC_009092	ATA	2	6	1032252	1032257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127511842
21252	NC_009092	AAG	2	6	1032515	1032520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511843
21253	NC_009092	CCCGG	2	10	1032576	1032585	0 %	0 %	40 %	60 %	127511843
21254	NC_009092	TCA	2	6	1032765	1032770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511843
21255	NC_009092	T	6	6	1032808	1032813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21256	NC_009092	GCTA	2	8	1032845	1032852	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21257	NC_009092	GCTA	2	8	1032862	1032869	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21258	NC_009092	GTG	2	6	1032906	1032911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21259	NC_009092	AAG	2	6	1032954	1032959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21260	NC_009092	TGA	2	6	1033031	1033036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511844
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21262	NC_009092	CTG	2	6	1033231	1033236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511844
21263	NC_009092	ATC	2	6	1033276	1033281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511844
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21270	NC_009092	AGAT	3	12	1033603	1033614	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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21279	NC_009092	CTG	2	6	1034237	1034242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511847
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21293	NC_009092	TTTA	2	8	1034866	1034873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21294	NC_009092	TAAA	2	8	1034892	1034899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21295	NC_009092	A	6	6	1034897	1034902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21296	NC_009092	TAA	2	6	1034925	1034930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21325	NC_009092	CAA	2	6	1036383	1036388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21327	NC_009092	TGTTT	2	10	1036519	1036528	0 %	80 %	20 %	0 %	127511850
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21342	NC_009092	AATT	2	8	1037401	1037408	50 %	50 %	0 %	0 %	127511850
21343	NC_009092	A	8	8	1037606	1037613	100 %	0 %	0 %	0 %	127511851
21344	NC_009092	TTA	2	6	1037624	1037629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127511851
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21347	NC_009092	TGA	2	6	1037830	1037835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511851
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21350	NC_009092	TGTAC	2	10	1038009	1038018	20 %	40 %	20 %	20 %	127511851
21351	NC_009092	GGC	2	6	1038044	1038049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511851
21352	NC_009092	AGA	2	6	1038076	1038081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511851
21353	NC_009092	ATG	2	6	1038120	1038125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511851
21354	NC_009092	TGT	2	6	1038136	1038141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511851
21355	NC_009092	ATG	2	6	1038192	1038197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511851
21356	NC_009092	ACT	2	6	1038232	1038237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511851
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21358	NC_009092	ATG	3	9	1038345	1038353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511851
21359	NC_009092	GCC	2	6	1038437	1038442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511851
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21364	NC_009092	TAC	2	6	1038595	1038600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511851
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21366	NC_009092	TGA	2	6	1038721	1038726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511851
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21379	NC_009092	GGT	2	6	1039646	1039651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511851
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21384	NC_009092	CAA	2	6	1039902	1039907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21385	NC_009092	TAA	2	6	1039908	1039913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21387	NC_009092	CAG	2	6	1040153	1040158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21392	NC_009092	GGCAG	2	10	1040312	1040321	20 %	0 %	60 %	20 %	127511852
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21448	NC_009092	GCA	2	6	1042743	1042748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511853
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21461	NC_009092	CTC	2	6	1043311	1043316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511853
21462	NC_009092	AGGAAG	2	12	1043342	1043353	50 %	0 %	50 %	0 %	127511853
21463	NC_009092	TGAG	2	8	1043355	1043362	25 %	25 %	50 %	0 %	127511853
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21465	NC_009092	GCG	2	6	1043369	1043374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511853
21466	NC_009092	AGA	2	6	1043382	1043387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511853
21467	NC_009092	CCA	2	6	1043421	1043426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511853
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21469	NC_009092	ACC	2	6	1043453	1043458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511853
21470	NC_009092	AGA	2	6	1043463	1043468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511853
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21485	NC_009092	AGC	2	6	1044125	1044130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21487	NC_009092	AG	3	6	1044261	1044266	50 %	0 %	50 %	0 %	127511854
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21492	NC_009092	TCG	2	6	1044560	1044565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511854
21493	NC_009092	GC	3	6	1044572	1044577	0 %	0 %	50 %	50 %	127511854
21494	NC_009092	GCA	2	6	1044588	1044593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511854
21495	NC_009092	CAG	2	6	1044610	1044615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511854
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