MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 93132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_009092	TGCC	2	8	923273	923280	0 %	25 %	25 %	50 %	127511741
19003	NC_009092	AGG	2	6	923291	923296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511741
19004	NC_009092	TAC	2	6	923350	923355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511741
19005	NC_009092	GCG	2	6	923519	923524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511741
19006	NC_009092	GCCTGA	2	12	923564	923575	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	127511741
19007	NC_009092	GACA	2	8	923613	923620	50 %	0 %	25 %	25 %	127511741
19008	NC_009092	GAA	2	6	923629	923634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511741
19009	NC_009092	CCG	2	6	923669	923674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511741
19010	NC_009092	CAC	2	6	923697	923702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511741
19011	NC_009092	GGT	2	6	923755	923760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511741
19012	NC_009092	TATC	2	8	923784	923791	25 %	50 %	0 %	25 %	127511741
19013	NC_009092	ACA	3	9	923855	923863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511741
19014	NC_009092	TGC	2	6	923885	923890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511741
19015	NC_009092	GGT	2	6	923908	923913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511741
19016	NC_009092	AAC	3	9	923938	923946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511741
19017	NC_009092	TCT	2	6	924026	924031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511741
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19019	NC_009092	CTATC	2	10	924131	924140	20 %	40 %	0 %	40 %	127511741
19020	NC_009092	CAC	2	6	924143	924148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511741
19021	NC_009092	CAA	2	6	924153	924158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511741
19022	NC_009092	AGCG	2	8	924163	924170	25 %	0 %	50 %	25 %	127511741
19023	NC_009092	CG	3	6	924228	924233	0 %	0 %	50 %	50 %	127511741
19024	NC_009092	CCTG	2	8	924240	924247	0 %	25 %	25 %	50 %	127511741
19025	NC_009092	GAT	3	9	924354	924362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511741
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19028	NC_009092	GAC	2	6	925018	925023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511741
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19030	NC_009092	TGA	2	6	925049	925054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511741
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19032	NC_009092	AGGGT	2	10	925098	925107	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
19033	NC_009092	GCC	2	6	925128	925133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19034	NC_009092	GTC	2	6	925175	925180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19035	NC_009092	T	6	6	925261	925266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19036	NC_009092	ATT	2	6	925301	925306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19037	NC_009092	CTA	2	6	925310	925315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19038	NC_009092	TTAC	2	8	925364	925371	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19039	NC_009092	TAA	2	6	925377	925382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19040	NC_009092	TCT	2	6	925468	925473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511742
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19045	NC_009092	AAG	2	6	925776	925781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511742
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19051	NC_009092	CGA	2	6	925934	925939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511742
19052	NC_009092	TGA	2	6	925972	925977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511742
19053	NC_009092	GAT	3	9	926000	926008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511742
19054	NC_009092	CTGGTG	2	12	926022	926033	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	127511742
19055	NC_009092	CCG	2	6	926041	926046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511742
19056	NC_009092	TGG	2	6	926056	926061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511742
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19065	NC_009092	GGC	2	6	926507	926512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511742
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19099	NC_009092	GGC	2	6	928161	928166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511743
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19101	NC_009092	AGT	2	6	928205	928210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511743
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19479	NC_009092	GCT	2	6	946662	946667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511757
19480	NC_009092	CAGCTG	2	12	946726	946737	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	127511757
19481	NC_009092	CAG	2	6	946786	946791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511757
19482	NC_009092	TGC	2	6	946827	946832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511757
19483	NC_009092	TCT	2	6	946893	946898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511757
19484	NC_009092	CCT	2	6	946914	946919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511757
19485	NC_009092	GTG	2	6	946949	946954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511757
19486	NC_009092	GCA	2	6	946959	946964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511757
19487	NC_009092	CCT	2	6	946989	946994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511757
19488	NC_009092	GTT	2	6	947031	947036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511757
19489	NC_009092	CGG	2	6	947037	947042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511757
19490	NC_009092	CGA	2	6	947073	947078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511757
19491	NC_009092	ATG	2	6	947155	947160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19492	NC_009092	AGA	2	6	947233	947238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511758
19493	NC_009092	ATT	2	6	947250	947255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127511758
19494	NC_009092	GCA	2	6	947275	947280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511758
19495	NC_009092	GCC	2	6	947302	947307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511758
19496	NC_009092	GA	3	6	947330	947335	50 %	0 %	50 %	0 %	127511758
19497	NC_009092	GGTCA	2	10	947364	947373	20 %	20 %	40 %	20 %	127511758
19498	NC_009092	GATC	2	8	947426	947433	25 %	25 %	25 %	25 %	127511758
19499	NC_009092	GTGG	2	8	947448	947455	0 %	25 %	75 %	0 %	127511758
19500	NC_009092	GCT	2	6	947501	947506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511758

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