MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 93132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_009092	GATCA	2	10	901773	901782	40 %	20 %	20 %	20 %	127511723
18503	NC_009092	AGA	2	6	901796	901801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511723
18504	NC_009092	GCC	2	6	901816	901821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511723
18505	NC_009092	CGT	2	6	901841	901846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511723
18506	NC_009092	GTC	2	6	901866	901871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511723
18507	NC_009092	TAC	2	6	901965	901970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511723
18508	NC_009092	CCG	2	6	901991	901996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511723
18509	NC_009092	CTC	2	6	902019	902024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511723
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18511	NC_009092	GTC	2	6	902283	902288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511723
18512	NC_009092	AGG	2	6	902304	902309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511723
18513	NC_009092	GTC	2	6	902424	902429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511723
18514	NC_009092	CTG	2	6	902433	902438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511723
18515	NC_009092	CAG	2	6	902440	902445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511723
18516	NC_009092	ATT	2	6	902478	902483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127511723
18517	NC_009092	GTT	2	6	902635	902640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511724
18518	NC_009092	GGTGAT	2	12	902647	902658	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	127511724
18519	NC_009092	GAT	2	6	902704	902709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511724
18520	NC_009092	GAA	2	6	902773	902778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511724
18521	NC_009092	CGG	2	6	902790	902795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511724
18522	NC_009092	CCA	2	6	902823	902828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511724
18523	NC_009092	GAG	2	6	902855	902860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511724
18524	NC_009092	CTG	2	6	902875	902880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511724
18525	NC_009092	GAT	3	9	902917	902925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511724
18526	NC_009092	CAG	2	6	902929	902934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511724
18527	NC_009092	AT	3	6	902942	902947	50 %	50 %	0 %	0 %	127511724
18528	NC_009092	GAAGAT	2	12	903031	903042	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	127511724
18529	NC_009092	CAAA	2	8	903109	903116	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18530	NC_009092	TAC	2	6	903117	903122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18531	NC_009092	ATG	2	6	903149	903154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18532	NC_009092	GGA	2	6	903183	903188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18533	NC_009092	GCT	2	6	903190	903195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18534	NC_009092	CTGC	2	8	903283	903290	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18535	NC_009092	TGT	2	6	903291	903296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18536	NC_009092	TTG	2	6	903376	903381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18537	NC_009092	GA	3	6	903420	903425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18538	NC_009092	ACC	2	6	903441	903446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511725
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18541	NC_009092	GAGCA	2	10	903531	903540	40 %	0 %	40 %	20 %	127511725
18542	NC_009092	GCT	2	6	903542	903547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511725
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18546	NC_009092	GAGG	2	8	903713	903720	25 %	0 %	75 %	0 %	127511725
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18552	NC_009092	CTG	2	6	903947	903952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511725
18553	NC_009092	GC	3	6	904013	904018	0 %	0 %	50 %	50 %	127511725
18554	NC_009092	GTG	2	6	904030	904035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511725
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18560	NC_009092	TAA	2	6	904346	904351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18561	NC_009092	AGCA	2	8	904362	904369	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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18608	NC_009092	GGGC	2	8	906777	906784	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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18742	NC_009092	TGAG	2	8	912450	912457	25 %	25 %	50 %	0 %	127511734
18743	NC_009092	GCT	2	6	912466	912471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511734
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18981	NC_009092	GGC	2	6	922315	922320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511741
18982	NC_009092	CCG	2	6	922406	922411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511741
18983	NC_009092	GAC	2	6	922432	922437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511741
18984	NC_009092	TGA	2	6	922439	922444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511741
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