MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 93132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_009092	TCT	2	6	829027	829032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511662
17003	NC_009092	CTGT	2	8	829135	829142	0 %	50 %	25 %	25 %	127511662
17004	NC_009092	GGC	2	6	829245	829250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511662
17005	NC_009092	GGC	2	6	829281	829286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511662
17006	NC_009092	GAA	2	6	829329	829334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511662
17007	NC_009092	CTT	2	6	829335	829340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511662
17008	NC_009092	GCC	2	6	829357	829362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511662
17009	NC_009092	CTG	2	6	829371	829376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511662
17010	NC_009092	AGGC	2	8	829398	829405	25 %	0 %	50 %	25 %	127511662
17011	NC_009092	ACC	2	6	829425	829430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511662
17012	NC_009092	TGG	2	6	829475	829480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511662
17013	NC_009092	TGG	2	6	829526	829531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511662
17014	NC_009092	ACC	2	6	829573	829578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511662
17015	NC_009092	TTG	2	6	829591	829596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511662
17016	NC_009092	TTC	2	6	829705	829710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511662
17017	NC_009092	GGC	2	6	829764	829769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511662
17018	NC_009092	CAC	2	6	829770	829775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511662
17019	NC_009092	GGC	2	6	829791	829796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511662
17020	NC_009092	GTG	2	6	829813	829818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511662
17021	NC_009092	TGG	2	6	829856	829861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511662
17022	NC_009092	TAG	2	6	829885	829890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511662
17023	NC_009092	TGG	2	6	829910	829915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511662
17024	NC_009092	ATG	3	9	829936	829944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511662
17025	NC_009092	GTC	2	6	830019	830024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511662
17026	NC_009092	CTTT	2	8	830060	830067	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17027	NC_009092	CTGG	2	8	830076	830083	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17028	NC_009092	TGGC	2	8	830092	830099	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17029	NC_009092	TAA	2	6	830156	830161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17030	NC_009092	TAA	2	6	830218	830223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17031	NC_009092	GAA	2	6	830302	830307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511663
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17033	NC_009092	GCG	2	6	830334	830339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511663
17034	NC_009092	CGG	3	9	830343	830351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511663
17035	NC_009092	CTG	2	6	830376	830381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511663
17036	NC_009092	GCG	2	6	830400	830405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511663
17037	NC_009092	GCCT	2	8	830430	830437	0 %	25 %	25 %	50 %	127511663
17038	NC_009092	TATCA	2	10	830438	830447	40 %	40 %	0 %	20 %	127511663
17039	NC_009092	GTG	2	6	830448	830453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511663
17040	NC_009092	CAGCG	2	10	830462	830471	20 %	0 %	40 %	40 %	127511663
17041	NC_009092	AG	3	6	830491	830496	50 %	0 %	50 %	0 %	127511663
17042	NC_009092	GGT	2	6	830539	830544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511663
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17044	NC_009092	GAC	2	6	830580	830585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511663
17045	NC_009092	CTG	2	6	830624	830629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511663
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17049	NC_009092	CAT	2	6	830810	830815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511663
17050	NC_009092	TGA	2	6	830856	830861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511663
17051	NC_009092	TCA	2	6	830893	830898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511663
17052	NC_009092	CGC	2	6	830986	830991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511663
17053	NC_009092	GCT	2	6	831055	831060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511663
17054	NC_009092	TGG	2	6	831145	831150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511663
17055	NC_009092	ATG	2	6	831167	831172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511663
17056	NC_009092	GGC	2	6	831289	831294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511663
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17058	NC_009092	GAG	2	6	831314	831319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511663
17059	NC_009092	GGTG	2	8	831370	831377	0 %	25 %	75 %	0 %	127511663
17060	NC_009092	AGC	2	6	831396	831401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511663
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17062	NC_009092	CTA	2	6	831460	831465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511663
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17064	NC_009092	GCT	2	6	831493	831498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511663
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17066	NC_009092	AGC	2	6	831609	831614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511663
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17069	NC_009092	GGC	2	6	831676	831681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511663
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17100	NC_009092	GCG	2	6	832677	832682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511665
17101	NC_009092	CTG	2	6	832709	832714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511665
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17103	NC_009092	ATC	2	6	832767	832772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511665
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17108	NC_009092	TGA	2	6	833107	833112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17109	NC_009092	TGG	2	6	833159	833164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17110	NC_009092	GCT	2	6	833167	833172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17111	NC_009092	GGC	2	6	833211	833216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17112	NC_009092	CTC	2	6	833300	833305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511666
17113	NC_009092	CATG	2	8	833346	833353	25 %	25 %	25 %	25 %	127511666
17114	NC_009092	TGA	2	6	833484	833489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511666
17115	NC_009092	CAGGC	2	10	833511	833520	20 %	0 %	40 %	40 %	127511666
17116	NC_009092	AGC	2	6	833553	833558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511666
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17240	NC_009092	CTTGC	2	10	840046	840055	0 %	40 %	20 %	40 %	127511672
17241	NC_009092	AGTC	2	8	840102	840109	25 %	25 %	25 %	25 %	127511672
17242	NC_009092	CAG	2	6	840175	840180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511672
17243	NC_009092	ACCG	2	8	840226	840233	25 %	0 %	25 %	50 %	127511672
17244	NC_009092	ATG	2	6	840242	840247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511672
17245	NC_009092	TTG	2	6	840250	840255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511672
17246	NC_009092	TGAA	2	8	840288	840295	50 %	25 %	25 %	0 %	127511672
17247	NC_009092	GGGC	2	8	840338	840345	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17248	NC_009092	GGCGC	2	10	840354	840363	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17249	NC_009092	GC	3	6	840383	840388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17250	NC_009092	GCC	2	6	840433	840438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17251	NC_009092	A	6	6	840461	840466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17252	NC_009092	ACA	2	6	840531	840536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17253	NC_009092	ATTC	2	8	840566	840573	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17254	NC_009092	CCTG	2	8	840618	840625	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17255	NC_009092	CGC	2	6	840672	840677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17256	NC_009092	GGGGC	2	10	840678	840687	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
17257	NC_009092	CCG	2	6	840823	840828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511673
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17267	NC_009092	GCCA	2	8	841385	841392	25 %	0 %	25 %	50 %	127511673
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17279	NC_009092	AGC	2	6	841722	841727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511673
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17283	NC_009092	TATG	2	8	841880	841887	25 %	50 %	25 %	0 %	127511673
17284	NC_009092	CT	3	6	841992	841997	0 %	50 %	0 %	50 %	127511673
17285	NC_009092	CCG	2	6	842028	842033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17286	NC_009092	CA	3	6	842106	842111	50 %	0 %	0 %	50 %	127511674
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17331	NC_009092	GCCAA	2	10	843997	844006	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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17355	NC_009092	AGCG	2	8	845018	845025	25 %	0 %	50 %	25 %	127511677
17356	NC_009092	TGA	2	6	845158	845163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511677
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17358	NC_009092	TA	3	6	845262	845267	50 %	50 %	0 %	0 %	127511677
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