MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 93132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_009092	GGC	2	6	782139	782144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511622
16002	NC_009092	TCG	2	6	782146	782151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511622
16003	NC_009092	TGG	2	6	782282	782287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511622
16004	NC_009092	CTT	2	6	782309	782314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511622
16005	NC_009092	CGA	2	6	782355	782360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511622
16006	NC_009092	AGC	2	6	782374	782379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511622
16007	NC_009092	GTC	2	6	782400	782405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511622
16008	NC_009092	GTG	2	6	782437	782442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511622
16009	NC_009092	GTT	2	6	782468	782473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511622
16010	NC_009092	AT	3	6	782597	782602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_009092	ATA	2	6	782605	782610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16012	NC_009092	ATT	2	6	782635	782640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_009092	A	6	6	782711	782716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_009092	GAT	2	6	782717	782722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_009092	GAA	2	6	782787	782792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_009092	CATC	2	8	782815	782822	25 %	25 %	0 %	50 %	127511623
16017	NC_009092	ACT	2	6	782902	782907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511623
16018	NC_009092	ATG	2	6	783019	783024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511623
16019	NC_009092	TAC	2	6	783069	783074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511623
16020	NC_009092	G	6	6	783137	783142	0 %	0 %	100 %	0 %	127511623
16021	NC_009092	AG	4	8	783211	783218	50 %	0 %	50 %	0 %	127511623
16022	NC_009092	TAC	2	6	783252	783257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511623
16023	NC_009092	CGA	3	9	783269	783277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511623
16024	NC_009092	GGC	2	6	783389	783394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511623
16025	NC_009092	GCA	2	6	783395	783400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511623
16026	NC_009092	GC	3	6	783441	783446	0 %	0 %	50 %	50 %	127511623
16027	NC_009092	TAGA	2	8	783641	783648	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_009092	ATG	2	6	783686	783691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_009092	TAG	2	6	783774	783779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_009092	AGG	2	6	783788	783793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16031	NC_009092	CAG	2	6	783811	783816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511624
16032	NC_009092	CGC	2	6	783865	783870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511624
16033	NC_009092	TAA	2	6	783890	783895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127511624
16034	NC_009092	GCA	2	6	783917	783922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511624
16035	NC_009092	AGG	2	6	783982	783987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511624
16036	NC_009092	CTG	2	6	784014	784019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511624
16037	NC_009092	CGA	2	6	784070	784075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511624
16038	NC_009092	GCC	2	6	784198	784203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511624
16039	NC_009092	CGG	2	6	784330	784335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511624
16040	NC_009092	GGC	3	9	784391	784399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511624
16041	NC_009092	CTT	2	6	784408	784413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511624
16042	NC_009092	CTG	2	6	784440	784445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511624
16043	NC_009092	TCGCCA	2	12	784450	784461	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	127511624
16044	NC_009092	GTGA	2	8	784545	784552	25 %	25 %	50 %	0 %	127511624
16045	NC_009092	GAG	2	6	784581	784586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511624
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16047	NC_009092	CACAG	2	10	784821	784830	40 %	0 %	20 %	40 %	127511624
16048	NC_009092	ATTA	2	8	784924	784931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_009092	GGT	2	6	784961	784966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_009092	AC	3	6	785038	785043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16051	NC_009092	GGAA	2	8	785048	785055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_009092	GCA	2	6	785081	785086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511625
16053	NC_009092	GCCC	2	8	785189	785196	0 %	0 %	25 %	75 %	127511625
16054	NC_009092	G	6	6	785200	785205	0 %	0 %	100 %	0 %	127511625
16055	NC_009092	CAT	2	6	785207	785212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511625
16056	NC_009092	GTC	2	6	785263	785268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511625
16057	NC_009092	TGGCC	2	10	785270	785279	0 %	20 %	40 %	40 %	127511625
16058	NC_009092	TGG	2	6	785296	785301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511625
16059	NC_009092	GTG	2	6	785328	785333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511625
16060	NC_009092	TGC	2	6	785377	785382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511625
16061	NC_009092	GCG	2	6	785386	785391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511625
16062	NC_009092	CAT	2	6	785435	785440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511625
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16090	NC_009092	TGCCGA	2	12	786822	786833	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	127511626
16091	NC_009092	GCT	2	6	786894	786899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511626
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16099	NC_009092	CGC	2	6	787154	787159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16100	NC_009092	AAC	2	6	787199	787204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16101	NC_009092	CTG	2	6	787335	787340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511627
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16104	NC_009092	GAG	2	6	787521	787526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511628
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16484	NC_009092	CTG	2	6	805026	805031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511643
16485	NC_009092	GCA	2	6	805043	805048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511643
16486	NC_009092	CGA	2	6	805088	805093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511643
16487	NC_009092	TGA	2	6	805150	805155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511643
16488	NC_009092	CGG	2	6	805159	805164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511643
16489	NC_009092	GAT	2	6	805350	805355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511643
16490	NC_009092	AGC	2	6	805390	805395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511643
16491	NC_009092	A	6	6	805398	805403	100 %	0 %	0 %	0 %	127511643
16492	NC_009092	GCCTG	2	10	805444	805453	0 %	20 %	40 %	40 %	127511643
16493	NC_009092	CGG	2	6	805459	805464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511643
16494	NC_009092	GGC	2	6	805491	805496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511643
16495	NC_009092	AAC	2	6	805545	805550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511643
16496	NC_009092	TAA	2	6	805604	805609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127511643
16497	NC_009092	GCC	2	6	805680	805685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511643
16498	NC_009092	GACG	2	8	805751	805758	25 %	0 %	50 %	25 %	127511643
16499	NC_009092	ACT	2	6	805804	805809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511643
16500	NC_009092	TGG	2	6	805849	805854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511643

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