MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 93132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_009092	CT	3	6	685725	685730	0 %	50 %	0 %	50 %	127511540
14002	NC_009092	GCCGAT	2	12	685760	685771	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	127511540
14003	NC_009092	CCG	2	6	685783	685788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511540
14004	NC_009092	C	6	6	685885	685890	0 %	0 %	0 %	100 %	127511541
14005	NC_009092	TCT	2	6	685938	685943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511541
14006	NC_009092	TGA	2	6	685965	685970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511541
14007	NC_009092	GCT	2	6	685984	685989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511541
14008	NC_009092	AC	3	6	686029	686034	50 %	0 %	0 %	50 %	127511541
14009	NC_009092	CA	3	6	686038	686043	50 %	0 %	0 %	50 %	127511541
14010	NC_009092	CGC	2	6	686055	686060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511541
14011	NC_009092	GCC	2	6	686099	686104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511541
14012	NC_009092	TGA	2	6	686118	686123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511541
14013	NC_009092	GCC	2	6	686144	686149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511541
14014	NC_009092	TACA	2	8	686156	686163	50 %	25 %	0 %	25 %	127511541
14015	NC_009092	TCG	2	6	686201	686206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511541
14016	NC_009092	CTG	2	6	686260	686265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511541
14017	NC_009092	GCG	2	6	686298	686303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511541
14018	NC_009092	TCG	2	6	686414	686419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511541
14019	NC_009092	AGT	2	6	686482	686487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511542
14020	NC_009092	GCA	2	6	686526	686531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511542
14021	NC_009092	GCT	2	6	686665	686670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511542
14022	NC_009092	CGC	2	6	686688	686693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511542
14023	NC_009092	CTG	2	6	686712	686717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511542
14024	NC_009092	CCTTG	2	10	686805	686814	0 %	40 %	20 %	40 %	127511542
14025	NC_009092	GTTTGA	2	12	686838	686849	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	127511542
14026	NC_009092	CGG	2	6	686877	686882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511542
14027	NC_009092	TCT	2	6	686886	686891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511542
14028	NC_009092	CTGAG	2	10	686901	686910	20 %	20 %	40 %	20 %	127511542
14029	NC_009092	TCA	2	6	686963	686968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511542
14030	NC_009092	GCC	2	6	687005	687010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511542
14031	NC_009092	GCA	2	6	687027	687032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511542
14032	NC_009092	GCA	2	6	687105	687110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511542
14033	NC_009092	TAG	2	6	687236	687241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511542
14034	NC_009092	GAT	2	6	687307	687312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511542
14035	NC_009092	GGC	2	6	687322	687327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511542
14036	NC_009092	CTT	2	6	687370	687375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511542
14037	NC_009092	ACC	2	6	687386	687391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511542
14038	NC_009092	CTGT	2	8	687398	687405	0 %	50 %	25 %	25 %	127511542
14039	NC_009092	TCA	2	6	687432	687437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511542
14040	NC_009092	GATA	2	8	687492	687499	50 %	25 %	25 %	0 %	127511542
14041	NC_009092	CAT	2	6	687514	687519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511542
14042	NC_009092	TTG	2	6	687623	687628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511542
14043	NC_009092	CTT	2	6	687640	687645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511542
14044	NC_009092	GCC	2	6	687658	687663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511542
14045	NC_009092	GGC	2	6	687694	687699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511542
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14049	NC_009092	GCG	2	6	687802	687807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511542
14050	NC_009092	CCT	2	6	687867	687872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511542
14051	NC_009092	CAGGGC	2	12	687952	687963	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	127511542
14052	NC_009092	TCG	2	6	688001	688006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511542
14053	NC_009092	ACC	2	6	688043	688048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511542
14054	NC_009092	TCA	2	6	688077	688082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511542
14055	NC_009092	TGA	2	6	688134	688139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511542
14056	NC_009092	GGC	2	6	688192	688197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511542
14057	NC_009092	GGA	2	6	688300	688305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511542
14058	NC_009092	TGC	2	6	688331	688336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511542
14059	NC_009092	CGC	2	6	688407	688412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511542
14060	NC_009092	CAG	2	6	688459	688464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511542
14061	NC_009092	GCC	2	6	688477	688482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511542
14062	NC_009092	GCC	2	6	688498	688503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511542
14063	NC_009092	GCG	2	6	688514	688519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511542
14064	NC_009092	CGA	2	6	688551	688556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511542
14065	NC_009092	TAA	2	6	688663	688668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127511542
14066	NC_009092	TAA	2	6	688710	688715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127511542
14067	NC_009092	TCC	2	6	688745	688750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14068	NC_009092	CA	3	6	688775	688780	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14069	NC_009092	TCCC	2	8	688798	688805	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14070	NC_009092	AGG	2	6	688808	688813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_009092	G	6	6	688872	688877	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_009092	A	6	6	688915	688920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_009092	TAA	2	6	688960	688965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_009092	CTT	2	6	689079	689084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511543
14075	NC_009092	GCT	2	6	689144	689149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511543
14076	NC_009092	CAG	2	6	689169	689174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511543
14077	NC_009092	GGC	2	6	689274	689279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511543
14078	NC_009092	AAG	2	6	689311	689316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511543
14079	NC_009092	GAT	2	6	689379	689384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511543
14080	NC_009092	CAG	2	6	689406	689411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511543
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14083	NC_009092	CCA	2	6	689588	689593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511543
14084	NC_009092	GCG	2	6	689612	689617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511543
14085	NC_009092	CCTAG	2	10	689662	689671	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14086	NC_009092	AGT	2	6	689801	689806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_009092	GCGA	2	8	689827	689834	25 %	0 %	50 %	25 %	127511544
14088	NC_009092	GCGG	2	8	689872	689879	0 %	0 %	75 %	25 %	127511544
14089	NC_009092	CGA	2	6	689971	689976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511544
14090	NC_009092	ATG	2	6	690047	690052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511544
14091	NC_009092	ACC	2	6	690054	690059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511544
14092	NC_009092	AGG	2	6	690066	690071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511544
14093	NC_009092	GGT	2	6	690091	690096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511544
14094	NC_009092	CGA	2	6	690109	690114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511544
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14097	NC_009092	CAG	2	6	690184	690189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511544
14098	NC_009092	CTGG	2	8	690205	690212	0 %	25 %	50 %	25 %	127511544
14099	NC_009092	CCA	2	6	690261	690266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511544
14100	NC_009092	GC	3	6	690274	690279	0 %	0 %	50 %	50 %	127511544
14101	NC_009092	TGG	2	6	690324	690329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511544
14102	NC_009092	G	6	6	690349	690354	0 %	0 %	100 %	0 %	127511544
14103	NC_009092	GCC	2	6	690362	690367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511544
14104	NC_009092	CTG	2	6	690374	690379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511544
14105	NC_009092	ACT	2	6	690405	690410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511544
14106	NC_009092	GGA	2	6	690508	690513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511544
14107	NC_009092	GAT	2	6	690514	690519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511544
14108	NC_009092	GAA	2	6	690535	690540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511544
14109	NC_009092	GGA	2	6	690541	690546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511544
14110	NC_009092	CCACC	2	10	690559	690568	20 %	0 %	0 %	80 %	127511544
14111	NC_009092	CGG	2	6	690573	690578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511544
14112	NC_009092	GCC	3	9	690626	690634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511544
14113	NC_009092	GCC	2	6	690643	690648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511544
14114	NC_009092	AGA	2	6	690660	690665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511544
14115	NC_009092	CGC	2	6	690703	690708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511544
14116	NC_009092	TCAG	2	8	690744	690751	25 %	25 %	25 %	25 %	127511544
14117	NC_009092	GCCACC	2	12	690793	690804	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	127511544
14118	NC_009092	TGGA	2	8	690827	690834	25 %	25 %	50 %	0 %	127511544
14119	NC_009092	GAA	2	6	690835	690840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511544
14120	NC_009092	GCT	2	6	690859	690864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511544
14121	NC_009092	AGA	2	6	690921	690926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511544
14122	NC_009092	GCG	2	6	690995	691000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511544
14123	NC_009092	GGCT	2	8	691023	691030	0 %	25 %	50 %	25 %	127511544
14124	NC_009092	CGC	2	6	691051	691056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511544
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14134	NC_009092	CTG	3	9	691430	691438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511544
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14230	NC_009092	ACTGTC	2	12	695853	695864	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	127511548
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14233	NC_009092	CTG	2	6	696025	696030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511548
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14240	NC_009092	TGA	2	6	696191	696196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511548
14241	NC_009092	CGC	2	6	696198	696203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511548
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14243	NC_009092	TGC	2	6	696260	696265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511548
14244	NC_009092	CTG	2	6	696280	696285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511548
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14250	NC_009092	TGC	2	6	696533	696538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511548
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14345	NC_009092	TG	3	6	701004	701009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14346	NC_009092	TTTG	2	8	701023	701030	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14347	NC_009092	GGC	2	6	701048	701053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14349	NC_009092	A	7	7	701130	701136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14350	NC_009092	GCTC	2	8	701164	701171	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14351	NC_009092	GAT	2	6	701185	701190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511550
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14356	NC_009092	TCG	2	6	701302	701307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511550
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14358	NC_009092	CTT	2	6	701369	701374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511550
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14474	NC_009092	TGT	2	6	707030	707035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14477	NC_009092	TGA	2	6	707268	707273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511556
14478	NC_009092	GGC	2	6	707300	707305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511556
14479	NC_009092	TCT	2	6	707340	707345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511556
14480	NC_009092	GCT	2	6	707380	707385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511556
14481	NC_009092	AG	4	8	707445	707452	50 %	0 %	50 %	0 %	127511556
14482	NC_009092	CTG	2	6	707495	707500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511556
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14485	NC_009092	GCT	2	6	707728	707733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14486	NC_009092	TCG	2	6	707991	707996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511557
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14489	NC_009092	CTG	3	9	708032	708040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511557
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14499	NC_009092	TCG	2	6	708667	708672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511558
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