MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 93132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_009092	CGC	2	6	636217	636222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511495
13002	NC_009092	GGGC	2	8	636223	636230	0 %	0 %	75 %	25 %	127511495
13003	NC_009092	AGG	2	6	636261	636266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511495
13004	NC_009092	GTC	3	9	636272	636280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511495
13005	NC_009092	GAT	2	6	636334	636339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511495
13006	NC_009092	TGACCT	2	12	636441	636452	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	127511495
13007	NC_009092	GC	3	6	636456	636461	0 %	0 %	50 %	50 %	127511495
13008	NC_009092	TGCC	2	8	636594	636601	0 %	25 %	25 %	50 %	127511495
13009	NC_009092	CGG	2	6	636649	636654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511495
13010	NC_009092	CAC	2	6	636675	636680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511495
13011	NC_009092	GCGG	2	8	636703	636710	0 %	0 %	75 %	25 %	127511495
13012	NC_009092	TGG	2	6	636720	636725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511495
13013	NC_009092	GTG	2	6	636755	636760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511495
13014	NC_009092	TGG	2	6	636801	636806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511495
13015	NC_009092	TGGGC	2	10	636828	636837	0 %	20 %	60 %	20 %	127511495
13016	NC_009092	CTG	2	6	636845	636850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511495
13017	NC_009092	TG	3	6	636923	636928	0 %	50 %	50 %	0 %	127511495
13018	NC_009092	CTG	2	6	636950	636955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511495
13019	NC_009092	GCC	2	6	637010	637015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511495
13020	NC_009092	GTT	2	6	637018	637023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511495
13021	NC_009092	CGC	2	6	637060	637065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511495
13022	NC_009092	GGC	2	6	637091	637096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511495
13023	NC_009092	GTG	3	9	637097	637105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511495
13024	NC_009092	GT	3	6	637142	637147	0 %	50 %	50 %	0 %	127511495
13025	NC_009092	GCG	2	6	637182	637187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511495
13026	NC_009092	CAT	2	6	637210	637215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511495
13027	NC_009092	GGC	2	6	637252	637257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511495
13028	NC_009092	GTG	2	6	637268	637273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511495
13029	NC_009092	GCGA	2	8	637311	637318	25 %	0 %	50 %	25 %	127511495
13030	NC_009092	A	6	6	637442	637447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_009092	GATA	2	8	637466	637473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_009092	GCC	2	6	637553	637558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511496
13033	NC_009092	GTG	2	6	637576	637581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511496
13034	NC_009092	AAC	2	6	637598	637603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511496
13035	NC_009092	TA	3	6	637717	637722	50 %	50 %	0 %	0 %	127511496
13036	NC_009092	AGA	2	6	637736	637741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511496
13037	NC_009092	ACT	2	6	637765	637770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511496
13038	NC_009092	ATC	2	6	637858	637863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511496
13039	NC_009092	CG	3	6	637897	637902	0 %	0 %	50 %	50 %	127511496
13040	NC_009092	GA	3	6	637906	637911	50 %	0 %	50 %	0 %	127511496
13041	NC_009092	ATA	2	6	637930	637935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127511496
13042	NC_009092	TAA	2	6	637955	637960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127511497
13043	NC_009092	TAT	2	6	637967	637972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127511497
13044	NC_009092	TTCC	2	8	637991	637998	0 %	50 %	0 %	50 %	127511497
13045	NC_009092	GCGT	2	8	638027	638034	0 %	25 %	50 %	25 %	127511497
13046	NC_009092	GCG	2	6	638041	638046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511497
13047	NC_009092	GTG	2	6	638062	638067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511497
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13050	NC_009092	GAC	2	6	638139	638144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511497
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13054	NC_009092	GATC	2	8	638247	638254	25 %	25 %	25 %	25 %	127511497
13055	NC_009092	TGG	3	9	638318	638326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511497
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13058	NC_009092	AAG	2	6	638488	638493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511497
13059	NC_009092	ACGCC	2	10	638510	638519	20 %	0 %	20 %	60 %	127511497
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13061	NC_009092	CAT	2	6	638532	638537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511497
13062	NC_009092	ACT	2	6	638552	638557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511497
13063	NC_009092	CTG	2	6	638608	638613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511497
13064	NC_009092	TG	3	6	638664	638669	0 %	50 %	50 %	0 %	127511497
13065	NC_009092	GCGCC	2	10	638682	638691	0 %	0 %	40 %	60 %	127511497
13066	NC_009092	GCT	2	6	638739	638744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511497
13067	NC_009092	CTG	2	6	638803	638808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511497
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13069	NC_009092	GGC	2	6	638910	638915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511497
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13074	NC_009092	CTGT	2	8	639142	639149	0 %	50 %	25 %	25 %	127511497
13075	NC_009092	GTCG	2	8	639171	639178	0 %	25 %	50 %	25 %	127511497
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13092	NC_009092	CCT	2	6	640316	640321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511498
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13104	NC_009092	A	6	6	640903	640908	100 %	0 %	0 %	0 %	127511498
13105	NC_009092	TGGT	2	8	641008	641015	0 %	50 %	50 %	0 %	127511498
13106	NC_009092	GGCC	2	8	641058	641065	0 %	0 %	50 %	50 %	127511498
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13111	NC_009092	CGG	3	9	641382	641390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511499
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13117	NC_009092	GCTA	2	8	642075	642082	25 %	25 %	25 %	25 %	127511499
13118	NC_009092	ATTC	2	8	642083	642090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13119	NC_009092	TA	3	6	642095	642100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_009092	AAACC	2	10	642107	642116	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13121	NC_009092	TAAT	2	8	642141	642148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_009092	TAA	2	6	642151	642156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_009092	ACG	2	6	642216	642221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511500
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13125	NC_009092	TTATT	2	10	642299	642308	20 %	80 %	0 %	0 %	127511500
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13240	NC_009092	TCT	2	6	647524	647529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511505
13241	NC_009092	TTC	2	6	647541	647546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511505
13242	NC_009092	GC	3	6	647874	647879	0 %	0 %	50 %	50 %	127511505
13243	NC_009092	TCT	2	6	647905	647910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511505
13244	NC_009092	AG	3	6	647957	647962	50 %	0 %	50 %	0 %	127511505
13245	NC_009092	A	6	6	647978	647983	100 %	0 %	0 %	0 %	127511506
13246	NC_009092	TGC	2	6	648025	648030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511506
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13259	NC_009092	G	6	6	648719	648724	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13260	NC_009092	GTTT	2	8	648736	648743	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13261	NC_009092	T	6	6	648748	648753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13262	NC_009092	TGC	2	6	648793	648798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511507
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13266	NC_009092	CAT	2	6	649003	649008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511507
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13276	NC_009092	T	7	7	649908	649914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13277	NC_009092	GAT	2	6	649982	649987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13279	NC_009092	TGA	2	6	650087	650092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511509
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13342	NC_009092	GGT	2	6	653453	653458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511511
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13358	NC_009092	TGC	2	6	654288	654293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511511
13359	NC_009092	GCT	2	6	654328	654333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511511
13360	NC_009092	GGC	2	6	654412	654417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511511
13361	NC_009092	AGATG	2	10	654460	654469	40 %	20 %	40 %	0 %	127511511
13362	NC_009092	GAT	2	6	654496	654501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511511
13363	NC_009092	TAT	2	6	654509	654514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127511511
13364	NC_009092	GGAGCA	2	12	654523	654534	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	127511511
13365	NC_009092	TTA	2	6	654574	654579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127511511
13366	NC_009092	TGA	2	6	654724	654729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13367	NC_009092	CAT	2	6	654730	654735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13368	NC_009092	CTA	2	6	654773	654778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13369	NC_009092	CGG	2	6	654793	654798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13370	NC_009092	ACA	2	6	654802	654807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13371	NC_009092	CCACG	2	10	654875	654884	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13372	NC_009092	TA	3	6	654897	654902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13373	NC_009092	ATTAT	2	10	654912	654921	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13374	NC_009092	T	6	6	654946	654951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13375	NC_009092	AAG	2	6	655036	655041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13376	NC_009092	GGA	2	6	655050	655055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13377	NC_009092	TGA	2	6	655230	655235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511512
13378	NC_009092	GTG	2	6	655280	655285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511512
13379	NC_009092	CGG	2	6	655335	655340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511512
13380	NC_009092	TGA	2	6	655430	655435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511512
13381	NC_009092	GCACTG	2	12	655447	655458	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	127511512
13382	NC_009092	CGT	2	6	655549	655554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511512
13383	NC_009092	CTT	2	6	655626	655631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511512
13384	NC_009092	GTGG	2	8	655642	655649	0 %	25 %	75 %	0 %	127511512
13385	NC_009092	GGC	2	6	655653	655658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511512
13386	NC_009092	CAT	2	6	655758	655763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511512
13387	NC_009092	GTC	2	6	655889	655894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511512
13388	NC_009092	CAC	2	6	655944	655949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511512
13389	NC_009092	GTG	2	6	655964	655969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511512
13390	NC_009092	CGG	2	6	656046	656051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511512
13391	NC_009092	AGC	2	6	656135	656140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511512
13392	NC_009092	CTG	3	9	656209	656217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511512
13393	NC_009092	AAC	2	6	656434	656439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13394	NC_009092	T	6	6	656445	656450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13395	NC_009092	GA	3	6	656455	656460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13396	NC_009092	GACAAG	2	12	656522	656533	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13397	NC_009092	GAG	2	6	656535	656540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13398	NC_009092	GAA	2	6	656645	656650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511513
13399	NC_009092	TCGT	2	8	656684	656691	0 %	50 %	25 %	25 %	127511513
13400	NC_009092	CGA	2	6	656713	656718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511513
13401	NC_009092	CTA	2	6	656836	656841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511513
13402	NC_009092	ACCCTG	2	12	656876	656887	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	127511513
13403	NC_009092	GCC	2	6	656906	656911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511513
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13405	NC_009092	TTCCTG	2	12	656984	656995	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	127511513
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13411	NC_009092	TGC	2	6	657198	657203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511513
13412	NC_009092	CGG	2	6	657313	657318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511513
13413	NC_009092	TTCG	2	8	657348	657355	0 %	50 %	25 %	25 %	127511513
13414	NC_009092	GA	4	8	657358	657365	50 %	0 %	50 %	0 %	127511513
13415	NC_009092	CTG	2	6	657371	657376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511513
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13419	NC_009092	AT	3	6	657571	657576	50 %	50 %	0 %	0 %	127511514
13420	NC_009092	TTA	2	6	657588	657593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127511514
13421	NC_009092	GAA	2	6	657634	657639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511514
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13427	NC_009092	TGC	2	6	657963	657968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511514
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13432	NC_009092	ATC	2	6	658328	658333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511514
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13435	NC_009092	CTG	2	6	658457	658462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511514
13436	NC_009092	CAGCCA	2	12	658514	658525	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	127511514
13437	NC_009092	CTG	2	6	658715	658720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511514
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13441	NC_009092	GACTAC	2	12	658817	658828	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	127511514
13442	NC_009092	TGG	2	6	658903	658908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511514
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13445	NC_009092	GCCA	2	8	659005	659012	25 %	0 %	25 %	50 %	127511514
13446	NC_009092	ACAA	2	8	659123	659130	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13447	NC_009092	GAT	2	6	659157	659162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13448	NC_009092	GAA	2	6	659169	659174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13449	NC_009092	GCC	2	6	659206	659211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511515
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13452	NC_009092	CAT	2	6	659283	659288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511515
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13454	NC_009092	ACC	2	6	659545	659550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511515
13455	NC_009092	AGC	2	6	659606	659611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511515
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13459	NC_009092	CGG	2	6	659783	659788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511515
13460	NC_009092	AGA	2	6	659852	659857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511515
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13462	NC_009092	T	7	7	660027	660033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13463	NC_009092	GTT	2	6	660046	660051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13464	NC_009092	GCT	2	6	660121	660126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511516
13465	NC_009092	AGGCT	2	10	660139	660148	20 %	20 %	40 %	20 %	127511516
13466	NC_009092	CAG	2	6	660239	660244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511516
13467	NC_009092	TCG	2	6	660255	660260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511516
13468	NC_009092	CAT	2	6	660274	660279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511516
13469	NC_009092	CAG	2	6	660362	660367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511516
13470	NC_009092	TCT	2	6	660390	660395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511516
13471	NC_009092	AGGC	2	8	660404	660411	25 %	0 %	50 %	25 %	127511516
13472	NC_009092	GCA	2	6	660526	660531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511516
13473	NC_009092	CGC	3	9	660548	660556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511516
13474	NC_009092	ATC	2	6	660570	660575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511516
13475	NC_009092	GGC	2	6	660611	660616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511516
13476	NC_009092	CTG	3	9	660647	660655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511516
13477	NC_009092	GCG	2	6	660667	660672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511516
13478	NC_009092	GTT	2	6	660701	660706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511516
13479	NC_009092	TGCT	2	8	660723	660730	0 %	50 %	25 %	25 %	127511516
13480	NC_009092	CAA	2	6	660740	660745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511516
13481	NC_009092	TGG	2	6	660779	660784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511516
13482	NC_009092	CT	3	6	660818	660823	0 %	50 %	0 %	50 %	127511516
13483	NC_009092	TCA	2	6	660829	660834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511516
13484	NC_009092	CAG	2	6	660875	660880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511516
13485	NC_009092	CCA	2	6	660895	660900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511516
13486	NC_009092	AGC	2	6	660906	660911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511516
13487	NC_009092	GGC	2	6	660961	660966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511516
13488	NC_009092	GCT	2	6	661019	661024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511516
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13490	NC_009092	TCT	2	6	661278	661283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511516
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13499	NC_009092	AGCTC	2	10	661692	661701	20 %	20 %	20 %	40 %	127511517
13500	NC_009092	TGG	2	6	661704	661709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511517

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