MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 93132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_009092	AAG	2	6	610844	610849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511472
12502	NC_009092	A	6	6	610853	610858	100 %	0 %	0 %	0 %	127511472
12503	NC_009092	GCA	2	6	610864	610869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511472
12504	NC_009092	GT	3	6	610872	610877	0 %	50 %	50 %	0 %	127511472
12505	NC_009092	GGC	2	6	610883	610888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511472
12506	NC_009092	CGT	2	6	610931	610936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511472
12507	NC_009092	CTA	2	6	611024	611029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511472
12508	NC_009092	GCG	2	6	611121	611126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511473
12509	NC_009092	TGA	2	6	611128	611133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511473
12510	NC_009092	TCT	2	6	611289	611294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511473
12511	NC_009092	TGT	2	6	611320	611325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511473
12512	NC_009092	TAC	2	6	611362	611367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511473
12513	NC_009092	GGC	2	6	611369	611374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511473
12514	NC_009092	CT	3	6	611511	611516	0 %	50 %	0 %	50 %	127511474
12515	NC_009092	CGC	2	6	611531	611536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511474
12516	NC_009092	CTT	2	6	611574	611579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511474
12517	NC_009092	TCA	2	6	611612	611617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511474
12518	NC_009092	GCA	2	6	611630	611635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511474
12519	NC_009092	AGC	3	9	611689	611697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511474
12520	NC_009092	GCA	3	9	611828	611836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511474
12521	NC_009092	CGG	2	6	611870	611875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511474
12522	NC_009092	CAG	2	6	611898	611903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511474
12523	NC_009092	GAT	2	6	611927	611932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511474
12524	NC_009092	T	6	6	611950	611955	0 %	100 %	0 %	0 %	127511474
12525	NC_009092	TCGCCT	2	12	611992	612003	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	127511474
12526	NC_009092	GAG	2	6	612006	612011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511474
12527	NC_009092	GCGTT	2	10	612088	612097	0 %	40 %	40 %	20 %	127511474
12528	NC_009092	TGA	2	6	612116	612121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511474
12529	NC_009092	AAT	2	6	612167	612172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_009092	GCC	2	6	612315	612320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511475
12531	NC_009092	CCG	2	6	612335	612340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511475
12532	NC_009092	TGA	2	6	612353	612358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511475
12533	NC_009092	TAG	2	6	612380	612385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511475
12534	NC_009092	CGA	2	6	612405	612410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511475
12535	NC_009092	AC	3	6	612420	612425	50 %	0 %	0 %	50 %	127511475
12536	NC_009092	TGG	2	6	612428	612433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511475
12537	NC_009092	AAG	2	6	612434	612439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511475
12538	NC_009092	GCCA	2	8	612481	612488	25 %	0 %	25 %	50 %	127511475
12539	NC_009092	TGC	2	6	612527	612532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511475
12540	NC_009092	A	7	7	612540	612546	100 %	0 %	0 %	0 %	127511475
12541	NC_009092	GTG	2	6	612568	612573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511475
12542	NC_009092	AGC	3	9	612602	612610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511475
12543	NC_009092	AGCA	2	8	612625	612632	50 %	0 %	25 %	25 %	127511475
12544	NC_009092	GAT	2	6	612649	612654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511475
12545	NC_009092	CAC	2	6	612667	612672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511475
12546	NC_009092	GGC	2	6	612720	612725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511476
12547	NC_009092	CAT	2	6	612750	612755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511476
12548	NC_009092	TGG	2	6	612763	612768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511476
12549	NC_009092	AAT	2	6	612805	612810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127511476
12550	NC_009092	CT	3	6	612849	612854	0 %	50 %	0 %	50 %	127511476
12551	NC_009092	CTC	2	6	612874	612879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511476
12552	NC_009092	CCTC	2	8	612916	612923	0 %	25 %	0 %	75 %	127511476
12553	NC_009092	CCG	2	6	613031	613036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511476
12554	NC_009092	CTG	2	6	613045	613050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511476
12555	NC_009092	AC	3	6	613077	613082	50 %	0 %	0 %	50 %	127511476
12556	NC_009092	AAT	2	6	613168	613173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127511476
12557	NC_009092	GCCA	2	8	613318	613325	25 %	0 %	25 %	50 %	127511476
12558	NC_009092	GCCA	2	8	613342	613349	25 %	0 %	25 %	50 %	127511476
12559	NC_009092	TGG	2	6	613366	613371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511476
12560	NC_009092	TCT	2	6	613385	613390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511476
12561	NC_009092	CTG	2	6	613417	613422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511476
12562	NC_009092	GAA	3	9	613464	613472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511476
12563	NC_009092	GCA	2	6	613491	613496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511476
12564	NC_009092	GCA	2	6	613521	613526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511476
12565	NC_009092	TG	3	6	613530	613535	0 %	50 %	50 %	0 %	127511476
12566	NC_009092	TAAC	2	8	613637	613644	50 %	25 %	0 %	25 %	127511476
12567	NC_009092	A	7	7	613670	613676	100 %	0 %	0 %	0 %	127511477
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12569	NC_009092	TGCTC	2	10	613690	613699	0 %	40 %	20 %	40 %	127511477
12570	NC_009092	GGC	2	6	613726	613731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511477
12571	NC_009092	GCG	2	6	613755	613760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511477
12572	NC_009092	ACT	2	6	613761	613766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511477
12573	NC_009092	GTA	2	6	613845	613850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511477
12574	NC_009092	CGA	2	6	613975	613980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511477
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12576	NC_009092	CTA	2	6	614023	614028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511477
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12580	NC_009092	GTA	2	6	614126	614131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511477
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12585	NC_009092	ATG	2	6	614457	614462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12586	NC_009092	T	7	7	614467	614473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12587	NC_009092	ACTG	2	8	614495	614502	25 %	25 %	25 %	25 %	127511478
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12590	NC_009092	CCTG	2	8	614692	614699	0 %	25 %	25 %	50 %	127511478
12591	NC_009092	AGA	2	6	614721	614726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511478
12592	NC_009092	GTT	2	6	614775	614780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511478
12593	NC_009092	GTT	2	6	614784	614789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511478
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12596	NC_009092	CCTG	2	8	614953	614960	0 %	25 %	25 %	50 %	127511478
12597	NC_009092	TTC	2	6	614962	614967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511478
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12599	NC_009092	CTG	2	6	615042	615047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511478
12600	NC_009092	CTG	2	6	615088	615093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511478
12601	NC_009092	TC	3	6	615200	615205	0 %	50 %	0 %	50 %	127511478
12602	NC_009092	ATG	2	6	615433	615438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511478
12603	NC_009092	CGC	2	6	615480	615485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511478
12604	NC_009092	TGT	2	6	615566	615571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511478
12605	NC_009092	TCA	3	9	615577	615585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511478
12606	NC_009092	GGTA	2	8	615627	615634	25 %	25 %	50 %	0 %	127511478
12607	NC_009092	CTG	2	6	615723	615728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511478
12608	NC_009092	AT	3	6	615729	615734	50 %	50 %	0 %	0 %	127511478
12609	NC_009092	TCG	2	6	615745	615750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511478
12610	NC_009092	T	6	6	615828	615833	0 %	100 %	0 %	0 %	127511478
12611	NC_009092	TAA	2	6	615867	615872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_009092	TTA	2	6	615949	615954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_009092	T	6	6	616029	616034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_009092	GTT	2	6	616201	616206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511479
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12618	NC_009092	GTG	2	6	616328	616333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511479
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12620	NC_009092	GCT	2	6	616354	616359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511479
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12743	NC_009092	CG	3	6	623593	623598	0 %	0 %	50 %	50 %	127511485
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12758	NC_009092	T	6	6	624240	624245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12765	NC_009092	ATGC	2	8	624481	624488	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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12768	NC_009092	TGG	2	6	624611	624616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12770	NC_009092	ATG	2	6	624724	624729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12771	NC_009092	GAT	2	6	624788	624793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12859	NC_009092	CTG	3	9	629259	629267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511489
12860	NC_009092	CCTGCT	2	12	629312	629323	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	127511489
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12962	NC_009092	A	6	6	633930	633935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12966	NC_009092	GTC	2	6	634673	634678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12968	NC_009092	ATT	2	6	634747	634752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12969	NC_009092	ATT	2	6	634803	634808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12970	NC_009092	A	8	8	634922	634929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12971	NC_009092	CAA	2	6	635014	635019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511494
12972	NC_009092	CAA	2	6	635134	635139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511494
12973	NC_009092	AAG	2	6	635147	635152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511494
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12975	NC_009092	CTG	2	6	635197	635202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511494
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