MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 93132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_009092	AGA	2	6	560910	560915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511436
11502	NC_009092	ATAGTG	2	12	560921	560932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511436
11503	NC_009092	GGC	2	6	560968	560973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511436
11504	NC_009092	TGC	2	6	561018	561023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511436
11505	NC_009092	CGT	2	6	561047	561052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511436
11506	NC_009092	CTG	2	6	561053	561058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511436
11507	NC_009092	AAG	2	6	561095	561100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511436
11508	NC_009092	GGC	2	6	561101	561106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511436
11509	NC_009092	GCG	2	6	561156	561161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511436
11510	NC_009092	GTCT	2	8	561229	561236	0 %	50 %	25 %	25 %	127511436
11511	NC_009092	GCGA	2	8	561292	561299	25 %	0 %	50 %	25 %	127511437
11512	NC_009092	CT	3	6	561304	561309	0 %	50 %	0 %	50 %	127511437
11513	NC_009092	CGA	2	6	561372	561377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511437
11514	NC_009092	GCG	2	6	561401	561406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511437
11515	NC_009092	CTG	2	6	561418	561423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511437
11516	NC_009092	GCA	2	6	561477	561482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511437
11517	NC_009092	CGC	2	6	561507	561512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511437
11518	NC_009092	GCC	2	6	561520	561525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511437
11519	NC_009092	AGT	2	6	561558	561563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511437
11520	NC_009092	CGG	2	6	561594	561599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511437
11521	NC_009092	AG	3	6	561692	561697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_009092	CTT	2	6	561759	561764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_009092	GGC	2	6	561814	561819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11524	NC_009092	TGTT	2	8	561839	561846	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_009092	GCA	2	6	561870	561875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11526	NC_009092	TGA	2	6	561888	561893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511438
11527	NC_009092	CTT	2	6	561945	561950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511438
11528	NC_009092	GCG	2	6	561956	561961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511438
11529	NC_009092	CTG	2	6	561964	561969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511438
11530	NC_009092	CTG	2	6	562024	562029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511438
11531	NC_009092	GGT	2	6	562050	562055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511438
11532	NC_009092	TGG	2	6	562063	562068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511438
11533	NC_009092	AGCCT	2	10	562151	562160	20 %	20 %	20 %	40 %	127511438
11534	NC_009092	CTG	2	6	562191	562196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511438
11535	NC_009092	TGC	2	6	562211	562216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511438
11536	NC_009092	CTT	2	6	562269	562274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511438
11537	NC_009092	CGG	2	6	562283	562288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511438
11538	NC_009092	CAT	2	6	562344	562349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511438
11539	NC_009092	TGG	2	6	562355	562360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511438
11540	NC_009092	CTG	2	6	562375	562380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511438
11541	NC_009092	TAC	2	6	562384	562389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511438
11542	NC_009092	CCA	2	6	562419	562424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511438
11543	NC_009092	TGG	2	6	562444	562449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511438
11544	NC_009092	CTG	2	6	562456	562461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511438
11545	NC_009092	CTT	2	6	562491	562496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511438
11546	NC_009092	TGA	2	6	562565	562570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511438
11547	NC_009092	TTG	2	6	562573	562578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511438
11548	NC_009092	CTG	2	6	562654	562659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511438
11549	NC_009092	GCTG	2	8	562670	562677	0 %	25 %	50 %	25 %	127511438
11550	NC_009092	GGC	2	6	562749	562754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511438
11551	NC_009092	CTG	2	6	562795	562800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511438
11552	NC_009092	GAT	2	6	562842	562847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511438
11553	NC_009092	GGC	2	6	562929	562934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511438
11554	NC_009092	GCTGTG	2	12	562980	562991	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	127511438
11555	NC_009092	GCT	2	6	563003	563008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511438
11556	NC_009092	GGTT	2	8	563023	563030	0 %	50 %	50 %	0 %	127511438
11557	NC_009092	GACG	2	8	563071	563078	25 %	0 %	50 %	25 %	127511438
11558	NC_009092	AGT	2	6	563115	563120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_009092	GAA	2	6	563147	563152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511439
11560	NC_009092	CTG	2	6	563175	563180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511439
11561	NC_009092	CGC	2	6	563207	563212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511439
11562	NC_009092	GGC	2	6	563285	563290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511439
11563	NC_009092	GC	3	6	563289	563294	0 %	0 %	50 %	50 %	127511439
11564	NC_009092	CGC	2	6	563318	563323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511439
11565	NC_009092	GGGC	2	8	563335	563342	0 %	0 %	75 %	25 %	127511439
11566	NC_009092	AAG	2	6	563442	563447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511439
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11568	NC_009092	GAA	2	6	563531	563536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511439
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11572	NC_009092	GCA	2	6	563776	563781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511439
11573	NC_009092	CGC	2	6	563814	563819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511439
11574	NC_009092	ATCC	2	8	563832	563839	25 %	25 %	0 %	50 %	127511439
11575	NC_009092	TG	3	6	563925	563930	0 %	50 %	50 %	0 %	127511439
11576	NC_009092	CGG	2	6	563944	563949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511439
11577	NC_009092	CGAC	2	8	563950	563957	25 %	0 %	25 %	50 %	127511439
11578	NC_009092	ACCA	2	8	563976	563983	50 %	0 %	0 %	50 %	127511439
11579	NC_009092	TG	3	6	564017	564022	0 %	50 %	50 %	0 %	127511439
11580	NC_009092	TGA	2	6	564052	564057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511439
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11584	NC_009092	CTG	2	6	564279	564284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511439
11585	NC_009092	CGC	2	6	564315	564320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511439
11586	NC_009092	GC	3	6	564319	564324	0 %	0 %	50 %	50 %	127511439
11587	NC_009092	TGT	2	6	564343	564348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511439
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11589	NC_009092	AGG	2	6	564385	564390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511439
11590	NC_009092	GCA	2	6	564395	564400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511439
11591	NC_009092	CAAG	2	8	564452	564459	50 %	0 %	25 %	25 %	127511439
11592	NC_009092	T	6	6	564561	564566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_009092	AGC	2	6	564581	564586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511440
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11595	NC_009092	CCT	2	6	564744	564749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511440
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11598	NC_009092	GCT	2	6	564939	564944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511440
11599	NC_009092	GGC	2	6	564957	564962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511440
11600	NC_009092	GC	3	6	565009	565014	0 %	0 %	50 %	50 %	127511440
11601	NC_009092	GAG	2	6	565034	565039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511440
11602	NC_009092	CCAG	2	8	565155	565162	25 %	0 %	25 %	50 %	127511440
11603	NC_009092	CTC	2	6	565306	565311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511440
11604	NC_009092	GCG	2	6	565382	565387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511440
11605	NC_009092	GCG	2	6	565421	565426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511440
11606	NC_009092	GAT	2	6	565479	565484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511440
11607	NC_009092	T	6	6	565497	565502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_009092	AAC	2	6	565568	565573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11609	NC_009092	CCAG	2	8	565698	565705	25 %	0 %	25 %	50 %	127511441
11610	NC_009092	GAT	2	6	565726	565731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511441
11611	NC_009092	CTA	2	6	565738	565743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511441
11612	NC_009092	GC	3	6	565750	565755	0 %	0 %	50 %	50 %	127511441
11613	NC_009092	CGG	2	6	565758	565763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511441
11614	NC_009092	GCGG	2	8	565886	565893	0 %	0 %	75 %	25 %	127511441
11615	NC_009092	GGT	2	6	566005	566010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511441
11616	NC_009092	AG	3	6	566057	566062	50 %	0 %	50 %	0 %	127511441
11617	NC_009092	CCG	2	6	566127	566132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511441
11618	NC_009092	CGG	2	6	566155	566160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511441
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11740	NC_009092	CGT	2	6	572104	572109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511444
11741	NC_009092	GTC	2	6	572111	572116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511444
11742	NC_009092	AGC	2	6	572136	572141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511444
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11977	NC_009092	GAT	2	6	584332	584337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511449
11978	NC_009092	CCA	2	6	584390	584395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511449
11979	NC_009092	GCC	2	6	584488	584493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511449
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