MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 93132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_009092	GTT	2	6	536960	536965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511413
11002	NC_009092	ACT	2	6	537070	537075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511413
11003	NC_009092	T	6	6	537078	537083	0 %	100 %	0 %	0 %	127511413
11004	NC_009092	GAT	2	6	537177	537182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511413
11005	NC_009092	GCC	2	6	537219	537224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511413
11006	NC_009092	TGG	2	6	537280	537285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511413
11007	NC_009092	CTG	2	6	537378	537383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511413
11008	NC_009092	TATGG	2	10	537509	537518	20 %	40 %	40 %	0 %	127511414
11009	NC_009092	ACA	2	6	537523	537528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511414
11010	NC_009092	GGCT	2	8	537633	537640	0 %	25 %	50 %	25 %	127511414
11011	NC_009092	CCG	2	6	537716	537721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511414
11012	NC_009092	GCC	2	6	537755	537760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511414
11013	NC_009092	AGG	2	6	537763	537768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511414
11014	NC_009092	GAA	2	6	537860	537865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511414
11015	NC_009092	GGC	2	6	537878	537883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511414
11016	NC_009092	ATC	2	6	537886	537891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511414
11017	NC_009092	GAT	2	6	537896	537901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511414
11018	NC_009092	GGGCG	2	10	537917	537926	0 %	0 %	80 %	20 %	127511414
11019	NC_009092	GGC	2	6	537959	537964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511414
11020	NC_009092	CAT	2	6	537977	537982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511414
11021	NC_009092	TGC	2	6	538012	538017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511414
11022	NC_009092	GCTT	2	8	538146	538153	0 %	50 %	25 %	25 %	127511414
11023	NC_009092	GGC	2	6	538184	538189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511414
11024	NC_009092	CTG	2	6	538287	538292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511414
11025	NC_009092	GCA	2	6	538293	538298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511414
11026	NC_009092	GCCG	2	8	538310	538317	0 %	0 %	50 %	50 %	127511414
11027	NC_009092	GTCT	2	8	538327	538334	0 %	50 %	25 %	25 %	127511414
11028	NC_009092	CTG	2	6	538446	538451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511414
11029	NC_009092	GCA	2	6	538466	538471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511414
11030	NC_009092	GCTT	2	8	538640	538647	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11031	NC_009092	GTG	2	6	538769	538774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511415
11032	NC_009092	GCT	3	9	538786	538794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511415
11033	NC_009092	ATG	3	9	538796	538804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511415
11034	NC_009092	GAG	2	6	538829	538834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511415
11035	NC_009092	CAGA	2	8	538898	538905	50 %	0 %	25 %	25 %	127511415
11036	NC_009092	AGC	2	6	538983	538988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511415
11037	NC_009092	CG	3	6	539003	539008	0 %	0 %	50 %	50 %	127511415
11038	NC_009092	GCC	2	6	539012	539017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511415
11039	NC_009092	CTG	2	6	539024	539029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511415
11040	NC_009092	GC	3	6	539131	539136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11041	NC_009092	TGC	2	6	539176	539181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11042	NC_009092	GTT	2	6	539269	539274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_009092	TGC	2	6	539315	539320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11044	NC_009092	CAA	2	6	539333	539338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_009092	CTG	2	6	539421	539426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511416
11046	NC_009092	GCC	3	9	539442	539450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511416
11047	NC_009092	GAA	2	6	539594	539599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511416
11048	NC_009092	CCT	2	6	539612	539617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511416
11049	NC_009092	TGG	2	6	539620	539625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511416
11050	NC_009092	GGCGC	2	10	539643	539652	0 %	0 %	60 %	40 %	127511416
11051	NC_009092	GAG	2	6	539655	539660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511416
11052	NC_009092	AAC	2	6	539700	539705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511416
11053	NC_009092	CTT	2	6	539735	539740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511416
11054	NC_009092	CGG	2	6	539744	539749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511416
11055	NC_009092	AGC	2	6	539752	539757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511416
11056	NC_009092	CTG	3	9	539760	539768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511416
11057	NC_009092	GTCT	2	8	539792	539799	0 %	50 %	25 %	25 %	127511416
11058	NC_009092	CGA	2	6	539852	539857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511416
11059	NC_009092	CGC	2	6	539875	539880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511416
11060	NC_009092	TTG	2	6	539911	539916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511416
11061	NC_009092	TGG	2	6	540025	540030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511416
11062	NC_009092	CCA	2	6	540070	540075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511416
11063	NC_009092	GTT	2	6	540083	540088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511416
11064	NC_009092	CAC	2	6	540176	540181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511416
11065	NC_009092	GCG	2	6	540241	540246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511416
11066	NC_009092	TGC	2	6	540262	540267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511416
11067	NC_009092	GAT	3	9	540329	540337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511416
11068	NC_009092	GCG	2	6	540394	540399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511416
11069	NC_009092	GCT	2	6	540440	540445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511416
11070	NC_009092	ACA	2	6	540484	540489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511416
11071	NC_009092	TCAACG	2	12	540541	540552	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	127511416
11072	NC_009092	TCT	2	6	540556	540561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511416
11073	NC_009092	TGC	2	6	540573	540578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511417
11074	NC_009092	TG	3	6	540588	540593	0 %	50 %	50 %	0 %	127511417
11075	NC_009092	GTT	2	6	540626	540631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511417
11076	NC_009092	CGC	2	6	540740	540745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511417
11077	NC_009092	ATCT	2	8	540758	540765	25 %	50 %	0 %	25 %	127511417
11078	NC_009092	AC	3	6	540775	540780	50 %	0 %	0 %	50 %	127511417
11079	NC_009092	CG	3	6	540818	540823	0 %	0 %	50 %	50 %	127511417
11080	NC_009092	GAG	2	6	540911	540916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511417
11081	NC_009092	TCA	2	6	540934	540939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511417
11082	NC_009092	TCAG	2	8	540981	540988	25 %	25 %	25 %	25 %	127511417
11083	NC_009092	GCCGC	2	10	540993	541002	0 %	0 %	40 %	60 %	127511417
11084	NC_009092	GGTGA	2	10	541019	541028	20 %	20 %	60 %	0 %	127511417
11085	NC_009092	GCAGG	2	10	541102	541111	20 %	0 %	60 %	20 %	127511417
11086	NC_009092	GCC	2	6	541184	541189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511417
11087	NC_009092	CTA	2	6	541255	541260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511417
11088	NC_009092	GC	3	6	541295	541300	0 %	0 %	50 %	50 %	127511417
11089	NC_009092	TGC	2	6	541314	541319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511417
11090	NC_009092	CTTT	2	8	541387	541394	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11091	NC_009092	GCTG	2	8	541529	541536	0 %	25 %	50 %	25 %	127511418
11092	NC_009092	GGC	2	6	541709	541714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511418
11093	NC_009092	GGC	2	6	541815	541820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511418
11094	NC_009092	CAGTC	2	10	541823	541832	20 %	20 %	20 %	40 %	127511418
11095	NC_009092	CAG	3	9	541836	541844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511418
11096	NC_009092	AGCGA	2	10	541870	541879	40 %	0 %	40 %	20 %	127511418
11097	NC_009092	TTG	2	6	541888	541893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511418
11098	NC_009092	GCT	2	6	541927	541932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511418
11099	NC_009092	CGC	2	6	541968	541973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511418
11100	NC_009092	CCG	2	6	542006	542011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511418
11101	NC_009092	TCA	2	6	542051	542056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511418
11102	NC_009092	ACC	2	6	542086	542091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511418
11103	NC_009092	GC	3	6	542115	542120	0 %	0 %	50 %	50 %	127511418
11104	NC_009092	GGCT	2	8	542168	542175	0 %	25 %	50 %	25 %	127511418
11105	NC_009092	GCT	2	6	542226	542231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511418
11106	NC_009092	GCA	2	6	542311	542316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511418
11107	NC_009092	GTT	2	6	542363	542368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511418
11108	NC_009092	TAG	2	6	542404	542409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511418
11109	NC_009092	CGCAG	2	10	542411	542420	20 %	0 %	40 %	40 %	127511418
11110	NC_009092	CGG	2	6	542489	542494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511418
11111	NC_009092	AGAT	2	8	542533	542540	50 %	25 %	25 %	0 %	127511418
11112	NC_009092	GGC	2	6	542558	542563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511418
11113	NC_009092	CGA	2	6	542564	542569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511418
11114	NC_009092	CTTG	2	8	542579	542586	0 %	50 %	25 %	25 %	127511418
11115	NC_009092	TTG	2	6	542629	542634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511418
11116	NC_009092	GAC	2	6	542643	542648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511418
11117	NC_009092	CTG	2	6	542703	542708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511418
11118	NC_009092	AGCGTT	2	12	542709	542720	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	127511418
11119	NC_009092	GAT	2	6	542748	542753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511418
11120	NC_009092	TTGT	2	8	542781	542788	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_009092	CAT	2	6	542840	542845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511419
11122	NC_009092	CCAT	2	8	542851	542858	25 %	25 %	0 %	50 %	127511419
11123	NC_009092	CGG	2	6	542984	542989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511419
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11223	NC_009092	CGA	2	6	547978	547983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511424
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11225	NC_009092	A	6	6	548107	548112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11226	NC_009092	ATT	2	6	548123	548128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11227	NC_009092	T	6	6	548139	548144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11228	NC_009092	GCC	2	6	548184	548189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511425
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11230	NC_009092	TGT	2	6	548271	548276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511425
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11232	NC_009092	GCA	2	6	548517	548522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11233	NC_009092	TCC	2	6	548586	548591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511426
11234	NC_009092	GCTG	2	8	548602	548609	0 %	25 %	50 %	25 %	127511426
11235	NC_009092	TGG	2	6	548700	548705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511426
11236	NC_009092	TGC	2	6	548718	548723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511426
11237	NC_009092	AGGCC	2	10	548821	548830	20 %	0 %	40 %	40 %	127511426
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11472	NC_009092	T	8	8	559202	559209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11481	NC_009092	TGA	2	6	559742	559747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511434
11482	NC_009092	CGG	2	6	559784	559789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511434
11483	NC_009092	GTA	2	6	559865	559870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511434
11484	NC_009092	CGAT	2	8	560039	560046	25 %	25 %	25 %	25 %	127511434
11485	NC_009092	GCA	2	6	560121	560126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511434
11486	NC_009092	AGC	2	6	560225	560230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511434
11487	NC_009092	GGT	2	6	560300	560305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11488	NC_009092	T	6	6	560316	560321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11489	NC_009092	TTTCA	2	10	560361	560370	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11490	NC_009092	TCA	2	6	560412	560417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11491	NC_009092	A	6	6	560456	560461	100 %	0 %	0 %	0 %	127511435
11492	NC_009092	CGC	2	6	560465	560470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511435
11493	NC_009092	CGA	2	6	560551	560556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511435
11494	NC_009092	GCC	2	6	560606	560611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511435
11495	NC_009092	ATC	2	6	560732	560737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11496	NC_009092	GGC	2	6	560773	560778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511436
11497	NC_009092	GCGCA	2	10	560792	560801	20 %	0 %	40 %	40 %	127511436
11498	NC_009092	CTT	2	6	560806	560811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511436
11499	NC_009092	GGT	2	6	560864	560869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511436
11500	NC_009092	GCT	2	6	560887	560892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511436

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