MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 93132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_009092	CTG	2	6	513337	513342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511393
10503	NC_009092	GTG	2	6	513343	513348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511393
10504	NC_009092	CTGT	2	8	513355	513362	0 %	50 %	25 %	25 %	127511393
10505	NC_009092	CGC	2	6	513391	513396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511393
10506	NC_009092	GCGTC	2	10	513412	513421	0 %	20 %	40 %	40 %	127511393
10507	NC_009092	TGT	2	6	513422	513427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511393
10508	NC_009092	GAA	2	6	513523	513528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511393
10509	NC_009092	TGG	2	6	513581	513586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511393
10510	NC_009092	GCG	2	6	513621	513626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511393
10511	NC_009092	CTG	2	6	513655	513660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511393
10512	NC_009092	ATC	2	6	513679	513684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511393
10513	NC_009092	CCG	2	6	513725	513730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511393
10514	NC_009092	GAT	2	6	513759	513764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511393
10515	NC_009092	CGC	2	6	513848	513853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511393
10516	NC_009092	CCG	2	6	513927	513932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511393
10517	NC_009092	GCT	2	6	513939	513944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511393
10518	NC_009092	CGTGA	2	10	513964	513973	20 %	20 %	40 %	20 %	127511393
10519	NC_009092	AGC	2	6	513995	514000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511393
10520	NC_009092	GGA	2	6	514011	514016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511393
10521	NC_009092	AGA	2	6	514044	514049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511393
10522	NC_009092	ATC	2	6	514084	514089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511393
10523	NC_009092	TAC	2	6	514102	514107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511393
10524	NC_009092	ACG	2	6	514238	514243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511393
10525	NC_009092	GCCGTG	2	12	514292	514303	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	127511393
10526	NC_009092	TGG	2	6	514304	514309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511393
10527	NC_009092	TGG	2	6	514340	514345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511393
10528	NC_009092	GCT	2	6	514389	514394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511393
10529	NC_009092	CAG	2	6	514531	514536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511393
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10534	NC_009092	GCG	2	6	514832	514837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511393
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10539	NC_009092	ATG	2	6	515038	515043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511393
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10543	NC_009092	GAT	2	6	515322	515327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511393
10544	NC_009092	GATG	2	8	515334	515341	25 %	25 %	50 %	0 %	127511393
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10551	NC_009092	CGG	2	6	515555	515560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511393
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10555	NC_009092	GCT	2	6	515649	515654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511393
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10564	NC_009092	ATG	2	6	516055	516060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10566	NC_009092	ATA	2	6	516132	516137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10567	NC_009092	AAC	2	6	516142	516147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10568	NC_009092	TC	3	6	516152	516157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10585	NC_009092	ATG	2	6	517553	517558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511394
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10589	NC_009092	GCCA	2	8	517711	517718	25 %	0 %	25 %	50 %	127511394
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10610	NC_009092	GCC	2	6	518562	518567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511394
10611	NC_009092	T	6	6	518622	518627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_009092	CGG	2	6	518649	518654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10613	NC_009092	GCGG	2	8	518686	518693	0 %	0 %	75 %	25 %	127511395
10614	NC_009092	CAG	2	6	518731	518736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511395
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10981	NC_009092	ATC	2	6	535847	535852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10982	NC_009092	CTC	2	6	535905	535910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511412
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10984	NC_009092	GCG	2	6	535960	535965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511412
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