MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 93132

< Previous12...175176177178179180181182183184185186187Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
93001	NC_009092	TA	3	6	4596750	4596755	50 %	50 %	0 %	0 %	127514789
93002	NC_009092	GA	4	8	4596779	4596786	50 %	0 %	50 %	0 %	127514789
93003	NC_009092	CTT	2	6	4596798	4596803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127514789
93004	NC_009092	ACT	2	6	4596909	4596914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127514789
93005	NC_009092	AGA	2	6	4596940	4596945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127514789
93006	NC_009092	ACA	2	6	4596995	4597000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127514789
93007	NC_009092	ATG	2	6	4597002	4597007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127514789
93008	NC_009092	GGAG	2	8	4597042	4597049	25 %	0 %	75 %	0 %	127514789
93009	NC_009092	TTC	2	6	4597069	4597074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127514789
93010	NC_009092	TGT	2	6	4597117	4597122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127514789
93011	NC_009092	ATT	2	6	4597189	4597194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127514789
93012	NC_009092	AAC	2	6	4597195	4597200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127514789
93013	NC_009092	GAA	2	6	4597206	4597211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127514789
93014	NC_009092	CAGGT	2	10	4597215	4597224	20 %	20 %	40 %	20 %	127514789
93015	NC_009092	TAA	2	6	4597332	4597337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127514789
93016	NC_009092	ATG	2	6	4597364	4597369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127514789
93017	NC_009092	CTA	2	6	4597382	4597387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127514789
93018	NC_009092	TACG	2	8	4597428	4597435	25 %	25 %	25 %	25 %	127514789
93019	NC_009092	ACTT	2	8	4597489	4597496	25 %	50 %	0 %	25 %	127514789
93020	NC_009092	CAT	2	6	4597548	4597553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127514789
93021	NC_009092	TAAAT	2	10	4597561	4597570	60 %	40 %	0 %	0 %	127514789
93022	NC_009092	TTAAA	2	10	4597638	4597647	60 %	40 %	0 %	0 %	127514789
93023	NC_009092	GAT	2	6	4597802	4597807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127514789
93024	NC_009092	ATG	2	6	4597809	4597814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127514789
93025	NC_009092	GGT	2	6	4597836	4597841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127514789
93026	NC_009092	TTCA	2	8	4597875	4597882	25 %	50 %	0 %	25 %	127514789
93027	NC_009092	TGG	2	6	4597952	4597957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127514789
93028	NC_009092	GAA	2	6	4597973	4597978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127514789
93029	NC_009092	CTT	2	6	4598006	4598011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127514789
93030	NC_009092	A	6	6	4598139	4598144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93031	NC_009092	AAT	2	6	4598154	4598159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93032	NC_009092	CCAT	2	8	4598173	4598180	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93033	NC_009092	GCA	2	6	4598325	4598330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93034	NC_009092	CAA	2	6	4598342	4598347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93035	NC_009092	AAT	2	6	4598354	4598359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93036	NC_009092	TGAT	2	8	4598418	4598425	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93037	NC_009092	ACTTC	2	10	4598431	4598440	20 %	40 %	0 %	40 %	127514790
93038	NC_009092	CTG	2	6	4598597	4598602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514790
93039	NC_009092	GAC	3	9	4598625	4598633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127514790
93040	NC_009092	CAGA	2	8	4598724	4598731	50 %	0 %	25 %	25 %	127514790
93041	NC_009092	TCG	2	6	4598753	4598758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514790
93042	NC_009092	TTG	2	6	4598792	4598797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127514790
93043	NC_009092	CAC	2	6	4598800	4598805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127514790
93044	NC_009092	CGAT	2	8	4598831	4598838	25 %	25 %	25 %	25 %	127514790
93045	NC_009092	GTG	3	9	4598876	4598884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127514790
93046	NC_009092	CCA	2	6	4598889	4598894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127514790
93047	NC_009092	GC	3	6	4598933	4598938	0 %	0 %	50 %	50 %	127514790
93048	NC_009092	GGCC	2	8	4598979	4598986	0 %	0 %	50 %	50 %	127514790
93049	NC_009092	ATG	2	6	4598993	4598998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127514790
93050	NC_009092	GCA	2	6	4599033	4599038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127514790
93051	NC_009092	GTG	2	6	4599047	4599052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127514790
93052	NC_009092	GAC	2	6	4599126	4599131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127514790
93053	NC_009092	CAC	2	6	4599139	4599144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127514790
93054	NC_009092	ATG	2	6	4599161	4599166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127514790
93055	NC_009092	TGA	2	6	4599207	4599212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127514790
93056	NC_009092	GA	3	6	4599245	4599250	50 %	0 %	50 %	0 %	127514790
93057	NC_009092	CCT	2	6	4599258	4599263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127514790
93058	NC_009092	CCA	2	6	4599318	4599323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127514790
93059	NC_009092	GC	3	6	4599366	4599371	0 %	0 %	50 %	50 %	127514790
93060	NC_009092	GCC	2	6	4599377	4599382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127514790
93061	NC_009092	TGG	2	6	4599390	4599395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127514790
93062	NC_009092	ACGC	2	8	4599487	4599494	25 %	0 %	25 %	50 %	127514790
93063	NC_009092	CGG	2	6	4599636	4599641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127514790
93064	NC_009092	AGT	2	6	4599654	4599659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127514790
93065	NC_009092	TGA	2	6	4599732	4599737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127514790
93066	NC_009092	CGC	3	9	4599744	4599752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127514790
93067	NC_009092	GTC	2	6	4599788	4599793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514790
93068	NC_009092	T	6	6	4599912	4599917	0 %	100 %	0 %	0 %	127514791
93069	NC_009092	GAT	2	6	4599933	4599938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127514791
93070	NC_009092	CTG	2	6	4599942	4599947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514791
93071	NC_009092	CCA	2	6	4599956	4599961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127514791
93072	NC_009092	ACCA	2	8	4599970	4599977	50 %	0 %	0 %	50 %	127514791
93073	NC_009092	GAA	2	6	4600008	4600013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127514791
93074	NC_009092	CAT	2	6	4600041	4600046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127514791
93075	NC_009092	TCT	2	6	4600088	4600093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127514791
93076	NC_009092	CAG	2	6	4600119	4600124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127514791
93077	NC_009092	CAG	2	6	4600206	4600211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127514791
93078	NC_009092	CTTTCT	2	12	4600280	4600291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127514791
93079	NC_009092	CAT	2	6	4600302	4600307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127514791
93080	NC_009092	TCT	2	6	4600319	4600324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127514791
93081	NC_009092	ACA	2	6	4600421	4600426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127514791
93082	NC_009092	TGAT	2	8	4600482	4600489	25 %	50 %	25 %	0 %	127514791
93083	NC_009092	CAA	2	6	4600497	4600502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127514791
93084	NC_009092	GGATTG	2	12	4600508	4600519	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	127514791
93085	NC_009092	CCA	2	6	4600524	4600529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127514791
93086	NC_009092	CTG	2	6	4600626	4600631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514791
93087	NC_009092	CAT	2	6	4600646	4600651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127514791
93088	NC_009092	CAC	2	6	4600658	4600663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127514791
93089	NC_009092	GCC	2	6	4600683	4600688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127514791
93090	NC_009092	AGA	2	6	4600703	4600708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127514791
93091	NC_009092	TGG	2	6	4600728	4600733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127514791
93092	NC_009092	AGT	2	6	4600751	4600756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127514791
93093	NC_009092	GCA	2	6	4600760	4600765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127514791
93094	NC_009092	ACC	2	6	4600776	4600781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127514791
93095	NC_009092	TCT	2	6	4600787	4600792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127514791
93096	NC_009092	CTG	2	6	4600847	4600852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514791
93097	NC_009092	GGC	2	6	4600860	4600865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127514791
93098	NC_009092	CAT	3	9	4600881	4600889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127514791
93099	NC_009092	GCT	2	6	4600890	4600895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514791
93100	NC_009092	GCT	2	6	4600946	4600951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514791
93101	NC_009092	GTT	2	6	4600962	4600967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127514791
93102	NC_009092	GCT	2	6	4601109	4601114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514791
93103	NC_009092	TGC	2	6	4601135	4601140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514791
93104	NC_009092	GA	3	6	4601174	4601179	50 %	0 %	50 %	0 %	127514791
93105	NC_009092	GTA	2	6	4601181	4601186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127514791
93106	NC_009092	TGC	2	6	4601200	4601205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514791
93107	NC_009092	TTC	2	6	4601220	4601225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127514791
93108	NC_009092	CCA	2	6	4601249	4601254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127514791
93109	NC_009092	CCAC	2	8	4601275	4601282	25 %	0 %	0 %	75 %	127514791
93110	NC_009092	GGC	2	6	4601337	4601342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127514791
93111	NC_009092	AGC	2	6	4601358	4601363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127514791
93112	NC_009092	TGC	2	6	4601464	4601469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514791
93113	NC_009092	AT	3	6	4601507	4601512	50 %	50 %	0 %	0 %	127514791
93114	NC_009092	TATT	2	8	4601533	4601540	25 %	75 %	0 %	0 %	127514792
93115	NC_009092	T	6	6	4601551	4601556	0 %	100 %	0 %	0 %	127514792
93116	NC_009092	AATCG	2	10	4601647	4601656	40 %	20 %	20 %	20 %	127514792
93117	NC_009092	TGC	2	6	4601810	4601815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514793
93118	NC_009092	ACG	2	6	4601850	4601855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127514793
93119	NC_009092	GCG	2	6	4601863	4601868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127514793
93120	NC_009092	GAT	2	6	4601903	4601908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127514793
93121	NC_009092	GAA	2	6	4602021	4602026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127514793
93122	NC_009092	TTA	2	6	4602122	4602127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127514794
93123	NC_009092	ACG	3	9	4602155	4602163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127514794
93124	NC_009092	CCA	2	6	4602180	4602185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127514794
93125	NC_009092	A	6	6	4602321	4602326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93126	NC_009092	CAA	2	6	4602361	4602366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93127	NC_009092	TCT	2	6	4602402	4602407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93128	NC_009092	AC	3	6	4602423	4602428	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93129	NC_009092	GATC	2	8	4602513	4602520	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93130	NC_009092	TAA	2	6	4602530	4602535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93131	NC_009092	TGC	2	6	4602545	4602550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93132	NC_009092	ATT	2	6	4602559	4602564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...175176177178179180181182183184185186187Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.