MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 93132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009092	TA	3	6	1	6	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009092	GAT	2	6	13	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009092	GCA	2	6	128	133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510936
4	NC_009092	GAC	2	6	142	147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510936
5	NC_009092	ATGG	2	8	207	214	25 %	25 %	50 %	0 %	127510936
6	NC_009092	GA	3	6	263	268	50 %	0 %	50 %	0 %	127510936
7	NC_009092	ATCA	2	8	285	292	50 %	25 %	0 %	25 %	127510936
8	NC_009092	TTC	2	6	294	299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127510936
9	NC_009092	CAAG	2	8	421	428	50 %	0 %	25 %	25 %	127510936
10	NC_009092	TCG	2	6	508	513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510936
11	NC_009092	GCC	2	6	543	548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510936
12	NC_009092	GGT	2	6	600	605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510936
13	NC_009092	CTG	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510936
14	NC_009092	CAT	2	6	650	655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510936
15	NC_009092	GGT	2	6	677	682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510936
16	NC_009092	AAC	2	6	732	737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127510936
17	NC_009092	TAC	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510936
18	NC_009092	GTT	2	6	779	784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127510936
19	NC_009092	GAT	2	6	789	794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510936
20	NC_009092	TTC	2	6	834	839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127510936
21	NC_009092	ATC	2	6	868	873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510936
22	NC_009092	GCC	2	6	971	976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510936
23	NC_009092	CTT	2	6	1052	1057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127510936
24	NC_009092	GC	3	6	1099	1104	0 %	0 %	50 %	50 %	127510936
25	NC_009092	CGCCAA	2	12	1118	1129	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	127510936
26	NC_009092	ACA	2	6	1216	1221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127510936
27	NC_009092	GATGGC	2	12	1310	1321	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	127510936
28	NC_009092	TAAC	2	8	1336	1343	50 %	25 %	0 %	25 %	127510936
29	NC_009092	TGG	2	6	1373	1378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510936
30	NC_009092	GAA	2	6	1431	1436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127510936
31	NC_009092	AGA	2	6	1451	1456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127510936
32	NC_009092	TGA	2	6	1509	1514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510937
33	NC_009092	GA	3	6	1574	1579	50 %	0 %	50 %	0 %	127510937
34	NC_009092	AAGT	2	8	1617	1624	50 %	25 %	25 %	0 %	127510937
35	NC_009092	TCAC	2	8	1627	1634	25 %	25 %	0 %	50 %	127510937
36	NC_009092	CAC	2	6	1711	1716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127510937
37	NC_009092	AGC	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510937
38	NC_009092	TGC	2	6	1803	1808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510937
39	NC_009092	GCCG	2	8	1843	1850	0 %	0 %	50 %	50 %	127510937
40	NC_009092	TAC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510937
41	NC_009092	TGC	2	6	2007	2012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510937
42	NC_009092	CT	3	6	2068	2073	0 %	50 %	0 %	50 %	127510937
43	NC_009092	TGG	2	6	2217	2222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510937
44	NC_009092	TCG	2	6	2242	2247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510937
45	NC_009092	GCT	2	6	2308	2313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510937
46	NC_009092	TC	3	6	2326	2331	0 %	50 %	0 %	50 %	127510937
47	NC_009092	CAA	2	6	2392	2397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127510937
48	NC_009092	CAA	2	6	2494	2499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127510937
49	NC_009092	GAA	2	6	2570	2575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127510937
50	NC_009092	CGT	2	6	2587	2592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510937
51	NC_009092	TCT	2	6	2644	2649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009092	AATCT	2	10	2759	2768	40 %	40 %	0 %	20 %	127510938
53	NC_009092	TCT	2	6	2811	2816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127510938
54	NC_009092	CGT	2	6	3077	3082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510938
55	NC_009092	GCG	2	6	3410	3415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510938
56	NC_009092	AC	3	6	3418	3423	50 %	0 %	0 %	50 %	127510938
57	NC_009092	ACA	2	6	3553	3558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127510938
58	NC_009092	TGG	2	6	3582	3587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510938
59	NC_009092	TGC	2	6	3630	3635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510938
60	NC_009092	AGC	2	6	3636	3641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510938
61	NC_009092	AAT	2	6	3691	3696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127510938
62	NC_009092	CGA	2	6	3768	3773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009092	GA	3	6	3772	3777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009092	TTC	2	6	3803	3808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127510939
65	NC_009092	CGA	2	6	3875	3880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510939
66	NC_009092	TCGGTA	2	12	3987	3998	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	127510939
67	NC_009092	GACG	2	8	4005	4012	25 %	0 %	50 %	25 %	127510939
68	NC_009092	AGA	2	6	4037	4042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127510939
69	NC_009092	CGG	2	6	4051	4056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510939
70	NC_009092	TTA	2	6	4063	4068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127510939
71	NC_009092	CGG	2	6	4085	4090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510939
72	NC_009092	CGA	2	6	4097	4102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510939
73	NC_009092	TGG	2	6	4121	4126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510939
74	NC_009092	CCA	2	6	4264	4269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127510939
75	NC_009092	CGA	2	6	4400	4405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510939
76	NC_009092	ACA	2	6	4411	4416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127510939
77	NC_009092	TCG	2	6	4456	4461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510939
78	NC_009092	CAA	2	6	4490	4495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127510939
79	NC_009092	TCT	2	6	4582	4587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127510939
80	NC_009092	CAA	2	6	4595	4600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127510939
81	NC_009092	TGG	2	6	4616	4621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510939
82	NC_009092	TGC	2	6	4643	4648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510939
83	NC_009092	AAGG	2	8	4680	4687	50 %	0 %	50 %	0 %	127510939
84	NC_009092	GAT	2	6	4722	4727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510939
85	NC_009092	CCG	2	6	4744	4749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510939
86	NC_009092	GAAGT	2	10	4815	4824	40 %	20 %	40 %	0 %	127510939
87	NC_009092	CTG	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510939
88	NC_009092	ATC	2	6	4908	4913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510939
89	NC_009092	GCCCGT	2	12	4920	4931	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	127510939
90	NC_009092	GCG	2	6	4935	4940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510939
91	NC_009092	CGT	2	6	4962	4967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510939
92	NC_009092	GGT	2	6	4986	4991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510939
93	NC_009092	GGT	2	6	5070	5075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510939
94	NC_009092	CT	3	6	5169	5174	0 %	50 %	0 %	50 %	127510939
95	NC_009092	CGA	2	6	5225	5230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510939
96	NC_009092	TCA	2	6	5266	5271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510939
97	NC_009092	CTT	3	9	5321	5329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127510939
98	NC_009092	GCC	2	6	5378	5383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510939
99	NC_009092	GAA	2	6	5396	5401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127510939
100	NC_009092	GAT	2	6	5427	5432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510939
101	NC_009092	GGT	2	6	5472	5477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510939
102	NC_009092	ATCC	2	8	5481	5488	25 %	25 %	0 %	50 %	127510939
103	NC_009092	GC	3	6	5515	5520	0 %	0 %	50 %	50 %	127510939
104	NC_009092	AGC	2	6	5578	5583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510939
105	NC_009092	CGA	2	6	5648	5653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510939
106	NC_009092	GTG	2	6	5669	5674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510939
107	NC_009092	TTC	2	6	5933	5938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127510939
108	NC_009092	TGA	2	6	5962	5967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510939
109	NC_009092	AGC	2	6	6028	6033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510939
110	NC_009092	ACC	2	6	6042	6047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127510939
111	NC_009092	GTCGC	2	10	6059	6068	0 %	20 %	40 %	40 %	127510939
112	NC_009092	CGC	2	6	6098	6103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510939
113	NC_009092	CGT	2	6	6147	6152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510939
114	NC_009092	T	6	6	6238	6243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009092	CGA	2	6	6317	6322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510940
116	NC_009092	ATACAG	2	12	6392	6403	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	127510940
117	NC_009092	GTG	2	6	6409	6414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510940
118	NC_009092	CAG	2	6	6571	6576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510940
119	NC_009092	AGC	2	6	6663	6668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510940
120	NC_009092	GAG	2	6	6805	6810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127510940
121	NC_009092	TGA	2	6	6822	6827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510940
122	NC_009092	GTG	2	6	6848	6853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510940
123	NC_009092	AGTT	2	8	6863	6870	25 %	50 %	25 %	0 %	127510940
124	NC_009092	CTG	2	6	6904	6909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510940
125	NC_009092	CGAG	2	8	6910	6917	25 %	0 %	50 %	25 %	127510940
126	NC_009092	TTC	2	6	6935	6940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127510940
127	NC_009092	ACA	2	6	6997	7002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127510940
128	NC_009092	GCT	2	6	7003	7008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510940
129	NC_009092	CTG	3	9	7015	7023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510940
130	NC_009092	GCAG	2	8	7137	7144	25 %	0 %	50 %	25 %	127510941
131	NC_009092	TGG	2	6	7149	7154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510941
132	NC_009092	CCG	2	6	7182	7187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510941
133	NC_009092	GC	3	6	7251	7256	0 %	0 %	50 %	50 %	127510941
134	NC_009092	ATC	2	6	7376	7381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510941
135	NC_009092	CAT	2	6	7452	7457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510941
136	NC_009092	GTG	2	6	7483	7488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510941
137	NC_009092	TCG	2	6	7505	7510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510941
138	NC_009092	TGT	2	6	7535	7540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127510941
139	NC_009092	GGC	2	6	7584	7589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510941
140	NC_009092	CCG	2	6	7694	7699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510941
141	NC_009092	CAG	2	6	7729	7734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510941
142	NC_009092	CCTC	2	8	7751	7758	0 %	25 %	0 %	75 %	127510941
143	NC_009092	CCAT	2	8	7800	7807	25 %	25 %	0 %	50 %	127510941
144	NC_009092	GCC	2	6	7961	7966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510942
145	NC_009092	CGG	2	6	8009	8014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510942
146	NC_009092	GC	3	6	8196	8201	0 %	0 %	50 %	50 %	127510942
147	NC_009092	CGT	2	6	8209	8214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510942
148	NC_009092	GCACC	2	10	8224	8233	20 %	0 %	20 %	60 %	127510942
149	NC_009092	CCG	2	6	8373	8378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510942
150	NC_009092	ATC	2	6	8477	8482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510942
151	NC_009092	CAG	2	6	8594	8599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510942
152	NC_009092	CTGC	2	8	8669	8676	0 %	25 %	25 %	50 %	127510942
153	NC_009092	CAT	2	6	8720	8725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510942
154	NC_009092	TGG	2	6	8790	8795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510943
155	NC_009092	GCCA	2	8	8832	8839	25 %	0 %	25 %	50 %	127510943
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157	NC_009092	CTGC	2	8	8891	8898	0 %	25 %	25 %	50 %	127510943
158	NC_009092	GT	3	6	8933	8938	0 %	50 %	50 %	0 %	127510943
159	NC_009092	GAA	2	6	8989	8994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127510943
160	NC_009092	CTT	2	6	9030	9035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127510943
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162	NC_009092	CGG	2	6	9135	9140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510943
163	NC_009092	TC	3	6	9195	9200	0 %	50 %	0 %	50 %	127510943
164	NC_009092	GTT	2	6	9217	9222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127510943
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167	NC_009092	GC	3	6	9341	9346	0 %	0 %	50 %	50 %	127510943
168	NC_009092	GATA	2	8	9357	9364	50 %	25 %	25 %	0 %	127510943
169	NC_009092	TC	3	6	9398	9403	0 %	50 %	0 %	50 %	127510943
170	NC_009092	A	6	6	9461	9466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_009092	T	6	6	9485	9490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_009092	GCA	2	6	9512	9517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510944
173	NC_009092	CGG	2	6	9527	9532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510944
174	NC_009092	CAG	2	6	9561	9566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510944
175	NC_009092	TCG	3	9	9592	9600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510944
176	NC_009092	CCATCA	2	12	9602	9613	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	127510944
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179	NC_009092	AC	3	6	9818	9823	50 %	0 %	0 %	50 %	127510944
180	NC_009092	TTG	2	6	9826	9831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127510944
181	NC_009092	TGC	2	6	9843	9848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510944
182	NC_009092	GAC	2	6	9917	9922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510944
183	NC_009092	CTTGAT	2	12	9959	9970	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	127510944
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186	NC_009092	CCG	2	6	10151	10156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510944
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223	NC_009092	CCCAG	2	10	12092	12101	20 %	0 %	20 %	60 %	127510945
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231	NC_009092	CTA	2	6	12497	12502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
232	NC_009092	TTG	2	6	12540	12545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
233	NC_009092	T	6	6	12566	12571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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235	NC_009092	A	6	6	12594	12599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
236	NC_009092	TA	3	6	12644	12649	50 %	50 %	0 %	0 %	127510946
237	NC_009092	AAG	2	6	12760	12765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127510946
238	NC_009092	TAC	2	6	12845	12850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510946
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242	NC_009092	GGTA	2	8	13113	13120	25 %	25 %	50 %	0 %	127510946
243	NC_009092	CCG	2	6	13136	13141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510946
244	NC_009092	CTAA	2	8	13166	13173	50 %	25 %	0 %	25 %	127510946
245	NC_009092	TGG	2	6	13199	13204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510947
246	NC_009092	TCTG	2	8	13213	13220	0 %	50 %	25 %	25 %	127510947
247	NC_009092	TTG	2	6	13317	13322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127510947
248	NC_009092	GTCT	2	8	13412	13419	0 %	50 %	25 %	25 %	127510947
249	NC_009092	TGG	2	6	13445	13450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510947
250	NC_009092	CAT	2	6	13451	13456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510947
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252	NC_009092	CCA	2	6	13562	13567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127510947
253	NC_009092	CCTCTA	2	12	13595	13606	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	127510947
254	NC_009092	CATTC	2	10	13610	13619	20 %	40 %	0 %	40 %	127510947
255	NC_009092	TTA	2	6	13639	13644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127510947
256	NC_009092	TCAC	2	8	13657	13664	25 %	25 %	0 %	50 %	127510947
257	NC_009092	CTGT	2	8	13687	13694	0 %	50 %	25 %	25 %	127510947
258	NC_009092	TCCTG	2	10	13727	13736	0 %	40 %	20 %	40 %	127510947
259	NC_009092	ATA	3	9	13823	13831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127510947
260	NC_009092	ATTTC	2	10	13853	13862	20 %	60 %	0 %	20 %	127510947
261	NC_009092	TTG	2	6	13922	13927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
262	NC_009092	A	7	7	13949	13955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_009092	GAA	2	6	14081	14086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127510948
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392	NC_009092	CTC	2	6	21182	21187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127510954
393	NC_009092	CGGC	2	8	21233	21240	0 %	0 %	50 %	50 %	127510954
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493	NC_009092	GCC	2	6	25664	25669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510957
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