MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal04

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009038	ACC	2	6	104	109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009038	AAT	2	6	118	123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009038	T	6	6	172	177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009038	TCTCTT	2	12	248	259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090339
5	NC_009038	TCT	2	6	271	276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090339
6	NC_009038	TTC	2	6	310	315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090339
7	NC_009038	GCT	2	6	398	403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090339
8	NC_009038	CTTT	2	8	482	489	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009038	TC	3	6	571	576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009038	AC	3	6	622	627	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009038	AT	3	6	667	672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009038	AGCA	2	8	734	741	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009038	TAT	2	6	819	824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009038	ATT	2	6	831	836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009038	AGCGT	2	10	856	865	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009038	ACTT	2	8	932	939	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009038	CA	3	6	1007	1012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009038	TGT	2	6	1104	1109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009038	CTT	2	6	1135	1140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090340
20	NC_009038	TTC	2	6	1141	1146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090340
21	NC_009038	T	7	7	1147	1153	0 %	100 %	0 %	0 %	126090340
22	NC_009038	TCC	2	6	1166	1171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126090340
23	NC_009038	TC	3	6	1181	1186	0 %	50 %	0 %	50 %	126090340
24	NC_009038	ATT	2	6	1196	1201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126090340
25	NC_009038	TTGG	2	8	1304	1311	0 %	50 %	50 %	0 %	126090340
26	NC_009038	CTAA	2	8	1331	1338	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009038	AC	3	6	1486	1491	50 %	0 %	0 %	50 %	126090341
28	NC_009038	T	6	6	1512	1517	0 %	100 %	0 %	0 %	126090341
29	NC_009038	GAA	2	6	1532	1537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090341
30	NC_009038	ATC	2	6	1617	1622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090341
31	NC_009038	CAAG	2	8	1673	1680	50 %	0 %	25 %	25 %	126090341
32	NC_009038	CAA	2	6	1993	1998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126090341
33	NC_009038	GTG	2	6	2004	2009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090341
34	NC_009038	TGA	2	6	2083	2088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090341
35	NC_009038	AAG	2	6	2105	2110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090341
36	NC_009038	A	6	6	2112	2117	100 %	0 %	0 %	0 %	126090341
37	NC_009038	TGT	2	6	2371	2376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126090341
38	NC_009038	A	6	6	2393	2398	100 %	0 %	0 %	0 %	126090341
39	NC_009038	GATA	2	8	2422	2429	50 %	25 %	25 %	0 %	126090341
40	NC_009038	AAC	2	6	2527	2532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126090341
41	NC_009038	ATC	2	6	2539	2544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090341
42	NC_009038	GGC	2	6	2572	2577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126090341
43	NC_009038	AAG	2	6	2612	2617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090341
44	NC_009038	CCT	2	6	2638	2643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126090341
45	NC_009038	CTG	2	6	2670	2675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090341
46	NC_009038	CTG	2	6	2745	2750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090341
47	NC_009038	TC	3	6	2795	2800	0 %	50 %	0 %	50 %	126090341
48	NC_009038	CTT	2	6	2820	2825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090341
49	NC_009038	GGA	2	6	2896	2901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126090341
50	NC_009038	TGA	2	6	3089	3094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090341
51	NC_009038	AATT	2	8	3105	3112	50 %	50 %	0 %	0 %	126090342
52	NC_009038	ACA	2	6	3236	3241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126090342
53	NC_009038	ATT	2	6	3301	3306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126090342
54	NC_009038	TAA	2	6	3318	3323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126090342
55	NC_009038	TCT	2	6	3343	3348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090342
56	NC_009038	ATT	2	6	3349	3354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126090342
57	NC_009038	TGA	2	6	3372	3377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090342
58	NC_009038	TCT	2	6	3388	3393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090342
59	NC_009038	AAT	2	6	3466	3471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009038	TCAA	2	8	3481	3488	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009038	TGT	2	6	3508	3513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009038	GTT	2	6	3562	3567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009038	TTTA	2	8	3574	3581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009038	CA	3	6	3601	3606	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009038	GCT	2	6	3723	3728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090343
66	NC_009038	GTTGCT	2	12	3747	3758	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	126090343
67	NC_009038	TGC	2	6	3773	3778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090343
68	NC_009038	ATT	2	6	3807	3812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126090343
69	NC_009038	GCT	2	6	3816	3821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090343
70	NC_009038	GTT	2	6	3902	3907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126090343
71	NC_009038	ATT	2	6	3994	3999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009038	T	7	7	4044	4050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009038	TCTT	2	8	4087	4094	0 %	75 %	0 %	25 %	126090344
74	NC_009038	T	6	6	4093	4098	0 %	100 %	0 %	0 %	126090344
75	NC_009038	TGG	2	6	4154	4159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090344
76	NC_009038	GCTT	2	8	4196	4203	0 %	50 %	25 %	25 %	126090344
77	NC_009038	T	8	8	4307	4314	0 %	100 %	0 %	0 %	126090344
78	NC_009038	TAC	2	6	4340	4345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090344
79	NC_009038	CTC	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126090344
80	NC_009038	TGC	2	6	4475	4480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090344
81	NC_009038	TTTG	2	8	4491	4498	0 %	75 %	25 %	0 %	126090344
82	NC_009038	TCC	2	6	4520	4525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126090344
83	NC_009038	TGG	2	6	4529	4534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090344
84	NC_009038	CTGGTT	2	12	4540	4551	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	126090344
85	NC_009038	AAT	2	6	4563	4568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126090344
86	NC_009038	TTCA	2	8	4571	4578	25 %	50 %	0 %	25 %	126090344
87	NC_009038	GTG	2	6	4894	4899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090344
88	NC_009038	CCT	2	6	5181	5186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126090344
89	NC_009038	ATG	2	6	5257	5262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090344
90	NC_009038	TGGCT	2	10	5315	5324	0 %	40 %	40 %	20 %	126090344
91	NC_009038	CTG	3	9	5503	5511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090344
92	NC_009038	AAG	2	6	5527	5532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090344
93	NC_009038	GATT	2	8	5567	5574	25 %	50 %	25 %	0 %	126090344
94	NC_009038	TTC	2	6	5591	5596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090344
95	NC_009038	AATT	2	8	5653	5660	50 %	50 %	0 %	0 %	126090344
96	NC_009038	AGA	2	6	5669	5674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090344
97	NC_009038	TTTA	2	8	5684	5691	25 %	75 %	0 %	0 %	126090344
98	NC_009038	A	6	6	5697	5702	100 %	0 %	0 %	0 %	126090344
99	NC_009038	CTT	2	6	5716	5721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090344
100	NC_009038	ATG	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090344
101	NC_009038	GTTTT	2	10	5761	5770	0 %	80 %	20 %	0 %	126090344
102	NC_009038	TTTA	2	8	5851	5858	25 %	75 %	0 %	0 %	126090344
103	NC_009038	ATTT	2	8	5920	5927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009038	T	7	7	6001	6007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009038	T	6	6	6023	6028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009038	CATTT	2	10	6041	6050	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009038	TAT	2	6	6095	6100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009038	TTA	2	6	6111	6116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009038	TGC	2	6	6160	6165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009038	TA	3	6	6293	6298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009038	AT	3	6	6316	6321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009038	CTT	2	6	6341	6346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090345
113	NC_009038	CGG	2	6	6386	6391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126090345
114	NC_009038	TTTG	2	8	6430	6437	0 %	75 %	25 %	0 %	126090345
115	NC_009038	T	6	6	6455	6460	0 %	100 %	0 %	0 %	126090345
116	NC_009038	GAA	2	6	6466	6471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090345
117	NC_009038	TTAT	2	8	6510	6517	25 %	75 %	0 %	0 %	126090345
118	NC_009038	TGA	2	6	6603	6608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090345
119	NC_009038	TA	3	6	6620	6625	50 %	50 %	0 %	0 %	126090345
120	NC_009038	CAA	2	6	6736	6741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126090345
121	NC_009038	TGA	2	6	6759	6764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090345
122	NC_009038	GAT	2	6	6775	6780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090345
123	NC_009038	ATT	2	6	6874	6879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126090345
124	NC_009038	TA	3	6	7088	7093	50 %	50 %	0 %	0 %	126090345
125	NC_009038	AAT	2	6	7114	7119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126090345
126	NC_009038	ATT	2	6	7215	7220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126090345
127	NC_009038	GGTT	2	8	7257	7264	0 %	50 %	50 %	0 %	126090345
128	NC_009038	TCT	2	6	7336	7341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090345
129	NC_009038	ATG	2	6	7367	7372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090345
130	NC_009038	TTG	2	6	7415	7420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126090345
131	NC_009038	A	6	6	7430	7435	100 %	0 %	0 %	0 %	126090345
132	NC_009038	TCT	2	6	7516	7521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090345
133	NC_009038	AAG	2	6	7579	7584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090345
134	NC_009038	TGT	2	6	7614	7619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126090345
135	NC_009038	CG	3	6	7711	7716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009038	GC	4	8	7732	7739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009038	ATT	2	6	7776	7781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009038	ATTT	2	8	7812	7819	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009038	T	8	8	7856	7863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009038	GCA	2	6	7963	7968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.