MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylothermus marinus F1 chromosome

Total Repeats: 39160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009033	GAA	2	6	20756	20761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_009033	ACT	2	6	20935	20940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_009033	TCTG	2	8	20970	20977	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
504	NC_009033	CTT	2	6	21037	21042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_009033	GAA	2	6	21065	21070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_009033	ATG	2	6	21095	21100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464934
507	NC_009033	ATT	2	6	21101	21106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464934
508	NC_009033	AT	4	8	21134	21141	50 %	50 %	0 %	0 %	126464934
509	NC_009033	TA	3	6	21156	21161	50 %	50 %	0 %	0 %	126464934
510	NC_009033	GCT	2	6	21233	21238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464934
511	NC_009033	GTT	2	6	21245	21250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126464934
512	NC_009033	ATT	2	6	21257	21262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464934
513	NC_009033	TGCT	2	8	21297	21304	0 %	50 %	25 %	25 %	126464934
514	NC_009033	AT	3	6	21311	21316	50 %	50 %	0 %	0 %	126464934
515	NC_009033	GAA	2	6	21349	21354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126464934
516	NC_009033	AGT	2	6	21366	21371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464934
517	NC_009033	GCA	2	6	21439	21444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464935
518	NC_009033	TGC	2	6	21486	21491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464935
519	NC_009033	GGT	2	6	21578	21583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126464935
520	NC_009033	TTG	2	6	21584	21589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126464935
521	NC_009033	TGG	3	9	21591	21599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126464935
522	NC_009033	CAT	2	6	21699	21704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464935
523	NC_009033	TG	3	6	21725	21730	0 %	50 %	50 %	0 %	126464935
524	NC_009033	GGT	2	6	21748	21753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126464935
525	NC_009033	GTA	2	6	21819	21824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464936
526	NC_009033	CTA	2	6	21908	21913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464936
527	NC_009033	CTGTTG	2	12	21952	21963	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	126464936
528	NC_009033	TTATAC	2	12	21979	21990	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	126464936
529	NC_009033	AGTAT	2	10	22208	22217	40 %	40 %	20 %	0 %	126464937
530	NC_009033	AAC	2	6	22249	22254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126464937
531	NC_009033	AAT	2	6	22270	22275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464937
532	NC_009033	AGC	2	6	22393	22398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464937
533	NC_009033	GGA	2	6	22433	22438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126464937
534	NC_009033	GAG	2	6	22446	22451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126464937
535	NC_009033	TC	3	6	22491	22496	0 %	50 %	0 %	50 %	126464937
536	NC_009033	AG	4	8	22510	22517	50 %	0 %	50 %	0 %	126464937
537	NC_009033	TTA	3	9	22539	22547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464937
538	NC_009033	TAG	2	6	22575	22580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464937
539	NC_009033	TAT	2	6	22582	22587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464937
540	NC_009033	AACC	2	8	22637	22644	50 %	0 %	0 %	50 %	126464937
541	NC_009033	AT	3	6	22675	22680	50 %	50 %	0 %	0 %	126464937
542	NC_009033	TTA	2	6	22692	22697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464937
543	NC_009033	TTC	2	6	22712	22717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464937
544	NC_009033	TTC	2	6	22730	22735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464937
545	NC_009033	TCC	2	6	22764	22769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464937
546	NC_009033	GA	3	6	22784	22789	50 %	0 %	50 %	0 %	126464937
547	NC_009033	GA	3	6	22806	22811	50 %	0 %	50 %	0 %	126464937
548	NC_009033	GATC	2	8	22815	22822	25 %	25 %	25 %	25 %	126464937
549	NC_009033	ACTT	2	8	22828	22835	25 %	50 %	0 %	25 %	126464938
550	NC_009033	TAT	2	6	22850	22855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464938
551	NC_009033	AAG	2	6	22915	22920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126464938
552	NC_009033	ATA	2	6	22921	22926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464938
553	NC_009033	CAC	2	6	22994	22999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126464938
554	NC_009033	CAA	2	6	23042	23047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126464938
555	NC_009033	GAGG	2	8	23196	23203	25 %	0 %	75 %	0 %	126464938
556	NC_009033	AGA	2	6	23206	23211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126464938
557	NC_009033	TTC	2	6	23235	23240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464939
558	NC_009033	TGT	2	6	23248	23253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126464939
559	NC_009033	CTA	2	6	23258	23263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464939
560	NC_009033	AT	3	6	23275	23280	50 %	50 %	0 %	0 %	126464939
561	NC_009033	TAG	2	6	23325	23330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464939
562	NC_009033	CTT	2	6	23437	23442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464939
563	NC_009033	ATGTA	2	10	23469	23478	40 %	40 %	20 %	0 %	126464939
564	NC_009033	GTT	3	9	23597	23605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126464939
565	NC_009033	TAA	3	9	23617	23625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464939
566	NC_009033	TAT	2	6	23630	23635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464939
567	NC_009033	A	6	6	23714	23719	100 %	0 %	0 %	0 %	126464939
568	NC_009033	GATTA	2	10	23726	23735	40 %	40 %	20 %	0 %	126464939
569	NC_009033	GGT	2	6	23736	23741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_009033	AAG	2	6	23852	23857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126464940
571	NC_009033	AT	3	6	23867	23872	50 %	50 %	0 %	0 %	126464940
572	NC_009033	ATC	2	6	23881	23886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464940
573	NC_009033	AAT	2	6	23947	23952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464940
574	NC_009033	TGG	2	6	23962	23967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126464940
575	NC_009033	TCC	2	6	23974	23979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464940
576	NC_009033	TCAAT	2	10	24004	24013	40 %	40 %	0 %	20 %	126464940
577	NC_009033	ATT	2	6	24025	24030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464940
578	NC_009033	TAA	2	6	24076	24081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464940
579	NC_009033	CGA	2	6	24088	24093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464940
580	NC_009033	ATTG	2	8	24115	24122	25 %	50 %	25 %	0 %	126464940
581	NC_009033	TA	3	6	24150	24155	50 %	50 %	0 %	0 %	126464940
582	NC_009033	TAG	2	6	24216	24221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464940
583	NC_009033	AGC	2	6	24253	24258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464940
584	NC_009033	TAT	2	6	24271	24276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464940
585	NC_009033	ACA	2	6	24290	24295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126464940
586	NC_009033	AT	3	6	24320	24325	50 %	50 %	0 %	0 %	126464940
587	NC_009033	ACT	2	6	24424	24429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464940
588	NC_009033	CAG	2	6	24531	24536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464940
589	NC_009033	GTT	2	6	24551	24556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126464940
590	NC_009033	TA	3	6	24588	24593	50 %	50 %	0 %	0 %	126464940
591	NC_009033	CT	3	6	24594	24599	0 %	50 %	0 %	50 %	126464940
592	NC_009033	AT	3	6	24623	24628	50 %	50 %	0 %	0 %	126464940
593	NC_009033	AGG	2	6	24673	24678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126464940
594	NC_009033	ATG	3	9	24695	24703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464940
595	NC_009033	AG	3	6	24708	24713	50 %	0 %	50 %	0 %	126464940
596	NC_009033	AGC	2	6	24802	24807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464940
597	NC_009033	ATA	2	6	24842	24847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464940
598	NC_009033	GCT	2	6	24902	24907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464940
599	NC_009033	ATGAA	2	10	24924	24933	60 %	20 %	20 %	0 %	126464940
600	NC_009033	TTC	2	6	25019	25024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464940
601	NC_009033	ATT	2	6	25067	25072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464940
602	NC_009033	ATA	2	6	25091	25096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464940
603	NC_009033	TAG	2	6	25156	25161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464940
604	NC_009033	AG	3	6	25160	25165	50 %	0 %	50 %	0 %	126464940
605	NC_009033	TAC	2	6	25197	25202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464940
606	NC_009033	TAT	2	6	25203	25208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464940
607	NC_009033	TTG	3	9	25223	25231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126464940
608	NC_009033	TATT	2	8	25264	25271	25 %	75 %	0 %	0 %	126464940
609	NC_009033	TCA	2	6	25283	25288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464940
610	NC_009033	GTG	2	6	25354	25359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_009033	TCA	2	6	25440	25445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464941
612	NC_009033	TAT	2	6	25446	25451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464941
613	NC_009033	CTT	2	6	25463	25468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464941
614	NC_009033	AAAGA	2	10	25477	25486	80 %	0 %	20 %	0 %	126464941
615	NC_009033	GTT	2	6	25526	25531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126464941
616	NC_009033	TTAT	2	8	25603	25610	25 %	75 %	0 %	0 %	126464941
617	NC_009033	GCAT	2	8	25617	25624	25 %	25 %	25 %	25 %	126464941
618	NC_009033	ATT	2	6	25672	25677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464941
619	NC_009033	ATCG	2	8	25687	25694	25 %	25 %	25 %	25 %	126464941
620	NC_009033	AAT	2	6	25702	25707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464941
621	NC_009033	AT	3	6	25706	25711	50 %	50 %	0 %	0 %	126464941
622	NC_009033	GTT	2	6	25712	25717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126464941
623	NC_009033	ATGGA	2	10	25728	25737	40 %	20 %	40 %	0 %	126464942
624	NC_009033	TAA	2	6	25743	25748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464942
625	NC_009033	ATT	2	6	25762	25767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464942
626	NC_009033	TATT	2	8	25785	25792	25 %	75 %	0 %	0 %	126464942
627	NC_009033	T	6	6	25791	25796	0 %	100 %	0 %	0 %	126464942
628	NC_009033	ACT	2	6	25915	25920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464942
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