MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 83796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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75002	NC_008750	CCA	2	6	4215699	4215704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120600476
75003	NC_008750	CTG	2	6	4215728	4215733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120600476
75004	NC_008750	A	6	6	4215946	4215951	100 %	0 %	0 %	0 %	120600476
75005	NC_008750	CAT	2	6	4216059	4216064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120600476
75006	NC_008750	TTG	2	6	4216142	4216147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120600476
75007	NC_008750	AGCGC	2	10	4216164	4216173	20 %	0 %	40 %	40 %	120600476
75008	NC_008750	CTG	2	6	4216245	4216250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120600476
75009	NC_008750	CAT	2	6	4216350	4216355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120600476
75010	NC_008750	ATC	2	6	4216369	4216374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120600476
75011	NC_008750	GT	3	6	4216479	4216484	0 %	50 %	50 %	0 %	120600476
75012	NC_008750	CTGA	2	8	4216528	4216535	25 %	25 %	25 %	25 %	120600476
75013	NC_008750	ATC	2	6	4216586	4216591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120600476
75014	NC_008750	TCC	2	6	4216604	4216609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120600476
75015	NC_008750	CAT	2	6	4216641	4216646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120600476
75016	NC_008750	AC	3	6	4216761	4216766	50 %	0 %	0 %	50 %	120600476
75017	NC_008750	GCA	2	6	4216772	4216777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120600476
75018	NC_008750	ACC	2	6	4216931	4216936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120600476
75019	NC_008750	CACTGA	2	12	4216977	4216988	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	120600476
75020	NC_008750	TTGG	2	8	4217021	4217028	0 %	50 %	50 %	0 %	120600476
75021	NC_008750	TTG	2	6	4217078	4217083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120600476
75022	NC_008750	CCGTTG	2	12	4217118	4217129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120600476
75023	NC_008750	GT	3	6	4217145	4217150	0 %	50 %	50 %	0 %	120600476
75024	NC_008750	TGAT	2	8	4217153	4217160	25 %	50 %	25 %	0 %	120600476
75025	NC_008750	TGG	2	6	4217184	4217189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120600476
75026	NC_008750	CGA	2	6	4217221	4217226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120600476
75027	NC_008750	CGTTGC	2	12	4217323	4217334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120600476
75028	NC_008750	TGG	2	6	4217445	4217450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120600476
75029	NC_008750	GCA	2	6	4217501	4217506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120600476
75030	NC_008750	TGCC	2	8	4217520	4217527	0 %	25 %	25 %	50 %	120600476
75031	NC_008750	CGC	2	6	4217554	4217559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120600476
75032	NC_008750	GTA	2	6	4217666	4217671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120600476
75033	NC_008750	CTGG	2	8	4217688	4217695	0 %	25 %	50 %	25 %	120600476
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75035	NC_008750	GCA	2	6	4217990	4217995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120600476
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75038	NC_008750	AC	3	6	4218096	4218101	50 %	0 %	0 %	50 %	120600476
75039	NC_008750	TGA	2	6	4218133	4218138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120600476
75040	NC_008750	TGC	2	6	4218238	4218243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120600476
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75051	NC_008750	GCC	2	6	4218907	4218912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120600476
75052	NC_008750	GTT	2	6	4218955	4218960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120600476
75053	NC_008750	TTG	2	6	4219017	4219022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120600476
75054	NC_008750	CTG	2	6	4219104	4219109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120600476
75055	NC_008750	CAG	3	9	4219119	4219127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120600476
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75069	NC_008750	TGG	2	6	4219968	4219973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120600476
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75091	NC_008750	ATA	2	6	4221603	4221608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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75102	NC_008750	A	6	6	4222112	4222117	100 %	0 %	0 %	0 %	120600478
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75117	NC_008750	ATA	2	6	4222835	4222840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120600479
75118	NC_008750	GCATA	2	10	4222846	4222855	40 %	20 %	20 %	20 %	120600479
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75155	NC_008750	ATGG	2	8	4225154	4225161	25 %	25 %	50 %	0 %	120600482
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75232	NC_008750	CAC	2	6	4229708	4229713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120600487
75233	NC_008750	TAA	2	6	4229744	4229749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120600487
75234	NC_008750	AACC	2	8	4229763	4229770	50 %	0 %	0 %	50 %	120600487
75235	NC_008750	GTA	2	6	4229835	4229840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120600487
75236	NC_008750	TGC	2	6	4229916	4229921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120600487
75237	NC_008750	AGC	2	6	4230042	4230047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120600487
75238	NC_008750	TG	3	6	4230056	4230061	0 %	50 %	50 %	0 %	120600487
75239	NC_008750	TAGT	2	8	4230067	4230074	25 %	50 %	25 %	0 %	120600487
75240	NC_008750	TGC	2	6	4230099	4230104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120600488
75241	NC_008750	ATC	2	6	4230159	4230164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120600488
75242	NC_008750	CGT	2	6	4230165	4230170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120600488
75243	NC_008750	CTT	2	6	4230224	4230229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120600488
75244	NC_008750	T	6	6	4230228	4230233	0 %	100 %	0 %	0 %	120600488
75245	NC_008750	CAA	2	6	4230392	4230397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120600488
75246	NC_008750	CAAG	2	8	4230404	4230411	50 %	0 %	25 %	25 %	120600488
75247	NC_008750	CACC	2	8	4230468	4230475	25 %	0 %	0 %	75 %	120600489
75248	NC_008750	CAC	2	6	4230540	4230545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120600489
75249	NC_008750	TCA	2	6	4230614	4230619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120600489
75250	NC_008750	TCT	2	6	4230641	4230646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120600489
75251	NC_008750	A	6	6	4230756	4230761	100 %	0 %	0 %	0 %	120600489
75252	NC_008750	T	6	6	4230777	4230782	0 %	100 %	0 %	0 %	120600489
75253	NC_008750	CTG	2	6	4230853	4230858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120600489
75254	NC_008750	CTG	2	6	4230877	4230882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120600489
75255	NC_008750	GCA	2	6	4230914	4230919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120600489
75256	NC_008750	ATC	2	6	4231028	4231033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120600490
75257	NC_008750	AGTA	2	8	4231104	4231111	50 %	25 %	25 %	0 %	120600490
75258	NC_008750	ATT	2	6	4231112	4231117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120600490
75259	NC_008750	CTT	2	6	4231153	4231158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120600490
75260	NC_008750	TTG	2	6	4231301	4231306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120600490
75261	NC_008750	TGT	2	6	4231414	4231419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120600490
75262	NC_008750	ACT	2	6	4231432	4231437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75263	NC_008750	A	7	7	4231444	4231450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75264	NC_008750	TTGGC	2	10	4231461	4231470	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
75265	NC_008750	CAA	2	6	4231487	4231492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75266	NC_008750	CTA	2	6	4231497	4231502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120600491
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75268	NC_008750	CAC	2	6	4231574	4231579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120600491
75269	NC_008750	AT	3	6	4231701	4231706	50 %	50 %	0 %	0 %	120600491
75270	NC_008750	CAT	2	6	4231709	4231714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120600491
75271	NC_008750	GCA	2	6	4231743	4231748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120600491
75272	NC_008750	CAT	2	6	4231783	4231788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120600491
75273	NC_008750	TCGC	2	8	4231824	4231831	0 %	25 %	25 %	50 %	120600491
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75276	NC_008750	A	6	6	4231947	4231952	100 %	0 %	0 %	0 %	120600491
75277	NC_008750	CAA	2	6	4232009	4232014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120600491
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75279	NC_008750	CAA	2	6	4232122	4232127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120600491
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75292	NC_008750	CTT	2	6	4232746	4232751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120600492
75293	NC_008750	CAT	2	6	4232788	4232793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120600492
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75299	NC_008750	TTCACG	2	12	4232996	4233007	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	120600492
75300	NC_008750	AC	3	6	4233070	4233075	50 %	0 %	0 %	50 %	120600492
75301	NC_008750	GTGA	2	8	4233183	4233190	25 %	25 %	50 %	0 %	120600492
75302	NC_008750	ATC	2	6	4233237	4233242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120600492
75303	NC_008750	ATA	2	6	4233453	4233458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120600492
75304	NC_008750	GAC	2	6	4233466	4233471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120600492
75305	NC_008750	GTT	2	6	4233517	4233522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120600492
75306	NC_008750	GCA	2	6	4233559	4233564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120600492
75307	NC_008750	GC	3	6	4233680	4233685	0 %	0 %	50 %	50 %	120600492
75308	NC_008750	GAC	2	6	4233714	4233719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120600492
75309	NC_008750	CTT	2	6	4233742	4233747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120600492
75310	NC_008750	CTT	3	9	4233817	4233825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120600492
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75312	NC_008750	TCA	3	9	4233873	4233881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120600492
75313	NC_008750	GGC	2	6	4234079	4234084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120600492
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75334	NC_008750	GTA	2	6	4235176	4235181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120600493
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75337	NC_008750	ACC	3	9	4235265	4235273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120600493
75338	NC_008750	AGC	2	6	4235280	4235285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120600493
75339	NC_008750	CGA	2	6	4235327	4235332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120600493
75340	NC_008750	TG	3	6	4235442	4235447	0 %	50 %	50 %	0 %	120600493
75341	NC_008750	ACG	2	6	4235469	4235474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120600493
75342	NC_008750	GCGTA	2	10	4235563	4235572	20 %	20 %	40 %	20 %	120600493
75343	NC_008750	ATGA	2	8	4235622	4235629	50 %	25 %	25 %	0 %	120600493
75344	NC_008750	ACC	2	6	4235635	4235640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120600493
75345	NC_008750	TCA	2	6	4235656	4235661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120600493
75346	NC_008750	CCA	2	6	4235696	4235701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120600493
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