MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophobacter fumaroxidans MPOB chromosome

Total Repeats: 101995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008554	CCGTGG	2	12	628780	628791	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116747966
13002	NC_008554	GCC	2	6	628795	628800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747966
13003	NC_008554	CGTT	2	8	628907	628914	0 %	50 %	25 %	25 %	116747966
13004	NC_008554	GTG	2	6	629034	629039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747966
13005	NC_008554	CG	4	8	629046	629053	0 %	0 %	50 %	50 %	116747966
13006	NC_008554	TCG	2	6	629083	629088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747966
13007	NC_008554	CGGG	2	8	629101	629108	0 %	0 %	75 %	25 %	116747966
13008	NC_008554	GCC	2	6	629112	629117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747966
13009	NC_008554	GC	3	6	629133	629138	0 %	0 %	50 %	50 %	116747966
13010	NC_008554	CGTT	2	8	629172	629179	0 %	50 %	25 %	25 %	116747966
13011	NC_008554	GGTG	2	8	629183	629190	0 %	25 %	75 %	0 %	116747966
13012	NC_008554	TCG	2	6	629206	629211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747966
13013	NC_008554	CGG	2	6	629333	629338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747966
13014	NC_008554	CG	3	6	629339	629344	0 %	0 %	50 %	50 %	116747966
13015	NC_008554	TCC	2	6	629421	629426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747967
13016	NC_008554	GCGG	2	8	629517	629524	0 %	0 %	75 %	25 %	116747967
13017	NC_008554	CT	3	6	629615	629620	0 %	50 %	0 %	50 %	116747967
13018	NC_008554	GCG	2	6	629646	629651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747967
13019	NC_008554	GTC	2	6	629670	629675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747967
13020	NC_008554	GGA	3	9	629685	629693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747967
13021	NC_008554	GCG	2	6	629706	629711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747967
13022	NC_008554	GCCT	2	8	629734	629741	0 %	25 %	25 %	50 %	116747967
13023	NC_008554	CGT	2	6	629795	629800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747967
13024	NC_008554	GGA	2	6	629822	629827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747967
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13026	NC_008554	GGGC	2	8	629984	629991	0 %	0 %	75 %	25 %	116747967
13027	NC_008554	GCC	2	6	630069	630074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747967
13028	NC_008554	GCT	2	6	630125	630130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747967
13029	NC_008554	CGAT	2	8	630286	630293	25 %	25 %	25 %	25 %	116747967
13030	NC_008554	GC	3	6	630310	630315	0 %	0 %	50 %	50 %	116747967
13031	NC_008554	GGTC	2	8	630317	630324	0 %	25 %	50 %	25 %	116747967
13032	NC_008554	GCGA	2	8	630392	630399	25 %	0 %	50 %	25 %	116747967
13033	NC_008554	CAT	2	6	630594	630599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_008554	AAG	2	6	630608	630613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_008554	CCCG	2	8	630683	630690	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13036	NC_008554	GGC	2	6	630693	630698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_008554	CG	4	8	630730	630737	0 %	0 %	50 %	50 %	116747968
13038	NC_008554	TGAA	2	8	630756	630763	50 %	25 %	25 %	0 %	116747968
13039	NC_008554	GAG	2	6	630938	630943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747968
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13041	NC_008554	GTC	2	6	631049	631054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747968
13042	NC_008554	TCT	2	6	631105	631110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747968
13043	NC_008554	GCC	2	6	631271	631276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747968
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13050	NC_008554	GGA	2	6	631436	631441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747968
13051	NC_008554	GTC	2	6	631443	631448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747968
13052	NC_008554	GAA	2	6	631487	631492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747968
13053	NC_008554	CGG	2	6	631558	631563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13054	NC_008554	TTG	2	6	631665	631670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116747969
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13056	NC_008554	CTT	2	6	631740	631745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747969
13057	NC_008554	ATGC	2	8	631758	631765	25 %	25 %	25 %	25 %	116747969
13058	NC_008554	CGG	2	6	631782	631787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747969
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13062	NC_008554	GGA	2	6	631996	632001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_008554	TAT	2	6	632025	632030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_008554	TA	3	6	632033	632038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_008554	GAA	2	6	632088	632093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_008554	CAT	2	6	632123	632128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747970
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13079	NC_008554	GTC	2	6	632862	632867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747970
13080	NC_008554	CTG	2	6	632916	632921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747970
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13082	NC_008554	ACG	2	6	632982	632987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13083	NC_008554	C	6	6	633067	633072	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13084	NC_008554	GCC	3	9	633138	633146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13085	NC_008554	GCG	2	6	633170	633175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13086	NC_008554	TCG	2	6	633319	633324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13087	NC_008554	GGGGGA	2	12	633329	633340	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_008554	GGC	2	6	633346	633351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13089	NC_008554	A	6	6	633359	633364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_008554	GTT	2	6	633431	633436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_008554	TGA	2	6	633464	633469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_008554	TTCGG	2	10	633470	633479	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13093	NC_008554	GC	3	6	633487	633492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13094	NC_008554	TTA	2	6	633504	633509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_008554	TGGA	2	8	633510	633517	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_008554	T	6	6	633523	633528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_008554	GCG	2	6	633573	633578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13098	NC_008554	GGC	2	6	633742	633747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747971
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13102	NC_008554	GGC	2	6	633820	633825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747971
13103	NC_008554	CGG	2	6	633843	633848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747971
13104	NC_008554	TAT	2	6	633899	633904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116747971
13105	NC_008554	CCT	2	6	633905	633910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747971
13106	NC_008554	GGAT	2	8	633918	633925	25 %	25 %	50 %	0 %	116747971
13107	NC_008554	AGG	2	6	633957	633962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747971
13108	NC_008554	TCG	2	6	633993	633998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747971
13109	NC_008554	GGT	2	6	634023	634028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747971
13110	NC_008554	TGGA	2	8	634055	634062	25 %	25 %	50 %	0 %	116747971
13111	NC_008554	GCG	2	6	634072	634077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747971
13112	NC_008554	CCG	2	6	634140	634145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747971
13113	NC_008554	GGC	2	6	634255	634260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747971
13114	NC_008554	CTG	2	6	634264	634269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747971
13115	NC_008554	CAT	2	6	634282	634287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747971
13116	NC_008554	CG	3	6	634298	634303	0 %	0 %	50 %	50 %	116747971
13117	NC_008554	GAT	2	6	634327	634332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747971
13118	NC_008554	GGTACG	2	12	634404	634415	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116747971
13119	NC_008554	TC	3	6	634473	634478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13120	NC_008554	TCT	2	6	634527	634532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13121	NC_008554	CGG	2	6	634539	634544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13122	NC_008554	TGCG	2	8	634549	634556	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13123	NC_008554	TGA	2	6	634636	634641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_008554	ACC	2	6	634649	634654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13125	NC_008554	GTG	2	6	634722	634727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13127	NC_008554	GGA	2	6	634861	634866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13252	NC_008554	GAA	2	6	641233	641238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747973
13253	NC_008554	AGA	2	6	641288	641293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747973
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13256	NC_008554	A	7	7	641367	641373	100 %	0 %	0 %	0 %	116747973
13257	NC_008554	GGA	2	6	641418	641423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13260	NC_008554	GCG	2	6	641559	641564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13499	NC_008554	TCC	2	6	652950	652955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747981
13500	NC_008554	CGGG	2	8	652985	652992	0 %	0 %	75 %	25 %	116747981

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