MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophobacter fumaroxidans MPOB chromosome

Total Repeats: 101995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_008554	CGTGC	2	10	557366	557375	0 %	20 %	40 %	40 %	116747909
11502	NC_008554	TGTT	2	8	557379	557386	0 %	75 %	25 %	0 %	116747909
11503	NC_008554	GA	3	6	557416	557421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_008554	ACTC	2	8	557426	557433	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11505	NC_008554	CAA	2	6	557498	557503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_008554	CACC	2	8	557567	557574	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11507	NC_008554	CCT	2	6	557596	557601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11508	NC_008554	CGG	2	6	557605	557610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11509	NC_008554	CATC	2	8	557658	557665	25 %	25 %	0 %	50 %	116747910
11510	NC_008554	GCG	2	6	557666	557671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747910
11511	NC_008554	TGC	2	6	557729	557734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747910
11512	NC_008554	TTC	2	6	557755	557760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747910
11513	NC_008554	ACC	2	6	557801	557806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747910
11514	NC_008554	TTC	2	6	557807	557812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747910
11515	NC_008554	CTC	2	6	557831	557836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747910
11516	NC_008554	CAG	2	6	557878	557883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747910
11517	NC_008554	GCC	2	6	557884	557889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747910
11518	NC_008554	CCG	2	6	557904	557909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747910
11519	NC_008554	AAG	2	6	557955	557960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_008554	CTC	2	6	558087	558092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747911
11521	NC_008554	CTC	2	6	558146	558151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747911
11522	NC_008554	TC	3	6	558167	558172	0 %	50 %	0 %	50 %	116747911
11523	NC_008554	CTT	2	6	558221	558226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747911
11524	NC_008554	GGC	2	6	558263	558268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747911
11525	NC_008554	CGA	2	6	558301	558306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747911
11526	NC_008554	GCT	2	6	558404	558409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747912
11527	NC_008554	GTG	2	6	558487	558492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747912
11528	NC_008554	GAT	2	6	558564	558569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747912
11529	NC_008554	CGC	2	6	558573	558578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747912
11530	NC_008554	CGC	2	6	558594	558599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747912
11531	NC_008554	GAT	2	6	558621	558626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747912
11532	NC_008554	GCG	2	6	558633	558638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747912
11533	NC_008554	TGG	2	6	558857	558862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747912
11534	NC_008554	CG	3	6	558953	558958	0 %	0 %	50 %	50 %	116747912
11535	NC_008554	TGA	2	6	558959	558964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747912
11536	NC_008554	GGCCC	2	10	559046	559055	0 %	0 %	40 %	60 %	116747912
11537	NC_008554	TCC	3	9	559180	559188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11538	NC_008554	GAC	2	6	559282	559287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747913
11539	NC_008554	TTC	2	6	559312	559317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747913
11540	NC_008554	CTG	2	6	559430	559435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747913
11541	NC_008554	GAAT	2	8	559500	559507	50 %	25 %	25 %	0 %	116747913
11542	NC_008554	GTG	2	6	559526	559531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747913
11543	NC_008554	GAA	2	6	559630	559635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747913
11544	NC_008554	TGC	2	6	559841	559846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747913
11545	NC_008554	GCT	2	6	559866	559871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747913
11546	NC_008554	GCA	2	6	559887	559892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747913
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11548	NC_008554	CTT	2	6	559933	559938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747913
11549	NC_008554	GTC	2	6	559954	559959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747913
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11551	NC_008554	CGG	2	6	559998	560003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747913
11552	NC_008554	GCG	2	6	560063	560068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747913
11553	NC_008554	TC	3	6	560130	560135	0 %	50 %	0 %	50 %	116747913
11554	NC_008554	GTTC	2	8	560167	560174	0 %	50 %	25 %	25 %	116747913
11555	NC_008554	GCC	2	6	560198	560203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747913
11556	NC_008554	TGA	2	6	560208	560213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747913
11557	NC_008554	CGC	2	6	560227	560232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747913
11558	NC_008554	TCC	2	6	560363	560368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747913
11559	NC_008554	TGA	2	6	560391	560396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747913
11560	NC_008554	CGA	2	6	560433	560438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747913
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11562	NC_008554	GCGG	2	8	560673	560680	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11563	NC_008554	GTGCC	2	10	560683	560692	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11564	NC_008554	CGG	2	6	560762	560767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11565	NC_008554	CCG	2	6	560785	560790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11566	NC_008554	GAG	2	6	560797	560802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_008554	ACA	2	6	560848	560853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11568	NC_008554	GCC	2	6	560958	560963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747914
11569	NC_008554	TCC	2	6	561010	561015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747914
11570	NC_008554	AGT	2	6	561092	561097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747914
11571	NC_008554	TGC	3	9	561122	561130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747914
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11573	NC_008554	TTC	2	6	561256	561261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747914
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11577	NC_008554	CGA	2	6	561356	561361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747914
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11582	NC_008554	GCC	3	9	561589	561597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747914
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11585	NC_008554	CAGG	2	8	561763	561770	25 %	0 %	50 %	25 %	116747915
11586	NC_008554	TTC	2	6	561878	561883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747915
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11588	NC_008554	CCG	2	6	561927	561932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747915
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11593	NC_008554	TCT	2	6	562044	562049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747915
11594	NC_008554	GCG	2	6	562050	562055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747915
11595	NC_008554	CCT	2	6	562056	562061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747915
11596	NC_008554	CG	3	6	562148	562153	0 %	0 %	50 %	50 %	116747915
11597	NC_008554	ACC	2	6	562157	562162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747915
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11602	NC_008554	CTT	2	6	562425	562430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747915
11603	NC_008554	GTTGC	3	15	562498	562512	0 %	40 %	40 %	20 %	116747915
11604	NC_008554	CGT	2	6	562564	562569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747915
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11608	NC_008554	GAC	2	6	562651	562656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747915
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11610	NC_008554	GCG	2	6	562761	562766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747915
11611	NC_008554	TGA	2	6	562767	562772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747915
11612	NC_008554	TCA	2	6	562791	562796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747915
11613	NC_008554	CTGC	2	8	562809	562816	0 %	25 %	25 %	50 %	116747915
11614	NC_008554	AGC	2	6	562827	562832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747915
11615	NC_008554	GCC	2	6	562864	562869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747915
11616	NC_008554	GCCT	2	8	563020	563027	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11617	NC_008554	GGGC	2	8	563081	563088	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11618	NC_008554	CGT	2	6	563111	563116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11619	NC_008554	GC	3	6	563162	563167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11620	NC_008554	CGG	2	6	563215	563220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11621	NC_008554	CCA	2	6	563227	563232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11622	NC_008554	TCGA	2	8	563259	563266	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11623	NC_008554	GACTT	2	10	563271	563280	20 %	40 %	20 %	20 %	116747916
11624	NC_008554	CCGG	2	8	563281	563288	0 %	0 %	50 %	50 %	116747916
11625	NC_008554	GTAT	2	8	563307	563314	25 %	50 %	25 %	0 %	116747916
11626	NC_008554	T	6	6	563321	563326	0 %	100 %	0 %	0 %	116747916
11627	NC_008554	TGA	2	6	563444	563449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747916
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11629	NC_008554	AGTCGG	3	18	563595	563612	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116747916
11630	NC_008554	GGA	2	6	563626	563631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747916
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11632	NC_008554	CGGG	2	8	563696	563703	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11633	NC_008554	GAC	2	6	563716	563721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11634	NC_008554	G	6	6	563736	563741	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11635	NC_008554	GAT	2	6	563787	563792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11636	NC_008554	ATC	2	6	563815	563820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11637	NC_008554	CGA	2	6	563870	563875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11638	NC_008554	TCGATA	2	12	563900	563911	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11639	NC_008554	ACC	2	6	563945	563950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11640	NC_008554	CTG	2	6	564026	564031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11641	NC_008554	A	6	6	564116	564121	100 %	0 %	0 %	0 %	116747917
11642	NC_008554	T	6	6	564205	564210	0 %	100 %	0 %	0 %	116747917
11643	NC_008554	ACCG	2	8	564216	564223	25 %	0 %	25 %	50 %	116747917
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11647	NC_008554	CCG	2	6	564418	564423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747917
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11652	NC_008554	CCG	2	6	564516	564521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747917
11653	NC_008554	TCC	2	6	564525	564530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747917
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11663	NC_008554	GGTCA	2	10	565389	565398	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11664	NC_008554	CTT	2	6	565489	565494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11990	NC_008554	CGA	2	6	580798	580803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747932
11991	NC_008554	CG	3	6	580873	580878	0 %	0 %	50 %	50 %	116747932
11992	NC_008554	CGG	2	6	581031	581036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747932
11993	NC_008554	GGA	2	6	581152	581157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747932
11994	NC_008554	GAT	2	6	581222	581227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747932
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11996	NC_008554	CTC	2	6	581354	581359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11997	NC_008554	GT	3	6	581367	581372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11998	NC_008554	CG	3	6	581447	581452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11999	NC_008554	GC	3	6	581491	581496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12000	NC_008554	CAG	2	6	581645	581650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747933

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