MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae D39 chromosome

Total Repeats: 41766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_008533	TCT	2	6	1518680	1518685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516337
31003	NC_008533	ATT	2	6	1518688	1518693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516337
31004	NC_008533	CCT	2	6	1518700	1518705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116515660
31005	NC_008533	TGA	2	6	1518718	1518723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515660
31006	NC_008533	CCA	2	6	1518748	1518753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116515660
31007	NC_008533	AGA	2	6	1518754	1518759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515660
31008	NC_008533	CTG	2	6	1518778	1518783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515660
31009	NC_008533	CAA	2	6	1518794	1518799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515660
31010	NC_008533	CGT	2	6	1518839	1518844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515660
31011	NC_008533	CCA	3	9	1518861	1518869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116515660
31012	NC_008533	TTA	2	6	1518894	1518899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515660
31013	NC_008533	AAC	2	6	1518920	1518925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515660
31014	NC_008533	ATCT	2	8	1518995	1519002	25 %	50 %	0 %	25 %	116515660
31015	NC_008533	AGC	2	6	1519004	1519009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515660
31016	NC_008533	TTC	2	6	1519019	1519024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515660
31017	NC_008533	CCAAA	2	10	1519074	1519083	60 %	0 %	0 %	40 %	116515660
31018	NC_008533	GATTA	2	10	1519166	1519175	40 %	40 %	20 %	0 %	116515660
31019	NC_008533	CAAT	2	8	1519252	1519259	50 %	25 %	0 %	25 %	116515660
31020	NC_008533	TA	3	6	1519267	1519272	50 %	50 %	0 %	0 %	116515660
31021	NC_008533	CTA	2	6	1519321	1519326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515660
31022	NC_008533	AAG	2	6	1519383	1519388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515660
31023	NC_008533	CAA	2	6	1519426	1519431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515660
31024	NC_008533	A	6	6	1519474	1519479	100 %	0 %	0 %	0 %	116515660
31025	NC_008533	TTCTCC	2	12	1519573	1519584	0 %	50 %	0 %	50 %	116515660
31026	NC_008533	CTT	2	6	1519585	1519590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31027	NC_008533	AAAT	2	8	1519667	1519674	75 %	25 %	0 %	0 %	116516571
31028	NC_008533	CTT	2	6	1519693	1519698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516571
31029	NC_008533	TGC	2	6	1519700	1519705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516571
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31032	NC_008533	CTT	2	6	1519846	1519851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516571
31033	NC_008533	CTT	2	6	1519865	1519870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516571
31034	NC_008533	TCT	2	6	1519965	1519970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516571
31035	NC_008533	AAC	2	6	1520030	1520035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116516571
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31040	NC_008533	TACG	2	8	1520347	1520354	25 %	25 %	25 %	25 %	116516571
31041	NC_008533	CTT	2	6	1520425	1520430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516571
31042	NC_008533	T	6	6	1520435	1520440	0 %	100 %	0 %	0 %	116516571
31043	NC_008533	AGT	2	6	1520548	1520553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516571
31044	NC_008533	ATC	2	6	1520555	1520560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516571
31045	NC_008533	CTG	2	6	1520803	1520808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516571
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31049	NC_008533	T	7	7	1520980	1520986	0 %	100 %	0 %	0 %	116516571
31050	NC_008533	TTC	2	6	1520992	1520997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31051	NC_008533	T	6	6	1521035	1521040	0 %	100 %	0 %	0 %	116515591
31052	NC_008533	TCA	2	6	1521048	1521053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515591
31053	NC_008533	TCT	2	6	1521081	1521086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515591
31054	NC_008533	TGA	2	6	1521094	1521099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515591
31055	NC_008533	TCA	2	6	1521168	1521173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515591
31056	NC_008533	CTT	2	6	1521220	1521225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515591
31057	NC_008533	GT	3	6	1521263	1521268	0 %	50 %	50 %	0 %	116515591
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31059	NC_008533	T	6	6	1521376	1521381	0 %	100 %	0 %	0 %	116515591
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31062	NC_008533	CCT	2	6	1521470	1521475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31063	NC_008533	TTC	2	6	1521509	1521514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31064	NC_008533	CTA	2	6	1521528	1521533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31065	NC_008533	ACT	2	6	1521549	1521554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31066	NC_008533	CT	3	6	1521553	1521558	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31067	NC_008533	TA	3	6	1521610	1521615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31068	NC_008533	CTA	2	6	1521661	1521666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31069	NC_008533	TCT	2	6	1521678	1521683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31070	NC_008533	TTCA	2	8	1521690	1521697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31071	NC_008533	AGG	2	6	1521718	1521723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31072	NC_008533	AATA	2	8	1521748	1521755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31073	NC_008533	AGTT	2	8	1521756	1521763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31074	NC_008533	CCTT	2	8	1521774	1521781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31075	NC_008533	GAAG	2	8	1521803	1521810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31076	NC_008533	T	6	6	1521821	1521826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31079	NC_008533	TAT	2	6	1521907	1521912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31080	NC_008533	AG	3	6	1521977	1521982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31081	NC_008533	T	11	11	1522042	1522052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31083	NC_008533	AAT	2	6	1522135	1522140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31084	NC_008533	ATA	2	6	1522225	1522230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31085	NC_008533	AATT	2	8	1522277	1522284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31086	NC_008533	GTT	2	6	1522301	1522306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31089	NC_008533	AGT	2	6	1522355	1522360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31090	NC_008533	TCA	2	6	1522396	1522401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31091	NC_008533	A	7	7	1522401	1522407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31092	NC_008533	TTC	2	6	1522467	1522472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31093	NC_008533	TC	3	6	1522482	1522487	0 %	50 %	0 %	50 %	116517141
31094	NC_008533	GAA	2	6	1522514	1522519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116517141
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31100	NC_008533	GGCT	2	8	1522787	1522794	0 %	25 %	50 %	25 %	116517141
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31102	NC_008533	CATTC	2	10	1522922	1522931	20 %	40 %	0 %	40 %	116517141
31103	NC_008533	AGG	2	6	1523040	1523045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116517141
31104	NC_008533	TTG	2	6	1523112	1523117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116517141
31105	NC_008533	TC	3	6	1523164	1523169	0 %	50 %	0 %	50 %	116517141
31106	NC_008533	TTC	2	6	1523384	1523389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116517141
31107	NC_008533	GAT	2	6	1523447	1523452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517141
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31111	NC_008533	ATC	2	6	1523750	1523755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116517141
31112	NC_008533	GAT	2	6	1523762	1523767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517141
31113	NC_008533	ATT	2	6	1523801	1523806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116517141
31114	NC_008533	CGT	2	6	1523950	1523955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116517141
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31116	NC_008533	TGTT	2	8	1524013	1524020	0 %	75 %	25 %	0 %	116517141
31117	NC_008533	ACA	2	6	1524099	1524104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116517141
31118	NC_008533	T	7	7	1524217	1524223	0 %	100 %	0 %	0 %	116517141
31119	NC_008533	CTT	3	9	1524229	1524237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116517141
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31121	NC_008533	ATAG	2	8	1524284	1524291	50 %	25 %	25 %	0 %	116517141
31122	NC_008533	CGAT	2	8	1524352	1524359	25 %	25 %	25 %	25 %	116517141
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31140	NC_008533	CTTT	2	8	1525620	1525627	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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31143	NC_008533	ATG	2	6	1525783	1525788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31151	NC_008533	TC	3	6	1526083	1526088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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31154	NC_008533	AGAT	2	8	1526150	1526157	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31155	NC_008533	TAT	2	6	1526188	1526193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31158	NC_008533	TA	3	6	1526259	1526264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31159	NC_008533	AGT	2	6	1526279	1526284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31163	NC_008533	GGCAA	2	10	1526578	1526587	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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31193	NC_008533	CTTC	2	8	1528110	1528117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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31230	NC_008533	CTTT	2	8	1530268	1530275	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31231	NC_008533	TAA	2	6	1530278	1530283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515765
31232	NC_008533	TC	3	6	1530287	1530292	0 %	50 %	0 %	50 %	116515765
31233	NC_008533	GAG	2	6	1530307	1530312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116515765
31234	NC_008533	ACC	2	6	1530317	1530322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116515765
31235	NC_008533	TCCA	2	8	1530522	1530529	25 %	25 %	0 %	50 %	116515765
31236	NC_008533	CTTC	2	8	1530801	1530808	0 %	50 %	0 %	50 %	116515765
31237	NC_008533	TCA	2	6	1530869	1530874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515765
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31239	NC_008533	CT	3	6	1530958	1530963	0 %	50 %	0 %	50 %	116515765
31240	NC_008533	AATC	2	8	1530987	1530994	50 %	25 %	0 %	25 %	116515765
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31242	NC_008533	CAT	2	6	1531206	1531211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515765
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31244	NC_008533	TTGG	2	8	1531352	1531359	0 %	50 %	50 %	0 %	116515765
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31483	NC_008533	CTT	2	6	1543302	1543307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116517075
31484	NC_008533	GTACC	2	10	1543315	1543324	20 %	20 %	20 %	40 %	116517075
31485	NC_008533	AAT	2	6	1543330	1543335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116517075
31486	NC_008533	CAC	2	6	1543338	1543343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116517075
31487	NC_008533	CAG	2	6	1543366	1543371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116517075
31488	NC_008533	CAG	2	6	1543506	1543511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116517075
31489	NC_008533	CTT	2	6	1543524	1543529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116517075
31490	NC_008533	TCTT	2	8	1543553	1543560	0 %	75 %	0 %	25 %	116517075
31491	NC_008533	TTC	2	6	1543601	1543606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116517075
31492	NC_008533	GAT	2	6	1543610	1543615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517075
31493	NC_008533	GCT	2	6	1543625	1543630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116517075
31494	NC_008533	TCA	2	6	1543701	1543706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116517075
31495	NC_008533	AAGTTG	2	12	1543852	1543863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516206
31496	NC_008533	ATC	2	6	1543962	1543967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516206
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31498	NC_008533	GGA	2	6	1544066	1544071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116516206
31499	NC_008533	TGA	2	6	1544076	1544081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516206
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