MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae D39 chromosome

Total Repeats: 41766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_008533	ATGGA	2	10	685166	685175	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_008533	TTG	2	6	685196	685201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_008533	TTCA	2	8	685209	685216	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14004	NC_008533	CTTT	2	8	685290	685297	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14005	NC_008533	AATA	2	8	685302	685309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_008533	GGA	2	6	685379	685384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_008533	TGA	2	6	685442	685447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516687
14008	NC_008533	GCA	2	6	685450	685455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516687
14009	NC_008533	AGA	2	6	685485	685490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516687
14010	NC_008533	AAT	2	6	685615	685620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116516687
14011	NC_008533	TAT	2	6	685630	685635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516687
14012	NC_008533	CGAAC	2	10	685670	685679	40 %	0 %	20 %	40 %	116516687
14013	NC_008533	TCT	2	6	685682	685687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516687
14014	NC_008533	A	6	6	685732	685737	100 %	0 %	0 %	0 %	116516687
14015	NC_008533	AG	3	6	685743	685748	50 %	0 %	50 %	0 %	116516687
14016	NC_008533	CTGA	2	8	685762	685769	25 %	25 %	25 %	25 %	116516687
14017	NC_008533	ACA	2	6	685828	685833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116516687
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14019	NC_008533	TA	3	6	685993	685998	50 %	50 %	0 %	0 %	116516687
14020	NC_008533	TGG	2	6	686037	686042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116516687
14021	NC_008533	TGG	2	6	686046	686051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116516687
14022	NC_008533	AAG	2	6	686216	686221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516687
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14026	NC_008533	GAA	2	6	686346	686351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_008533	GA	3	6	686354	686359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_008533	GAA	2	6	686374	686379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515334
14029	NC_008533	GAGCCT	2	12	686409	686420	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116515334
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14031	NC_008533	CTG	2	6	686492	686497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515334
14032	NC_008533	AGT	2	6	686529	686534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515334
14033	NC_008533	CTTT	2	8	686570	686577	0 %	75 %	0 %	25 %	116515334
14034	NC_008533	ATT	2	6	686603	686608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515334
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14041	NC_008533	GA	3	6	687069	687074	50 %	0 %	50 %	0 %	116515334
14042	NC_008533	AGT	2	6	687193	687198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515334
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14044	NC_008533	CTTT	2	8	687268	687275	0 %	75 %	0 %	25 %	116515334
14045	NC_008533	AAGC	2	8	687286	687293	50 %	0 %	25 %	25 %	116515334
14046	NC_008533	TTGA	2	8	687304	687311	25 %	50 %	25 %	0 %	116515334
14047	NC_008533	TTG	2	6	687403	687408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_008533	TTATT	2	10	687461	687470	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_008533	A	6	6	687505	687510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_008533	A	6	6	687515	687520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_008533	AGAA	2	8	687549	687556	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_008533	TAT	2	6	687577	687582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515547
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14055	NC_008533	CTTG	2	8	687736	687743	0 %	50 %	25 %	25 %	116515547
14056	NC_008533	CAA	2	6	687787	687792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515547
14057	NC_008533	TGG	2	6	687793	687798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116515547
14058	NC_008533	TGA	2	6	687831	687836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515547
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14063	NC_008533	GCA	3	9	687926	687934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515547
14064	NC_008533	TGGT	2	8	687962	687969	0 %	50 %	50 %	0 %	116515547
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14067	NC_008533	A	6	6	688037	688042	100 %	0 %	0 %	0 %	116515547
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14070	NC_008533	GCT	2	6	688166	688171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515547
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14073	NC_008533	TTC	2	6	688200	688205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14075	NC_008533	T	6	6	688250	688255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_008533	GAC	2	6	688471	688476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516259
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14099	NC_008533	CGT	2	6	689647	689652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516867
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14101	NC_008533	A	6	6	689845	689850	100 %	0 %	0 %	0 %	116516867
14102	NC_008533	TG	3	6	689860	689865	0 %	50 %	50 %	0 %	116516867
14103	NC_008533	A	7	7	689978	689984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_008533	CTC	2	6	690048	690053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116515988
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14106	NC_008533	AGTG	2	8	690142	690149	25 %	25 %	50 %	0 %	116515988
14107	NC_008533	T	7	7	690171	690177	0 %	100 %	0 %	0 %	116515988
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14110	NC_008533	A	6	6	690256	690261	100 %	0 %	0 %	0 %	116515988
14111	NC_008533	CTT	2	6	690266	690271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515988
14112	NC_008533	TGA	2	6	690355	690360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515988
14113	NC_008533	TGGCT	2	10	690390	690399	0 %	40 %	40 %	20 %	116515988
14114	NC_008533	TGC	2	6	690598	690603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516136
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14491	NC_008533	GAT	2	6	709020	709025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515543
14492	NC_008533	ATT	2	6	709086	709091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515543
14493	NC_008533	TAT	2	6	709110	709115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515543
14494	NC_008533	ATC	3	9	709146	709154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515543
14495	NC_008533	CTAGC	2	10	709174	709183	20 %	20 %	20 %	40 %	116515543
14496	NC_008533	AGGTGG	2	12	709184	709195	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	116515543
14497	NC_008533	TGGC	2	8	709225	709232	0 %	25 %	50 %	25 %	116515543
14498	NC_008533	T	7	7	709417	709423	0 %	100 %	0 %	0 %	116515543
14499	NC_008533	AGCG	2	8	709436	709443	25 %	0 %	50 %	25 %	116515543
14500	NC_008533	TGG	2	6	709472	709477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116515543

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