MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae D39 chromosome

Total Repeats: 41766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_008533	TAT	2	6	510125	510130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515619
10503	NC_008533	T	7	7	510175	510181	0 %	100 %	0 %	0 %	116515619
10504	NC_008533	GGC	2	6	510182	510187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116515619
10505	NC_008533	TTC	2	6	510214	510219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515619
10506	NC_008533	GCT	2	6	510252	510257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515619
10507	NC_008533	ATA	3	9	510286	510294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515619
10508	NC_008533	GCA	2	6	510312	510317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515619
10509	NC_008533	A	6	6	510381	510386	100 %	0 %	0 %	0 %	116515619
10510	NC_008533	TGG	3	9	510407	510415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116515619
10511	NC_008533	ATT	2	6	510425	510430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515619
10512	NC_008533	ATTT	2	8	510494	510501	25 %	75 %	0 %	0 %	116515619
10513	NC_008533	GTT	2	6	510555	510560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116515619
10514	NC_008533	TA	3	6	510579	510584	50 %	50 %	0 %	0 %	116515619
10515	NC_008533	GAA	2	6	510597	510602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515619
10516	NC_008533	A	7	7	510645	510651	100 %	0 %	0 %	0 %	116515619
10517	NC_008533	ATT	2	6	510744	510749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515619
10518	NC_008533	AAGGT	2	10	510757	510766	40 %	20 %	40 %	0 %	116515619
10519	NC_008533	TGA	2	6	510833	510838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515619
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10521	NC_008533	AGA	2	6	510911	510916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515619
10522	NC_008533	GTATTA	2	12	511035	511046	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116515619
10523	NC_008533	TAA	2	6	511049	511054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515619
10524	NC_008533	GGA	2	6	511099	511104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_008533	GAT	2	6	511125	511130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515964
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10527	NC_008533	AT	3	6	511309	511314	50 %	50 %	0 %	0 %	116515964
10528	NC_008533	GAA	2	6	511392	511397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515964
10529	NC_008533	ATG	2	6	511423	511428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515964
10530	NC_008533	TGA	2	6	511436	511441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515964
10531	NC_008533	ATGG	2	8	511519	511526	25 %	25 %	50 %	0 %	116515964
10532	NC_008533	GGA	2	6	511656	511661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116515964
10533	NC_008533	CAT	2	6	511713	511718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515964
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10538	NC_008533	T	6	6	511997	512002	0 %	100 %	0 %	0 %	116515964
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10540	NC_008533	TCT	2	6	512106	512111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515964
10541	NC_008533	ATT	2	6	512186	512191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515964
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10543	NC_008533	TAA	2	6	512243	512248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515964
10544	NC_008533	GAT	2	6	512262	512267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515964
10545	NC_008533	ATG	3	9	512428	512436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515964
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10547	NC_008533	TGA	2	6	512535	512540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_008533	GCA	2	6	512562	512567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10549	NC_008533	TTTAT	2	10	512620	512629	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_008533	ATTA	2	8	512636	512643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10551	NC_008533	AG	3	6	512659	512664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10552	NC_008533	TA	4	8	512699	512706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_008533	AATT	2	8	512756	512763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_008533	TAG	2	6	512912	512917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_008533	GAG	2	6	512938	512943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_008533	CT	3	6	512959	512964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10557	NC_008533	GA	3	6	513097	513102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_008533	GGA	2	6	513108	513113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_008533	GAA	2	6	513129	513134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516862
10560	NC_008533	GAA	2	6	513153	513158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516862
10561	NC_008533	CTG	2	6	513184	513189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516862
10562	NC_008533	CTG	2	6	513280	513285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516862
10563	NC_008533	ATC	2	6	513297	513302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516862
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10580	NC_008533	A	6	6	514513	514518	100 %	0 %	0 %	0 %	116516224
10581	NC_008533	ATA	2	6	514554	514559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116516224
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10592	NC_008533	GTC	2	6	514884	514889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116517104
10593	NC_008533	GTCTT	2	10	514896	514905	0 %	60 %	20 %	20 %	116517104
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10597	NC_008533	GAT	2	6	515220	515225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517104
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10599	NC_008533	TG	3	6	515275	515280	0 %	50 %	50 %	0 %	116517104
10600	NC_008533	GACA	2	8	515390	515397	50 %	0 %	25 %	25 %	116517104
10601	NC_008533	ATGC	2	8	515550	515557	25 %	25 %	25 %	25 %	116517104
10602	NC_008533	GAA	2	6	515640	515645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116517104
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10613	NC_008533	CA	3	6	516230	516235	50 %	0 %	0 %	50 %	116517104
10614	NC_008533	CCG	2	6	516242	516247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116517104
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10618	NC_008533	AACA	2	8	516493	516500	75 %	0 %	0 %	25 %	116517104
10619	NC_008533	AGA	2	6	516512	516517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116517104
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10747	NC_008533	AAGC	2	8	523409	523416	50 %	0 %	25 %	25 %	116515732
10748	NC_008533	TGT	2	6	523426	523431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116515732
10749	NC_008533	CTG	2	6	523461	523466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515732
10750	NC_008533	TTC	2	6	523499	523504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515732
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10753	NC_008533	TGG	2	6	523555	523560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116515732
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10755	NC_008533	TCA	2	6	523671	523676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515732
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10757	NC_008533	GCT	2	6	523718	523723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515732
10758	NC_008533	ATC	3	9	523814	523822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515732
10759	NC_008533	TCT	2	6	523852	523857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515732
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10762	NC_008533	ATTG	2	8	523975	523982	25 %	50 %	25 %	0 %	116515732
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10767	NC_008533	GAA	2	6	524177	524182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515732
10768	NC_008533	GAA	2	6	524198	524203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515732
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10772	NC_008533	CTTC	2	8	524344	524351	0 %	50 %	0 %	50 %	116515732
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10774	NC_008533	GTC	2	6	524538	524543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515732
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10780	NC_008533	GAA	2	6	525119	525124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515732
10781	NC_008533	TCTA	2	8	525134	525141	25 %	50 %	0 %	25 %	116515732
10782	NC_008533	ATT	2	6	525179	525184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515732
10783	NC_008533	TGGTT	2	10	525187	525196	0 %	60 %	40 %	0 %	116515732
10784	NC_008533	TCGT	2	8	525234	525241	0 %	50 %	25 %	25 %	116515732
10785	NC_008533	TGA	2	6	525385	525390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515732
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10793	NC_008533	CAGT	2	8	525733	525740	25 %	25 %	25 %	25 %	116516473
10794	NC_008533	GATT	2	8	525784	525791	25 %	50 %	25 %	0 %	116516473
10795	NC_008533	TCTGG	2	10	525815	525824	0 %	40 %	40 %	20 %	116516473
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10797	NC_008533	TTG	2	6	525843	525848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516473
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10802	NC_008533	GAA	2	6	526112	526117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516473
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10805	NC_008533	A	6	6	526246	526251	100 %	0 %	0 %	0 %	116515456
10806	NC_008533	TC	3	6	526299	526304	0 %	50 %	0 %	50 %	116515456
10807	NC_008533	TAT	2	6	526348	526353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515456
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10809	NC_008533	TTA	2	6	526375	526380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515456
10810	NC_008533	GA	4	8	526477	526484	50 %	0 %	50 %	0 %	116515456
10811	NC_008533	CTT	2	6	526490	526495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515456
10812	NC_008533	GTCA	2	8	526506	526513	25 %	25 %	25 %	25 %	116515456
10813	NC_008533	CAGA	2	8	526519	526526	50 %	0 %	25 %	25 %	116515456
10814	NC_008533	T	7	7	526532	526538	0 %	100 %	0 %	0 %	116515456
10815	NC_008533	ATC	2	6	526544	526549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515456
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10817	NC_008533	GA	3	6	526731	526736	50 %	0 %	50 %	0 %	116515456
10818	NC_008533	GATA	2	8	526744	526751	50 %	25 %	25 %	0 %	116515456
10819	NC_008533	TA	3	6	526787	526792	50 %	50 %	0 %	0 %	116515456
10820	NC_008533	TTA	2	6	526795	526800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515456
10821	NC_008533	CAAC	2	8	526929	526936	50 %	0 %	0 %	50 %	116515456
10822	NC_008533	A	6	6	527009	527014	100 %	0 %	0 %	0 %	116515456
10823	NC_008533	GGT	2	6	527037	527042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116515456
10824	NC_008533	TGA	2	6	527117	527122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10825	NC_008533	CAAGAT	2	12	527226	527237	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116517189
10826	NC_008533	TCG	2	6	527313	527318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116517189
10827	NC_008533	GAT	2	6	527374	527379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517189
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10830	NC_008533	CAT	2	6	527523	527528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116517189
10831	NC_008533	GA	3	6	527551	527556	50 %	0 %	50 %	0 %	116517189
10832	NC_008533	TAA	2	6	527628	527633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116517189
10833	NC_008533	GAA	2	6	527677	527682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116517189
10834	NC_008533	GGT	2	6	527842	527847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116517189
10835	NC_008533	CCACA	2	10	527866	527875	40 %	0 %	0 %	60 %	116517189
10836	NC_008533	ACT	2	6	527924	527929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116517189
10837	NC_008533	TCT	2	6	528041	528046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116517189
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10841	NC_008533	TGC	2	6	528225	528230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116517189
10842	NC_008533	ATG	2	6	528284	528289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517189
10843	NC_008533	CAAG	2	8	528297	528304	50 %	0 %	25 %	25 %	116517189
10844	NC_008533	TTG	2	6	528341	528346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116517189
10845	NC_008533	CAG	2	6	528422	528427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116517189
10846	NC_008533	TGAT	2	8	528501	528508	25 %	50 %	25 %	0 %	116517189
10847	NC_008533	AAG	2	6	528621	528626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515371
10848	NC_008533	AGGCTC	2	12	528648	528659	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116515371
10849	NC_008533	GGA	2	6	528679	528684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116515371
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10851	NC_008533	CA	3	6	528743	528748	50 %	0 %	0 %	50 %	116515371
10852	NC_008533	ACCA	2	8	528939	528946	50 %	0 %	0 %	50 %	116516580
10853	NC_008533	CAG	2	6	528986	528991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516580
10854	NC_008533	GGA	2	6	529003	529008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116516580
10855	NC_008533	AGCG	2	8	529019	529026	25 %	0 %	50 %	25 %	116516580
10856	NC_008533	GTTG	2	8	529036	529043	0 %	50 %	50 %	0 %	116516580
10857	NC_008533	CAG	2	6	529055	529060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516580
10858	NC_008533	TCTT	2	8	529159	529166	0 %	75 %	0 %	25 %	116516580
10859	NC_008533	CAG	2	6	529172	529177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516580
10860	NC_008533	CTT	2	6	529188	529193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516580
10861	NC_008533	ATG	2	6	529202	529207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516580
10862	NC_008533	CAA	2	6	529274	529279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116516580
10863	NC_008533	TGG	2	6	529442	529447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116516580
10864	NC_008533	GAT	2	6	529549	529554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516580
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10990	NC_008533	TTC	2	6	535940	535945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515343
10991	NC_008533	CCT	2	6	535961	535966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116515343
10992	NC_008533	TGG	2	6	535982	535987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116515343
10993	NC_008533	TTG	2	6	536009	536014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116515343
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