MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae D39 chromosome

Total Repeats: 41766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_008533	GGT	2	6	484571	484576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116517135
10003	NC_008533	GGCT	2	8	484625	484632	0 %	25 %	50 %	25 %	116517135
10004	NC_008533	GTTT	2	8	484767	484774	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_008533	TGTT	2	8	484813	484820	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_008533	GAG	2	6	484821	484826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_008533	T	6	6	484842	484847	0 %	100 %	0 %	0 %	116515839
10008	NC_008533	TAA	2	6	484885	484890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515839
10009	NC_008533	T	7	7	484928	484934	0 %	100 %	0 %	0 %	116515839
10010	NC_008533	ATT	2	6	484953	484958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515839
10011	NC_008533	TCT	2	6	484964	484969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515839
10012	NC_008533	AAC	2	6	485038	485043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515839
10013	NC_008533	TCTT	2	8	485062	485069	0 %	75 %	0 %	25 %	116515839
10014	NC_008533	TTC	2	6	485103	485108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515839
10015	NC_008533	TCT	2	6	485115	485120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515839
10016	NC_008533	CAG	2	6	485150	485155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515839
10017	NC_008533	AGG	2	6	485206	485211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116515839
10018	NC_008533	CTT	2	6	485229	485234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515839
10019	NC_008533	CT	4	8	485282	485289	0 %	50 %	0 %	50 %	116515839
10020	NC_008533	TTTC	2	8	485290	485297	0 %	75 %	0 %	25 %	116515839
10021	NC_008533	T	6	6	485329	485334	0 %	100 %	0 %	0 %	116515839
10022	NC_008533	TTG	2	6	485349	485354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116515839
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10025	NC_008533	AGA	2	6	485467	485472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_008533	TAG	2	6	485570	485575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_008533	GGA	2	6	485597	485602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_008533	CTAG	2	8	485737	485744	25 %	25 %	25 %	25 %	116516934
10029	NC_008533	ATT	2	6	485763	485768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516934
10030	NC_008533	GTC	2	6	485774	485779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516934
10031	NC_008533	TG	3	6	485801	485806	0 %	50 %	50 %	0 %	116516934
10032	NC_008533	TATGA	2	10	485842	485851	40 %	40 %	20 %	0 %	116516934
10033	NC_008533	TGA	2	6	485903	485908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516934
10034	NC_008533	TAC	2	6	485954	485959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516934
10035	NC_008533	AGTGA	2	10	486010	486019	40 %	20 %	40 %	0 %	116516934
10036	NC_008533	AG	3	6	486052	486057	50 %	0 %	50 %	0 %	116516934
10037	NC_008533	ATTT	2	8	486124	486131	25 %	75 %	0 %	0 %	116516934
10038	NC_008533	GGAA	2	8	486215	486222	50 %	0 %	50 %	0 %	116516934
10039	NC_008533	CTA	2	6	486231	486236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516934
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10043	NC_008533	ACT	2	6	486703	486708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515622
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10045	NC_008533	CGT	2	6	486780	486785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515622
10046	NC_008533	TGCTTT	2	12	487063	487074	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10047	NC_008533	GAG	2	6	487154	487159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_008533	CAA	2	6	487173	487178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116516675
10049	NC_008533	GTCCT	2	10	487344	487353	0 %	40 %	20 %	40 %	116516675
10050	NC_008533	TTG	2	6	487523	487528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516675
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10052	NC_008533	AAAG	2	8	487642	487649	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_008533	GAA	2	6	487674	487679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_008533	GAA	2	6	487719	487724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515364
10055	NC_008533	A	6	6	487737	487742	100 %	0 %	0 %	0 %	116515364
10056	NC_008533	ATC	2	6	487749	487754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515364
10057	NC_008533	AGT	2	6	487760	487765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515364
10058	NC_008533	GTCA	2	8	487801	487808	25 %	25 %	25 %	25 %	116515364
10059	NC_008533	A	6	6	487834	487839	100 %	0 %	0 %	0 %	116515364
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10064	NC_008533	CAT	2	6	488021	488026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515364
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10066	NC_008533	GCAA	2	8	488038	488045	50 %	0 %	25 %	25 %	116515364
10067	NC_008533	GTG	2	6	488251	488256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116515364
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10096	NC_008533	AAG	2	6	489495	489500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516588
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10105	NC_008533	ACG	2	6	489811	489816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516588
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10241	NC_008533	A	6	6	496986	496991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10242	NC_008533	TTTTA	2	10	497008	497017	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10497	NC_008533	A	6	6	509932	509937	100 %	0 %	0 %	0 %	116515619
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10500	NC_008533	TTG	2	6	510046	510051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116515619

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