MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 38104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_008532	ATA	2	6	1852027	1852032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628678
38003	NC_008532	A	6	6	1852032	1852037	100 %	0 %	0 %	0 %	116628678
38004	NC_008532	ATT	2	6	1852143	1852148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628678
38005	NC_008532	TTG	2	6	1852172	1852177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628678
38006	NC_008532	TAAAA	2	10	1852196	1852205	80 %	20 %	0 %	0 %	116628678
38007	NC_008532	TAAA	2	8	1852229	1852236	75 %	25 %	0 %	0 %	116628678
38008	NC_008532	A	7	7	1852287	1852293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38009	NC_008532	CAT	2	6	1852352	1852357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38010	NC_008532	CTA	2	6	1852374	1852379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38011	NC_008532	CCG	2	6	1852450	1852455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38012	NC_008532	TTA	3	9	1852524	1852532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38013	NC_008532	T	6	6	1852560	1852565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38014	NC_008532	A	7	7	1852567	1852573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38015	NC_008532	AAATT	2	10	1852576	1852585	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38016	NC_008532	TA	3	6	1852651	1852656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38017	NC_008532	CTG	2	6	1852742	1852747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38018	NC_008532	A	6	6	1852758	1852763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38019	NC_008532	AAT	2	6	1852814	1852819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628679
38020	NC_008532	TA	3	6	1852847	1852852	50 %	50 %	0 %	0 %	116628679
38021	NC_008532	TGC	2	6	1852890	1852895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628679
38022	NC_008532	CCA	2	6	1852901	1852906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628679
38023	NC_008532	GAT	2	6	1852917	1852922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628679
38024	NC_008532	AAT	2	6	1852923	1852928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628679
38025	NC_008532	AAG	2	6	1852934	1852939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628679
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38027	NC_008532	TCA	2	6	1853015	1853020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628679
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38030	NC_008532	GA	3	6	1853070	1853075	50 %	0 %	50 %	0 %	116628679
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38032	NC_008532	TCA	2	6	1853144	1853149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628679
38033	NC_008532	TAA	2	6	1853198	1853203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628679
38034	NC_008532	CTT	2	6	1853208	1853213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628679
38035	NC_008532	A	8	8	1853217	1853224	100 %	0 %	0 %	0 %	116628679
38036	NC_008532	A	6	6	1853226	1853231	100 %	0 %	0 %	0 %	116628679
38037	NC_008532	A	7	7	1853248	1853254	100 %	0 %	0 %	0 %	116628679
38038	NC_008532	CAA	2	6	1853294	1853299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628679
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38041	NC_008532	TA	3	6	1853391	1853396	50 %	50 %	0 %	0 %	116628679
38042	NC_008532	ACTA	2	8	1853397	1853404	50 %	25 %	0 %	25 %	116628679
38043	NC_008532	T	6	6	1853445	1853450	0 %	100 %	0 %	0 %	116628679
38044	NC_008532	TGA	2	6	1853554	1853559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229072728
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38047	NC_008532	TAA	2	6	1853639	1853644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229072728
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38049	NC_008532	TCT	2	6	1853831	1853836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229072728
38050	NC_008532	TTTC	2	8	1853918	1853925	0 %	75 %	0 %	25 %	229072728
38051	NC_008532	TTA	2	6	1854016	1854021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38052	NC_008532	TATT	2	8	1854027	1854034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38053	NC_008532	ATC	2	6	1854051	1854056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38054	NC_008532	T	7	7	1854062	1854068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38055	NC_008532	T	6	6	1854095	1854100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38056	NC_008532	AAG	2	6	1854145	1854150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38057	NC_008532	A	7	7	1854165	1854171	100 %	0 %	0 %	0 %	116628681
38058	NC_008532	GAA	2	6	1854179	1854184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628681
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38061	NC_008532	CTA	2	6	1854249	1854254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628681
38062	NC_008532	CAG	2	6	1854256	1854261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628681
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38070	NC_008532	TTG	2	6	1854637	1854642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628681
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38082	NC_008532	AAT	2	6	1855428	1855433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38083	NC_008532	T	6	6	1855443	1855448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38088	NC_008532	ATT	2	6	1855616	1855621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628682
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38090	NC_008532	TAT	2	6	1855735	1855740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628682
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38092	NC_008532	TAATT	2	10	1855795	1855804	40 %	60 %	0 %	0 %	116628682
38093	NC_008532	GAG	2	6	1855826	1855831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628682
38094	NC_008532	AT	3	6	1855861	1855866	50 %	50 %	0 %	0 %	116628682
38095	NC_008532	ACT	2	6	1855882	1855887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628682
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38102	NC_008532	CAA	2	6	1856215	1856220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628682
38103	NC_008532	TAT	2	6	1856312	1856317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38104	NC_008532	T	6	6	1856359	1856364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.