MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 38104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_008532	AGC	2	6	1717679	1717684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628547
35002	NC_008532	ATG	2	6	1717752	1717757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628547
35003	NC_008532	AAC	2	6	1717814	1717819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628547
35004	NC_008532	GAC	2	6	1717834	1717839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628547
35005	NC_008532	TCA	2	6	1717920	1717925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628547
35006	NC_008532	ACGA	2	8	1717955	1717962	50 %	0 %	25 %	25 %	116628547
35007	NC_008532	CAC	2	6	1717969	1717974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628547
35008	NC_008532	TTC	2	6	1718045	1718050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628547
35009	NC_008532	TTACC	2	10	1718080	1718089	20 %	40 %	0 %	40 %	116628547
35010	NC_008532	CTT	2	6	1718104	1718109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628547
35011	NC_008532	ATA	2	6	1718130	1718135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628547
35012	NC_008532	CTT	2	6	1718161	1718166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628547
35013	NC_008532	TTC	2	6	1718195	1718200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628547
35014	NC_008532	TTC	2	6	1718237	1718242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628547
35015	NC_008532	CATGT	2	10	1718322	1718331	20 %	40 %	20 %	20 %	116628547
35016	NC_008532	ACG	2	6	1718468	1718473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628547
35017	NC_008532	ACG	2	6	1718513	1718518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628547
35018	NC_008532	CAT	2	6	1718557	1718562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628547
35019	NC_008532	GCA	2	6	1718577	1718582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628547
35020	NC_008532	CAA	2	6	1718620	1718625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628547
35021	NC_008532	ATCA	2	8	1718639	1718646	50 %	25 %	0 %	25 %	116628547
35022	NC_008532	GAC	2	6	1718809	1718814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628547
35023	NC_008532	TCT	2	6	1718826	1718831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628547
35024	NC_008532	TCT	2	6	1718886	1718891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628547
35025	NC_008532	TCG	2	6	1718892	1718897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628547
35026	NC_008532	AACCA	2	10	1718904	1718913	60 %	0 %	0 %	40 %	116628547
35027	NC_008532	TGAA	2	8	1718964	1718971	50 %	25 %	25 %	0 %	116628547
35028	NC_008532	ACC	2	6	1719116	1719121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628547
35029	NC_008532	ACG	2	6	1719140	1719145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628547
35030	NC_008532	TG	3	6	1719148	1719153	0 %	50 %	50 %	0 %	116628547
35031	NC_008532	GAA	2	6	1719201	1719206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628547
35032	NC_008532	GAA	2	6	1719209	1719214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628547
35033	NC_008532	TGA	2	6	1719247	1719252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628547
35034	NC_008532	TGT	2	6	1719255	1719260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628547
35035	NC_008532	CACG	2	8	1719298	1719305	25 %	0 %	25 %	50 %	116628547
35036	NC_008532	AGCA	2	8	1719344	1719351	50 %	0 %	25 %	25 %	116628547
35037	NC_008532	ACG	2	6	1719371	1719376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628547
35038	NC_008532	GGT	2	6	1719385	1719390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628547
35039	NC_008532	ATC	2	6	1719395	1719400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628547
35040	NC_008532	TGT	2	6	1719461	1719466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628547
35041	NC_008532	ATC	2	6	1719482	1719487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628547
35042	NC_008532	CAA	2	6	1719502	1719507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628547
35043	NC_008532	GAA	2	6	1719556	1719561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628547
35044	NC_008532	GT	3	6	1719595	1719600	0 %	50 %	50 %	0 %	116628547
35045	NC_008532	AATC	2	8	1719643	1719650	50 %	25 %	0 %	25 %	116628547
35046	NC_008532	CAA	2	6	1719679	1719684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628547
35047	NC_008532	TTGT	2	8	1719724	1719731	0 %	75 %	25 %	0 %	116628547
35048	NC_008532	T	6	6	1719758	1719763	0 %	100 %	0 %	0 %	116628547
35049	NC_008532	CAG	2	6	1719784	1719789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628547
35050	NC_008532	ACG	2	6	1719800	1719805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628547
35051	NC_008532	CAAG	2	8	1719826	1719833	50 %	0 %	25 %	25 %	116628547
35052	NC_008532	CAG	2	6	1719847	1719852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628547
35053	NC_008532	TCA	2	6	1719900	1719905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628547
35054	NC_008532	CTG	2	6	1719916	1719921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628547
35055	NC_008532	CAA	2	6	1719982	1719987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628547
35056	NC_008532	TCA	2	6	1719993	1719998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628547
35057	NC_008532	GCAC	2	8	1720014	1720021	25 %	0 %	25 %	50 %	116628547
35058	NC_008532	TCAAGC	2	12	1720089	1720100	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116628547
35059	NC_008532	ATA	2	6	1720206	1720211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628547
35060	NC_008532	CAC	2	6	1720216	1720221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628547
35061	NC_008532	TGA	2	6	1720225	1720230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628547
35062	NC_008532	GAA	2	6	1720268	1720273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628547
35063	NC_008532	TAA	2	6	1720309	1720314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628547
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35065	NC_008532	CAT	2	6	1720351	1720356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628547
35066	NC_008532	CTT	2	6	1720366	1720371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628547
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35068	NC_008532	ATTCCA	2	12	1720411	1720422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628547
35069	NC_008532	TGAA	2	8	1720495	1720502	50 %	25 %	25 %	0 %	116628547
35070	NC_008532	TCAA	2	8	1720515	1720522	50 %	25 %	0 %	25 %	116628547
35071	NC_008532	CTT	2	6	1720540	1720545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628547
35072	NC_008532	ACG	2	6	1720562	1720567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628547
35073	NC_008532	TCT	2	6	1720608	1720613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35074	NC_008532	T	6	6	1720677	1720682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35075	NC_008532	AGC	2	6	1720826	1720831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35076	NC_008532	A	6	6	1720844	1720849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35077	NC_008532	CTG	2	6	1720861	1720866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35078	NC_008532	TCAA	2	8	1720889	1720896	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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35082	NC_008532	CAC	2	6	1721088	1721093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628548
35083	NC_008532	AT	3	6	1721252	1721257	50 %	50 %	0 %	0 %	116628548
35084	NC_008532	TCA	2	6	1721303	1721308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628548
35085	NC_008532	CAAC	2	8	1721349	1721356	50 %	0 %	0 %	50 %	116628548
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35087	NC_008532	TAAG	2	8	1721481	1721488	50 %	25 %	25 %	0 %	116628548
35088	NC_008532	ATAA	2	8	1721548	1721555	75 %	25 %	0 %	0 %	116628548
35089	NC_008532	ATCA	2	8	1721581	1721588	50 %	25 %	0 %	25 %	116628548
35090	NC_008532	CTG	2	6	1721641	1721646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628548
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35101	NC_008532	TTG	2	6	1722165	1722170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628548
35102	NC_008532	ACC	2	6	1722184	1722189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628548
35103	NC_008532	CTTGA	2	10	1722252	1722261	20 %	40 %	20 %	20 %	116628548
35104	NC_008532	AAT	2	6	1722282	1722287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628548
35105	NC_008532	TGAC	2	8	1722338	1722345	25 %	25 %	25 %	25 %	116628548
35106	NC_008532	T	6	6	1722494	1722499	0 %	100 %	0 %	0 %	116628548
35107	NC_008532	GCA	2	6	1722587	1722592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628548
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35115	NC_008532	ATA	2	6	1723148	1723153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628548
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35117	NC_008532	TGCT	2	8	1723246	1723253	0 %	50 %	25 %	25 %	116628548
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35234	NC_008532	ATCA	2	8	1728736	1728743	50 %	25 %	0 %	25 %	116628553
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35239	NC_008532	TGGA	2	8	1728901	1728908	25 %	25 %	50 %	0 %	116628553
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35332	NC_008532	GCT	2	6	1732827	1732832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628556
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35339	NC_008532	TTTTC	2	10	1733456	1733465	0 %	80 %	0 %	20 %	116628557
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35342	NC_008532	CAT	2	6	1733565	1733570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628557
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35345	NC_008532	A	6	6	1733674	1733679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35346	NC_008532	AAG	3	9	1733681	1733689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35347	NC_008532	TAAA	2	8	1733698	1733705	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35348	NC_008532	CAT	2	6	1733716	1733721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35349	NC_008532	AT	3	6	1733788	1733793	50 %	50 %	0 %	0 %	116628558
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35472	NC_008532	TA	3	6	1739809	1739814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35473	NC_008532	TCA	2	6	1739864	1739869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35474	NC_008532	ATA	2	6	1739881	1739886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628560
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35476	NC_008532	TCG	2	6	1739950	1739955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628560
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