MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 38104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_008532	CTA	2	6	1621734	1621739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33002	NC_008532	TAAGT	2	10	1621797	1621806	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33003	NC_008532	T	7	7	1621808	1621814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33004	NC_008532	AATC	2	8	1621819	1621826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33005	NC_008532	AGA	2	6	1621903	1621908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33006	NC_008532	TTAA	2	8	1621909	1621916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33007	NC_008532	AAT	2	6	1621935	1621940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33008	NC_008532	AGT	2	6	1621955	1621960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33009	NC_008532	A	6	6	1621967	1621972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33010	NC_008532	TTTC	2	8	1622114	1622121	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33011	NC_008532	TCG	2	6	1622239	1622244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628454
33012	NC_008532	GGA	2	6	1622279	1622284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628454
33013	NC_008532	CAG	2	6	1622354	1622359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628454
33014	NC_008532	ACG	2	6	1622445	1622450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628454
33015	NC_008532	CTT	2	6	1622565	1622570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628454
33016	NC_008532	GTT	2	6	1622586	1622591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628454
33017	NC_008532	ACG	2	6	1622649	1622654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628454
33018	NC_008532	CCT	2	6	1622729	1622734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628454
33019	NC_008532	TAG	2	6	1622811	1622816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628454
33020	NC_008532	GAC	2	6	1622858	1622863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628454
33021	NC_008532	CTA	2	6	1623044	1623049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628454
33022	NC_008532	T	6	6	1623140	1623145	0 %	100 %	0 %	0 %	116628454
33023	NC_008532	TTC	2	6	1623189	1623194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628454
33024	NC_008532	T	7	7	1623414	1623420	0 %	100 %	0 %	0 %	116628454
33025	NC_008532	ACC	2	6	1623481	1623486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628454
33026	NC_008532	GCT	2	6	1623673	1623678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628454
33027	NC_008532	GAT	2	6	1623753	1623758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628454
33028	NC_008532	TG	3	6	1623765	1623770	0 %	50 %	50 %	0 %	116628454
33029	NC_008532	AGA	2	6	1623797	1623802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628454
33030	NC_008532	ATC	2	6	1623969	1623974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628454
33031	NC_008532	AAGG	2	8	1624026	1624033	50 %	0 %	50 %	0 %	116628454
33032	NC_008532	TGA	2	6	1624049	1624054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628454
33033	NC_008532	TCATC	2	10	1624079	1624088	20 %	40 %	0 %	40 %	116628454
33034	NC_008532	CGA	2	6	1624211	1624216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628454
33035	NC_008532	TTC	2	6	1624288	1624293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628454
33036	NC_008532	TCA	2	6	1624315	1624320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628454
33037	NC_008532	ACA	2	6	1624351	1624356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628454
33038	NC_008532	ATA	2	6	1624440	1624445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628454
33039	NC_008532	GTT	2	6	1624558	1624563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628454
33040	NC_008532	CTA	2	6	1624580	1624585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628454
33041	NC_008532	A	6	6	1624705	1624710	100 %	0 %	0 %	0 %	116628454
33042	NC_008532	T	8	8	1624749	1624756	0 %	100 %	0 %	0 %	116628454
33043	NC_008532	TAT	2	6	1624772	1624777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33044	NC_008532	TTGA	2	8	1624800	1624807	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33045	NC_008532	ATAA	2	8	1624851	1624858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33046	NC_008532	AGAA	2	8	1625092	1625099	75 %	0 %	25 %	0 %	116628455
33047	NC_008532	CAT	2	6	1625150	1625155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628455
33048	NC_008532	AAG	2	6	1625249	1625254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628455
33049	NC_008532	ATG	2	6	1625385	1625390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628455
33050	NC_008532	CGT	2	6	1625435	1625440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628455
33051	NC_008532	TGA	2	6	1625455	1625460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628455
33052	NC_008532	TACC	2	8	1625566	1625573	25 %	25 %	0 %	50 %	116628455
33053	NC_008532	GTT	2	6	1625591	1625596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628455
33054	NC_008532	A	6	6	1625661	1625666	100 %	0 %	0 %	0 %	116628455
33055	NC_008532	CTG	2	6	1625745	1625750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628455
33056	NC_008532	ATT	2	6	1625831	1625836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628455
33057	NC_008532	AATC	2	8	1625893	1625900	50 %	25 %	0 %	25 %	116628455
33058	NC_008532	TGA	2	6	1625923	1625928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628455
33059	NC_008532	GTCATT	2	12	1625939	1625950	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116628455
33060	NC_008532	TGG	2	6	1625965	1625970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628455
33061	NC_008532	CTTGGT	2	12	1626181	1626192	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116628455
33062	NC_008532	CTA	2	6	1626288	1626293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628455
33063	NC_008532	ACA	2	6	1626331	1626336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628455
33064	NC_008532	ACCT	2	8	1626379	1626386	25 %	25 %	0 %	50 %	116628455
33065	NC_008532	CGC	2	6	1626437	1626442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116628455
33066	NC_008532	ATT	2	6	1626458	1626463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628455
33067	NC_008532	ATC	2	6	1626512	1626517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628455
33068	NC_008532	TGG	2	6	1626684	1626689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628455
33069	NC_008532	TTC	2	6	1626825	1626830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628455
33070	NC_008532	AAGA	2	8	1626839	1626846	75 %	0 %	25 %	0 %	116628455
33071	NC_008532	TGA	2	6	1626874	1626879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628455
33072	NC_008532	ATC	2	6	1626881	1626886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628455
33073	NC_008532	TCA	2	6	1626960	1626965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628455
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33077	NC_008532	AAG	2	6	1627061	1627066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628455
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33082	NC_008532	TGG	2	6	1627288	1627293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628455
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33084	NC_008532	AT	3	6	1627367	1627372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33085	NC_008532	A	6	6	1627388	1627393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33086	NC_008532	AATT	2	8	1627478	1627485	50 %	50 %	0 %	0 %	116628456
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33089	NC_008532	CA	3	6	1627692	1627697	50 %	0 %	0 %	50 %	116628456
33090	NC_008532	ATA	2	6	1627725	1627730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628456
33091	NC_008532	A	7	7	1627764	1627770	100 %	0 %	0 %	0 %	116628456
33092	NC_008532	TCA	2	6	1627983	1627988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628457
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33098	NC_008532	TTA	2	6	1628286	1628291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33100	NC_008532	CTC	2	6	1628418	1628423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33101	NC_008532	ATC	2	6	1628426	1628431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33102	NC_008532	A	7	7	1628433	1628439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33103	NC_008532	TTC	2	6	1628510	1628515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33104	NC_008532	T	6	6	1628572	1628577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33105	NC_008532	CAG	2	6	1628620	1628625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628458
33106	NC_008532	T	8	8	1628690	1628697	0 %	100 %	0 %	0 %	116628458
33107	NC_008532	CTAG	2	8	1628775	1628782	25 %	25 %	25 %	25 %	116628458
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33113	NC_008532	GGA	2	6	1628999	1629004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628458
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33119	NC_008532	GCT	2	6	1629387	1629392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628458
33120	NC_008532	ACT	2	6	1629429	1629434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628458
33121	NC_008532	A	6	6	1629459	1629464	100 %	0 %	0 %	0 %	116628458
33122	NC_008532	TTC	2	6	1629538	1629543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628459
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33124	NC_008532	ATC	2	6	1629756	1629761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628459
33125	NC_008532	AAG	2	6	1629817	1629822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628459
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33128	NC_008532	CAA	2	6	1629906	1629911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628459
33129	NC_008532	ACT	2	6	1629957	1629962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628459
33130	NC_008532	ATAAG	2	10	1630137	1630146	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33131	NC_008532	TTA	2	6	1630164	1630169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33132	NC_008532	A	6	6	1630180	1630185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33133	NC_008532	ATTTT	2	10	1630197	1630206	20 %	80 %	0 %	0 %	116628460
33134	NC_008532	CAT	2	6	1630224	1630229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628460
33135	NC_008532	T	7	7	1630248	1630254	0 %	100 %	0 %	0 %	116628460
33136	NC_008532	TGA	2	6	1630275	1630280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628460
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33140	NC_008532	GCC	2	6	1630846	1630851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116628460
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33142	NC_008532	CTTG	2	8	1630914	1630921	0 %	50 %	25 %	25 %	116628460
33143	NC_008532	ATA	2	6	1631045	1631050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628460
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33149	NC_008532	ATT	2	6	1631338	1631343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628460
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33156	NC_008532	TAC	2	6	1631550	1631555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628460
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33159	NC_008532	A	6	6	1631749	1631754	100 %	0 %	0 %	0 %	116628460
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33175	NC_008532	TCCA	2	8	1632857	1632864	25 %	25 %	0 %	50 %	116628461
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33190	NC_008532	TAA	2	6	1633415	1633420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628462
33191	NC_008532	GTT	2	6	1633494	1633499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628462
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33194	NC_008532	GAGCC	2	10	1633603	1633612	20 %	0 %	40 %	40 %	116628462
33195	NC_008532	CA	3	6	1633627	1633632	50 %	0 %	0 %	50 %	116628462
33196	NC_008532	CGAA	2	8	1633739	1633746	50 %	0 %	25 %	25 %	116628462
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33198	NC_008532	TTC	2	6	1633802	1633807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33199	NC_008532	TTC	2	6	1633811	1633816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628463
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33220	NC_008532	TACAGC	2	12	1634579	1634590	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116628463
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33227	NC_008532	AT	3	6	1634805	1634810	50 %	50 %	0 %	0 %	116628463
33228	NC_008532	TCC	2	6	1634852	1634857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628464
33229	NC_008532	ATA	2	6	1634869	1634874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628464
33230	NC_008532	AAGA	2	8	1634953	1634960	75 %	0 %	25 %	0 %	116628464
33231	NC_008532	CTC	2	6	1634974	1634979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628464
33232	NC_008532	TCA	2	6	1634988	1634993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628464
33233	NC_008532	ACTG	2	8	1634994	1635001	25 %	25 %	25 %	25 %	116628464
33234	NC_008532	A	6	6	1635080	1635085	100 %	0 %	0 %	0 %	116628464
33235	NC_008532	CAA	2	6	1635087	1635092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628464
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33237	NC_008532	AGT	2	6	1635124	1635129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628464
33238	NC_008532	ACC	2	6	1635149	1635154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628464
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33253	NC_008532	TAT	2	6	1635953	1635958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33259	NC_008532	T	7	7	1636142	1636148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33261	NC_008532	T	6	6	1636199	1636204	0 %	100 %	0 %	0 %	116628466
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33337	NC_008532	AT	3	6	1639342	1639347	50 %	50 %	0 %	0 %	116628468
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33343	NC_008532	CTT	2	6	1639511	1639516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628468
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33357	NC_008532	GCT	2	6	1640260	1640265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628468
33358	NC_008532	ATA	2	6	1640275	1640280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628468
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33360	NC_008532	TCA	2	6	1640386	1640391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628469
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33367	NC_008532	ATTTT	2	10	1640823	1640832	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33368	NC_008532	A	6	6	1640833	1640838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33369	NC_008532	A	6	6	1640842	1640847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33370	NC_008532	AATCAT	2	12	1640895	1640906	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116628470
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33380	NC_008532	A	6	6	1641435	1641440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33381	NC_008532	ATTCA	2	10	1641476	1641485	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33382	NC_008532	A	7	7	1641488	1641494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33383	NC_008532	CAT	2	6	1641602	1641607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33385	NC_008532	TTA	2	6	1641627	1641632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33386	NC_008532	CAT	2	6	1641670	1641675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33388	NC_008532	ACA	2	6	1641777	1641782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33389	NC_008532	TAA	2	6	1641936	1641941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33390	NC_008532	A	6	6	1641966	1641971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33394	NC_008532	CAAG	2	8	1642187	1642194	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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33398	NC_008532	CT	3	6	1642414	1642419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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33424	NC_008532	GCA	2	6	1643582	1643587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628471
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33428	NC_008532	TAG	2	6	1643794	1643799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33430	NC_008532	TAAA	2	8	1643859	1643866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33431	NC_008532	A	6	6	1643873	1643878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33434	NC_008532	AGCTTC	2	12	1644032	1644043	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116628472
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33440	NC_008532	TTAG	2	8	1644227	1644234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33441	NC_008532	TAGA	2	8	1644284	1644291	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33442	NC_008532	TAT	2	6	1644316	1644321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628473
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33447	NC_008532	GATT	2	8	1644438	1644445	25 %	50 %	25 %	0 %	116628473
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33453	NC_008532	AGA	2	6	1644646	1644651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33464	NC_008532	TCG	2	6	1645091	1645096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628475
33465	NC_008532	TTC	2	6	1645109	1645114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628475
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33472	NC_008532	TCTT	2	8	1645495	1645502	0 %	75 %	0 %	25 %	116628476
33473	NC_008532	ACTT	2	8	1645550	1645557	25 %	50 %	0 %	25 %	116628476
33474	NC_008532	ATT	2	6	1645592	1645597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628476
33475	NC_008532	ACA	4	12	1645598	1645609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628476
33476	NC_008532	ACT	2	6	1645659	1645664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33477	NC_008532	AACCA	2	10	1645727	1645736	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
33478	NC_008532	GAA	2	6	1645744	1645749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33479	NC_008532	TTA	2	6	1645760	1645765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33480	NC_008532	CAT	2	6	1645874	1645879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33481	NC_008532	GAT	2	6	1645899	1645904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33482	NC_008532	CTA	2	6	1645966	1645971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33483	NC_008532	A	6	6	1645978	1645983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33484	NC_008532	AGA	2	6	1646125	1646130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33485	NC_008532	CTG	2	6	1646204	1646209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33486	NC_008532	CGC	2	6	1646305	1646310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33487	NC_008532	ACT	2	6	1646314	1646319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33488	NC_008532	ACT	2	6	1646327	1646332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33489	NC_008532	CAT	2	6	1646456	1646461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33490	NC_008532	AAG	2	6	1646520	1646525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33491	NC_008532	TC	3	6	1646589	1646594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33492	NC_008532	CAC	2	6	1646632	1646637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33493	NC_008532	GTT	2	6	1646643	1646648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33494	NC_008532	ACT	2	6	1646683	1646688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33495	NC_008532	GCTTTT	2	12	1646702	1646713	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33496	NC_008532	AG	3	6	1646728	1646733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33497	NC_008532	ATT	2	6	1646782	1646787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33498	NC_008532	TAA	2	6	1646879	1646884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33499	NC_008532	AAG	2	6	1646940	1646945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33500	NC_008532	TCA	2	6	1646953	1646958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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