MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 38104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31502	NC_008532	TTA	3	9	1546881	1546889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628379
31503	NC_008532	CCA	2	6	1546987	1546992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628379
31504	NC_008532	GAA	2	6	1547015	1547020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628379
31505	NC_008532	TGACA	2	10	1547066	1547075	40 %	20 %	20 %	20 %	116628379
31506	NC_008532	CCA	2	6	1547079	1547084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628379
31507	NC_008532	AG	3	6	1547097	1547102	50 %	0 %	50 %	0 %	116628379
31508	NC_008532	TGG	2	6	1547113	1547118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628379
31509	NC_008532	AAG	2	6	1547158	1547163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628379
31510	NC_008532	GCC	2	6	1547277	1547282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116628379
31511	NC_008532	GACCC	2	10	1547351	1547360	20 %	0 %	20 %	60 %	116628379
31512	NC_008532	AGG	2	6	1547369	1547374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628379
31513	NC_008532	ACC	2	6	1547449	1547454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31514	NC_008532	TGAT	2	8	1547467	1547474	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31515	NC_008532	A	7	7	1547480	1547486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31516	NC_008532	GAT	2	6	1547515	1547520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31517	NC_008532	TCT	2	6	1547566	1547571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31518	NC_008532	CAT	2	6	1547663	1547668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31519	NC_008532	CTT	2	6	1547710	1547715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628380
31520	NC_008532	TCA	2	6	1547738	1547743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628380
31521	NC_008532	CT	3	6	1547755	1547760	0 %	50 %	0 %	50 %	116628380
31522	NC_008532	AGTT	2	8	1547781	1547788	25 %	50 %	25 %	0 %	116628380
31523	NC_008532	CT	4	8	1547836	1547843	0 %	50 %	0 %	50 %	116628380
31524	NC_008532	ATA	2	6	1547882	1547887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628380
31525	NC_008532	TTG	2	6	1547935	1547940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31526	NC_008532	ACT	2	6	1547961	1547966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31527	NC_008532	TGT	2	6	1548029	1548034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31528	NC_008532	GA	3	6	1548043	1548048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31529	NC_008532	T	6	6	1548084	1548089	0 %	100 %	0 %	0 %	116628381
31530	NC_008532	AGG	2	6	1548122	1548127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628381
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31533	NC_008532	ATC	2	6	1548175	1548180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628381
31534	NC_008532	CAC	2	6	1548433	1548438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628381
31535	NC_008532	CAA	2	6	1548503	1548508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628381
31536	NC_008532	TTC	2	6	1548558	1548563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628381
31537	NC_008532	GTC	2	6	1548599	1548604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628381
31538	NC_008532	CTTA	2	8	1548616	1548623	25 %	50 %	0 %	25 %	116628382
31539	NC_008532	AGC	2	6	1548701	1548706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628382
31540	NC_008532	ACGA	2	8	1548731	1548738	50 %	0 %	25 %	25 %	116628382
31541	NC_008532	GGT	2	6	1548907	1548912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628382
31542	NC_008532	ACG	2	6	1548950	1548955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628382
31543	NC_008532	GTTG	2	8	1548956	1548963	0 %	50 %	50 %	0 %	116628382
31544	NC_008532	ATG	2	6	1549026	1549031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628382
31545	NC_008532	AAG	2	6	1549191	1549196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628382
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31547	NC_008532	TCACCA	2	12	1549263	1549274	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	116628382
31548	NC_008532	TCA	2	6	1549278	1549283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628382
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31551	NC_008532	GTT	2	6	1549339	1549344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628382
31552	NC_008532	CA	3	6	1549403	1549408	50 %	0 %	0 %	50 %	116628382
31553	NC_008532	GACA	2	8	1549409	1549416	50 %	0 %	25 %	25 %	116628382
31554	NC_008532	TCAA	2	8	1549446	1549453	50 %	25 %	0 %	25 %	116628382
31555	NC_008532	TTC	2	6	1549586	1549591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628382
31556	NC_008532	CTT	2	6	1549607	1549612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628382
31557	NC_008532	T	8	8	1549646	1549653	0 %	100 %	0 %	0 %	116628382
31558	NC_008532	TCAA	2	8	1549674	1549681	50 %	25 %	0 %	25 %	116628382
31559	NC_008532	TCA	2	6	1549683	1549688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628382
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31563	NC_008532	T	6	6	1549869	1549874	0 %	100 %	0 %	0 %	116628383
31564	NC_008532	TCT	2	6	1549882	1549887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628383
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31567	NC_008532	TC	3	6	1550074	1550079	0 %	50 %	0 %	50 %	116628383
31568	NC_008532	GAA	2	6	1550091	1550096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628383
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31571	NC_008532	ACG	2	6	1550114	1550119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628383
31572	NC_008532	CGA	2	6	1550127	1550132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628383
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31575	NC_008532	CT	3	6	1550528	1550533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31576	NC_008532	ATT	2	6	1550591	1550596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628384
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31589	NC_008532	TAT	2	6	1551212	1551217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628384
31590	NC_008532	CAG	2	6	1551271	1551276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628384
31591	NC_008532	TCA	2	6	1551378	1551383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628384
31592	NC_008532	AGGTA	2	10	1551502	1551511	40 %	20 %	40 %	0 %	116628384
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31597	NC_008532	ATC	2	6	1551836	1551841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628384
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31599	NC_008532	CATT	2	8	1551961	1551968	25 %	50 %	0 %	25 %	116628384
31600	NC_008532	T	6	6	1552012	1552017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31601	NC_008532	ATG	2	6	1552041	1552046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31602	NC_008532	T	6	6	1552047	1552052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31603	NC_008532	ATG	2	6	1552113	1552118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31604	NC_008532	AC	3	6	1552123	1552128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31605	NC_008532	AC	4	8	1552155	1552162	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31606	NC_008532	CTAA	2	8	1552201	1552208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31607	NC_008532	CAA	2	6	1552278	1552283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31611	NC_008532	TAT	2	6	1552498	1552503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31613	NC_008532	A	6	6	1552519	1552524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31614	NC_008532	CTTTTA	2	12	1552575	1552586	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31615	NC_008532	TCT	2	6	1552594	1552599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31616	NC_008532	AAT	2	6	1552687	1552692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31617	NC_008532	T	6	6	1552733	1552738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31618	NC_008532	CTT	2	6	1552783	1552788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628386
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31620	NC_008532	TCT	2	6	1552872	1552877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628386
31621	NC_008532	T	7	7	1552893	1552899	0 %	100 %	0 %	0 %	116628386
31622	NC_008532	TCT	2	6	1552905	1552910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628386
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31721	NC_008532	CACGCT	2	12	1558403	1558414	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116628390
31722	NC_008532	AC	3	6	1558469	1558474	50 %	0 %	0 %	50 %	116628390
31723	NC_008532	TAT	2	6	1558764	1558769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31724	NC_008532	GTT	2	6	1558804	1558809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31725	NC_008532	A	6	6	1558818	1558823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31726	NC_008532	TGAT	2	8	1558847	1558854	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31727	NC_008532	AT	3	6	1558853	1558858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31728	NC_008532	TAA	3	9	1558885	1558893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31729	NC_008532	GT	3	6	1558996	1559001	0 %	50 %	50 %	0 %	116628391
31730	NC_008532	GGAAT	2	10	1559010	1559019	40 %	20 %	40 %	0 %	116628391
31731	NC_008532	TA	3	6	1559035	1559040	50 %	50 %	0 %	0 %	116628391
31732	NC_008532	TCA	2	6	1559190	1559195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628391
31733	NC_008532	TGAGCT	2	12	1559204	1559215	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116628391
31734	NC_008532	ATG	2	6	1559230	1559235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628391
31735	NC_008532	ACT	2	6	1559243	1559248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628391
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31737	NC_008532	TCC	2	6	1559271	1559276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628391
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31979	NC_008532	CTG	2	6	1571281	1571286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628401
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