MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 38104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_008532	TAT	2	6	1522256	1522261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31002	NC_008532	CAT	2	6	1522362	1522367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31003	NC_008532	TCT	2	6	1522387	1522392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31004	NC_008532	AGC	2	6	1522423	1522428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31005	NC_008532	T	6	6	1522432	1522437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31006	NC_008532	ATC	2	6	1522452	1522457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628349
31007	NC_008532	CTT	2	6	1522490	1522495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628349
31008	NC_008532	T	6	6	1522518	1522523	0 %	100 %	0 %	0 %	116628349
31009	NC_008532	AAC	2	6	1522533	1522538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628349
31010	NC_008532	TGG	2	6	1522634	1522639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628349
31011	NC_008532	A	6	6	1522647	1522652	100 %	0 %	0 %	0 %	116628349
31012	NC_008532	TTG	2	6	1522659	1522664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628349
31013	NC_008532	TGCA	2	8	1522743	1522750	25 %	25 %	25 %	25 %	116628349
31014	NC_008532	TTG	2	6	1522848	1522853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628349
31015	NC_008532	CAC	2	6	1522903	1522908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628349
31016	NC_008532	CCT	2	6	1522942	1522947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31017	NC_008532	A	6	6	1522949	1522954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31018	NC_008532	CTTC	2	8	1523070	1523077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31019	NC_008532	TAT	2	6	1523104	1523109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31020	NC_008532	CGG	2	6	1523127	1523132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31021	NC_008532	A	7	7	1523237	1523243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31022	NC_008532	TATC	2	8	1523263	1523270	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31023	NC_008532	GT	3	6	1523285	1523290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31024	NC_008532	AT	3	6	1523291	1523296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31025	NC_008532	ATC	2	6	1523308	1523313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31026	NC_008532	TCAA	2	8	1523314	1523321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31027	NC_008532	CAT	2	6	1523534	1523539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628350
31028	NC_008532	GACT	2	8	1523548	1523555	25 %	25 %	25 %	25 %	116628350
31029	NC_008532	TGGT	2	8	1523581	1523588	0 %	50 %	50 %	0 %	116628350
31030	NC_008532	CACG	2	8	1523611	1523618	25 %	0 %	25 %	50 %	116628350
31031	NC_008532	AGCC	2	8	1523714	1523721	25 %	0 %	25 %	50 %	116628350
31032	NC_008532	TAA	2	6	1523846	1523851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628350
31033	NC_008532	T	6	6	1523888	1523893	0 %	100 %	0 %	0 %	116628350
31034	NC_008532	CAT	2	6	1523927	1523932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628350
31035	NC_008532	TTG	2	6	1523952	1523957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628350
31036	NC_008532	ACA	2	6	1524003	1524008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628350
31037	NC_008532	CCAAG	2	10	1524040	1524049	40 %	0 %	20 %	40 %	116628350
31038	NC_008532	CGA	2	6	1524076	1524081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628350
31039	NC_008532	GCC	2	6	1524093	1524098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116628350
31040	NC_008532	TAT	2	6	1524112	1524117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628350
31041	NC_008532	GCA	2	6	1524182	1524187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628351
31042	NC_008532	TTA	2	6	1524272	1524277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628351
31043	NC_008532	TAA	2	6	1524307	1524312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628351
31044	NC_008532	CAC	2	6	1524366	1524371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628351
31045	NC_008532	GTTC	2	8	1524401	1524408	0 %	50 %	25 %	25 %	116628351
31046	NC_008532	ATT	2	6	1524421	1524426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628351
31047	NC_008532	GTT	2	6	1524522	1524527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628351
31048	NC_008532	GCC	2	6	1524546	1524551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116628351
31049	NC_008532	CAC	2	6	1524657	1524662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628351
31050	NC_008532	CAAT	2	8	1524707	1524714	50 %	25 %	0 %	25 %	116628351
31051	NC_008532	C	6	6	1524788	1524793	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31052	NC_008532	ACA	2	6	1524816	1524821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31053	NC_008532	ATT	2	6	1524982	1524987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628352
31054	NC_008532	CTT	2	6	1525019	1525024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628352
31055	NC_008532	TCAA	2	8	1525032	1525039	50 %	25 %	0 %	25 %	116628352
31056	NC_008532	AAT	2	6	1525163	1525168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628352
31057	NC_008532	CTT	2	6	1525205	1525210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628352
31058	NC_008532	ATC	2	6	1525247	1525252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628352
31059	NC_008532	AAT	2	6	1525258	1525263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628352
31060	NC_008532	CTG	2	6	1525306	1525311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628352
31061	NC_008532	TG	3	6	1525316	1525321	0 %	50 %	50 %	0 %	116628352
31062	NC_008532	TCC	2	6	1525358	1525363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628352
31063	NC_008532	TG	3	6	1525410	1525415	0 %	50 %	50 %	0 %	116628352
31064	NC_008532	GCA	2	6	1525566	1525571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628352
31065	NC_008532	TCA	2	6	1525593	1525598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628352
31066	NC_008532	CTA	2	6	1525626	1525631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628352
31067	NC_008532	AAG	2	6	1525637	1525642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628352
31068	NC_008532	ATA	2	6	1525679	1525684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628352
31069	NC_008532	AGA	2	6	1525729	1525734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628352
31070	NC_008532	CTAG	2	8	1525770	1525777	25 %	25 %	25 %	25 %	116628352
31071	NC_008532	AGT	2	6	1525828	1525833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628352
31072	NC_008532	CAT	2	6	1525852	1525857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628352
31073	NC_008532	TGTT	2	8	1525919	1525926	0 %	75 %	25 %	0 %	116628352
31074	NC_008532	ATT	2	6	1525938	1525943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628352
31075	NC_008532	TCAG	2	8	1525973	1525980	25 %	25 %	25 %	25 %	116628353
31076	NC_008532	ACTT	2	8	1526113	1526120	25 %	50 %	0 %	25 %	116628353
31077	NC_008532	GATA	2	8	1526152	1526159	50 %	25 %	25 %	0 %	116628353
31078	NC_008532	TTC	2	6	1526167	1526172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628353
31079	NC_008532	A	6	6	1526192	1526197	100 %	0 %	0 %	0 %	116628353
31080	NC_008532	ACA	2	6	1526216	1526221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628353
31081	NC_008532	TCAAAG	2	12	1526223	1526234	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116628353
31082	NC_008532	T	8	8	1526269	1526276	0 %	100 %	0 %	0 %	116628353
31083	NC_008532	ATC	2	6	1526317	1526322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628353
31084	NC_008532	ATC	2	6	1526413	1526418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628353
31085	NC_008532	TTA	2	6	1526471	1526476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628353
31086	NC_008532	CTC	2	6	1526521	1526526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628353
31087	NC_008532	CAGT	2	8	1526555	1526562	25 %	25 %	25 %	25 %	116628353
31088	NC_008532	TAT	2	6	1526640	1526645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628353
31089	NC_008532	GT	3	6	1526661	1526666	0 %	50 %	50 %	0 %	116628353
31090	NC_008532	TG	3	6	1526733	1526738	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31091	NC_008532	AAG	2	6	1526741	1526746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31092	NC_008532	T	6	6	1526772	1526777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31093	NC_008532	ATTAT	2	10	1526806	1526815	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31094	NC_008532	TTC	2	6	1526837	1526842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31095	NC_008532	ATA	2	6	1526853	1526858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31096	NC_008532	TAC	2	6	1526922	1526927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31097	NC_008532	G	6	6	1526930	1526935	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31098	NC_008532	T	6	6	1526945	1526950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31099	NC_008532	TCC	2	6	1527037	1527042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31100	NC_008532	TGA	2	6	1527058	1527063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31101	NC_008532	CTT	2	6	1527071	1527076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31102	NC_008532	ACT	2	6	1527083	1527088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31103	NC_008532	TTGG	2	8	1527110	1527117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31104	NC_008532	CCA	2	6	1527178	1527183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31105	NC_008532	CT	4	8	1527223	1527230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31106	NC_008532	A	6	6	1527241	1527246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31107	NC_008532	A	6	6	1527385	1527390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31108	NC_008532	T	6	6	1527411	1527416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31109	NC_008532	ATT	2	6	1527417	1527422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31110	NC_008532	AG	3	6	1527433	1527438	50 %	0 %	50 %	0 %	116628354
31111	NC_008532	ACC	2	6	1527502	1527507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628354
31112	NC_008532	GAA	2	6	1527559	1527564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628354
31113	NC_008532	AGC	2	6	1527632	1527637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628354
31114	NC_008532	CAG	2	6	1527715	1527720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628354
31115	NC_008532	TTG	2	6	1527728	1527733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628354
31116	NC_008532	AGT	2	6	1527751	1527756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628354
31117	NC_008532	CAAGG	2	10	1527764	1527773	40 %	0 %	40 %	20 %	116628354
31118	NC_008532	AGA	2	6	1527781	1527786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628354
31119	NC_008532	GGA	2	6	1527787	1527792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628354
31120	NC_008532	ACGATT	2	12	1527833	1527844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116628354
31121	NC_008532	TCA	2	6	1527855	1527860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628354
31122	NC_008532	CTG	2	6	1527871	1527876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628354
31123	NC_008532	GCA	2	6	1528032	1528037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628354
31124	NC_008532	CAT	2	6	1528100	1528105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628354
31125	NC_008532	AAC	2	6	1528224	1528229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628354
31126	NC_008532	CTT	2	6	1528267	1528272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628354
31127	NC_008532	TCAT	2	8	1528281	1528288	25 %	50 %	0 %	25 %	116628354
31128	NC_008532	AAT	2	6	1528317	1528322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31129	NC_008532	TAT	2	6	1528386	1528391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31130	NC_008532	CAGTT	2	10	1528421	1528430	20 %	40 %	20 %	20 %	116628355
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31132	NC_008532	AGAC	2	8	1528596	1528603	50 %	0 %	25 %	25 %	116628355
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31194	NC_008532	A	7	7	1532274	1532280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31232	NC_008532	CAACCA	2	12	1533861	1533872	50 %	0 %	0 %	50 %	116628362
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31236	NC_008532	ACT	2	6	1533965	1533970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628362
31237	NC_008532	TTG	2	6	1534020	1534025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628362
31238	NC_008532	GAA	2	6	1534107	1534112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628363
31239	NC_008532	CTGCAG	2	12	1534124	1534135	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116628363
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31481	NC_008532	TCC	2	6	1545746	1545751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628379
31482	NC_008532	ACCA	2	8	1545790	1545797	50 %	0 %	0 %	50 %	116628379
31483	NC_008532	GTC	2	6	1545812	1545817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628379
31484	NC_008532	CAC	2	6	1545875	1545880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628379
31485	NC_008532	TAA	2	6	1545901	1545906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628379
31486	NC_008532	GTT	2	6	1545909	1545914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628379
31487	NC_008532	AAT	2	6	1545944	1545949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628379
31488	NC_008532	CAAAAT	2	12	1545992	1546003	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116628379
31489	NC_008532	GTT	2	6	1546042	1546047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628379
31490	NC_008532	ACC	2	6	1546052	1546057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628379
31491	NC_008532	ATC	2	6	1546118	1546123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628379
31492	NC_008532	CTT	2	6	1546147	1546152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628379
31493	NC_008532	ATGTC	2	10	1546281	1546290	20 %	40 %	20 %	20 %	116628379
31494	NC_008532	TTGA	2	8	1546310	1546317	25 %	50 %	25 %	0 %	116628379
31495	NC_008532	CCAA	2	8	1546374	1546381	50 %	0 %	0 %	50 %	116628379
31496	NC_008532	ATCCTC	2	12	1546430	1546441	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	116628379
31497	NC_008532	AAAGC	2	10	1546443	1546452	60 %	0 %	20 %	20 %	116628379
31498	NC_008532	TAA	2	6	1546633	1546638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628379
31499	NC_008532	AGG	2	6	1546695	1546700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628379
31500	NC_008532	CAA	2	6	1546720	1546725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628379

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