MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 38104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_008532	ATG	2	6	1470121	1470126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628295
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30004	NC_008532	A	7	7	1470173	1470179	100 %	0 %	0 %	0 %	116628295
30005	NC_008532	TGG	3	9	1470210	1470218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628295
30006	NC_008532	ATT	2	6	1470325	1470330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628295
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30010	NC_008532	CTA	2	6	1470452	1470457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628295
30011	NC_008532	A	6	6	1470487	1470492	100 %	0 %	0 %	0 %	116628295
30012	NC_008532	CTT	2	6	1470754	1470759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628295
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30099	NC_008532	ATC	2	6	1476127	1476132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628302
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30101	NC_008532	T	6	6	1476340	1476345	0 %	100 %	0 %	0 %	116628303
30102	NC_008532	ACTGTT	2	12	1476353	1476364	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116628303
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30104	NC_008532	ATTC	2	8	1476414	1476421	25 %	50 %	0 %	25 %	116628303
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30106	NC_008532	CTTT	2	8	1476645	1476652	0 %	75 %	0 %	25 %	116628303
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30109	NC_008532	TAT	2	6	1476738	1476743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628303
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30111	NC_008532	ACT	2	6	1476785	1476790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628303
30112	NC_008532	TAAGAC	2	12	1476904	1476915	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116628303
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30114	NC_008532	T	7	7	1476954	1476960	0 %	100 %	0 %	0 %	116628303
30115	NC_008532	TTCA	2	8	1476968	1476975	25 %	50 %	0 %	25 %	116628303
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30117	NC_008532	ATC	2	6	1477112	1477117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628304
30118	NC_008532	AATTT	2	10	1477156	1477165	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30119	NC_008532	AT	10	20	1477175	1477194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30120	NC_008532	ATATA	2	10	1477224	1477233	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30121	NC_008532	TCATA	2	10	1477245	1477254	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30122	NC_008532	ATT	2	6	1477257	1477262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30220	NC_008532	TTTTTC	2	12	1482378	1482389	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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30222	NC_008532	CAA	2	6	1482474	1482479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30226	NC_008532	CTT	2	6	1482681	1482686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628308
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30230	NC_008532	TAAT	2	8	1482878	1482885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30231	NC_008532	TTGCT	2	10	1483014	1483023	0 %	60 %	20 %	20 %	116628309
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30234	NC_008532	T	6	6	1483227	1483232	0 %	100 %	0 %	0 %	116628309
30235	NC_008532	AGG	2	6	1483309	1483314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628309
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30237	NC_008532	TCA	2	6	1483441	1483446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628309
30238	NC_008532	CTT	2	6	1483547	1483552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628310
30239	NC_008532	CAA	2	6	1483654	1483659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628310
30240	NC_008532	TCA	2	6	1483680	1483685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628310
30241	NC_008532	GGTA	2	8	1483701	1483708	25 %	25 %	50 %	0 %	116628310
30242	NC_008532	AAT	2	6	1483727	1483732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628310
30243	NC_008532	TAA	2	6	1483737	1483742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628310
30244	NC_008532	TCA	2	6	1483884	1483889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628310
30245	NC_008532	T	6	6	1483898	1483903	0 %	100 %	0 %	0 %	116628310
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30247	NC_008532	CTG	2	6	1483958	1483963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628310
30248	NC_008532	CAA	2	6	1483978	1483983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628310
30249	NC_008532	TTC	2	6	1484057	1484062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628310
30250	NC_008532	T	6	6	1484139	1484144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30251	NC_008532	T	6	6	1484256	1484261	0 %	100 %	0 %	0 %	116628311
30252	NC_008532	TCT	2	6	1484323	1484328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628311
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30257	NC_008532	GAT	2	6	1484564	1484569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30258	NC_008532	T	6	6	1484604	1484609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30259	NC_008532	T	6	6	1484737	1484742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30260	NC_008532	AAT	2	6	1484770	1484775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628312
30261	NC_008532	GCA	2	6	1484816	1484821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628312
30262	NC_008532	TGGT	3	12	1484826	1484837	0 %	50 %	50 %	0 %	116628312
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30289	NC_008532	CTT	2	6	1486436	1486441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30290	NC_008532	TG	3	6	1486466	1486471	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30291	NC_008532	T	6	6	1486486	1486491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30292	NC_008532	AAC	2	6	1486495	1486500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30293	NC_008532	AAAGA	2	10	1486515	1486524	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30294	NC_008532	T	6	6	1486560	1486565	0 %	100 %	0 %	0 %	116628314
30295	NC_008532	ATG	3	9	1486598	1486606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628314
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30298	NC_008532	ACCAA	2	10	1486790	1486799	60 %	0 %	0 %	40 %	116628314
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30302	NC_008532	CA	3	6	1487109	1487114	50 %	0 %	0 %	50 %	116628314
30303	NC_008532	AGACC	2	10	1487211	1487220	40 %	0 %	20 %	40 %	116628314
30304	NC_008532	TACT	2	8	1487241	1487248	25 %	50 %	0 %	25 %	116628314
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30307	NC_008532	TATT	2	8	1487490	1487497	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30308	NC_008532	CCA	2	6	1487570	1487575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628315
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30315	NC_008532	TTTA	2	8	1488013	1488020	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30316	NC_008532	TCT	2	6	1488025	1488030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628317
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30339	NC_008532	GTTC	2	8	1489367	1489374	0 %	50 %	25 %	25 %	116628317
30340	NC_008532	ATTCA	2	10	1489416	1489425	40 %	40 %	0 %	20 %	116628317
30341	NC_008532	GTT	2	6	1489489	1489494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628318
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30345	NC_008532	GTA	2	6	1489823	1489828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628318
30346	NC_008532	ACG	2	6	1489862	1489867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628318
30347	NC_008532	TCA	2	6	1489875	1489880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628318
30348	NC_008532	ATG	2	6	1490001	1490006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628318
30349	NC_008532	TAG	2	6	1490007	1490012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628318
30350	NC_008532	AGGC	2	8	1490036	1490043	25 %	0 %	50 %	25 %	116628318
30351	NC_008532	CAA	2	6	1490368	1490373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628318
30352	NC_008532	GCT	2	6	1490454	1490459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628318
30353	NC_008532	CCA	2	6	1490478	1490483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628318
30354	NC_008532	AAG	2	6	1490527	1490532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628318
30355	NC_008532	GTC	2	6	1490667	1490672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628318
30356	NC_008532	AGG	2	6	1490724	1490729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628318
30357	NC_008532	CTT	2	6	1490782	1490787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628318
30358	NC_008532	CTT	2	6	1490815	1490820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628318
30359	NC_008532	TTG	2	6	1490916	1490921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628318
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30362	NC_008532	GTA	2	6	1490971	1490976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628319
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30373	NC_008532	A	7	7	1491309	1491315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30374	NC_008532	T	6	6	1491326	1491331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30375	NC_008532	AAT	2	6	1491424	1491429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30380	NC_008532	TAA	2	6	1492013	1492018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30382	NC_008532	TGCT	2	8	1492111	1492118	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30383	NC_008532	CCAGA	2	10	1492137	1492146	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
30384	NC_008532	CTT	2	6	1492195	1492200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30388	NC_008532	T	6	6	1492286	1492291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30393	NC_008532	TCT	2	6	1492710	1492715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30396	NC_008532	AGT	2	6	1492837	1492842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30447	NC_008532	AG	3	6	1495213	1495218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30448	NC_008532	A	7	7	1495227	1495233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30463	NC_008532	A	7	7	1495818	1495824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30464	NC_008532	ACCT	2	8	1495839	1495846	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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30470	NC_008532	GTC	3	9	1496221	1496229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628324
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30472	NC_008532	ACC	3	9	1496278	1496286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628324
30473	NC_008532	ATC	2	6	1496323	1496328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628324
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30475	NC_008532	GTT	2	6	1496427	1496432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628324
30476	NC_008532	A	6	6	1496440	1496445	100 %	0 %	0 %	0 %	116628324
30477	NC_008532	TTG	2	6	1496462	1496467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628324
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30479	NC_008532	AGC	2	6	1496518	1496523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628324
30480	NC_008532	CAAT	2	8	1496528	1496535	50 %	25 %	0 %	25 %	116628324
30481	NC_008532	AGC	2	6	1496551	1496556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628324
30482	NC_008532	TGT	3	9	1496559	1496567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628324
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30487	NC_008532	ATTAT	2	10	1496801	1496810	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30488	NC_008532	T	6	6	1496814	1496819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30489	NC_008532	TTC	2	6	1496963	1496968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628325
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