MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 38104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29001	NC_008532	CTA	2	6	1418634	1418639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29002	NC_008532	CT	3	6	1418684	1418689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29003	NC_008532	T	7	7	1418716	1418722	0 %	100 %	0 %	0 %	116628245
29004	NC_008532	T	7	7	1418724	1418730	0 %	100 %	0 %	0 %	116628245
29005	NC_008532	CCT	2	6	1418782	1418787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628245
29006	NC_008532	CTAG	2	8	1418855	1418862	25 %	25 %	25 %	25 %	116628245
29007	NC_008532	CAAA	2	8	1418955	1418962	75 %	0 %	0 %	25 %	116628245
29008	NC_008532	ATG	2	6	1419008	1419013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628245
29009	NC_008532	GAA	2	6	1419042	1419047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628245
29010	NC_008532	CAT	2	6	1419061	1419066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628245
29011	NC_008532	GTTAG	2	10	1419122	1419131	20 %	40 %	40 %	0 %	116628245
29012	NC_008532	ATAGG	2	10	1419137	1419146	40 %	20 %	40 %	0 %	116628245
29013	NC_008532	TGAT	2	8	1419149	1419156	25 %	50 %	25 %	0 %	116628245
29014	NC_008532	AAT	2	6	1419175	1419180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628245
29015	NC_008532	CCA	2	6	1419236	1419241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628245
29016	NC_008532	CAA	2	6	1419361	1419366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628245
29017	NC_008532	AAC	2	6	1419397	1419402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628245
29018	NC_008532	TCAT	2	8	1419440	1419447	25 %	50 %	0 %	25 %	116628245
29019	NC_008532	GCA	2	6	1419497	1419502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628245
29020	NC_008532	ATA	2	6	1419535	1419540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628245
29021	NC_008532	ATCT	2	8	1419562	1419569	25 %	50 %	0 %	25 %	116628245
29022	NC_008532	TAA	2	6	1419660	1419665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628246
29023	NC_008532	TTCT	2	8	1419667	1419674	0 %	75 %	0 %	25 %	116628246
29024	NC_008532	CTT	2	6	1419844	1419849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628246
29025	NC_008532	TTC	2	6	1419896	1419901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628246
29026	NC_008532	TTG	2	6	1419907	1419912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628246
29027	NC_008532	TCA	2	6	1420074	1420079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628246
29028	NC_008532	ACC	2	6	1420121	1420126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628246
29029	NC_008532	T	7	7	1420145	1420151	0 %	100 %	0 %	0 %	116628246
29030	NC_008532	TCA	2	6	1420287	1420292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628246
29031	NC_008532	ACA	2	6	1420301	1420306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628246
29032	NC_008532	ATG	2	6	1420326	1420331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628246
29033	NC_008532	CTTC	2	8	1420332	1420339	0 %	50 %	0 %	50 %	116628246
29034	NC_008532	TCT	2	6	1420368	1420373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628246
29035	NC_008532	ACG	3	9	1420379	1420387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628246
29036	NC_008532	ATT	2	6	1420518	1420523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628246
29037	NC_008532	TTA	2	6	1420560	1420565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628247
29038	NC_008532	ACT	3	9	1420579	1420587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628247
29039	NC_008532	ATC	2	6	1420683	1420688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628247
29040	NC_008532	GCC	2	6	1420696	1420701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116628247
29041	NC_008532	CAT	2	6	1420716	1420721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628247
29042	NC_008532	AAC	2	6	1420770	1420775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628247
29043	NC_008532	ATCA	2	8	1420824	1420831	50 %	25 %	0 %	25 %	116628247
29044	NC_008532	CAC	2	6	1420913	1420918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628247
29045	NC_008532	TTA	2	6	1420921	1420926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628247
29046	NC_008532	GAC	2	6	1420949	1420954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628247
29047	NC_008532	ATC	2	6	1421020	1421025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628247
29048	NC_008532	ATA	2	6	1421080	1421085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628247
29049	NC_008532	ATC	2	6	1421151	1421156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628247
29050	NC_008532	TTC	2	6	1421247	1421252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628247
29051	NC_008532	AGT	2	6	1421352	1421357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628247
29052	NC_008532	ATT	2	6	1421439	1421444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628247
29053	NC_008532	TAA	2	6	1421457	1421462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628247
29054	NC_008532	CAA	2	6	1421483	1421488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628247
29055	NC_008532	CTTT	2	8	1421654	1421661	0 %	75 %	0 %	25 %	116628247
29056	NC_008532	CTT	2	6	1421717	1421722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628247
29057	NC_008532	TAC	2	6	1421771	1421776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628247
29058	NC_008532	TTC	2	6	1421846	1421851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628248
29059	NC_008532	ACAA	2	8	1422024	1422031	75 %	0 %	0 %	25 %	116628248
29060	NC_008532	A	6	6	1422077	1422082	100 %	0 %	0 %	0 %	116628248
29061	NC_008532	ATCT	2	8	1422112	1422119	25 %	50 %	0 %	25 %	116628248
29062	NC_008532	TTA	2	6	1422146	1422151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628248
29063	NC_008532	CCT	2	6	1422186	1422191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628248
29064	NC_008532	AAT	2	6	1422198	1422203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628248
29065	NC_008532	GAAA	2	8	1422246	1422253	75 %	0 %	25 %	0 %	116628248
29066	NC_008532	AAAG	2	8	1422323	1422330	75 %	0 %	25 %	0 %	116628248
29067	NC_008532	AAG	2	6	1422344	1422349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628248
29068	NC_008532	TAT	2	6	1422387	1422392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29069	NC_008532	TCAA	2	8	1422454	1422461	50 %	25 %	0 %	25 %	116628249
29070	NC_008532	TAT	2	6	1422534	1422539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628249
29071	NC_008532	GCA	2	6	1422580	1422585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628249
29072	NC_008532	CGCA	2	8	1422588	1422595	25 %	0 %	25 %	50 %	116628249
29073	NC_008532	ACC	2	6	1422654	1422659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628249
29074	NC_008532	CAA	3	9	1422759	1422767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628249
29075	NC_008532	GTT	2	6	1422779	1422784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628249
29076	NC_008532	TTC	2	6	1422849	1422854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628249
29077	NC_008532	TTTTAA	2	12	1422944	1422955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628249
29078	NC_008532	GCC	2	6	1422973	1422978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116628249
29079	NC_008532	CT	3	6	1423042	1423047	0 %	50 %	0 %	50 %	116628249
29080	NC_008532	TGA	2	6	1423061	1423066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628249
29081	NC_008532	TTG	2	6	1423102	1423107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628249
29082	NC_008532	AAT	2	6	1423125	1423130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628249
29083	NC_008532	CTT	3	9	1423283	1423291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628249
29084	NC_008532	CCA	2	6	1423366	1423371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628249
29085	NC_008532	CTA	2	6	1423379	1423384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628249
29086	NC_008532	ATA	2	6	1423422	1423427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628249
29087	NC_008532	TGGCAT	2	12	1423458	1423469	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116628249
29088	NC_008532	ACC	2	6	1423524	1423529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628249
29089	NC_008532	AAT	2	6	1423539	1423544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628249
29090	NC_008532	ATG	2	6	1423612	1423617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628249
29091	NC_008532	CAA	2	6	1423631	1423636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628249
29092	NC_008532	ACC	2	6	1423683	1423688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628249
29093	NC_008532	TGA	2	6	1423691	1423696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628249
29094	NC_008532	TCTT	2	8	1423719	1423726	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29095	NC_008532	TCA	2	6	1423904	1423909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628250
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29098	NC_008532	A	6	6	1423976	1423981	100 %	0 %	0 %	0 %	116628250
29099	NC_008532	TGA	2	6	1423987	1423992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628250
29100	NC_008532	TAGC	2	8	1424048	1424055	25 %	25 %	25 %	25 %	116628250
29101	NC_008532	CTT	2	6	1424073	1424078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628250
29102	NC_008532	ACC	2	6	1424149	1424154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628250
29103	NC_008532	CAT	2	6	1424197	1424202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628250
29104	NC_008532	TCTTAA	2	12	1424307	1424318	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116628250
29105	NC_008532	T	6	6	1424464	1424469	0 %	100 %	0 %	0 %	116628250
29106	NC_008532	A	7	7	1424534	1424540	100 %	0 %	0 %	0 %	116628250
29107	NC_008532	ACC	2	6	1424564	1424569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628250
29108	NC_008532	TTA	2	6	1424580	1424585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628250
29109	NC_008532	ATC	2	6	1424621	1424626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628250
29110	NC_008532	TCCA	2	8	1424771	1424778	25 %	25 %	0 %	50 %	116628250
29111	NC_008532	A	6	6	1424802	1424807	100 %	0 %	0 %	0 %	116628250
29112	NC_008532	AG	3	6	1424870	1424875	50 %	0 %	50 %	0 %	116628250
29113	NC_008532	ATA	2	6	1424917	1424922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628250
29114	NC_008532	A	6	6	1424930	1424935	100 %	0 %	0 %	0 %	116628250
29115	NC_008532	TAAA	2	8	1425006	1425013	75 %	25 %	0 %	0 %	116628250
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29117	NC_008532	AAC	2	6	1425033	1425038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628250
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29231	NC_008532	TGGT	2	8	1430195	1430202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29232	NC_008532	TAT	2	6	1430225	1430230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29234	NC_008532	CTTA	2	8	1430291	1430298	25 %	50 %	0 %	25 %	116628255
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29479	NC_008532	GAT	2	6	1441793	1441798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628265
29480	NC_008532	CCA	2	6	1441800	1441805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628265
29481	NC_008532	GA	4	8	1441915	1441922	50 %	0 %	50 %	0 %	116628265
29482	NC_008532	CAAA	2	8	1441938	1441945	75 %	0 %	0 %	25 %	116628265
29483	NC_008532	ATC	2	6	1441984	1441989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628266
29484	NC_008532	ACA	2	6	1442009	1442014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628266
29485	NC_008532	GATT	2	8	1442228	1442235	25 %	50 %	25 %	0 %	116628266
29486	NC_008532	TCA	2	6	1442263	1442268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628266
29487	NC_008532	TGA	2	6	1442282	1442287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628266
29488	NC_008532	CTT	2	6	1442335	1442340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628267
29489	NC_008532	ATGT	2	8	1442380	1442387	25 %	50 %	25 %	0 %	116628267
29490	NC_008532	GAT	2	6	1442437	1442442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628267
29491	NC_008532	TA	3	6	1442555	1442560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29492	NC_008532	CTAG	2	8	1442624	1442631	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29493	NC_008532	GTT	2	6	1442652	1442657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29494	NC_008532	TTA	2	6	1442663	1442668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29495	NC_008532	CT	3	6	1442681	1442686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29496	NC_008532	CAA	2	6	1442722	1442727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628268
29497	NC_008532	TCA	2	6	1442733	1442738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628268
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29499	NC_008532	T	6	6	1442773	1442778	0 %	100 %	0 %	0 %	116628268
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