MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 38104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_008532	ACT	2	6	1249334	1249339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628095
25503	NC_008532	A	7	7	1249355	1249361	100 %	0 %	0 %	0 %	116628095
25504	NC_008532	TTGT	2	8	1249401	1249408	0 %	75 %	25 %	0 %	116628095
25505	NC_008532	CTTAT	2	10	1249491	1249500	20 %	60 %	0 %	20 %	116628095
25506	NC_008532	TAA	2	6	1249531	1249536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628095
25507	NC_008532	A	6	6	1249554	1249559	100 %	0 %	0 %	0 %	116628095
25508	NC_008532	CCT	2	6	1249565	1249570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628095
25509	NC_008532	ATT	2	6	1249628	1249633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628095
25510	NC_008532	TTA	2	6	1249682	1249687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628095
25511	NC_008532	TTG	2	6	1249719	1249724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628095
25512	NC_008532	ATT	2	6	1249737	1249742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628095
25513	NC_008532	TA	3	6	1249743	1249748	50 %	50 %	0 %	0 %	116628095
25514	NC_008532	T	7	7	1249750	1249756	0 %	100 %	0 %	0 %	116628095
25515	NC_008532	GGT	2	6	1249814	1249819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628095
25516	NC_008532	ATT	2	6	1249912	1249917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25517	NC_008532	AAAT	2	8	1249973	1249980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25518	NC_008532	ATT	2	6	1249993	1249998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25519	NC_008532	A	7	7	1250013	1250019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25520	NC_008532	CGA	2	6	1250126	1250131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25521	NC_008532	GAA	2	6	1250144	1250149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25522	NC_008532	TTA	2	6	1250160	1250165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25523	NC_008532	ATT	2	6	1250207	1250212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628096
25524	NC_008532	CAT	2	6	1250274	1250279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628096
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25526	NC_008532	CTG	3	9	1250372	1250380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628096
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25529	NC_008532	CTT	2	6	1250441	1250446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628096
25530	NC_008532	ATC	2	6	1250490	1250495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628096
25531	NC_008532	GAAA	2	8	1250503	1250510	75 %	0 %	25 %	0 %	116628096
25532	NC_008532	T	6	6	1250539	1250544	0 %	100 %	0 %	0 %	116628096
25533	NC_008532	ACT	2	6	1250570	1250575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25534	NC_008532	TAGA	2	8	1250600	1250607	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25535	NC_008532	TCA	2	6	1250663	1250668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25536	NC_008532	T	6	6	1250735	1250740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25537	NC_008532	A	6	6	1250832	1250837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25538	NC_008532	CAT	2	6	1250864	1250869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25539	NC_008532	AATA	2	8	1250962	1250969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25540	NC_008532	AC	3	6	1250992	1250997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25541	NC_008532	T	7	7	1251022	1251028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25542	NC_008532	AAT	2	6	1251117	1251122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25543	NC_008532	CTT	2	6	1251135	1251140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628097
25544	NC_008532	GTTT	2	8	1251242	1251249	0 %	75 %	25 %	0 %	116628097
25545	NC_008532	ACT	2	6	1251277	1251282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628097
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25548	NC_008532	TAGAC	2	10	1251720	1251729	40 %	20 %	20 %	20 %	116628097
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25557	NC_008532	ACT	2	6	1252125	1252130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628097
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25580	NC_008532	T	6	6	1253233	1253238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25581	NC_008532	CTAG	2	8	1253239	1253246	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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25589	NC_008532	A	6	6	1253612	1253617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25590	NC_008532	TCTT	2	8	1253623	1253630	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25591	NC_008532	CCTA	2	8	1253690	1253697	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25592	NC_008532	CATT	2	8	1253709	1253716	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25593	NC_008532	A	6	6	1253762	1253767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25594	NC_008532	TAA	3	9	1253833	1253841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25595	NC_008532	ATT	2	6	1253861	1253866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25596	NC_008532	ATT	2	6	1253954	1253959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628098
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25602	NC_008532	GTA	2	6	1254231	1254236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628098
25603	NC_008532	CGT	2	6	1254259	1254264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628098
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25609	NC_008532	TAT	3	9	1254577	1254585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628098
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25617	NC_008532	AGTA	2	8	1254969	1254976	50 %	25 %	25 %	0 %	116628099
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25620	NC_008532	A	6	6	1255143	1255148	100 %	0 %	0 %	0 %	116628099
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25745	NC_008532	TTC	2	6	1260286	1260291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628106
25746	NC_008532	ATC	2	6	1260324	1260329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628106
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25802	NC_008532	AAT	2	6	1262626	1262631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25858	NC_008532	A	7	7	1265447	1265453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25859	NC_008532	TCCG	2	8	1265454	1265461	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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25861	NC_008532	GTT	2	6	1265535	1265540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25863	NC_008532	TAT	2	6	1265615	1265620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25865	NC_008532	TGA	2	6	1265683	1265688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628114
25866	NC_008532	CTT	2	6	1265710	1265715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628114
25867	NC_008532	TGA	2	6	1265734	1265739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628114
25868	NC_008532	TCG	2	6	1265823	1265828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628114
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25877	NC_008532	GAGC	2	8	1266289	1266296	25 %	0 %	50 %	25 %	116628114
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25953	NC_008532	GTA	2	6	1270578	1270583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25982	NC_008532	GTTA	2	8	1272348	1272355	25 %	50 %	25 %	0 %	116628116
25983	NC_008532	TTC	2	6	1272423	1272428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628116
25984	NC_008532	CATA	2	8	1272446	1272453	50 %	25 %	0 %	25 %	116628116
25985	NC_008532	TGTAA	2	10	1272468	1272477	40 %	40 %	20 %	0 %	116628116
25986	NC_008532	GT	3	6	1272735	1272740	0 %	50 %	50 %	0 %	116628116
25987	NC_008532	TCA	2	6	1272778	1272783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628116
25988	NC_008532	CA	3	6	1272782	1272787	50 %	0 %	0 %	50 %	116628116
25989	NC_008532	ATGTT	2	10	1272838	1272847	20 %	60 %	20 %	0 %	116628116
25990	NC_008532	TCA	2	6	1272851	1272856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628116
25991	NC_008532	TCT	2	6	1272877	1272882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628116
25992	NC_008532	CAA	2	6	1273019	1273024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628116
25993	NC_008532	TCA	2	6	1273030	1273035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628116
25994	NC_008532	TCT	2	6	1273193	1273198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628116
25995	NC_008532	TTTG	2	8	1273249	1273256	0 %	75 %	25 %	0 %	116628116
25996	NC_008532	CAA	2	6	1273421	1273426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628116
25997	NC_008532	T	6	6	1273542	1273547	0 %	100 %	0 %	0 %	116628116
25998	NC_008532	CAT	2	6	1273559	1273564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628116
25999	NC_008532	ATG	2	6	1273586	1273591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628116
26000	NC_008532	TGA	2	6	1273715	1273720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628116

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