MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 38104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_008532	GCA	2	6	1175890	1175895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628027
24003	NC_008532	CAC	2	6	1175909	1175914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628027
24004	NC_008532	TCA	2	6	1175968	1175973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628027
24005	NC_008532	TCT	2	6	1176013	1176018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628027
24006	NC_008532	AAT	2	6	1176054	1176059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628027
24007	NC_008532	T	6	6	1176129	1176134	0 %	100 %	0 %	0 %	116628027
24008	NC_008532	CAA	2	6	1176173	1176178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628027
24009	NC_008532	CAG	2	6	1176191	1176196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628027
24010	NC_008532	CAAGTG	2	12	1176261	1176272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116628027
24011	NC_008532	CAA	2	6	1176308	1176313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628027
24012	NC_008532	CAG	2	6	1176332	1176337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628027
24013	NC_008532	GTC	2	6	1176367	1176372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628027
24014	NC_008532	T	6	6	1176377	1176382	0 %	100 %	0 %	0 %	116628027
24015	NC_008532	CAAC	2	8	1176413	1176420	50 %	0 %	0 %	50 %	116628027
24016	NC_008532	TAAC	2	8	1176436	1176443	50 %	25 %	0 %	25 %	116628027
24017	NC_008532	ATA	2	6	1176448	1176453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628027
24018	NC_008532	AAG	2	6	1176613	1176618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24019	NC_008532	CT	3	6	1176727	1176732	0 %	50 %	0 %	50 %	116628028
24020	NC_008532	AAC	2	6	1176766	1176771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628029
24021	NC_008532	A	6	6	1176845	1176850	100 %	0 %	0 %	0 %	116628029
24022	NC_008532	CTT	2	6	1176914	1176919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628029
24023	NC_008532	GCAAA	2	10	1176920	1176929	60 %	0 %	20 %	20 %	116628029
24024	NC_008532	AAT	2	6	1176934	1176939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628029
24025	NC_008532	CTGA	2	8	1176969	1176976	25 %	25 %	25 %	25 %	116628029
24026	NC_008532	TGC	2	6	1177012	1177017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628029
24027	NC_008532	CAT	2	6	1177064	1177069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628029
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24029	NC_008532	TAT	2	6	1177172	1177177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628029
24030	NC_008532	TTC	2	6	1177224	1177229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628029
24031	NC_008532	CTT	2	6	1177232	1177237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628029
24032	NC_008532	GAA	2	6	1177241	1177246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628029
24033	NC_008532	AAC	2	6	1177257	1177262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628029
24034	NC_008532	CCT	2	6	1177274	1177279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24035	NC_008532	GACCAA	2	12	1177374	1177385	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116628030
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24039	NC_008532	T	6	6	1177602	1177607	0 %	100 %	0 %	0 %	116628030
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24051	NC_008532	GCT	2	6	1178090	1178095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628030
24052	NC_008532	TTC	2	6	1178158	1178163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628030
24053	NC_008532	T	6	6	1178209	1178214	0 %	100 %	0 %	0 %	116628030
24054	NC_008532	CAC	2	6	1178259	1178264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628030
24055	NC_008532	CAAA	2	8	1178362	1178369	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24056	NC_008532	A	8	8	1178367	1178374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24057	NC_008532	T	6	6	1178422	1178427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24058	NC_008532	GAG	2	6	1178491	1178496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24059	NC_008532	ACC	2	6	1178569	1178574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24060	NC_008532	TCAAT	2	10	1178619	1178628	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24061	NC_008532	T	7	7	1178632	1178638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24062	NC_008532	A	6	6	1178741	1178746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24063	NC_008532	CTT	2	6	1178747	1178752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24064	NC_008532	T	9	9	1178857	1178865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24065	NC_008532	T	7	7	1178881	1178887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24066	NC_008532	A	6	6	1178896	1178901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24067	NC_008532	CTG	3	9	1179033	1179041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628031
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24071	NC_008532	TGG	2	6	1179268	1179273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628031
24072	NC_008532	CTG	2	6	1179330	1179335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628031
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24101	NC_008532	GCT	2	6	1181153	1181158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628031
24102	NC_008532	GCTA	2	8	1181179	1181186	25 %	25 %	25 %	25 %	116628031
24103	NC_008532	AG	3	6	1181197	1181202	50 %	0 %	50 %	0 %	116628031
24104	NC_008532	TTC	2	6	1181227	1181232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628031
24105	NC_008532	GTGA	2	8	1181272	1181279	25 %	25 %	50 %	0 %	116628031
24106	NC_008532	TCC	2	6	1181309	1181314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628031
24107	NC_008532	TCT	2	6	1181333	1181338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628031
24108	NC_008532	TCA	2	6	1181366	1181371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628031
24109	NC_008532	ATTCA	2	10	1181422	1181431	40 %	40 %	0 %	20 %	116628031
24110	NC_008532	CT	3	6	1181495	1181500	0 %	50 %	0 %	50 %	116628031
24111	NC_008532	GCT	2	6	1181516	1181521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628031
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24113	NC_008532	TC	3	6	1181533	1181538	0 %	50 %	0 %	50 %	116628031
24114	NC_008532	GCT	2	6	1181544	1181549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628031
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24118	NC_008532	AGA	2	6	1181629	1181634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628031
24119	NC_008532	ATA	2	6	1181707	1181712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628031
24120	NC_008532	TCT	2	6	1181744	1181749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628031
24121	NC_008532	GTCT	2	8	1181810	1181817	0 %	50 %	25 %	25 %	116628031
24122	NC_008532	GCT	2	6	1181855	1181860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628031
24123	NC_008532	GAT	2	6	1181899	1181904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628031
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24125	NC_008532	TTTC	2	8	1181955	1181962	0 %	75 %	0 %	25 %	116628031
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24133	NC_008532	AAGG	2	8	1182798	1182805	50 %	0 %	50 %	0 %	116628032
24134	NC_008532	TGG	2	6	1182827	1182832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628032
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24142	NC_008532	AC	3	6	1183196	1183201	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24143	NC_008532	A	7	7	1183218	1183224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24144	NC_008532	ATG	2	6	1183235	1183240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24145	NC_008532	TAG	2	6	1183254	1183259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24146	NC_008532	A	7	7	1183299	1183305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24147	NC_008532	TAA	2	6	1183333	1183338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628033
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24172	NC_008532	CAGA	3	12	1184321	1184332	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24173	NC_008532	A	7	7	1184394	1184400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24174	NC_008532	AG	3	6	1184402	1184407	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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24177	NC_008532	TTCAA	2	10	1184609	1184618	40 %	40 %	0 %	20 %	116628034
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24201	NC_008532	TAT	2	6	1185728	1185733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24218	NC_008532	ATTT	2	8	1186544	1186551	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24219	NC_008532	TG	3	6	1186568	1186573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24220	NC_008532	TTG	2	6	1186660	1186665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24221	NC_008532	TAC	2	6	1186687	1186692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24222	NC_008532	TAAT	2	8	1186771	1186778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24223	NC_008532	CATG	2	8	1186929	1186936	25 %	25 %	25 %	25 %	116628036
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24225	NC_008532	GATA	2	8	1187064	1187071	50 %	25 %	25 %	0 %	116628036
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24229	NC_008532	CTA	2	6	1187157	1187162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628036
24230	NC_008532	TCT	2	6	1187247	1187252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628036
24231	NC_008532	AT	3	6	1187266	1187271	50 %	50 %	0 %	0 %	116628036
24232	NC_008532	ATC	2	6	1187318	1187323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628036
24233	NC_008532	ACT	2	6	1187388	1187393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24234	NC_008532	CAT	2	6	1187464	1187469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24236	NC_008532	TTA	2	6	1187489	1187494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24237	NC_008532	CAT	2	6	1187532	1187537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24238	NC_008532	ACT	2	6	1187608	1187613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24239	NC_008532	ACA	2	6	1187639	1187644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24240	NC_008532	TAA	2	6	1187798	1187803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24241	NC_008532	TAC	2	6	1187809	1187814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24242	NC_008532	A	6	6	1187828	1187833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24243	NC_008532	TC	3	6	1187871	1187876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24244	NC_008532	AGA	2	6	1187951	1187956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24245	NC_008532	AG	3	6	1188010	1188015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24246	NC_008532	ACT	2	6	1188064	1188069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24250	NC_008532	A	7	7	1188336	1188342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24251	NC_008532	CTT	2	6	1188357	1188362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24282	NC_008532	TTAA	2	8	1189995	1190002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24331	NC_008532	CTTA	2	8	1192684	1192691	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24332	NC_008532	T	6	6	1192743	1192748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24337	NC_008532	CAT	2	6	1193410	1193415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628041
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24342	NC_008532	TGA	2	6	1193664	1193669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628042
24343	NC_008532	G	7	7	1193723	1193729	0 %	0 %	100 %	0 %	116628042
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24353	NC_008532	TAG	2	6	1194213	1194218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628042
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24357	NC_008532	ATC	2	6	1194472	1194477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24358	NC_008532	TAA	3	9	1194499	1194507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24359	NC_008532	TTAAAG	2	12	1194530	1194541	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24360	NC_008532	TAA	2	6	1194551	1194556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24361	NC_008532	ATA	2	6	1194572	1194577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24362	NC_008532	CTA	2	6	1194624	1194629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24363	NC_008532	AG	3	6	1194635	1194640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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24365	NC_008532	ATT	2	6	1194660	1194665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24389	NC_008532	ATT	2	6	1195743	1195748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24479	NC_008532	T	6	6	1200615	1200620	0 %	100 %	0 %	0 %	116628049
24480	NC_008532	ACC	2	6	1200717	1200722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628049
24481	NC_008532	AAT	2	6	1200723	1200728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628049
24482	NC_008532	A	6	6	1200738	1200743	100 %	0 %	0 %	0 %	116628049
24483	NC_008532	CGA	2	6	1200755	1200760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628049
24484	NC_008532	TTG	2	6	1200771	1200776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628049
24485	NC_008532	AGACT	2	10	1200815	1200824	40 %	20 %	20 %	20 %	116628049
24486	NC_008532	CT	3	6	1201023	1201028	0 %	50 %	0 %	50 %	116628049
24487	NC_008532	GAA	2	6	1201158	1201163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628049
24488	NC_008532	ATG	2	6	1201186	1201191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628049
24489	NC_008532	AGT	2	6	1201234	1201239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628049
24490	NC_008532	TCC	2	6	1201254	1201259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628050
24491	NC_008532	ACT	2	6	1201340	1201345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628050
24492	NC_008532	ACA	2	6	1201380	1201385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628050
24493	NC_008532	CAT	2	6	1201402	1201407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628050
24494	NC_008532	TGC	2	6	1201412	1201417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628050
24495	NC_008532	CTTTTC	2	12	1201463	1201474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628050
24496	NC_008532	GTA	2	6	1201497	1201502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628050
24497	NC_008532	TAA	2	6	1201507	1201512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628050
24498	NC_008532	TGA	2	6	1201521	1201526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628050
24499	NC_008532	TG	3	6	1201547	1201552	0 %	50 %	50 %	0 %	116628050
24500	NC_008532	CTT	2	6	1201558	1201563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628050

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