MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 38104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_008532	CAGATC	2	12	642869	642880	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116627541
13003	NC_008532	CAA	2	6	642969	642974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627541
13004	NC_008532	TAG	2	6	642977	642982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627541
13005	NC_008532	AAAAT	2	10	643001	643010	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_008532	T	6	6	643037	643042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_008532	ACT	2	6	643069	643074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_008532	T	6	6	643079	643084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_008532	GTT	2	6	643111	643116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_008532	T	6	6	643141	643146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_008532	A	6	6	643170	643175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_008532	A	6	6	643211	643216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_008532	ATT	2	6	643227	643232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_008532	CAG	2	6	643341	643346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627542
13015	NC_008532	ACG	2	6	643402	643407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627542
13016	NC_008532	A	6	6	643409	643414	100 %	0 %	0 %	0 %	116627542
13017	NC_008532	GAA	2	6	643541	643546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627542
13018	NC_008532	GAT	2	6	643598	643603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627542
13019	NC_008532	TGA	2	6	643609	643614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627542
13020	NC_008532	TCA	2	6	643622	643627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627542
13021	NC_008532	GTG	2	6	643731	643736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627542
13022	NC_008532	A	6	6	643760	643765	100 %	0 %	0 %	0 %	116627542
13023	NC_008532	CAA	2	6	643832	643837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627542
13024	NC_008532	TTA	2	6	643866	643871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627542
13025	NC_008532	AGC	2	6	644035	644040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627542
13026	NC_008532	AGA	2	6	644133	644138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627542
13027	NC_008532	ATTA	2	8	644147	644154	50 %	50 %	0 %	0 %	116627542
13028	NC_008532	AT	3	6	644197	644202	50 %	50 %	0 %	0 %	116627542
13029	NC_008532	AAG	2	6	644400	644405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627542
13030	NC_008532	GCAAA	2	10	644472	644481	60 %	0 %	20 %	20 %	116627542
13031	NC_008532	TGA	2	6	644526	644531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627542
13032	NC_008532	AGA	2	6	644563	644568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627542
13033	NC_008532	A	6	6	644601	644606	100 %	0 %	0 %	0 %	116627542
13034	NC_008532	AT	3	6	644632	644637	50 %	50 %	0 %	0 %	116627542
13035	NC_008532	GAA	2	6	644657	644662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627542
13036	NC_008532	TGT	2	6	644674	644679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627542
13037	NC_008532	GCG	2	6	644717	644722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116627542
13038	NC_008532	GAT	2	6	644783	644788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627542
13039	NC_008532	AAAG	2	8	644791	644798	75 %	0 %	25 %	0 %	116627542
13040	NC_008532	CAA	2	6	644821	644826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627542
13041	NC_008532	GCA	2	6	644840	644845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627542
13042	NC_008532	GCT	2	6	644855	644860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627542
13043	NC_008532	ATAA	2	8	644999	645006	75 %	25 %	0 %	0 %	116627542
13044	NC_008532	GAT	2	6	645056	645061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627542
13045	NC_008532	GAT	2	6	645146	645151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627542
13046	NC_008532	A	6	6	645212	645217	100 %	0 %	0 %	0 %	116627542
13047	NC_008532	CCT	2	6	645223	645228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116627542
13048	NC_008532	AGA	3	9	645232	645240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627542
13049	NC_008532	GAAA	2	8	645261	645268	75 %	0 %	25 %	0 %	116627542
13050	NC_008532	ATC	2	6	645438	645443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627542
13051	NC_008532	ATT	2	6	645464	645469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627542
13052	NC_008532	GCC	2	6	645470	645475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116627542
13053	NC_008532	A	6	6	645497	645502	100 %	0 %	0 %	0 %	116627542
13054	NC_008532	AGA	2	6	645529	645534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627542
13055	NC_008532	TTA	2	6	645564	645569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627542
13056	NC_008532	TGA	3	9	645571	645579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627542
13057	NC_008532	TTG	2	6	645618	645623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627542
13058	NC_008532	ATG	2	6	645807	645812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627542
13059	NC_008532	AAG	2	6	645830	645835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627542
13060	NC_008532	TAA	2	6	645916	645921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627542
13061	NC_008532	AAAT	2	8	645924	645931	75 %	25 %	0 %	0 %	116627542
13062	NC_008532	AGA	2	6	645976	645981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627542
13063	NC_008532	A	6	6	646007	646012	100 %	0 %	0 %	0 %	116627542
13064	NC_008532	CAGT	2	8	646112	646119	25 %	25 %	25 %	25 %	116627542
13065	NC_008532	ACT	2	6	646154	646159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627542
13066	NC_008532	A	6	6	646259	646264	100 %	0 %	0 %	0 %	116627542
13067	NC_008532	AAC	2	6	646347	646352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627542
13068	NC_008532	TTTC	2	8	646364	646371	0 %	75 %	0 %	25 %	116627542
13069	NC_008532	AGG	2	6	646435	646440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627542
13070	NC_008532	TTAA	2	8	646448	646455	50 %	50 %	0 %	0 %	116627542
13071	NC_008532	A	6	6	646490	646495	100 %	0 %	0 %	0 %	116627542
13072	NC_008532	ATC	2	6	646559	646564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627542
13073	NC_008532	TAA	2	6	646645	646650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_008532	GAA	2	6	646771	646776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_008532	GTCA	2	8	646798	646805	25 %	25 %	25 %	25 %	116627543
13076	NC_008532	TTA	2	6	646837	646842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627543
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13079	NC_008532	GTT	2	6	646969	646974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627543
13080	NC_008532	TCAC	2	8	647007	647014	25 %	25 %	0 %	50 %	116627543
13081	NC_008532	TTA	2	6	647103	647108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627543
13082	NC_008532	A	6	6	647147	647152	100 %	0 %	0 %	0 %	116627543
13083	NC_008532	ACA	2	6	647159	647164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627543
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13085	NC_008532	TGC	2	6	647229	647234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627543
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13087	NC_008532	TCA	2	6	647300	647305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627543
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13089	NC_008532	GAC	2	6	647431	647436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627543
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13092	NC_008532	T	7	7	647719	647725	0 %	100 %	0 %	0 %	116627544
13093	NC_008532	A	6	6	647751	647756	100 %	0 %	0 %	0 %	116627544
13094	NC_008532	AATT	2	8	647781	647788	50 %	50 %	0 %	0 %	116627544
13095	NC_008532	TAT	2	6	647822	647827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627544
13096	NC_008532	AAAT	2	8	647854	647861	75 %	25 %	0 %	0 %	116627544
13097	NC_008532	AAG	2	6	647867	647872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627544
13098	NC_008532	CTGC	2	8	647888	647895	0 %	25 %	25 %	50 %	116627544
13099	NC_008532	ATTA	2	8	647947	647954	50 %	50 %	0 %	0 %	116627544
13100	NC_008532	ATA	2	6	647991	647996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627544
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13102	NC_008532	T	6	6	648016	648021	0 %	100 %	0 %	0 %	116627545
13103	NC_008532	ATTGA	2	10	648046	648055	40 %	40 %	20 %	0 %	116627545
13104	NC_008532	CA	3	6	648069	648074	50 %	0 %	0 %	50 %	116627545
13105	NC_008532	TTG	2	6	648077	648082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627545
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13107	NC_008532	ATATT	2	10	648102	648111	40 %	60 %	0 %	0 %	116627545
13108	NC_008532	TGG	2	6	648135	648140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627545
13109	NC_008532	A	7	7	648141	648147	100 %	0 %	0 %	0 %	116627545
13110	NC_008532	GA	3	6	648153	648158	50 %	0 %	50 %	0 %	116627545
13111	NC_008532	GAG	2	6	648181	648186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627545
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13113	NC_008532	TCAA	2	8	648326	648333	50 %	25 %	0 %	25 %	116627545
13114	NC_008532	GAA	2	6	648385	648390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627545
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13118	NC_008532	T	6	6	648493	648498	0 %	100 %	0 %	0 %	116627545
13119	NC_008532	ATCT	2	8	648515	648522	25 %	50 %	0 %	25 %	116627545
13120	NC_008532	TCT	2	6	648579	648584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627545
13121	NC_008532	ACAA	2	8	648588	648595	75 %	0 %	0 %	25 %	116627545
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13493	NC_008532	TCG	2	6	667090	667095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627566
13494	NC_008532	AGC	3	9	667110	667118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627566
13495	NC_008532	TCT	2	6	667228	667233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627566
13496	NC_008532	GTTG	2	8	667285	667292	0 %	50 %	50 %	0 %	116627566
13497	NC_008532	CAA	2	6	667307	667312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627566
13498	NC_008532	TTC	2	6	667314	667319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627566
13499	NC_008532	GAA	2	6	667320	667325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627566
13500	NC_008532	CTT	2	6	667400	667405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627566

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