MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 38104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_008532	TGC	2	6	490020	490025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627396
10003	NC_008532	TTG	2	6	490049	490054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627396
10004	NC_008532	TG	3	6	490053	490058	0 %	50 %	50 %	0 %	116627396
10005	NC_008532	CCTG	2	8	490148	490155	0 %	25 %	25 %	50 %	116627396
10006	NC_008532	AGAA	2	8	490156	490163	75 %	0 %	25 %	0 %	116627396
10007	NC_008532	TCG	2	6	490190	490195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627396
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10009	NC_008532	GAA	2	6	490326	490331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627396
10010	NC_008532	CAATC	2	10	490344	490353	40 %	20 %	0 %	40 %	116627396
10011	NC_008532	AAT	2	6	490504	490509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627396
10012	NC_008532	TTGGT	2	10	490526	490535	0 %	60 %	40 %	0 %	116627396
10013	NC_008532	AAT	2	6	490582	490587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627396
10014	NC_008532	CT	3	6	490610	490615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10015	NC_008532	CAAAAA	2	12	490681	490692	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10016	NC_008532	ATT	2	6	490715	490720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_008532	CAG	2	6	490766	490771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_008532	AGT	2	6	490805	490810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_008532	TATT	2	8	490837	490844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_008532	T	7	7	490848	490854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10022	NC_008532	A	7	7	490955	490961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_008532	TG	3	6	490981	490986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10031	NC_008532	GCA	2	6	491302	491307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_008532	TATG	2	8	491334	491341	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_008532	GCA	2	6	491353	491358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10038	NC_008532	CAA	2	6	491876	491881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_008532	CAG	2	6	491903	491908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_008532	TAT	2	6	491949	491954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10042	NC_008532	GTTT	2	8	492000	492007	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_008532	CTAT	2	8	492035	492042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10044	NC_008532	TGG	2	6	492144	492149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10053	NC_008532	ACT	2	6	492753	492758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10057	NC_008532	ATTT	2	8	492837	492844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10106	NC_008532	T	7	7	495459	495465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10119	NC_008532	GAT	3	9	496258	496266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627401
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10124	NC_008532	TGA	2	6	496457	496462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627402
10125	NC_008532	ATG	2	6	496528	496533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627402
10126	NC_008532	TGA	2	6	496589	496594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627402
10127	NC_008532	TAA	2	6	496637	496642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627402
10128	NC_008532	AAGA	2	8	496755	496762	75 %	0 %	25 %	0 %	116627402
10129	NC_008532	T	6	6	496771	496776	0 %	100 %	0 %	0 %	116627402
10130	NC_008532	AGA	2	6	496838	496843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627402
10131	NC_008532	TGT	2	6	497029	497034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627403
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10137	NC_008532	TAA	2	6	497303	497308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10138	NC_008532	TGAT	2	8	497312	497319	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10139	NC_008532	AAGA	2	8	497325	497332	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10174	NC_008532	T	17	17	499634	499650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10176	NC_008532	T	6	6	499794	499799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10177	NC_008532	T	7	7	499813	499819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10230	NC_008532	GAC	2	6	502621	502626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627409
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10236	NC_008532	ATT	2	6	503005	503010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10237	NC_008532	GTT	2	6	503011	503016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10248	NC_008532	AC	3	6	503959	503964	50 %	0 %	0 %	50 %	116627410
10249	NC_008532	TGA	2	6	504104	504109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627410
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10251	NC_008532	CGT	2	6	504150	504155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627410
10252	NC_008532	CTA	2	6	504209	504214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10253	NC_008532	AG	3	6	504233	504238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10254	NC_008532	TGCT	2	8	504319	504326	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10255	NC_008532	TTA	2	6	504352	504357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10256	NC_008532	ACGG	2	8	504399	504406	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10257	NC_008532	GTC	2	6	504482	504487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10360	NC_008532	GAAA	2	8	510033	510040	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10361	NC_008532	ATT	2	6	510079	510084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10362	NC_008532	A	6	6	510091	510096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10363	NC_008532	AAC	2	6	510099	510104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10364	NC_008532	AGC	2	6	510265	510270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627414
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10366	NC_008532	CAAA	2	8	510360	510367	75 %	0 %	0 %	25 %	116627414
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10497	NC_008532	ATCT	2	8	515792	515799	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10498	NC_008532	GCT	2	6	515876	515881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10499	NC_008532	CCA	2	6	515887	515892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10500	NC_008532	T	7	7	515910	515916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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