MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 38104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008532	GGT	2	6	292108	292113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627218
6002	NC_008532	T	7	7	292303	292309	0 %	100 %	0 %	0 %	116627218
6003	NC_008532	AT	3	6	292311	292316	50 %	50 %	0 %	0 %	116627218
6004	NC_008532	TCTT	2	8	292337	292344	0 %	75 %	0 %	25 %	116627218
6005	NC_008532	ATT	2	6	292360	292365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627218
6006	NC_008532	TTTA	2	8	292380	292387	25 %	75 %	0 %	0 %	116627218
6007	NC_008532	CTTTT	2	10	292412	292421	0 %	80 %	0 %	20 %	116627218
6008	NC_008532	AGG	2	6	292467	292472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627218
6009	NC_008532	GTA	2	6	292548	292553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_008532	TA	3	6	292578	292583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_008532	AC	3	6	292602	292607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6012	NC_008532	GGGC	2	8	292630	292637	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6013	NC_008532	TTGA	2	8	292653	292660	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_008532	T	6	6	292688	292693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_008532	TGT	2	6	292803	292808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627219
6016	NC_008532	TTGAT	2	10	292922	292931	20 %	60 %	20 %	0 %	116627219
6017	NC_008532	CGA	2	6	292942	292947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627219
6018	NC_008532	GAGCTA	2	12	293036	293047	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116627219
6019	NC_008532	A	7	7	293196	293202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_008532	TAT	2	6	293220	293225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627220
6021	NC_008532	A	7	7	293233	293239	100 %	0 %	0 %	0 %	116627220
6022	NC_008532	TGCT	2	8	293279	293286	0 %	50 %	25 %	25 %	116627220
6023	NC_008532	AAG	2	6	293309	293314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627220
6024	NC_008532	ACA	2	6	293365	293370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627220
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6027	NC_008532	AGA	2	6	293550	293555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627220
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6029	NC_008532	ATG	2	6	293642	293647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627220
6030	NC_008532	GTT	2	6	293671	293676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627220
6031	NC_008532	AAC	2	6	293682	293687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627220
6032	NC_008532	TGAA	2	8	293786	293793	50 %	25 %	25 %	0 %	116627220
6033	NC_008532	ATC	2	6	293839	293844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627220
6034	NC_008532	TGA	2	6	293889	293894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627220
6035	NC_008532	CTT	2	6	293910	293915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627220
6036	NC_008532	AAAC	2	8	293952	293959	75 %	0 %	0 %	25 %	116627220
6037	NC_008532	GAA	2	6	293965	293970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627220
6038	NC_008532	A	6	6	294064	294069	100 %	0 %	0 %	0 %	116627220
6039	NC_008532	AGG	2	6	294076	294081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_008532	ATA	2	6	294192	294197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_008532	A	7	7	294241	294247	100 %	0 %	0 %	0 %	116627221
6042	NC_008532	GCT	2	6	294292	294297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627221
6043	NC_008532	GGT	2	6	294307	294312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627221
6044	NC_008532	GAT	2	6	294328	294333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627221
6045	NC_008532	ATA	2	6	294365	294370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627221
6046	NC_008532	AAC	2	6	294523	294528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627221
6047	NC_008532	CTA	2	6	294656	294661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627221
6048	NC_008532	CTG	2	6	294812	294817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627221
6049	NC_008532	TCA	2	6	294838	294843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627221
6050	NC_008532	GTT	2	6	294856	294861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627221
6051	NC_008532	AAC	2	6	294862	294867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627221
6052	NC_008532	CAA	3	9	294877	294885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627221
6053	NC_008532	AAG	2	6	294914	294919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627221
6054	NC_008532	TAA	2	6	294963	294968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627221
6055	NC_008532	CAAA	2	8	294983	294990	75 %	0 %	0 %	25 %	116627221
6056	NC_008532	ATG	2	6	295028	295033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627221
6057	NC_008532	ATG	2	6	295052	295057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627221
6058	NC_008532	GAA	2	6	295181	295186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_008532	GAA	2	6	295211	295216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_008532	AGC	2	6	295218	295223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_008532	ATG	2	6	295239	295244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_008532	A	6	6	295289	295294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_008532	TGC	2	6	295330	295335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_008532	T	6	6	295350	295355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_008532	ATT	2	6	295448	295453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6068	NC_008532	GAT	3	9	295559	295567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_008532	ATG	2	6	295649	295654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_008532	GAG	2	6	295664	295669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_008532	TGA	2	6	295711	295716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_008532	CAG	2	6	295725	295730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_008532	CAA	2	6	295792	295797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_008532	ATT	2	6	295802	295807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_008532	TGTC	2	8	295818	295825	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6076	NC_008532	TACT	2	8	295886	295893	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6077	NC_008532	TGA	2	6	295915	295920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6082	NC_008532	TGG	2	6	296488	296493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6112	NC_008532	CTT	2	6	298246	298251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627223
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6115	NC_008532	AT	3	6	298355	298360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_008532	ATA	2	6	298382	298387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_008532	TGTT	2	8	298571	298578	0 %	75 %	25 %	0 %	116627224
6118	NC_008532	CAC	2	6	298598	298603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116627224
6119	NC_008532	CT	3	6	298633	298638	0 %	50 %	0 %	50 %	116627224
6120	NC_008532	CAG	2	6	298654	298659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627224
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6374	NC_008532	ATG	2	6	311516	311521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6375	NC_008532	CAGATG	2	12	311543	311554	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6376	NC_008532	GTCA	2	8	311570	311577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6377	NC_008532	TTA	2	6	311601	311606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6378	NC_008532	GAA	2	6	311660	311665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6382	NC_008532	TTA	2	6	311907	311912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6383	NC_008532	TGAT	2	8	311919	311926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6389	NC_008532	TGG	2	6	312367	312372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6488	NC_008532	ATA	2	6	317120	317125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6493	NC_008532	TG	3	6	317420	317425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6498	NC_008532	AAT	2	6	317742	317747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6499	NC_008532	AGTG	2	8	317783	317790	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6500	NC_008532	TCT	2	6	317796	317801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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