MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9 plasmid 2

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008501	A	6	6	19	24	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008501	TAC	2	6	75	80	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326685
3	NC_008501	T	7	7	95	101	0 %	100 %	0 %	0 %	116326685
4	NC_008501	TTG	2	6	108	113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326685
5	NC_008501	AAG	2	6	154	159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326685
6	NC_008501	TCT	2	6	171	176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326685
7	NC_008501	TAA	2	6	188	193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326685
8	NC_008501	TTG	2	6	211	216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326685
9	NC_008501	T	6	6	245	250	0 %	100 %	0 %	0 %	116326685
10	NC_008501	TGT	2	6	273	278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326685
11	NC_008501	GTAA	2	8	308	315	50 %	25 %	25 %	0 %	116326685
12	NC_008501	A	7	7	443	449	100 %	0 %	0 %	0 %	116326685
13	NC_008501	ATA	2	6	504	509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326685
14	NC_008501	TTA	2	6	541	546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008501	A	6	6	553	558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008501	TAT	2	6	572	577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008501	AAC	2	6	624	629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008501	AACA	2	8	715	722	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008501	TTCT	2	8	730	737	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_008501	TGT	2	6	833	838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008501	AT	3	6	889	894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008501	AAGA	2	8	924	931	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008501	CCAA	2	8	966	973	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008501	AGA	2	6	1061	1066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008501	GA	3	6	1065	1070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008501	TCT	2	6	1083	1088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008501	CTG	2	6	1093	1098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008501	ATA	2	6	1182	1187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008501	TTGG	2	8	1260	1267	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008501	T	6	6	1292	1297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008501	GTGAT	2	10	1488	1497	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008501	TTC	2	6	1498	1503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008501	TC	3	6	1568	1573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008501	ATT	2	6	1592	1597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008501	ATTT	2	8	1694	1701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008501	ATG	2	6	1718	1723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008501	GGTC	2	8	1725	1732	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008501	GGT	2	6	1753	1758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008501	GTT	2	6	1893	1898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008501	CTT	2	6	1907	1912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008501	A	7	7	1954	1960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008501	TCT	2	6	1979	1984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008501	TAG	2	6	1996	2001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008501	A	6	6	2018	2023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008501	TAC	2	6	2053	2058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008501	A	9	9	2072	2080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008501	T	8	8	2158	2165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008501	TTA	2	6	2175	2180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008501	GTG	2	6	2357	2362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326686
50	NC_008501	TTTA	2	8	2616	2623	25 %	75 %	0 %	0 %	116326686
51	NC_008501	TAAAG	2	10	2631	2640	60 %	20 %	20 %	0 %	116326686
52	NC_008501	ATA	2	6	2693	2698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326686
53	NC_008501	TGA	2	6	2723	2728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326686
54	NC_008501	AGTGG	2	10	2777	2786	20 %	20 %	60 %	0 %	116326686
55	NC_008501	TA	3	6	2948	2953	50 %	50 %	0 %	0 %	116326686
56	NC_008501	TGG	2	6	2985	2990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326686
57	NC_008501	AAG	2	6	3007	3012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326686
58	NC_008501	TGA	2	6	3024	3029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326686
59	NC_008501	ATT	2	6	3125	3130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326686
60	NC_008501	A	6	6	3136	3141	100 %	0 %	0 %	0 %	116326686
61	NC_008501	T	7	7	3169	3175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008501	CGTGA	2	10	3213	3222	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_008501	TGG	2	6	3235	3240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008501	G	6	6	3264	3269	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.