MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen chromosome

Total Repeats: 61287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_008346	TTC	2	6	806633	806638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17002	NC_008346	TGC	2	6	806691	806696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114566248
17003	NC_008346	GTA	2	6	806708	806713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114566248
17004	NC_008346	ACT	2	6	806727	806732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114566248
17005	NC_008346	GATA	2	8	806757	806764	50 %	25 %	25 %	0 %	114566248
17006	NC_008346	TAT	2	6	806776	806781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114566248
17007	NC_008346	AGA	2	6	806820	806825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114566248
17008	NC_008346	CAG	2	6	806846	806851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114566248
17009	NC_008346	TCA	2	6	806892	806897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114566248
17010	NC_008346	TTA	2	6	806909	806914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114566248
17011	NC_008346	TGC	2	6	806919	806924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114566248
17012	NC_008346	AT	5	10	806960	806969	50 %	50 %	0 %	0 %	114566248
17013	NC_008346	GAC	2	6	806970	806975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114566248
17014	NC_008346	TCT	2	6	806997	807002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114566248
17015	NC_008346	CTT	2	6	807053	807058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114566248
17016	NC_008346	AGA	2	6	807087	807092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114566248
17017	NC_008346	GCA	2	6	807124	807129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114566248
17018	NC_008346	AGC	2	6	807138	807143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114566248
17019	NC_008346	ATG	2	6	807148	807153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114566248
17020	NC_008346	TACC	2	8	807159	807166	25 %	25 %	0 %	50 %	114566248
17021	NC_008346	ATT	2	6	807167	807172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114566248
17022	NC_008346	CAG	2	6	807221	807226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114566248
17023	NC_008346	GGAA	2	8	807270	807277	50 %	0 %	50 %	0 %	114566248
17024	NC_008346	GAT	2	6	807331	807336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114566248
17025	NC_008346	ATT	2	6	807382	807387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114566248
17026	NC_008346	A	8	8	807453	807460	100 %	0 %	0 %	0 %	114566248
17027	NC_008346	TTA	2	6	807535	807540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114566248
17028	NC_008346	GCAA	2	8	807546	807553	50 %	0 %	25 %	25 %	114566248
17029	NC_008346	GGAA	2	8	807567	807574	50 %	0 %	50 %	0 %	114566248
17030	NC_008346	TAT	2	6	807632	807637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114566248
17031	NC_008346	TCT	2	6	807648	807653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17032	NC_008346	A	7	7	807684	807690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17033	NC_008346	AT	3	6	807717	807722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17034	NC_008346	TAT	3	9	807725	807733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17035	NC_008346	CTT	2	6	807734	807739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17036	NC_008346	TA	3	6	807748	807753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17037	NC_008346	TAT	2	6	807778	807783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17038	NC_008346	AT	3	6	807797	807802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17039	NC_008346	TTA	2	6	807806	807811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17040	NC_008346	ATT	2	6	807842	807847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17041	NC_008346	GTG	2	6	807907	807912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114566249
17042	NC_008346	GCAA	2	8	807937	807944	50 %	0 %	25 %	25 %	114566249
17043	NC_008346	AGT	2	6	807957	807962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114566249
17044	NC_008346	TAT	2	6	808088	808093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114566249
17045	NC_008346	GAA	2	6	808235	808240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114566249
17046	NC_008346	T	6	6	808370	808375	0 %	100 %	0 %	0 %	114566249
17047	NC_008346	TA	3	6	808397	808402	50 %	50 %	0 %	0 %	114566249
17048	NC_008346	GA	3	6	808433	808438	50 %	0 %	50 %	0 %	114566249
17049	NC_008346	TTA	2	6	808457	808462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114566249
17050	NC_008346	CATT	2	8	808626	808633	25 %	50 %	0 %	25 %	114566249
17051	NC_008346	TTA	2	6	808677	808682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114566249
17052	NC_008346	T	6	6	808729	808734	0 %	100 %	0 %	0 %	114566249
17053	NC_008346	GCA	2	6	808738	808743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114566249
17054	NC_008346	AT	3	6	808749	808754	50 %	50 %	0 %	0 %	114566249
17055	NC_008346	AAT	2	6	808960	808965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17056	NC_008346	ATT	2	6	808974	808979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17057	NC_008346	AAT	2	6	809018	809023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17058	NC_008346	TAA	2	6	809072	809077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17059	NC_008346	ACAAA	2	10	809081	809090	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17060	NC_008346	AGG	2	6	809099	809104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17061	NC_008346	AAT	2	6	809190	809195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114566250
17062	NC_008346	ACTT	2	8	809349	809356	25 %	50 %	0 %	25 %	114566250
17063	NC_008346	GTT	2	6	809456	809461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114566250
17064	NC_008346	ATT	2	6	809469	809474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114566250
17065	NC_008346	CTT	2	6	809509	809514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114566250
17066	NC_008346	ATC	2	6	809584	809589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114566250
17067	NC_008346	GTTG	2	8	809754	809761	0 %	50 %	50 %	0 %	114566250
17068	NC_008346	TGT	2	6	809767	809772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114566250
17069	NC_008346	GATG	2	8	809805	809812	25 %	25 %	50 %	0 %	114566250
17070	NC_008346	ACC	2	6	809822	809827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114566250
17071	NC_008346	AT	3	6	809833	809838	50 %	50 %	0 %	0 %	114566250
17072	NC_008346	AAC	2	6	809900	809905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114566250
17073	NC_008346	TGG	2	6	810071	810076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114566250
17074	NC_008346	AGA	2	6	810210	810215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114566250
17075	NC_008346	CAG	2	6	810309	810314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114566250
17076	NC_008346	ATC	2	6	810321	810326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114566250
17077	NC_008346	AGC	2	6	810327	810332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114566250
17078	NC_008346	ATA	2	6	810333	810338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114566250
17079	NC_008346	T	6	6	810348	810353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17080	NC_008346	GAG	2	6	810374	810379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17081	NC_008346	ATT	2	6	810397	810402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17082	NC_008346	GCG	3	9	810448	810456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17083	NC_008346	TTTGCT	2	12	810473	810484	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17084	NC_008346	T	7	7	810492	810498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17085	NC_008346	ATA	3	9	810653	810661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114566251
17086	NC_008346	GA	3	6	810709	810714	50 %	0 %	50 %	0 %	114566251
17087	NC_008346	GAA	2	6	810781	810786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114566251
17088	NC_008346	ATTTC	2	10	810799	810808	20 %	60 %	0 %	20 %	114566251
17089	NC_008346	TGG	2	6	810868	810873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114566251
17090	NC_008346	AGA	2	6	810961	810966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114566251
17091	NC_008346	ACC	2	6	810981	810986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114566251
17092	NC_008346	TAA	2	6	810991	810996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114566251
17093	NC_008346	CAA	2	6	810997	811002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114566251
17094	NC_008346	CCA	2	6	811014	811019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114566251
17095	NC_008346	TAA	2	6	811152	811157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114566251
17096	NC_008346	GCC	2	6	811189	811194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114566251
17097	NC_008346	GGT	2	6	811195	811200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114566251
17098	NC_008346	ACT	2	6	811322	811327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114566251
17099	NC_008346	A	6	6	811411	811416	100 %	0 %	0 %	0 %	114566251
17100	NC_008346	AAAT	2	8	811449	811456	75 %	25 %	0 %	0 %	114566251
17101	NC_008346	AAG	2	6	811545	811550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114566251
17102	NC_008346	GAA	3	9	811608	811616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114566252
17103	NC_008346	GGCA	2	8	811618	811625	25 %	0 %	50 %	25 %	114566252
17104	NC_008346	GCC	2	6	811674	811679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114566252
17105	NC_008346	ATC	2	6	811702	811707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114566252
17106	NC_008346	ACT	2	6	811728	811733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114566252
17107	NC_008346	ACA	2	6	811740	811745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114566252
17108	NC_008346	CCTATA	2	12	811879	811890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114566252
17109	NC_008346	GAA	2	6	811923	811928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114566252
17110	NC_008346	A	6	6	811935	811940	100 %	0 %	0 %	0 %	114566252
17111	NC_008346	ATT	2	6	811959	811964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114566252
17112	NC_008346	AGT	2	6	812036	812041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114566252
17113	NC_008346	CGG	2	6	812086	812091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114566252
17114	NC_008346	GCT	2	6	812110	812115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114566252
17115	NC_008346	TTCC	2	8	812117	812124	0 %	50 %	0 %	50 %	114566252
17116	NC_008346	ACC	2	6	812166	812171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114566252
17117	NC_008346	ATG	3	9	812173	812181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114566252
17118	NC_008346	AGC	2	6	812236	812241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114566252
17119	NC_008346	ATTT	2	8	812357	812364	25 %	75 %	0 %	0 %	114566252
17120	NC_008346	ATT	2	6	812374	812379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114566252
17121	NC_008346	TAT	2	6	812388	812393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114566252
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17123	NC_008346	A	7	7	812488	812494	100 %	0 %	0 %	0 %	114566252
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17492	NC_008346	AAGG	2	8	829664	829671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17493	NC_008346	TTGA	2	8	829685	829692	25 %	50 %	25 %	0 %	114566265
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17500	NC_008346	T	6	6	829926	829931	0 %	100 %	0 %	0 %	114566265

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