MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen chromosome

Total Repeats: 61287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008346	ATC	2	6	621263	621268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114566072
13002	NC_008346	GTTG	2	8	621433	621440	0 %	50 %	50 %	0 %	114566072
13003	NC_008346	TGT	2	6	621446	621451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114566072
13004	NC_008346	GATG	2	8	621484	621491	25 %	25 %	50 %	0 %	114566072
13005	NC_008346	ACC	2	6	621501	621506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114566072
13006	NC_008346	AT	3	6	621512	621517	50 %	50 %	0 %	0 %	114566072
13007	NC_008346	AAC	2	6	621579	621584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114566072
13008	NC_008346	TGG	2	6	621750	621755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114566072
13009	NC_008346	AGA	2	6	621889	621894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114566072
13010	NC_008346	CAG	2	6	621988	621993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114566072
13011	NC_008346	ATC	2	6	622000	622005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114566072
13012	NC_008346	AGC	2	6	622006	622011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114566072
13013	NC_008346	ATA	2	6	622012	622017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114566072
13014	NC_008346	T	6	6	622027	622032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_008346	GAG	2	6	622053	622058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_008346	ATT	2	6	622076	622081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_008346	TTTGCT	2	12	622152	622163	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	114566073
13018	NC_008346	T	7	7	622171	622177	0 %	100 %	0 %	0 %	114566073
13019	NC_008346	AGAAT	2	10	622226	622235	60 %	20 %	20 %	0 %	114566073
13020	NC_008346	AT	3	6	622294	622299	50 %	50 %	0 %	0 %	114566073
13021	NC_008346	CCAG	2	8	622400	622407	25 %	0 %	25 %	50 %	114566073
13022	NC_008346	CTA	2	6	622408	622413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114566073
13023	NC_008346	CAG	2	6	622415	622420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114566073
13024	NC_008346	AAT	2	6	622477	622482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114566073
13025	NC_008346	ATA	2	6	622547	622552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114566073
13026	NC_008346	TAT	2	6	622636	622641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114566073
13027	NC_008346	CCT	2	6	622662	622667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114566073
13028	NC_008346	ATA	2	6	622668	622673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114566073
13029	NC_008346	ACCGG	2	10	622685	622694	20 %	0 %	40 %	40 %	114566073
13030	NC_008346	TTA	2	6	622783	622788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114566073
13031	NC_008346	GCT	2	6	622817	622822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114566073
13032	NC_008346	CT	3	6	622821	622826	0 %	50 %	0 %	50 %	114566073
13033	NC_008346	ATC	2	6	622848	622853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114566073
13034	NC_008346	TAG	2	6	622856	622861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114566073
13035	NC_008346	ATA	2	6	622977	622982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114566074
13036	NC_008346	TATCC	2	10	623068	623077	20 %	40 %	0 %	40 %	114566074
13037	NC_008346	AAC	2	6	623078	623083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114566074
13038	NC_008346	AG	3	6	623091	623096	50 %	0 %	50 %	0 %	114566074
13039	NC_008346	TTC	2	6	623165	623170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114566074
13040	NC_008346	CT	3	6	623175	623180	0 %	50 %	0 %	50 %	114566074
13041	NC_008346	GGA	2	6	623246	623251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114566074
13042	NC_008346	CGGG	2	8	623255	623262	0 %	0 %	75 %	25 %	114566074
13043	NC_008346	TGG	2	6	623277	623282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114566074
13044	NC_008346	AG	4	8	623295	623302	50 %	0 %	50 %	0 %	114566074
13045	NC_008346	GTC	2	6	623369	623374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114566074
13046	NC_008346	GTC	2	6	623399	623404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_008346	G	6	6	623427	623432	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_008346	T	6	6	623471	623476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_008346	GAAA	2	8	623548	623555	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_008346	GCA	2	6	623607	623612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114566075
13051	NC_008346	AGGA	2	8	623690	623697	50 %	0 %	50 %	0 %	114566075
13052	NC_008346	TTCC	2	8	623711	623718	0 %	50 %	0 %	50 %	114566075
13053	NC_008346	GCG	2	6	623809	623814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114566075
13054	NC_008346	GAA	2	6	623905	623910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114566075
13055	NC_008346	GTT	2	6	623934	623939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114566075
13056	NC_008346	CTGG	2	8	623980	623987	0 %	25 %	50 %	25 %	114566075
13057	NC_008346	GCC	2	6	623999	624004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114566075
13058	NC_008346	T	6	6	624009	624014	0 %	100 %	0 %	0 %	114566075
13059	NC_008346	GGATTT	2	12	624015	624026	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	114566075
13060	NC_008346	GTAA	2	8	624190	624197	50 %	25 %	25 %	0 %	114566075
13061	NC_008346	TTAT	2	8	624236	624243	25 %	75 %	0 %	0 %	114566075
13062	NC_008346	T	6	6	624261	624266	0 %	100 %	0 %	0 %	114566075
13063	NC_008346	GTTC	2	8	624315	624322	0 %	50 %	25 %	25 %	114566075
13064	NC_008346	CTG	2	6	624349	624354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114566075
13065	NC_008346	GAAG	2	8	624381	624388	50 %	0 %	50 %	0 %	114566075
13066	NC_008346	A	6	6	624407	624412	100 %	0 %	0 %	0 %	114566075
13067	NC_008346	CTTGG	2	10	624452	624461	0 %	40 %	40 %	20 %	114566076
13068	NC_008346	CCTGGC	2	12	624463	624474	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114566076
13069	NC_008346	TAT	2	6	624493	624498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114566076
13070	NC_008346	AGC	2	6	624504	624509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114566076
13071	NC_008346	TGC	2	6	624543	624548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114566076
13072	NC_008346	AGC	2	6	624706	624711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114566076
13073	NC_008346	TAT	2	6	624790	624795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114566076
13074	NC_008346	GGA	2	6	624813	624818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114566076
13075	NC_008346	GAT	2	6	624932	624937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114566077
13076	NC_008346	CGG	2	6	624964	624969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114566077
13077	NC_008346	T	7	7	624980	624986	0 %	100 %	0 %	0 %	114566077
13078	NC_008346	TTAT	2	8	624994	625001	25 %	75 %	0 %	0 %	114566077
13079	NC_008346	TGAA	2	8	625033	625040	50 %	25 %	25 %	0 %	114566077
13080	NC_008346	ACT	2	6	625049	625054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114566077
13081	NC_008346	TCC	2	6	625084	625089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114566077
13082	NC_008346	GAA	2	6	625104	625109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114566077
13083	NC_008346	G	6	6	625129	625134	0 %	0 %	100 %	0 %	114566077
13084	NC_008346	GGA	2	6	625172	625177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114566077
13085	NC_008346	GAA	2	6	625185	625190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114566077
13086	NC_008346	TTG	2	6	625205	625210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114566077
13087	NC_008346	TGGCTG	2	12	625270	625281	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	114566077
13088	NC_008346	AT	3	6	625293	625298	50 %	50 %	0 %	0 %	114566077
13089	NC_008346	AT	3	6	625355	625360	50 %	50 %	0 %	0 %	114566077
13090	NC_008346	TTA	2	6	625397	625402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114566078
13091	NC_008346	TTG	2	6	625439	625444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114566078
13092	NC_008346	TGCC	2	8	625451	625458	0 %	25 %	25 %	50 %	114566078
13093	NC_008346	GAA	2	6	625678	625683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114566078
13094	NC_008346	A	6	6	625682	625687	100 %	0 %	0 %	0 %	114566078
13095	NC_008346	TCAG	2	8	625743	625750	25 %	25 %	25 %	25 %	114566078
13096	NC_008346	CTG	2	6	625790	625795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114566078
13097	NC_008346	TGA	2	6	625985	625990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114566078
13098	NC_008346	CCAGG	2	10	626004	626013	20 %	0 %	40 %	40 %	114566078
13099	NC_008346	GGC	2	6	626032	626037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114566078
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13101	NC_008346	TA	3	6	626083	626088	50 %	50 %	0 %	0 %	114566078
13102	NC_008346	TGA	2	6	626129	626134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114566078
13103	NC_008346	GGC	2	6	626151	626156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114566078
13104	NC_008346	CTG	2	6	626183	626188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114566078
13105	NC_008346	GGA	2	6	626263	626268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114566078
13106	NC_008346	AGG	2	6	626274	626279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114566078
13107	NC_008346	GA	3	6	626291	626296	50 %	0 %	50 %	0 %	114566078
13108	NC_008346	AGG	2	6	626375	626380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114566078
13109	NC_008346	TAG	2	6	626432	626437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114566078
13110	NC_008346	A	6	6	626564	626569	100 %	0 %	0 %	0 %	114566078
13111	NC_008346	ATCA	2	8	626691	626698	50 %	25 %	0 %	25 %	114566079
13112	NC_008346	GGA	2	6	626735	626740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114566079
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13114	NC_008346	GGA	2	6	626793	626798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114566079
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13116	NC_008346	GA	3	6	626834	626839	50 %	0 %	50 %	0 %	114566079
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13119	NC_008346	GCC	2	6	626911	626916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114566079
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13248	NC_008346	TCA	2	6	633136	633141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114566084
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13487	NC_008346	TCG	2	6	643131	643136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114566096
13488	NC_008346	TGGAT	2	10	643356	643365	20 %	40 %	40 %	0 %	114566096
13489	NC_008346	CT	3	6	643426	643431	0 %	50 %	0 %	50 %	114566096
13490	NC_008346	GAA	2	6	643453	643458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114566096
13491	NC_008346	TGG	2	6	643463	643468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114566096
13492	NC_008346	GGA	2	6	643504	643509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114566096
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13495	NC_008346	GTC	2	6	643601	643606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13497	NC_008346	AT	3	6	643632	643637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13500	NC_008346	CATT	2	8	643680	643687	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

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