MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen chromosome

Total Repeats: 61287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50001	NC_008346	GTTTT	2	10	2392446	2392455	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
50002	NC_008346	GGC	2	6	2392501	2392506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50003	NC_008346	TAA	2	6	2392605	2392610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114567589
50004	NC_008346	TCA	2	6	2392641	2392646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114567589
50005	NC_008346	CCG	2	6	2392803	2392808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114567589
50006	NC_008346	GCG	2	6	2392825	2392830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114567589
50007	NC_008346	AAT	2	6	2392885	2392890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114567589
50008	NC_008346	ATAA	2	8	2392951	2392958	75 %	25 %	0 %	0 %	114567589
50009	NC_008346	TCCG	2	8	2392964	2392971	0 %	25 %	25 %	50 %	114567589
50010	NC_008346	ATA	3	9	2392974	2392982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114567589
50011	NC_008346	GCG	2	6	2393093	2393098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114567589
50012	NC_008346	CTTT	2	8	2393140	2393147	0 %	75 %	0 %	25 %	114567589
50013	NC_008346	TTG	2	6	2393148	2393153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114567589
50014	NC_008346	T	6	6	2393219	2393224	0 %	100 %	0 %	0 %	114567589
50015	NC_008346	TTC	2	6	2393398	2393403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50016	NC_008346	CTT	2	6	2393509	2393514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50017	NC_008346	ACC	2	6	2393701	2393706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50018	NC_008346	TTG	2	6	2393716	2393721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50019	NC_008346	T	7	7	2393750	2393756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50020	NC_008346	A	6	6	2393781	2393786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50021	NC_008346	A	6	6	2393792	2393797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50022	NC_008346	CCT	2	6	2393919	2393924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50023	NC_008346	CAGGAT	2	12	2394082	2394093	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114567590
50024	NC_008346	CCA	2	6	2394112	2394117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114567590
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50026	NC_008346	CCT	2	6	2394196	2394201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114567590
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50028	NC_008346	GGCCA	2	10	2394383	2394392	20 %	0 %	40 %	40 %	114567590
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50032	NC_008346	GAA	2	6	2394774	2394779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50033	NC_008346	AC	3	6	2394797	2394802	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50034	NC_008346	GGA	2	6	2394817	2394822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50035	NC_008346	T	7	7	2394840	2394846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50036	NC_008346	AAG	2	6	2394867	2394872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50037	NC_008346	TAG	2	6	2394897	2394902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50038	NC_008346	TAAGAT	2	12	2395050	2395061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	114567591
50039	NC_008346	GCT	2	6	2395105	2395110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114567591
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50041	NC_008346	A	7	7	2395154	2395160	100 %	0 %	0 %	0 %	114567591
50042	NC_008346	CCA	2	6	2395224	2395229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114567591
50043	NC_008346	CTT	2	6	2395288	2395293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114567591
50044	NC_008346	AT	3	6	2395300	2395305	50 %	50 %	0 %	0 %	114567591
50045	NC_008346	TCC	3	9	2395399	2395407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114567591
50046	NC_008346	TCAGGC	2	12	2395457	2395468	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114567591
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50049	NC_008346	CTG	2	6	2395521	2395526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114567591
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50052	NC_008346	TAA	2	6	2395691	2395696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114567591
50053	NC_008346	AGT	2	6	2395701	2395706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114567591
50054	NC_008346	ATAA	2	8	2395711	2395718	75 %	25 %	0 %	0 %	114567591
50055	NC_008346	TCCT	2	8	2395735	2395742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50056	NC_008346	TGT	2	6	2395795	2395800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50057	NC_008346	TTG	2	6	2395819	2395824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50058	NC_008346	CTG	2	6	2395873	2395878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50059	NC_008346	GAA	2	6	2395925	2395930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50060	NC_008346	CGC	2	6	2395983	2395988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50061	NC_008346	TAG	2	6	2396035	2396040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50062	NC_008346	TTTTAT	2	12	2396042	2396053	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50063	NC_008346	GAA	2	6	2396089	2396094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114567592
50064	NC_008346	TTG	2	6	2396114	2396119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114567592
50065	NC_008346	CCTGGC	2	12	2396131	2396142	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114567592
50066	NC_008346	GCCG	2	8	2396157	2396164	0 %	0 %	50 %	50 %	114567592
50067	NC_008346	GCA	2	6	2396171	2396176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114567592
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50069	NC_008346	TGC	2	6	2396286	2396291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114567592
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50089	NC_008346	T	6	6	2397002	2397007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50090	NC_008346	TCC	2	6	2397012	2397017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50091	NC_008346	CAT	2	6	2397088	2397093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114567593
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50109	NC_008346	CAA	2	6	2397939	2397944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50110	NC_008346	T	6	6	2397957	2397962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50111	NC_008346	TAA	2	6	2397965	2397970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50112	NC_008346	CTT	2	6	2397982	2397987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50113	NC_008346	GTT	2	6	2398083	2398088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114567594
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50115	NC_008346	TAT	3	9	2398119	2398127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114567594
50116	NC_008346	TA	3	6	2398182	2398187	50 %	50 %	0 %	0 %	114567594
50117	NC_008346	AAT	2	6	2398206	2398211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114567594
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50120	NC_008346	CCAA	2	8	2398359	2398366	50 %	0 %	0 %	50 %	114567594
50121	NC_008346	ATT	2	6	2398395	2398400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114567594
50122	NC_008346	TTCC	2	8	2398435	2398442	0 %	50 %	0 %	50 %	114567594
50123	NC_008346	GCT	2	6	2398460	2398465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114567594
50124	NC_008346	CTG	2	6	2398479	2398484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114567594
50125	NC_008346	TCC	2	6	2398636	2398641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114567594
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50130	NC_008346	GCG	2	6	2398865	2398870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114567594
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50210	NC_008346	AAACG	2	10	2402810	2402819	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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50220	NC_008346	AT	3	6	2403241	2403246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50221	NC_008346	TAT	2	6	2403253	2403258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50222	NC_008346	CAG	2	6	2403268	2403273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50223	NC_008346	AAT	2	6	2403274	2403279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50224	NC_008346	TTG	2	6	2403318	2403323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50225	NC_008346	TAT	2	6	2403339	2403344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50226	NC_008346	GAG	2	6	2403361	2403366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50227	NC_008346	GTTA	2	8	2403427	2403434	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50228	NC_008346	GAGC	2	8	2403573	2403580	25 %	0 %	50 %	25 %	114567597
50229	NC_008346	GCTT	2	8	2403583	2403590	0 %	50 %	25 %	25 %	114567597
50230	NC_008346	GCT	2	6	2403608	2403613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114567597
50231	NC_008346	C	6	6	2403725	2403730	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50232	NC_008346	ATT	2	6	2403771	2403776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114567598
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50235	NC_008346	CAA	2	6	2403895	2403900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114567598
50236	NC_008346	TACC	2	8	2403904	2403911	25 %	25 %	0 %	50 %	114567598
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50478	NC_008346	AT	3	6	2414308	2414313	50 %	50 %	0 %	0 %	114567606
50479	NC_008346	TC	3	6	2414342	2414347	0 %	50 %	0 %	50 %	114567606
50480	NC_008346	ATGGTA	2	12	2414363	2414374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114567606
50481	NC_008346	CT	3	6	2414378	2414383	0 %	50 %	0 %	50 %	114567606
50482	NC_008346	AAC	2	6	2414421	2414426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114567606
50483	NC_008346	TAA	2	6	2414446	2414451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114567606
50484	NC_008346	ATTC	2	8	2414522	2414529	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50485	NC_008346	A	7	7	2414564	2414570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50486	NC_008346	TAC	2	6	2414579	2414584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50487	NC_008346	A	6	6	2414625	2414630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50488	NC_008346	CTA	2	6	2414694	2414699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50489	NC_008346	TGTT	2	8	2414704	2414711	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50490	NC_008346	TTA	2	6	2414720	2414725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50491	NC_008346	A	6	6	2414818	2414823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50492	NC_008346	AGCTTT	2	12	2414827	2414838	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50493	NC_008346	CAGCTG	2	12	2414868	2414879	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50494	NC_008346	GTA	2	6	2414930	2414935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114567607
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50499	NC_008346	CCT	2	6	2415112	2415117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114567607
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