MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 94497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008345	ATGG	2	8	205144	205151	25 %	25 %	50 %	0 %	114561375
4002	NC_008345	CGCTGA	2	12	205152	205163	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114561375
4003	NC_008345	GAA	2	6	205198	205203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561375
4004	NC_008345	TGT	2	6	205300	205305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561375
4005	NC_008345	TTG	2	6	205309	205314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561375
4006	NC_008345	GCTG	2	8	205352	205359	0 %	25 %	50 %	25 %	114561375
4007	NC_008345	CTG	2	6	205371	205376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561375
4008	NC_008345	TGT	2	6	205390	205395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561375
4009	NC_008345	CAGC	2	8	205418	205425	25 %	0 %	25 %	50 %	114561375
4010	NC_008345	CAT	2	6	205461	205466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561375
4011	NC_008345	ATT	2	6	205477	205482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_008345	TGAT	2	8	205520	205527	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_008345	ACA	2	6	205601	205606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_008345	A	6	6	205606	205611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_008345	TAC	2	6	205635	205640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_008345	TGT	2	6	205676	205681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561376
4017	NC_008345	CTGG	2	8	205749	205756	0 %	25 %	50 %	25 %	114561376
4018	NC_008345	GTT	2	6	205948	205953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561376
4019	NC_008345	TTG	2	6	205965	205970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561376
4020	NC_008345	CTG	2	6	205971	205976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561376
4021	NC_008345	TTG	2	6	206051	206056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561376
4022	NC_008345	TTA	2	6	206084	206089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561376
4023	NC_008345	ACTG	2	8	206124	206131	25 %	25 %	25 %	25 %	114561376
4024	NC_008345	CAGT	2	8	206139	206146	25 %	25 %	25 %	25 %	114561376
4025	NC_008345	AACAAT	2	12	206147	206158	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	114561376
4026	NC_008345	ATC	2	6	206186	206191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561376
4027	NC_008345	CTG	2	6	206207	206212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561377
4028	NC_008345	CAG	2	6	206252	206257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561377
4029	NC_008345	AAG	2	6	206302	206307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561377
4030	NC_008345	ATA	2	6	206396	206401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561377
4031	NC_008345	ATG	2	6	206448	206453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561377
4032	NC_008345	GTA	2	6	206481	206486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561377
4033	NC_008345	AAAG	2	8	206547	206554	75 %	0 %	25 %	0 %	114561377
4034	NC_008345	AAT	2	6	206578	206583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561377
4035	NC_008345	CGC	2	6	206591	206596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561377
4036	NC_008345	CCAAG	2	10	206629	206638	40 %	0 %	20 %	40 %	114561377
4037	NC_008345	CG	3	6	206685	206690	0 %	0 %	50 %	50 %	114561377
4038	NC_008345	ACC	2	6	206703	206708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561377
4039	NC_008345	CAA	2	6	206789	206794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561377
4040	NC_008345	TTC	2	6	206802	206807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561377
4041	NC_008345	TGCA	2	8	206854	206861	25 %	25 %	25 %	25 %	114561377
4042	NC_008345	T	6	6	206874	206879	0 %	100 %	0 %	0 %	114561377
4043	NC_008345	GGT	3	9	206887	206895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561377
4044	NC_008345	TA	3	6	206924	206929	50 %	50 %	0 %	0 %	114561377
4045	NC_008345	TGG	2	6	207024	207029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561377
4046	NC_008345	AAC	2	6	207094	207099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561377
4047	NC_008345	T	6	6	207117	207122	0 %	100 %	0 %	0 %	114561377
4048	NC_008345	AC	3	6	207123	207128	50 %	0 %	0 %	50 %	114561377
4049	NC_008345	AACT	2	8	207132	207139	50 %	25 %	0 %	25 %	114561377
4050	NC_008345	ATC	2	6	207211	207216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561377
4051	NC_008345	CTT	2	6	207218	207223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561377
4052	NC_008345	CAAT	2	8	207250	207257	50 %	25 %	0 %	25 %	114561377
4053	NC_008345	AAT	2	6	207313	207318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561377
4054	NC_008345	CTT	2	6	207350	207355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561377
4055	NC_008345	TAA	2	6	207363	207368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561377
4056	NC_008345	GCT	2	6	207434	207439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561377
4057	NC_008345	CAT	2	6	207476	207481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561377
4058	NC_008345	TTG	2	6	207497	207502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561377
4059	NC_008345	ACG	2	6	207681	207686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561377
4060	NC_008345	T	6	6	207816	207821	0 %	100 %	0 %	0 %	114561377
4061	NC_008345	CAAG	2	8	207962	207969	50 %	0 %	25 %	25 %	114561377
4062	NC_008345	TGC	3	9	207996	208004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561377
4063	NC_008345	CTT	2	6	208025	208030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561377
4064	NC_008345	GA	3	6	208038	208043	50 %	0 %	50 %	0 %	114561377
4065	NC_008345	GA	3	6	208100	208105	50 %	0 %	50 %	0 %	114561377
4066	NC_008345	CGTT	2	8	208240	208247	0 %	50 %	25 %	25 %	114561377
4067	NC_008345	GACGCA	2	12	208286	208297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561377
4068	NC_008345	TTG	2	6	208305	208310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561377
4069	NC_008345	TCAG	2	8	208321	208328	25 %	25 %	25 %	25 %	114561377
4070	NC_008345	GCG	2	6	208389	208394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561377
4071	NC_008345	T	6	6	208441	208446	0 %	100 %	0 %	0 %	114561377
4072	NC_008345	T	6	6	208464	208469	0 %	100 %	0 %	0 %	114561377
4073	NC_008345	AGT	2	6	208498	208503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561377
4074	NC_008345	CA	4	8	208521	208528	50 %	0 %	0 %	50 %	114561377
4075	NC_008345	TCG	2	6	208534	208539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561377
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4078	NC_008345	T	7	7	208692	208698	0 %	100 %	0 %	0 %	114561377
4079	NC_008345	CATA	2	8	208808	208815	50 %	25 %	0 %	25 %	114561377
4080	NC_008345	TACT	2	8	208835	208842	25 %	50 %	0 %	25 %	114561377
4081	NC_008345	A	7	7	208847	208853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_008345	A	6	6	208945	208950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_008345	ATT	2	6	208977	208982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_008345	T	7	7	209014	209020	0 %	100 %	0 %	0 %	114561378
4085	NC_008345	CTGG	2	8	209068	209075	0 %	25 %	50 %	25 %	114561378
4086	NC_008345	TTG	2	6	209127	209132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561378
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4088	NC_008345	AGT	2	6	209299	209304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561378
4089	NC_008345	CAA	2	6	209373	209378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561378
4090	NC_008345	TGC	2	6	209478	209483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561378
4091	NC_008345	ATGA	2	8	209554	209561	50 %	25 %	25 %	0 %	114561378
4092	NC_008345	TGG	2	6	209629	209634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561378
4093	NC_008345	TGG	2	6	209701	209706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561378
4094	NC_008345	TTC	2	6	209708	209713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561378
4095	NC_008345	A	6	6	209792	209797	100 %	0 %	0 %	0 %	114561378
4096	NC_008345	TCA	2	6	209880	209885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561378
4097	NC_008345	CTGTAT	2	12	209893	209904	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	114561378
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4101	NC_008345	ACTG	2	8	210077	210084	25 %	25 %	25 %	25 %	114561378
4102	NC_008345	TGC	2	6	210089	210094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561378
4103	NC_008345	AAC	2	6	210109	210114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561378
4104	NC_008345	A	6	6	210150	210155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_008345	AT	3	6	210179	210184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_008345	TAAT	2	8	210189	210196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_008345	TG	3	6	210199	210204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_008345	AAT	2	6	210297	210302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_008345	CGA	2	6	210319	210324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_008345	GGC	2	6	210338	210343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_008345	TC	3	6	210373	210378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4112	NC_008345	ATT	2	6	210379	210384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_008345	AAAC	2	8	210393	210400	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4114	NC_008345	ATT	2	6	210418	210423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561379
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4116	NC_008345	TACA	2	8	210552	210559	50 %	25 %	0 %	25 %	114561379
4117	NC_008345	TGA	2	6	210591	210596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561379
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4119	NC_008345	TCAG	2	8	210652	210659	25 %	25 %	25 %	25 %	114561379
4120	NC_008345	TGC	2	6	210669	210674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561379
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4122	NC_008345	AAAC	2	8	210835	210842	75 %	0 %	0 %	25 %	114561379
4123	NC_008345	GTT	2	6	210863	210868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561379
4124	NC_008345	GTG	2	6	210947	210952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561379
4125	NC_008345	AAG	2	6	211067	211072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561379
4126	NC_008345	CGC	2	6	211082	211087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561379
4127	NC_008345	CAC	2	6	211146	211151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561379
4128	NC_008345	CAAT	2	8	211215	211222	50 %	25 %	0 %	25 %	114561379
4129	NC_008345	TGA	2	6	211233	211238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561379
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4132	NC_008345	GT	3	6	211376	211381	0 %	50 %	50 %	0 %	114561379
4133	NC_008345	AAT	2	6	211410	211415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561380
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4142	NC_008345	CAAA	2	8	211667	211674	75 %	0 %	0 %	25 %	114561380
4143	NC_008345	AGC	3	9	211683	211691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561380
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4146	NC_008345	TTG	2	6	212027	212032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561380
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4148	NC_008345	AGT	3	9	212197	212205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4152	NC_008345	CGT	2	6	212304	212309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561381
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4171	NC_008345	TTA	2	6	213162	213167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4172	NC_008345	A	7	7	213221	213227	100 %	0 %	0 %	0 %	114561382
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4193	NC_008345	AAGA	2	8	214504	214511	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4194	NC_008345	TAT	2	6	214530	214535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561383
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4222	NC_008345	CCA	2	6	216047	216052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4224	NC_008345	CAC	2	6	216181	216186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4225	NC_008345	CGCCA	2	10	216266	216275	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4226	NC_008345	T	7	7	216289	216295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4229	NC_008345	T	6	6	216451	216456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4230	NC_008345	ATGTTG	2	12	216484	216495	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4231	NC_008345	TAA	2	6	216502	216507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4232	NC_008345	A	6	6	216506	216511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_008345	ATA	2	6	216530	216535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4234	NC_008345	GCA	2	6	216564	216569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4239	NC_008345	AATAA	2	10	216817	216826	80 %	20 %	0 %	0 %	114561384
4240	NC_008345	CAGT	2	8	216828	216835	25 %	25 %	25 %	25 %	114561384
4241	NC_008345	TAT	2	6	216933	216938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561384
4242	NC_008345	GTG	2	6	217019	217024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561384
4243	NC_008345	CGT	2	6	217124	217129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561384
4244	NC_008345	ACGTTT	2	12	217209	217220	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	114561384
4245	NC_008345	GAT	2	6	217276	217281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561384
4246	NC_008345	GTT	2	6	217285	217290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561384
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4248	NC_008345	GTT	2	6	217337	217342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561384
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4371	NC_008345	CTG	2	6	223852	223857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561389
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4489	NC_008345	T	8	8	229622	229629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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