MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 94497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
83001	NC_008345	CA	3	6	4249549	4249554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83002	NC_008345	ATC	2	6	4249611	4249616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114564731
83003	NC_008345	CGGCTT	2	12	4249660	4249671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114564731
83004	NC_008345	AAC	2	6	4249713	4249718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114564731
83005	NC_008345	ACC	2	6	4249776	4249781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114564731
83006	NC_008345	AT	3	6	4249801	4249806	50 %	50 %	0 %	0 %	114564731
83007	NC_008345	GCTT	2	8	4249905	4249912	0 %	50 %	25 %	25 %	114564731
83008	NC_008345	TTG	2	6	4249935	4249940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114564731
83009	NC_008345	AAT	2	6	4249983	4249988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114564731
83010	NC_008345	T	6	6	4250023	4250028	0 %	100 %	0 %	0 %	114564731
83011	NC_008345	GGTA	2	8	4250077	4250084	25 %	25 %	50 %	0 %	114564731
83012	NC_008345	T	6	6	4250119	4250124	0 %	100 %	0 %	0 %	114564731
83013	NC_008345	AATA	2	8	4250214	4250221	75 %	25 %	0 %	0 %	114564731
83014	NC_008345	ACGA	2	8	4250238	4250245	50 %	0 %	25 %	25 %	114564731
83015	NC_008345	TGA	2	6	4250301	4250306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114564731
83016	NC_008345	CAC	2	6	4250341	4250346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114564731
83017	NC_008345	AT	3	6	4250365	4250370	50 %	50 %	0 %	0 %	114564731
83018	NC_008345	AT	3	6	4250492	4250497	50 %	50 %	0 %	0 %	114564731
83019	NC_008345	ATTT	2	8	4250630	4250637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83020	NC_008345	TTA	2	6	4250676	4250681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83021	NC_008345	A	7	7	4250685	4250691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83022	NC_008345	CTTT	2	8	4250697	4250704	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83023	NC_008345	GAA	2	6	4250710	4250715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83024	NC_008345	ATG	2	6	4250745	4250750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83025	NC_008345	CTTTTA	2	12	4250934	4250945	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	114564732
83026	NC_008345	GAA	2	6	4250965	4250970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114564732
83027	NC_008345	ACC	2	6	4251022	4251027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114564732
83028	NC_008345	CCA	2	6	4251032	4251037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114564732
83029	NC_008345	TAACT	2	10	4251104	4251113	40 %	40 %	0 %	20 %	114564732
83030	NC_008345	GCG	2	6	4251148	4251153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114564732
83031	NC_008345	TTGG	2	8	4251161	4251168	0 %	50 %	50 %	0 %	114564732
83032	NC_008345	AGC	2	6	4251184	4251189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114564732
83033	NC_008345	AGTTA	2	10	4251214	4251223	40 %	40 %	20 %	0 %	114564732
83034	NC_008345	CAA	2	6	4251228	4251233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114564732
83035	NC_008345	TGC	2	6	4251249	4251254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114564732
83036	NC_008345	ATT	2	6	4251418	4251423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114564732
83037	NC_008345	GAA	2	6	4251496	4251501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114564732
83038	NC_008345	GTG	2	6	4251596	4251601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114564732
83039	NC_008345	GTTT	2	8	4251605	4251612	0 %	75 %	25 %	0 %	114564732
83040	NC_008345	AACC	2	8	4251635	4251642	50 %	0 %	0 %	50 %	114564732
83041	NC_008345	TCT	2	6	4251644	4251649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114564732
83042	NC_008345	ACC	2	6	4251679	4251684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114564732
83043	NC_008345	CGA	2	6	4251728	4251733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114564732
83044	NC_008345	CGT	2	6	4251807	4251812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114564732
83045	NC_008345	CGG	2	6	4251819	4251824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114564732
83046	NC_008345	TCA	2	6	4251908	4251913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114564732
83047	NC_008345	ATC	2	6	4252090	4252095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114564732
83048	NC_008345	ATA	2	6	4252149	4252154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114564732
83049	NC_008345	GTC	2	6	4252165	4252170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114564732
83050	NC_008345	GC	3	6	4252222	4252227	0 %	0 %	50 %	50 %	114564732
83051	NC_008345	ATG	2	6	4252276	4252281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114564732
83052	NC_008345	TTC	2	6	4252312	4252317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114564732
83053	NC_008345	TTC	2	6	4252372	4252377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114564732
83054	NC_008345	CAT	2	6	4252392	4252397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114564732
83055	NC_008345	AGT	2	6	4252417	4252422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114564732
83056	NC_008345	GCT	2	6	4252537	4252542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114564732
83057	NC_008345	GCTT	2	8	4252583	4252590	0 %	50 %	25 %	25 %	114564732
83058	NC_008345	ATA	2	6	4252622	4252627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114564732
83059	NC_008345	TCG	2	6	4252628	4252633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114564732
83060	NC_008345	CGC	2	6	4252665	4252670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114564732
83061	NC_008345	TGC	2	6	4252750	4252755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114564732
83062	NC_008345	CCA	2	6	4252808	4252813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114564732
83063	NC_008345	TTA	2	6	4252829	4252834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114564732
83064	NC_008345	TGC	2	6	4252848	4252853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114564732
83065	NC_008345	ATC	2	6	4252879	4252884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114564732
83066	NC_008345	CCA	2	6	4252886	4252891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114564732
83067	NC_008345	AGA	2	6	4252956	4252961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114564732
83068	NC_008345	CCA	2	6	4253003	4253008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114564732
83069	NC_008345	TAC	2	6	4253089	4253094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114564732
83070	NC_008345	ACG	2	6	4253212	4253217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114564732
83071	NC_008345	TCACCG	2	12	4253234	4253245	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114564732
83072	NC_008345	ATA	2	6	4253270	4253275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114564732
83073	NC_008345	ACG	2	6	4253296	4253301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114564732
83074	NC_008345	TTC	2	6	4253302	4253307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114564732
83075	NC_008345	CGC	2	6	4253443	4253448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114564732
83076	NC_008345	ACTTA	2	10	4253473	4253482	40 %	40 %	0 %	20 %	114564732
83077	NC_008345	GCGG	2	8	4253552	4253559	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83078	NC_008345	GTTG	2	8	4253659	4253666	0 %	50 %	50 %	0 %	114564733
83079	NC_008345	ATC	2	6	4253680	4253685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114564733
83080	NC_008345	TGC	2	6	4253728	4253733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114564733
83081	NC_008345	CTT	2	6	4253775	4253780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114564733
83082	NC_008345	CTG	2	6	4253814	4253819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114564733
83083	NC_008345	CAG	2	6	4253961	4253966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114564733
83084	NC_008345	TGC	2	6	4253967	4253972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114564733
83085	NC_008345	CAG	2	6	4254009	4254014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114564733
83086	NC_008345	GTGA	2	8	4254178	4254185	25 %	25 %	50 %	0 %	114564733
83087	NC_008345	CAC	2	6	4254279	4254284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114564733
83088	NC_008345	CGT	2	6	4254300	4254305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114564733
83089	NC_008345	GTT	3	9	4254451	4254459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114564733
83090	NC_008345	ACC	2	6	4254460	4254465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114564733
83091	NC_008345	ACG	2	6	4254489	4254494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114564733
83092	NC_008345	C	7	7	4254554	4254560	0 %	0 %	0 %	100 %	114564733
83093	NC_008345	GTG	2	6	4254731	4254736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114564733
83094	NC_008345	CCAC	2	8	4254743	4254750	25 %	0 %	0 %	75 %	114564733
83095	NC_008345	GAC	2	6	4254751	4254756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114564733
83096	NC_008345	TA	3	6	4254861	4254866	50 %	50 %	0 %	0 %	114564733
83097	NC_008345	CTG	2	6	4254870	4254875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114564733
83098	NC_008345	TGT	2	6	4254889	4254894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114564733
83099	NC_008345	GAT	2	6	4255076	4255081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114564733
83100	NC_008345	CTG	3	9	4255107	4255115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114564733
83101	NC_008345	GCA	2	6	4255181	4255186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114564733
83102	NC_008345	GTT	2	6	4255261	4255266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114564733
83103	NC_008345	GTC	2	6	4255276	4255281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114564733
83104	NC_008345	CAC	3	9	4255383	4255391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114564733
83105	NC_008345	TGC	2	6	4255526	4255531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114564733
83106	NC_008345	TCA	2	6	4255568	4255573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114564733
83107	NC_008345	ACC	2	6	4255612	4255617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114564733
83108	NC_008345	ACC	2	6	4255735	4255740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114564733
83109	NC_008345	TTGA	2	8	4255760	4255767	25 %	50 %	25 %	0 %	114564733
83110	NC_008345	ACC	2	6	4255792	4255797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114564733
83111	NC_008345	ACC	2	6	4255885	4255890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114564733
83112	NC_008345	CTT	2	6	4255908	4255913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114564733
83113	NC_008345	GCATTG	2	12	4256057	4256068	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114564733
83114	NC_008345	CCA	2	6	4256144	4256149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114564733
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83116	NC_008345	TGC	2	6	4256164	4256169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114564733
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