MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 85011

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_008322	AAG	2	6	1107996	1108001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046470
19502	NC_008322	GA	3	6	1108008	1108013	50 %	0 %	50 %	0 %	114046470
19503	NC_008322	GGC	2	6	1108016	1108021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046470
19504	NC_008322	CCA	2	6	1108073	1108078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046470
19505	NC_008322	GAC	2	6	1108088	1108093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046470
19506	NC_008322	GT	3	6	1108123	1108128	0 %	50 %	50 %	0 %	114046470
19507	NC_008322	CCA	2	6	1108183	1108188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046470
19508	NC_008322	A	6	6	1108199	1108204	100 %	0 %	0 %	0 %	114046470
19509	NC_008322	T	6	6	1108211	1108216	0 %	100 %	0 %	0 %	114046470
19510	NC_008322	ACA	2	6	1108237	1108242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046470
19511	NC_008322	TGC	2	6	1108312	1108317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046470
19512	NC_008322	GCT	2	6	1108432	1108437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046470
19513	NC_008322	TTGT	2	8	1108449	1108456	0 %	75 %	25 %	0 %	114046470
19514	NC_008322	ATCAAA	2	12	1108574	1108585	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	114046470
19515	NC_008322	GCA	2	6	1108604	1108609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19516	NC_008322	CGC	2	6	1108651	1108656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19517	NC_008322	TG	3	6	1108665	1108670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19518	NC_008322	CAG	2	6	1108746	1108751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046471
19519	NC_008322	GGCA	2	8	1108792	1108799	25 %	0 %	50 %	25 %	114046471
19520	NC_008322	TAG	2	6	1108927	1108932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046471
19521	NC_008322	CGCT	2	8	1109109	1109116	0 %	25 %	25 %	50 %	114046471
19522	NC_008322	CGT	2	6	1109143	1109148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046471
19523	NC_008322	GCG	2	6	1109289	1109294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046471
19524	NC_008322	GTTG	2	8	1109464	1109471	0 %	50 %	50 %	0 %	114046471
19525	NC_008322	A	6	6	1109517	1109522	100 %	0 %	0 %	0 %	114046471
19526	NC_008322	ACT	2	6	1109537	1109542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046471
19527	NC_008322	CAT	2	6	1109550	1109555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046471
19528	NC_008322	GAT	2	6	1109571	1109576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046471
19529	NC_008322	GGTTG	2	10	1109697	1109706	0 %	40 %	60 %	0 %	114046471
19530	NC_008322	TGCC	2	8	1109950	1109957	0 %	25 %	25 %	50 %	114046471
19531	NC_008322	GC	3	6	1109986	1109991	0 %	0 %	50 %	50 %	114046471
19532	NC_008322	CCT	2	6	1110070	1110075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114046471
19533	NC_008322	GTGC	2	8	1110096	1110103	0 %	25 %	50 %	25 %	114046471
19534	NC_008322	CTC	2	6	1110123	1110128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114046471
19535	NC_008322	A	7	7	1110190	1110196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19536	NC_008322	GAT	2	6	1110452	1110457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046472
19537	NC_008322	ATTT	2	8	1110474	1110481	25 %	75 %	0 %	0 %	114046472
19538	NC_008322	CGA	2	6	1110525	1110530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046472
19539	NC_008322	AGC	2	6	1110543	1110548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046472
19540	NC_008322	GGC	2	6	1110566	1110571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046472
19541	NC_008322	GGC	2	6	1110601	1110606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046472
19542	NC_008322	CGG	2	6	1110673	1110678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046472
19543	NC_008322	TTTG	2	8	1110688	1110695	0 %	75 %	25 %	0 %	114046472
19544	NC_008322	GGC	2	6	1110733	1110738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046472
19545	NC_008322	CCG	2	6	1110816	1110821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046472
19546	NC_008322	TTG	2	6	1110828	1110833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046472
19547	NC_008322	TCG	2	6	1110882	1110887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046472
19548	NC_008322	GTC	2	6	1110915	1110920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046472
19549	NC_008322	GGC	2	6	1110971	1110976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046472
19550	NC_008322	ACG	2	6	1110983	1110988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046472
19551	NC_008322	GGC	2	6	1110992	1110997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046472
19552	NC_008322	ATT	2	6	1111001	1111006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046472
19553	NC_008322	TGCTC	2	10	1111048	1111057	0 %	40 %	20 %	40 %	114046472
19554	NC_008322	CTT	2	6	1111071	1111076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046472
19555	NC_008322	GCA	2	6	1111109	1111114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046472
19556	NC_008322	GTG	2	6	1111136	1111141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046472
19557	NC_008322	TGC	2	6	1111188	1111193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046472
19558	NC_008322	A	6	6	1111338	1111343	100 %	0 %	0 %	0 %	114046472
19559	NC_008322	CGG	2	6	1111348	1111353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046472
19560	NC_008322	ATC	2	6	1111367	1111372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046472
19561	NC_008322	GGC	2	6	1111387	1111392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046472
19562	NC_008322	GAG	2	6	1111400	1111405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114046472
19563	NC_008322	TGG	2	6	1111417	1111422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046472
19564	NC_008322	GAT	2	6	1111444	1111449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046472
19565	NC_008322	CAC	2	6	1111504	1111509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046472
19566	NC_008322	CGA	2	6	1111594	1111599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046472
19567	NC_008322	TAT	2	6	1111600	1111605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046472
19568	NC_008322	CTT	2	6	1111720	1111725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046473
19569	NC_008322	CGG	2	6	1111870	1111875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046473
19570	NC_008322	AAT	2	6	1111970	1111975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046473
19571	NC_008322	AAG	2	6	1112055	1112060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046473
19572	NC_008322	CGC	2	6	1112083	1112088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046473
19573	NC_008322	GCA	2	6	1112185	1112190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046473
19574	NC_008322	ATA	2	6	1112429	1112434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046473
19575	NC_008322	GCA	2	6	1112497	1112502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046473
19576	NC_008322	CAG	2	6	1112531	1112536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046473
19577	NC_008322	GGT	2	6	1112579	1112584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046473
19578	NC_008322	GCCA	2	8	1112592	1112599	25 %	0 %	25 %	50 %	114046473
19579	NC_008322	CTG	2	6	1112670	1112675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046473
19580	NC_008322	GGC	2	6	1112774	1112779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046473
19581	NC_008322	CAG	2	6	1112828	1112833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046473
19582	NC_008322	GGC	2	6	1112837	1112842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046473
19583	NC_008322	ACA	2	6	1113001	1113006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046473
19584	NC_008322	GAT	2	6	1113026	1113031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046473
19585	NC_008322	ATA	2	6	1113038	1113043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046473
19586	NC_008322	GCT	2	6	1113047	1113052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046473
19587	NC_008322	GCC	2	6	1113063	1113068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046473
19588	NC_008322	CGC	2	6	1113080	1113085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046473
19589	NC_008322	TCA	2	6	1113153	1113158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046473
19590	NC_008322	GCC	2	6	1113189	1113194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046473
19591	NC_008322	TAAGGC	2	12	1113200	1113211	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114046473
19592	NC_008322	AGC	2	6	1113213	1113218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046473
19593	NC_008322	GCC	2	6	1113231	1113236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046473
19594	NC_008322	TCGC	2	8	1113245	1113252	0 %	25 %	25 %	50 %	114046473
19595	NC_008322	GCC	2	6	1113455	1113460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046473
19596	NC_008322	TAA	2	6	1113467	1113472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046473
19597	NC_008322	CAG	2	6	1113602	1113607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046473
19598	NC_008322	TGAG	2	8	1113637	1113644	25 %	25 %	50 %	0 %	114046473
19599	NC_008322	CAG	2	6	1113809	1113814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046473
19600	NC_008322	CAGT	2	8	1113859	1113866	25 %	25 %	25 %	25 %	114046473
19601	NC_008322	AGC	2	6	1113909	1113914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046473
19602	NC_008322	GCC	2	6	1113932	1113937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046473
19603	NC_008322	AGC	2	6	1114011	1114016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046473
19604	NC_008322	CCCG	2	8	1114157	1114164	0 %	0 %	25 %	75 %	114046473
19605	NC_008322	AAT	2	6	1114166	1114171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046473
19606	NC_008322	TGAT	2	8	1114224	1114231	25 %	50 %	25 %	0 %	114046473
19607	NC_008322	TGA	2	6	1114270	1114275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046473
19608	NC_008322	TCA	2	6	1114288	1114293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046473
19609	NC_008322	ATG	2	6	1114374	1114379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046473
19610	NC_008322	ATC	2	6	1114478	1114483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046473
19611	NC_008322	CTG	2	6	1114484	1114489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046473
19612	NC_008322	TTC	2	6	1114601	1114606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046473
19613	NC_008322	TGC	2	6	1114611	1114616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046473
19614	NC_008322	AATC	2	8	1114636	1114643	50 %	25 %	0 %	25 %	114046473
19615	NC_008322	GTG	2	6	1114689	1114694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046473
19616	NC_008322	TGC	2	6	1114710	1114715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046473
19617	NC_008322	GGC	2	6	1114765	1114770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046473
19618	NC_008322	TGC	2	6	1114782	1114787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046473
19619	NC_008322	TGC	2	6	1114794	1114799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046473
19620	NC_008322	TGC	2	6	1114925	1114930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19621	NC_008322	AG	4	8	1115007	1115014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19622	NC_008322	AGT	2	6	1115107	1115112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046474
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19632	NC_008322	GGC	2	6	1115554	1115559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046474
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19646	NC_008322	GCT	2	6	1116421	1116426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046475
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19672	NC_008322	TTGC	2	8	1117717	1117724	0 %	50 %	25 %	25 %	114046477
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19724	NC_008322	TTTA	2	8	1120509	1120516	25 %	75 %	0 %	0 %	114046479
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19735	NC_008322	CTTGGC	2	12	1121245	1121256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046479
19736	NC_008322	TGGG	2	8	1121270	1121277	0 %	25 %	75 %	0 %	114046479
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19744	NC_008322	TCGG	2	8	1121842	1121849	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19745	NC_008322	GC	3	6	1121948	1121953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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19769	NC_008322	T	6	6	1123517	1123522	0 %	100 %	0 %	0 %	114046481
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19774	NC_008322	CCTA	2	8	1123785	1123792	25 %	25 %	0 %	50 %	114046481
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19799	NC_008322	TTTA	2	8	1124994	1125001	25 %	75 %	0 %	0 %	114046482
19800	NC_008322	TATG	2	8	1125070	1125077	25 %	50 %	25 %	0 %	114046482
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19831	NC_008322	GT	3	6	1126634	1126639	0 %	50 %	50 %	0 %	114046484
19832	NC_008322	CTT	2	6	1126662	1126667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19833	NC_008322	TTAGTG	2	12	1126775	1126786	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	114046485
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19839	NC_008322	GTCT	2	8	1127046	1127053	0 %	50 %	25 %	25 %	114046485
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19841	NC_008322	AAG	2	6	1127114	1127119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046485
19842	NC_008322	GTTCC	2	10	1127201	1127210	0 %	40 %	20 %	40 %	114046485
19843	NC_008322	GGT	2	6	1127216	1127221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046485
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19845	NC_008322	CTT	2	6	1127311	1127316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046485
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19851	NC_008322	CA	3	6	1127592	1127597	50 %	0 %	0 %	50 %	114046485
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19853	NC_008322	TG	3	6	1127853	1127858	0 %	50 %	50 %	0 %	114046485
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19886	NC_008322	AAGA	2	8	1129510	1129517	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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19889	NC_008322	GAG	2	6	1129567	1129572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19968	NC_008322	TTCA	2	8	1135023	1135030	25 %	50 %	0 %	25 %	114046492
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19970	NC_008322	TTG	2	6	1135171	1135176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046492
19971	NC_008322	CCATA	2	10	1135275	1135284	40 %	20 %	0 %	40 %	114046492
19972	NC_008322	CGC	2	6	1135307	1135312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046492
19973	NC_008322	CTT	2	6	1135337	1135342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046492
19974	NC_008322	CTT	2	6	1135418	1135423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046492
19975	NC_008322	AGC	2	6	1135435	1135440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046492
19976	NC_008322	TCG	2	6	1135465	1135470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046492
19977	NC_008322	ACG	2	6	1135642	1135647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046492
19978	NC_008322	GTT	2	6	1135724	1135729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046492
19979	NC_008322	AGG	2	6	1135857	1135862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19980	NC_008322	TCA	2	6	1135867	1135872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19981	NC_008322	TCT	2	6	1135933	1135938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19982	NC_008322	TG	3	6	1135950	1135955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19983	NC_008322	T	6	6	1136008	1136013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19984	NC_008322	AAT	2	6	1136040	1136045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19985	NC_008322	AAT	2	6	1136054	1136059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19986	NC_008322	TTG	2	6	1136091	1136096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046493
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19989	NC_008322	TGA	2	6	1136311	1136316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046493
19990	NC_008322	GCC	2	6	1136354	1136359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046493
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19994	NC_008322	GGC	2	6	1136775	1136780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046493
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19997	NC_008322	GCG	2	6	1136874	1136879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046493
19998	NC_008322	GCG	2	6	1136895	1136900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046493
19999	NC_008322	GGC	2	6	1136927	1136932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046493
20000	NC_008322	CGG	2	6	1137162	1137167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046493

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