MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 85011

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_008322	TAC	2	6	1048620	1048625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046420
18502	NC_008322	CAT	2	6	1048765	1048770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046420
18503	NC_008322	TGC	2	6	1048875	1048880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18504	NC_008322	A	6	6	1048928	1048933	100 %	0 %	0 %	0 %	114046421
18505	NC_008322	A	6	6	1048988	1048993	100 %	0 %	0 %	0 %	114046421
18506	NC_008322	TTG	2	6	1049006	1049011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046421
18507	NC_008322	TTATTT	2	12	1049103	1049114	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	114046421
18508	NC_008322	A	6	6	1049131	1049136	100 %	0 %	0 %	0 %	114046421
18509	NC_008322	GTT	2	6	1049193	1049198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046421
18510	NC_008322	ACAA	2	8	1049202	1049209	75 %	0 %	0 %	25 %	114046421
18511	NC_008322	AAT	2	6	1049408	1049413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046421
18512	NC_008322	G	6	6	1049441	1049446	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18513	NC_008322	CG	3	6	1049455	1049460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18514	NC_008322	AT	3	6	1049560	1049565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18515	NC_008322	T	6	6	1049713	1049718	0 %	100 %	0 %	0 %	114046422
18516	NC_008322	GTG	2	6	1049727	1049732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046422
18517	NC_008322	TGC	2	6	1049734	1049739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046422
18518	NC_008322	CAAAG	2	10	1049897	1049906	60 %	0 %	20 %	20 %	114046422
18519	NC_008322	AG	3	6	1049990	1049995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18520	NC_008322	TAG	2	6	1050000	1050005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18521	NC_008322	TAAA	2	8	1050008	1050015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18522	NC_008322	GCT	2	6	1050071	1050076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18523	NC_008322	GCA	2	6	1050086	1050091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046423
18524	NC_008322	CTT	2	6	1050119	1050124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046423
18525	NC_008322	AAT	2	6	1050136	1050141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046423
18526	NC_008322	CCA	2	6	1050161	1050166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046423
18527	NC_008322	GCC	2	6	1050171	1050176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046423
18528	NC_008322	TCA	2	6	1050269	1050274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046423
18529	NC_008322	GA	3	6	1050394	1050399	50 %	0 %	50 %	0 %	114046423
18530	NC_008322	AGC	2	6	1050445	1050450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046423
18531	NC_008322	TGGG	2	8	1050643	1050650	0 %	25 %	75 %	0 %	114046423
18532	NC_008322	CCGCTG	2	12	1050691	1050702	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114046423
18533	NC_008322	GGTT	2	8	1050788	1050795	0 %	50 %	50 %	0 %	114046423
18534	NC_008322	CCCG	2	8	1050932	1050939	0 %	0 %	25 %	75 %	114046424
18535	NC_008322	CGG	2	6	1050972	1050977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046424
18536	NC_008322	AAT	2	6	1051045	1051050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046424
18537	NC_008322	TTGC	2	8	1051065	1051072	0 %	50 %	25 %	25 %	114046424
18538	NC_008322	CGAG	3	12	1051080	1051091	25 %	0 %	50 %	25 %	114046424
18539	NC_008322	AAT	2	6	1051135	1051140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046424
18540	NC_008322	GGC	2	6	1051183	1051188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046424
18541	NC_008322	TGC	2	6	1051210	1051215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046424
18542	NC_008322	ACC	2	6	1051247	1051252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046424
18543	NC_008322	CGG	2	6	1051287	1051292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046424
18544	NC_008322	TGA	2	6	1051312	1051317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046424
18545	NC_008322	TCA	2	6	1051323	1051328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046424
18546	NC_008322	TAA	2	6	1051357	1051362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046424
18547	NC_008322	GAA	2	6	1051369	1051374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046424
18548	NC_008322	CAG	2	6	1051411	1051416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046424
18549	NC_008322	CGT	2	6	1051431	1051436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046424
18550	NC_008322	ATTG	2	8	1051462	1051469	25 %	50 %	25 %	0 %	114046424
18551	NC_008322	CTTT	2	8	1051525	1051532	0 %	75 %	0 %	25 %	114046425
18552	NC_008322	TTA	2	6	1051549	1051554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046425
18553	NC_008322	GCT	3	9	1051574	1051582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046425
18554	NC_008322	G	6	6	1051609	1051614	0 %	0 %	100 %	0 %	114046425
18555	NC_008322	CGC	2	6	1051662	1051667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046425
18556	NC_008322	TTC	2	6	1051705	1051710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046425
18557	NC_008322	ATG	2	6	1051717	1051722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046425
18558	NC_008322	T	6	6	1051764	1051769	0 %	100 %	0 %	0 %	114046425
18559	NC_008322	CAT	2	6	1051773	1051778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046425
18560	NC_008322	CGG	2	6	1051781	1051786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046425
18561	NC_008322	GTC	2	6	1051824	1051829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046425
18562	NC_008322	TAG	2	6	1051885	1051890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046425
18563	NC_008322	AATC	2	8	1051952	1051959	50 %	25 %	0 %	25 %	114046425
18564	NC_008322	TGAGT	2	10	1051965	1051974	20 %	40 %	40 %	0 %	114046425
18565	NC_008322	TCG	2	6	1052074	1052079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046425
18566	NC_008322	CCA	2	6	1052089	1052094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046425
18567	NC_008322	GGC	2	6	1052115	1052120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046425
18568	NC_008322	AAC	2	6	1052167	1052172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046425
18569	NC_008322	GCC	2	6	1052193	1052198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046425
18570	NC_008322	TAA	2	6	1052199	1052204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046425
18571	NC_008322	T	6	6	1052211	1052216	0 %	100 %	0 %	0 %	114046425
18572	NC_008322	CT	3	6	1052226	1052231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18573	NC_008322	GAT	2	6	1052265	1052270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18574	NC_008322	AAT	2	6	1052282	1052287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18575	NC_008322	AAG	2	6	1052321	1052326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18576	NC_008322	CAA	2	6	1052507	1052512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18577	NC_008322	TAATC	2	10	1052546	1052555	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18578	NC_008322	TCAG	2	8	1052644	1052651	25 %	25 %	25 %	25 %	114046426
18579	NC_008322	AGA	2	6	1052655	1052660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046426
18580	NC_008322	TTG	2	6	1052702	1052707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046426
18581	NC_008322	CAT	2	6	1052745	1052750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046426
18582	NC_008322	CGA	2	6	1052820	1052825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046426
18583	NC_008322	CTT	3	9	1052904	1052912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046426
18584	NC_008322	CAAGC	2	10	1052968	1052977	40 %	0 %	20 %	40 %	114046426
18585	NC_008322	GGCT	2	8	1053039	1053046	0 %	25 %	50 %	25 %	114046426
18586	NC_008322	G	6	6	1053098	1053103	0 %	0 %	100 %	0 %	114046426
18587	NC_008322	ACG	2	6	1053200	1053205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046426
18588	NC_008322	ATT	2	6	1053257	1053262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046426
18589	NC_008322	ACT	2	6	1053350	1053355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046426
18590	NC_008322	ATC	2	6	1053456	1053461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046427
18591	NC_008322	CAC	2	6	1053548	1053553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046427
18592	NC_008322	CGC	2	6	1053570	1053575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046427
18593	NC_008322	ATC	2	6	1053594	1053599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046427
18594	NC_008322	CGC	2	6	1053611	1053616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046427
18595	NC_008322	TCG	2	6	1053744	1053749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046427
18596	NC_008322	GTGAG	2	10	1053778	1053787	20 %	20 %	60 %	0 %	114046427
18597	NC_008322	GCA	2	6	1053802	1053807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046427
18598	NC_008322	CCA	3	9	1053808	1053816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046427
18599	NC_008322	TCG	2	6	1053852	1053857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046427
18600	NC_008322	TAA	2	6	1053862	1053867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046427
18601	NC_008322	CGC	3	9	1053919	1053927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046427
18602	NC_008322	CCG	2	6	1054263	1054268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046427
18603	NC_008322	GAT	2	6	1054274	1054279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046427
18604	NC_008322	GCA	2	6	1054294	1054299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046427
18605	NC_008322	ATA	2	6	1054323	1054328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18606	NC_008322	T	8	8	1054366	1054373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18607	NC_008322	TGC	2	6	1054662	1054667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046428
18608	NC_008322	T	6	6	1054670	1054675	0 %	100 %	0 %	0 %	114046428
18609	NC_008322	GT	3	6	1054761	1054766	0 %	50 %	50 %	0 %	114046428
18610	NC_008322	TGG	2	6	1054773	1054778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046428
18611	NC_008322	GCC	2	6	1054859	1054864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046428
18612	NC_008322	CTTAA	2	10	1054876	1054885	40 %	40 %	0 %	20 %	114046429
18613	NC_008322	GCG	2	6	1054891	1054896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046429
18614	NC_008322	TTA	2	6	1054945	1054950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046429
18615	NC_008322	GT	3	6	1054997	1055002	0 %	50 %	50 %	0 %	114046429
18616	NC_008322	GGT	2	6	1055003	1055008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046429
18617	NC_008322	GTG	2	6	1055032	1055037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046429
18618	NC_008322	CGA	2	6	1055123	1055128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046429
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18629	NC_008322	GGAT	2	8	1055783	1055790	25 %	25 %	50 %	0 %	114046430
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18735	NC_008322	A	6	6	1061787	1061792	100 %	0 %	0 %	0 %	114046434
18736	NC_008322	CGC	2	6	1061829	1061834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046434
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18747	NC_008322	GAAG	2	8	1062150	1062157	50 %	0 %	50 %	0 %	114046434
18748	NC_008322	T	6	6	1062185	1062190	0 %	100 %	0 %	0 %	114046434
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18848	NC_008322	GGC	2	6	1068429	1068434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046438
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18852	NC_008322	TGC	2	6	1068740	1068745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046438
18853	NC_008322	GCA	2	6	1068746	1068751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046438
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18871	NC_008322	GCG	2	6	1070694	1070699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18965	NC_008322	T	7	7	1077031	1077037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18966	NC_008322	TA	3	6	1077042	1077047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18967	NC_008322	GTG	2	6	1077060	1077065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18972	NC_008322	TAAA	2	8	1077231	1077238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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