MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 85011

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_008322	TAA	2	6	961688	961693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046351
17003	NC_008322	ATG	2	6	961779	961784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046351
17004	NC_008322	CTAT	2	8	961846	961853	25 %	50 %	0 %	25 %	114046351
17005	NC_008322	TTA	2	6	961876	961881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046351
17006	NC_008322	CG	4	8	961938	961945	0 %	0 %	50 %	50 %	114046351
17007	NC_008322	CAGG	2	8	961968	961975	25 %	0 %	50 %	25 %	114046351
17008	NC_008322	ATT	2	6	961991	961996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046351
17009	NC_008322	TCG	2	6	962063	962068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046351
17010	NC_008322	TTG	2	6	962077	962082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046351
17011	NC_008322	AGC	2	6	962101	962106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046351
17012	NC_008322	AACA	2	8	962121	962128	75 %	0 %	0 %	25 %	114046351
17013	NC_008322	A	6	6	962128	962133	100 %	0 %	0 %	0 %	114046351
17014	NC_008322	TTAT	2	8	962144	962151	25 %	75 %	0 %	0 %	114046351
17015	NC_008322	TCG	2	6	962153	962158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046351
17016	NC_008322	ACC	2	6	962196	962201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046351
17017	NC_008322	AATT	2	8	962266	962273	50 %	50 %	0 %	0 %	114046351
17018	NC_008322	AGC	2	6	962284	962289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046351
17019	NC_008322	TGG	2	6	962309	962314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046351
17020	NC_008322	A	6	6	962317	962322	100 %	0 %	0 %	0 %	114046351
17021	NC_008322	A	6	6	962364	962369	100 %	0 %	0 %	0 %	114046351
17022	NC_008322	ATT	2	6	962384	962389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046351
17023	NC_008322	CTG	2	6	962509	962514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046351
17024	NC_008322	TTAC	2	8	962516	962523	25 %	50 %	0 %	25 %	114046351
17025	NC_008322	CAA	2	6	962549	962554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046351
17026	NC_008322	GCG	2	6	962619	962624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046351
17027	NC_008322	AAG	2	6	962665	962670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046351
17028	NC_008322	CTA	2	6	962705	962710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046351
17029	NC_008322	GTT	2	6	962723	962728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046351
17030	NC_008322	A	7	7	962833	962839	100 %	0 %	0 %	0 %	114046351
17031	NC_008322	TTG	2	6	962945	962950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046352
17032	NC_008322	CT	3	6	962959	962964	0 %	50 %	0 %	50 %	114046352
17033	NC_008322	ACGATT	2	12	962983	962994	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	114046352
17034	NC_008322	TGG	2	6	962995	963000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046352
17035	NC_008322	TGG	2	6	963016	963021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046352
17036	NC_008322	GAAA	2	8	963054	963061	75 %	0 %	25 %	0 %	114046352
17037	NC_008322	TAA	2	6	963234	963239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046352
17038	NC_008322	GGAT	2	8	963253	963260	25 %	25 %	50 %	0 %	114046352
17039	NC_008322	CAA	2	6	963352	963357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046352
17040	NC_008322	TAT	2	6	963378	963383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046352
17041	NC_008322	TTA	2	6	963391	963396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046352
17042	NC_008322	TGG	2	6	963463	963468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046352
17043	NC_008322	AATT	2	8	963522	963529	50 %	50 %	0 %	0 %	114046352
17044	NC_008322	GAT	3	9	963547	963555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046352
17045	NC_008322	TCA	2	6	963575	963580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046352
17046	NC_008322	TGCGAT	2	12	963636	963647	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114046352
17047	NC_008322	A	6	6	963695	963700	100 %	0 %	0 %	0 %	114046352
17048	NC_008322	CTC	2	6	963770	963775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114046352
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17050	NC_008322	A	6	6	963798	963803	100 %	0 %	0 %	0 %	114046352
17051	NC_008322	GAT	2	6	963823	963828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046352
17052	NC_008322	AGG	2	6	963849	963854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114046352
17053	NC_008322	TTAT	2	8	963883	963890	25 %	75 %	0 %	0 %	114046352
17054	NC_008322	CTG	2	6	963892	963897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046352
17055	NC_008322	ATT	2	6	964007	964012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046352
17056	NC_008322	AGC	2	6	964022	964027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046352
17057	NC_008322	CTAA	2	8	964054	964061	50 %	25 %	0 %	25 %	114046352
17058	NC_008322	CAA	2	6	964066	964071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046352
17059	NC_008322	CTTA	2	8	964153	964160	25 %	50 %	0 %	25 %	114046352
17060	NC_008322	GAC	2	6	964165	964170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046352
17061	NC_008322	AAAT	2	8	964185	964192	75 %	25 %	0 %	0 %	114046352
17062	NC_008322	AAG	2	6	964223	964228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046352
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17064	NC_008322	A	6	6	964342	964347	100 %	0 %	0 %	0 %	114046352
17065	NC_008322	AAC	2	6	964379	964384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046352
17066	NC_008322	A	8	8	964421	964428	100 %	0 %	0 %	0 %	114046352
17067	NC_008322	GCT	2	6	964473	964478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046352
17068	NC_008322	GAAA	2	8	964587	964594	75 %	0 %	25 %	0 %	114046353
17069	NC_008322	GTT	2	6	964606	964611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046353
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17072	NC_008322	AAT	2	6	964985	964990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046353
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17075	NC_008322	TAA	2	6	965349	965354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046353
17076	NC_008322	TGT	2	6	965401	965406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17077	NC_008322	A	6	6	965413	965418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17078	NC_008322	ATTTT	2	10	965471	965480	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17079	NC_008322	CGAA	2	8	965553	965560	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17080	NC_008322	TCA	2	6	965565	965570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17082	NC_008322	ATC	2	6	965640	965645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046354
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17085	NC_008322	GCG	2	6	965741	965746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046354
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17087	NC_008322	GCA	2	6	965841	965846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046354
17088	NC_008322	CGA	2	6	965883	965888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046354
17089	NC_008322	AAT	2	6	966020	966025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046354
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17091	NC_008322	GTCGA	2	10	966138	966147	20 %	20 %	40 %	20 %	114046354
17092	NC_008322	CG	3	6	966206	966211	0 %	0 %	50 %	50 %	114046354
17093	NC_008322	AAT	2	6	966354	966359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046354
17094	NC_008322	GGC	2	6	966378	966383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046354
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17100	NC_008322	TTA	2	6	967002	967007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046355
17101	NC_008322	CT	3	6	967035	967040	0 %	50 %	0 %	50 %	114046355
17102	NC_008322	TGA	2	6	967056	967061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046355
17103	NC_008322	GTT	2	6	967186	967191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046355
17104	NC_008322	GCT	2	6	967228	967233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046355
17105	NC_008322	A	7	7	967247	967253	100 %	0 %	0 %	0 %	114046355
17106	NC_008322	GCA	2	6	967264	967269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046355
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17108	NC_008322	ATA	2	6	967281	967286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046355
17109	NC_008322	A	6	6	967286	967291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17110	NC_008322	CAGA	2	8	967294	967301	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17111	NC_008322	ACA	2	6	967359	967364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046356
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17116	NC_008322	CAGA	2	8	967464	967471	50 %	0 %	25 %	25 %	114046356
17117	NC_008322	CCG	2	6	967478	967483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046356
17118	NC_008322	TTGA	2	8	967709	967716	25 %	50 %	25 %	0 %	114046356
17119	NC_008322	CTTG	2	8	967800	967807	0 %	50 %	25 %	25 %	114046356
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17121	NC_008322	TAC	2	6	968014	968019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046356
17122	NC_008322	ACC	2	6	968057	968062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046356
17123	NC_008322	ACC	2	6	968074	968079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046356
17124	NC_008322	AAT	2	6	968098	968103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046356
17125	NC_008322	TGA	2	6	968133	968138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046356
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17132	NC_008322	AC	3	6	968409	968414	50 %	0 %	0 %	50 %	114046356
17133	NC_008322	GGA	2	6	968424	968429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114046356
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17151	NC_008322	TAAG	2	8	969325	969332	50 %	25 %	25 %	0 %	114046356
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17153	NC_008322	TCG	2	6	969446	969451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046356
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17222	NC_008322	TGAG	2	8	973333	973340	25 %	25 %	50 %	0 %	114046359
17223	NC_008322	TTGC	2	8	973367	973374	0 %	50 %	25 %	25 %	114046359
17224	NC_008322	TGG	2	6	973408	973413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046359
17225	NC_008322	T	6	6	973607	973612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17226	NC_008322	A	6	6	973616	973621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17227	NC_008322	TA	3	6	973644	973649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17228	NC_008322	TGA	2	6	973732	973737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17231	NC_008322	ATAA	2	8	973814	973821	75 %	25 %	0 %	0 %	114046360
17232	NC_008322	AG	3	6	973949	973954	50 %	0 %	50 %	0 %	114046360
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17240	NC_008322	GC	3	6	974566	974571	0 %	0 %	50 %	50 %	114046360
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17482	NC_008322	AAG	2	6	988850	988855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046373
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17484	NC_008322	GCTT	2	8	988916	988923	0 %	50 %	25 %	25 %	114046373
17485	NC_008322	GGCCTT	2	12	988951	988962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046373
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