MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 85011

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_008322	A	6	6	824298	824303	100 %	0 %	0 %	0 %	114046214
14502	NC_008322	ATTT	2	8	824342	824349	25 %	75 %	0 %	0 %	114046214
14503	NC_008322	ATT	2	6	824386	824391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046214
14504	NC_008322	GCCA	2	8	824543	824550	25 %	0 %	25 %	50 %	114046215
14505	NC_008322	GAA	2	6	824575	824580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046215
14506	NC_008322	CG	4	8	824593	824600	0 %	0 %	50 %	50 %	114046215
14507	NC_008322	AAC	2	6	824704	824709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046216
14508	NC_008322	AAC	2	6	824749	824754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046216
14509	NC_008322	AATGA	2	10	824775	824784	60 %	20 %	20 %	0 %	114046216
14510	NC_008322	ACA	2	6	824795	824800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046216
14511	NC_008322	GAA	2	6	824829	824834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046216
14512	NC_008322	GCC	2	6	824943	824948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046216
14513	NC_008322	TTA	2	6	824968	824973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046216
14514	NC_008322	ATCAAA	2	12	825025	825036	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	114046217
14515	NC_008322	AGC	2	6	825136	825141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046217
14516	NC_008322	TGAA	2	8	825152	825159	50 %	25 %	25 %	0 %	114046217
14517	NC_008322	AACAG	2	10	825216	825225	60 %	0 %	20 %	20 %	114046217
14518	NC_008322	GCAGC	2	10	825304	825313	20 %	0 %	40 %	40 %	114046217
14519	NC_008322	AGA	2	6	825351	825356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046217
14520	NC_008322	AG	3	6	825406	825411	50 %	0 %	50 %	0 %	114046217
14521	NC_008322	GAA	2	6	825412	825417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046217
14522	NC_008322	AGA	2	6	825489	825494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046217
14523	NC_008322	GCC	2	6	825547	825552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046217
14524	NC_008322	CTAT	2	8	825602	825609	25 %	50 %	0 %	25 %	114046218
14525	NC_008322	AGC	2	6	825611	825616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046218
14526	NC_008322	AC	3	6	825617	825622	50 %	0 %	0 %	50 %	114046218
14527	NC_008322	CGT	2	6	825664	825669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046218
14528	NC_008322	ACAG	2	8	825704	825711	50 %	0 %	25 %	25 %	114046218
14529	NC_008322	ATC	2	6	825842	825847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046218
14530	NC_008322	T	6	6	825943	825948	0 %	100 %	0 %	0 %	114046218
14531	NC_008322	ATC	2	6	826007	826012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046218
14532	NC_008322	CCGCGC	2	12	826016	826027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046218
14533	NC_008322	CAT	2	6	826120	826125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046218
14534	NC_008322	GAA	2	6	826130	826135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046218
14535	NC_008322	AAG	2	6	826148	826153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046218
14536	NC_008322	GAT	2	6	826183	826188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046219
14537	NC_008322	CG	3	6	826333	826338	0 %	0 %	50 %	50 %	114046219
14538	NC_008322	GCA	2	6	826404	826409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046219
14539	NC_008322	CAA	2	6	826497	826502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046219
14540	NC_008322	AGCC	2	8	826562	826569	25 %	0 %	25 %	50 %	114046219
14541	NC_008322	ACT	2	6	826610	826615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046219
14542	NC_008322	TGG	2	6	826705	826710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046219
14543	NC_008322	GAG	2	6	826744	826749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114046219
14544	NC_008322	ATC	2	6	826759	826764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046219
14545	NC_008322	ATG	2	6	826864	826869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046219
14546	NC_008322	GAG	2	6	826981	826986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114046219
14547	NC_008322	AAGT	2	8	827037	827044	50 %	25 %	25 %	0 %	114046219
14548	NC_008322	GCAAAA	2	12	827057	827068	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	114046219
14549	NC_008322	GCG	2	6	827099	827104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046219
14550	NC_008322	CGC	2	6	827157	827162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046219
14551	NC_008322	CAC	2	6	827212	827217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046219
14552	NC_008322	TTA	2	6	827239	827244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046219
14553	NC_008322	T	6	6	827248	827253	0 %	100 %	0 %	0 %	114046219
14554	NC_008322	GC	3	6	827275	827280	0 %	0 %	50 %	50 %	114046219
14555	NC_008322	CAC	2	6	827327	827332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046219
14556	NC_008322	GCAA	2	8	827495	827502	50 %	0 %	25 %	25 %	114046219
14557	NC_008322	GC	3	6	827504	827509	0 %	0 %	50 %	50 %	114046219
14558	NC_008322	GGC	2	6	827517	827522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046219
14559	NC_008322	CAA	2	6	827554	827559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046219
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14561	NC_008322	GC	3	6	827680	827685	0 %	0 %	50 %	50 %	114046219
14562	NC_008322	GCC	2	6	827714	827719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046219
14563	NC_008322	TGA	2	6	827721	827726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046219
14564	NC_008322	GC	3	6	827861	827866	0 %	0 %	50 %	50 %	114046219
14565	NC_008322	GCC	2	6	827872	827877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046219
14566	NC_008322	GCC	2	6	827883	827888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046219
14567	NC_008322	TGAT	2	8	828119	828126	25 %	50 %	25 %	0 %	114046219
14568	NC_008322	GTG	2	6	828130	828135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046219
14569	NC_008322	TCA	2	6	828144	828149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046219
14570	NC_008322	CA	3	6	828219	828224	50 %	0 %	0 %	50 %	114046219
14571	NC_008322	GC	3	6	828273	828278	0 %	0 %	50 %	50 %	114046219
14572	NC_008322	GC	3	6	828306	828311	0 %	0 %	50 %	50 %	114046219
14573	NC_008322	GCC	2	6	828369	828374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046219
14574	NC_008322	GAC	2	6	828430	828435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046219
14575	NC_008322	CCA	2	6	828476	828481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046219
14576	NC_008322	GA	4	8	828493	828500	50 %	0 %	50 %	0 %	114046219
14577	NC_008322	CAAG	2	8	828562	828569	50 %	0 %	25 %	25 %	114046220
14578	NC_008322	GCA	2	6	828586	828591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046220
14579	NC_008322	TGT	2	6	828593	828598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046220
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14581	NC_008322	CAT	2	6	828770	828775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046221
14582	NC_008322	GAA	2	6	828783	828788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046221
14583	NC_008322	CCG	2	6	828820	828825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046221
14584	NC_008322	AAC	2	6	828882	828887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046221
14585	NC_008322	CCG	2	6	828931	828936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046221
14586	NC_008322	CAT	2	6	828968	828973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046221
14587	NC_008322	CGC	2	6	828974	828979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046221
14588	NC_008322	A	6	6	828996	829001	100 %	0 %	0 %	0 %	114046221
14589	NC_008322	GGGAA	2	10	829015	829024	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14590	NC_008322	ACTAAC	2	12	829030	829041	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14591	NC_008322	A	7	7	829184	829190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14592	NC_008322	GCA	2	6	829236	829241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046222
14593	NC_008322	CAG	2	6	829272	829277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046222
14594	NC_008322	A	6	6	829285	829290	100 %	0 %	0 %	0 %	114046222
14595	NC_008322	TCG	2	6	829310	829315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046222
14596	NC_008322	GC	3	6	829332	829337	0 %	0 %	50 %	50 %	114046222
14597	NC_008322	GC	3	6	829342	829347	0 %	0 %	50 %	50 %	114046222
14598	NC_008322	CGC	2	6	829422	829427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046222
14599	NC_008322	A	6	6	829433	829438	100 %	0 %	0 %	0 %	114046222
14600	NC_008322	TGA	2	6	829458	829463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046222
14601	NC_008322	A	6	6	829472	829477	100 %	0 %	0 %	0 %	114046222
14602	NC_008322	TCA	2	6	829478	829483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046222
14603	NC_008322	CGG	2	6	829497	829502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046222
14604	NC_008322	ATC	2	6	829523	829528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046222
14605	NC_008322	ACC	2	6	829539	829544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046222
14606	NC_008322	GAT	2	6	829549	829554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046222
14607	NC_008322	AGT	2	6	829583	829588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14608	NC_008322	A	6	6	829592	829597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14609	NC_008322	TAA	2	6	829618	829623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14610	NC_008322	ACT	2	6	829721	829726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046223
14611	NC_008322	ATT	2	6	829747	829752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046223
14612	NC_008322	AGT	2	6	829772	829777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046223
14613	NC_008322	A	7	7	829793	829799	100 %	0 %	0 %	0 %	114046223
14614	NC_008322	TGA	2	6	829805	829810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046223
14615	NC_008322	A	7	7	829843	829849	100 %	0 %	0 %	0 %	114046223
14616	NC_008322	A	6	6	829868	829873	100 %	0 %	0 %	0 %	114046223
14617	NC_008322	TTG	2	6	829888	829893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046223
14618	NC_008322	A	6	6	829921	829926	100 %	0 %	0 %	0 %	114046223
14619	NC_008322	ACG	2	6	829954	829959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046223
14620	NC_008322	AATAA	2	10	829981	829990	80 %	20 %	0 %	0 %	114046223
14621	NC_008322	TGC	2	6	830080	830085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046224
14622	NC_008322	ATC	2	6	830103	830108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046224
14623	NC_008322	TCATA	2	10	830198	830207	40 %	40 %	0 %	20 %	114046224
14624	NC_008322	CCT	2	6	830249	830254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114046224
14625	NC_008322	T	6	6	830284	830289	0 %	100 %	0 %	0 %	114046224
14626	NC_008322	A	6	6	830368	830373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14627	NC_008322	CAA	2	6	830378	830383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14628	NC_008322	A	6	6	830392	830397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14629	NC_008322	AAC	2	6	830411	830416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14630	NC_008322	CGTA	2	8	830452	830459	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14631	NC_008322	AAC	2	6	830478	830483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14632	NC_008322	TCA	2	6	830542	830547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14633	NC_008322	GAA	2	6	830640	830645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14634	NC_008322	G	6	6	830696	830701	0 %	0 %	100 %	0 %	114046225
14635	NC_008322	GGT	2	6	830735	830740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046225
14636	NC_008322	AGCAAC	2	12	830831	830842	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	114046225
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14638	NC_008322	CAA	2	6	830943	830948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14639	NC_008322	T	7	7	830973	830979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14640	NC_008322	CA	3	6	831023	831028	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14641	NC_008322	GC	3	6	831075	831080	0 %	0 %	50 %	50 %	114046226
14642	NC_008322	TAA	2	6	831123	831128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046226
14643	NC_008322	ATC	2	6	831203	831208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046226
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14645	NC_008322	AACA	2	8	831349	831356	75 %	0 %	0 %	25 %	114046226
14646	NC_008322	T	6	6	831393	831398	0 %	100 %	0 %	0 %	114046226
14647	NC_008322	GC	3	6	831465	831470	0 %	0 %	50 %	50 %	114046226
14648	NC_008322	GTA	2	6	831478	831483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046226
14649	NC_008322	TTCA	2	8	831508	831515	25 %	50 %	0 %	25 %	114046226
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14651	NC_008322	AAT	2	6	831592	831597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046226
14652	NC_008322	CAC	2	6	831640	831645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046226
14653	NC_008322	CCA	2	6	831650	831655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046226
14654	NC_008322	AAC	2	6	831692	831697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046226
14655	NC_008322	CAC	2	6	831700	831705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046226
14656	NC_008322	GC	3	6	831786	831791	0 %	0 %	50 %	50 %	114046226
14657	NC_008322	GCC	2	6	831847	831852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046226
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14659	NC_008322	CGG	2	6	831866	831871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046226
14660	NC_008322	GGC	2	6	831902	831907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046226
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14669	NC_008322	CGC	3	9	832196	832204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046227
14670	NC_008322	GCG	2	6	832218	832223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046227
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14676	NC_008322	AATCG	2	10	832374	832383	40 %	20 %	20 %	20 %	114046227
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14683	NC_008322	CAT	2	6	832706	832711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046227
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14701	NC_008322	TTCA	2	8	833562	833569	25 %	50 %	0 %	25 %	114046227
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14712	NC_008322	T	6	6	834048	834053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14713	NC_008322	GGCA	2	8	834061	834068	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14714	NC_008322	GCAA	2	8	834078	834085	50 %	0 %	25 %	25 %	114046228
14715	NC_008322	CTGG	2	8	834087	834094	0 %	25 %	50 %	25 %	114046228
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14722	NC_008322	CAGC	2	8	834508	834515	25 %	0 %	25 %	50 %	114046228
14723	NC_008322	AGA	2	6	834517	834522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046228
14724	NC_008322	ACT	2	6	834570	834575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046228
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14727	NC_008322	CGC	2	6	834763	834768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046228
14728	NC_008322	A	6	6	834794	834799	100 %	0 %	0 %	0 %	114046228
14729	NC_008322	GAC	2	6	834800	834805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046228
14730	NC_008322	GAT	2	6	834815	834820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046228
14731	NC_008322	GAC	2	6	834839	834844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046228
14732	NC_008322	GCA	2	6	834851	834856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046228
14733	NC_008322	CAA	2	6	834940	834945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046228
14734	NC_008322	CGA	2	6	834994	834999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046228
14735	NC_008322	CAG	2	6	835025	835030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14736	NC_008322	AGC	2	6	835053	835058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14737	NC_008322	GCCT	2	8	835094	835101	0 %	25 %	25 %	50 %	114046229
14738	NC_008322	CGC	2	6	835195	835200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046229
14739	NC_008322	CAC	2	6	835234	835239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046229
14740	NC_008322	GCA	2	6	835325	835330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046229
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14742	NC_008322	CAAGC	2	10	835810	835819	40 %	0 %	20 %	40 %	114046229
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14975	NC_008322	CAAG	2	8	847670	847677	50 %	0 %	25 %	25 %	114046247
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14983	NC_008322	TGA	2	6	848087	848092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046247
14984	NC_008322	ATA	2	6	848100	848105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046247
14985	NC_008322	TAA	2	6	848138	848143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046247
14986	NC_008322	TCT	2	6	848157	848162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046247
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14991	NC_008322	TAA	2	6	848341	848346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046247
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