MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 85011

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_008322	CAG	2	6	681302	681307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046089
12002	NC_008322	ACTA	2	8	681312	681319	50 %	25 %	0 %	25 %	114046089
12003	NC_008322	GAT	2	6	681339	681344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046089
12004	NC_008322	AGA	2	6	681444	681449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046089
12005	NC_008322	GC	3	6	681484	681489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12006	NC_008322	CCAT	2	8	681622	681629	25 %	25 %	0 %	50 %	114046090
12007	NC_008322	TGAT	2	8	681646	681653	25 %	50 %	25 %	0 %	114046090
12008	NC_008322	CTGA	2	8	681734	681741	25 %	25 %	25 %	25 %	114046090
12009	NC_008322	GACTGA	4	24	681736	681759	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114046090
12010	NC_008322	TAA	2	6	681867	681872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046090
12011	NC_008322	TGG	2	6	681906	681911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046090
12012	NC_008322	TCT	2	6	682102	682107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046090
12013	NC_008322	ATT	2	6	682251	682256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046091
12014	NC_008322	TGTT	2	8	682262	682269	0 %	75 %	25 %	0 %	114046091
12015	NC_008322	T	6	6	682273	682278	0 %	100 %	0 %	0 %	114046091
12016	NC_008322	CGC	2	6	682348	682353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046091
12017	NC_008322	GGGC	2	8	682434	682441	0 %	0 %	75 %	25 %	114046091
12018	NC_008322	CT	3	6	682445	682450	0 %	50 %	0 %	50 %	114046091
12019	NC_008322	TCG	2	6	682484	682489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046091
12020	NC_008322	TGC	2	6	682524	682529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046091
12021	NC_008322	AAT	2	6	682556	682561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046091
12022	NC_008322	AAC	2	6	682688	682693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046091
12023	NC_008322	CGT	2	6	682719	682724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046091
12024	NC_008322	TTC	3	9	682747	682755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046091
12025	NC_008322	TGT	2	6	682901	682906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046091
12026	NC_008322	TGA	2	6	682943	682948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046091
12027	NC_008322	TTGA	2	8	683020	683027	25 %	50 %	25 %	0 %	114046091
12028	NC_008322	ATG	2	6	683060	683065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046091
12029	NC_008322	GCG	2	6	683093	683098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046091
12030	NC_008322	TGCT	2	8	683120	683127	0 %	50 %	25 %	25 %	114046091
12031	NC_008322	CTT	2	6	683157	683162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046091
12032	NC_008322	TGC	2	6	683166	683171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046091
12033	NC_008322	GTT	2	6	683229	683234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046091
12034	NC_008322	ATTG	2	8	683241	683248	25 %	50 %	25 %	0 %	114046091
12035	NC_008322	AAT	2	6	683422	683427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046091
12036	NC_008322	AAT	2	6	683509	683514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046091
12037	NC_008322	CTGC	2	8	683515	683522	0 %	25 %	25 %	50 %	114046091
12038	NC_008322	GGC	2	6	683599	683604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046091
12039	NC_008322	TTC	2	6	683647	683652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046091
12040	NC_008322	TGA	2	6	683661	683666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046091
12041	NC_008322	TGT	2	6	683669	683674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046091
12042	NC_008322	GCGA	2	8	683738	683745	25 %	0 %	50 %	25 %	114046091
12043	NC_008322	ATC	2	6	683764	683769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046091
12044	NC_008322	CTG	2	6	683794	683799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046091
12045	NC_008322	TCA	2	6	683858	683863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046091
12046	NC_008322	CTT	2	6	683883	683888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046091
12047	NC_008322	GAG	2	6	683912	683917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114046091
12048	NC_008322	TTGT	2	8	683935	683942	0 %	75 %	25 %	0 %	114046091
12049	NC_008322	TGC	2	6	683962	683967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046091
12050	NC_008322	TAA	2	6	684138	684143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046091
12051	NC_008322	TAA	2	6	684150	684155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046091
12052	NC_008322	CAA	2	6	684157	684162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046091
12053	NC_008322	TTG	2	6	684187	684192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046091
12054	NC_008322	TTC	2	6	684231	684236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046091
12055	NC_008322	TG	3	6	684331	684336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12056	NC_008322	TC	3	6	684354	684359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12057	NC_008322	GGT	2	6	684374	684379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12058	NC_008322	TGC	2	6	684389	684394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12059	NC_008322	TATG	2	8	684400	684407	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12060	NC_008322	AAATG	2	10	684443	684452	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12061	NC_008322	CTG	2	6	684525	684530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046092
12062	NC_008322	TGC	2	6	684586	684591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046092
12063	NC_008322	ATC	2	6	684636	684641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046092
12064	NC_008322	TGGA	2	8	684654	684661	25 %	25 %	50 %	0 %	114046092
12065	NC_008322	GAA	2	6	684772	684777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046092
12066	NC_008322	GGT	2	6	684780	684785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046092
12067	NC_008322	A	6	6	684830	684835	100 %	0 %	0 %	0 %	114046092
12068	NC_008322	CAG	2	6	684870	684875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046092
12069	NC_008322	CGC	2	6	684876	684881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046092
12070	NC_008322	GCTT	2	8	684926	684933	0 %	50 %	25 %	25 %	114046092
12071	NC_008322	TTC	2	6	684945	684950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046092
12072	NC_008322	GC	3	6	685039	685044	0 %	0 %	50 %	50 %	114046092
12073	NC_008322	CGG	2	6	685047	685052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046092
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12077	NC_008322	GCAT	2	8	685306	685313	25 %	25 %	25 %	25 %	114046092
12078	NC_008322	AAG	3	9	685366	685374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12079	NC_008322	AT	3	6	685589	685594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12080	NC_008322	AAT	2	6	685642	685647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12081	NC_008322	TGA	2	6	685656	685661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12082	NC_008322	TGA	2	6	685665	685670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046093
12083	NC_008322	CAGT	2	8	685756	685763	25 %	25 %	25 %	25 %	114046093
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12088	NC_008322	ATC	2	6	686057	686062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046093
12089	NC_008322	CCTG	2	8	686251	686258	0 %	25 %	25 %	50 %	114046093
12090	NC_008322	GCCA	2	8	686291	686298	25 %	0 %	25 %	50 %	114046093
12091	NC_008322	CTT	2	6	686359	686364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046093
12092	NC_008322	AAG	2	6	686370	686375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046093
12093	NC_008322	A	6	6	686474	686479	100 %	0 %	0 %	0 %	114046093
12094	NC_008322	TGC	2	6	686497	686502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046093
12095	NC_008322	CCCAT	2	10	686533	686542	20 %	20 %	0 %	60 %	114046093
12096	NC_008322	TGG	2	6	686575	686580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046093
12097	NC_008322	CTG	2	6	686648	686653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046093
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12100	NC_008322	ACG	2	6	686895	686900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046093
12101	NC_008322	GCGT	2	8	686952	686959	0 %	25 %	50 %	25 %	114046093
12102	NC_008322	GAC	2	6	686960	686965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046093
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12105	NC_008322	GGC	2	6	687146	687151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046093
12106	NC_008322	GTC	2	6	687167	687172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12107	NC_008322	AAC	2	6	687413	687418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046094
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12109	NC_008322	TGTT	2	8	687447	687454	0 %	75 %	25 %	0 %	114046094
12110	NC_008322	GCG	2	6	687485	687490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046094
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12114	NC_008322	GCC	2	6	687740	687745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046094
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12118	NC_008322	GGT	2	6	687947	687952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046094
12119	NC_008322	CGC	2	6	687953	687958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046094
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12121	NC_008322	CGC	2	6	688303	688308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046094
12122	NC_008322	A	6	6	688362	688367	100 %	0 %	0 %	0 %	114046094
12123	NC_008322	ACA	2	6	688535	688540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046094
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12125	NC_008322	AAG	2	6	688668	688673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046094
12126	NC_008322	TGA	2	6	688788	688793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046094
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12128	NC_008322	GGC	2	6	688834	688839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046094
12129	NC_008322	TGG	2	6	688859	688864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12130	NC_008322	CTGT	2	8	688892	688899	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12131	NC_008322	CTC	2	6	688964	688969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114046095
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12143	NC_008322	CGG	2	6	689795	689800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12144	NC_008322	AGT	2	6	689809	689814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12163	NC_008322	TG	4	8	691540	691547	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12164	NC_008322	GCTAT	2	10	691562	691571	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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12189	NC_008322	CT	3	6	693287	693292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12202	NC_008322	T	6	6	694084	694089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12225	NC_008322	TG	3	6	695322	695327	0 %	50 %	50 %	0 %	114046102
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12231	NC_008322	CGT	2	6	695642	695647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046102
12232	NC_008322	GAA	3	9	695698	695706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046102
12233	NC_008322	T	8	8	695849	695856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12234	NC_008322	ATG	2	6	695896	695901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046103
12235	NC_008322	TGTT	2	8	695941	695948	0 %	75 %	25 %	0 %	114046103
12236	NC_008322	CAAATT	2	12	696097	696108	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	114046103
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12238	NC_008322	ATT	2	6	696280	696285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12239	NC_008322	T	6	6	696284	696289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12240	NC_008322	TAA	2	6	696323	696328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12241	NC_008322	TAT	2	6	696361	696366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046104
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12243	NC_008322	TAT	2	6	696420	696425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046104
12244	NC_008322	TGA	3	9	696457	696465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046104
12245	NC_008322	TCC	2	6	696541	696546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114046104
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12247	NC_008322	TGG	2	6	696744	696749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046104
12248	NC_008322	TGA	2	6	696750	696755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046104
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12264	NC_008322	T	7	7	697601	697607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12267	NC_008322	GCG	2	6	697764	697769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12293	NC_008322	CTG	3	9	699251	699259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12300	NC_008322	GCT	2	6	699555	699560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12323	NC_008322	TGA	2	6	701132	701137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046107
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12328	NC_008322	AAT	2	6	701472	701477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12329	NC_008322	AGA	2	6	701533	701538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046108
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12331	NC_008322	AG	3	6	701751	701756	50 %	0 %	50 %	0 %	114046108
12332	NC_008322	TCAA	2	8	701766	701773	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12333	NC_008322	AC	3	6	701898	701903	50 %	0 %	0 %	50 %	114046109
12334	NC_008322	GCTT	2	8	701988	701995	0 %	50 %	25 %	25 %	114046109
12335	NC_008322	CTTAA	2	10	702008	702017	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12336	NC_008322	GTT	2	6	702024	702029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12337	NC_008322	TG	3	6	702038	702043	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12338	NC_008322	ATTG	2	8	702146	702153	25 %	50 %	25 %	0 %	114046110
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12348	NC_008322	CTGCG	2	10	703119	703128	0 %	20 %	40 %	40 %	114046110
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12351	NC_008322	TTC	2	6	703407	703412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046110
12352	NC_008322	CCTGT	2	10	703413	703422	0 %	40 %	20 %	40 %	114046110
12353	NC_008322	A	6	6	703440	703445	100 %	0 %	0 %	0 %	114046110
12354	NC_008322	AAAT	2	8	703461	703468	75 %	25 %	0 %	0 %	114046110
12355	NC_008322	GAC	2	6	703545	703550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046110
12356	NC_008322	GCTG	2	8	703680	703687	0 %	25 %	50 %	25 %	114046111
12357	NC_008322	CAT	2	6	703690	703695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046111
12358	NC_008322	GCTG	2	8	703714	703721	0 %	25 %	50 %	25 %	114046111
12359	NC_008322	ATC	2	6	703724	703729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046111
12360	NC_008322	TGG	2	6	703738	703743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046111
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12362	NC_008322	TGA	2	6	703768	703773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046111
12363	NC_008322	CAA	2	6	703837	703842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046111
12364	NC_008322	CTG	2	6	703844	703849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046111
12365	NC_008322	CAT	2	6	704017	704022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046111
12366	NC_008322	CTG	2	6	704041	704046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046111
12367	NC_008322	AATC	2	8	704081	704088	50 %	25 %	0 %	25 %	114046111
12368	NC_008322	TTGA	2	8	704105	704112	25 %	50 %	25 %	0 %	114046111
12369	NC_008322	CAG	2	6	704153	704158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046111
12370	NC_008322	TCA	2	6	704295	704300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12372	NC_008322	CAT	2	6	704405	704410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046112
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12384	NC_008322	CAT	2	6	704831	704836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046112
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12389	NC_008322	TTG	2	6	705086	705091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12402	NC_008322	GAA	2	6	705845	705850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046113
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12405	NC_008322	GTCA	2	8	705942	705949	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12406	NC_008322	T	6	6	705960	705965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12425	NC_008322	TTTTA	2	10	707066	707075	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12426	NC_008322	TAT	2	6	707146	707151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12475	NC_008322	GCA	3	9	710359	710367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046118
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12486	NC_008322	GGC	2	6	710875	710880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046118
12487	NC_008322	GCAG	2	8	710990	710997	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12488	NC_008322	A	7	7	711059	711065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12489	NC_008322	CCTT	2	8	711089	711096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12490	NC_008322	TCC	2	6	711108	711113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12491	NC_008322	GGA	2	6	711120	711125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12492	NC_008322	GTC	2	6	711182	711187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046119
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12494	NC_008322	GGC	2	6	711321	711326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046119
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12498	NC_008322	A	6	6	711435	711440	100 %	0 %	0 %	0 %	114046119
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