MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 85011

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
68001	NC_008322	GCGG	2	8	3839353	3839360	0 %	0 %	75 %	25 %	114048727
68002	NC_008322	GC	3	6	3839430	3839435	0 %	0 %	50 %	50 %	114048728
68003	NC_008322	TTC	2	6	3839445	3839450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048728
68004	NC_008322	GCA	2	6	3839462	3839467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048728
68005	NC_008322	TTGCC	2	10	3839543	3839552	0 %	40 %	20 %	40 %	114048728
68006	NC_008322	TCG	2	6	3839606	3839611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048728
68007	NC_008322	GTT	2	6	3839699	3839704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048728
68008	NC_008322	GACT	2	8	3839782	3839789	25 %	25 %	25 %	25 %	114048728
68009	NC_008322	GGT	2	6	3839790	3839795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114048728
68010	NC_008322	AG	3	6	3839846	3839851	50 %	0 %	50 %	0 %	114048728
68011	NC_008322	GAT	2	6	3839952	3839957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048728
68012	NC_008322	ACC	2	6	3839968	3839973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048728
68013	NC_008322	CTT	2	6	3840041	3840046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048728
68014	NC_008322	CTTG	2	8	3840113	3840120	0 %	50 %	25 %	25 %	114048728
68015	NC_008322	GTT	2	6	3840138	3840143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048728
68016	NC_008322	GCGTG	2	10	3840218	3840227	0 %	20 %	60 %	20 %	114048728
68017	NC_008322	GTT	3	9	3840245	3840253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048728
68018	NC_008322	AAGA	2	8	3840263	3840270	75 %	0 %	25 %	0 %	114048728
68019	NC_008322	GCGAT	2	10	3840400	3840409	20 %	20 %	40 %	20 %	114048728
68020	NC_008322	TTC	2	6	3840480	3840485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048728
68021	NC_008322	AGT	2	6	3840548	3840553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048728
68022	NC_008322	GCG	2	6	3840558	3840563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048728
68023	NC_008322	CAA	2	6	3840566	3840571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114048728
68024	NC_008322	CTT	2	6	3840590	3840595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048728
68025	NC_008322	GC	3	6	3840608	3840613	0 %	0 %	50 %	50 %	114048728
68026	NC_008322	TTC	2	6	3840705	3840710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048728
68027	NC_008322	ACA	2	6	3840733	3840738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114048728
68028	NC_008322	TTGG	2	8	3840891	3840898	0 %	50 %	50 %	0 %	114048729
68029	NC_008322	CTG	2	6	3840958	3840963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048729
68030	NC_008322	CCG	2	6	3841154	3841159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048729
68031	NC_008322	TTG	2	6	3841203	3841208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048729
68032	NC_008322	CGA	2	6	3841292	3841297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048729
68033	NC_008322	CCT	2	6	3841359	3841364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114048730
68034	NC_008322	GAG	2	6	3841493	3841498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114048730
68035	NC_008322	TTG	2	6	3841577	3841582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048730
68036	NC_008322	TGT	2	6	3841616	3841621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048730
68037	NC_008322	AG	3	6	3841645	3841650	50 %	0 %	50 %	0 %	114048730
68038	NC_008322	CAA	2	6	3841726	3841731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114048730
68039	NC_008322	CCA	2	6	3841738	3841743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048730
68040	NC_008322	GTGCA	2	10	3841796	3841805	20 %	20 %	40 %	20 %	114048730
68041	NC_008322	AGGA	2	8	3841859	3841866	50 %	0 %	50 %	0 %	114048730
68042	NC_008322	CCGC	2	8	3841881	3841888	0 %	0 %	25 %	75 %	114048730
68043	NC_008322	AGG	2	6	3841909	3841914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114048730
68044	NC_008322	CAAC	2	8	3841971	3841978	50 %	0 %	0 %	50 %	114048730
68045	NC_008322	TCA	2	6	3842021	3842026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048730
68046	NC_008322	C	6	6	3842072	3842077	0 %	0 %	0 %	100 %	114048730
68047	NC_008322	ATA	2	6	3842084	3842089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048730
68048	NC_008322	ATC	2	6	3842108	3842113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68049	NC_008322	GGC	2	6	3842166	3842171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68050	NC_008322	AAT	2	6	3842308	3842313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68051	NC_008322	CA	3	6	3842323	3842328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68052	NC_008322	ATT	2	6	3842439	3842444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68053	NC_008322	ATG	2	6	3842464	3842469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68054	NC_008322	TGAT	2	8	3842488	3842495	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68055	NC_008322	TAA	2	6	3842509	3842514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68056	NC_008322	ATG	2	6	3842527	3842532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048731
68057	NC_008322	CGG	2	6	3842579	3842584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048731
68058	NC_008322	GCG	2	6	3842620	3842625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048731
68059	NC_008322	GGC	2	6	3842725	3842730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048731
68060	NC_008322	TGCCGA	2	12	3842784	3842795	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114048731
68061	NC_008322	GAT	2	6	3842908	3842913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048731
68062	NC_008322	TAT	2	6	3842956	3842961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114048731
68063	NC_008322	TCG	2	6	3842996	3843001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048731
68064	NC_008322	A	6	6	3843023	3843028	100 %	0 %	0 %	0 %	114048731
68065	NC_008322	GCCT	2	8	3843107	3843114	0 %	25 %	25 %	50 %	114048731
68066	NC_008322	GCT	2	6	3843134	3843139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048731
68067	NC_008322	TTA	2	6	3843162	3843167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114048731
68068	NC_008322	GCA	2	6	3843269	3843274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048731
68069	NC_008322	CGG	2	6	3843290	3843295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048731
68070	NC_008322	CAC	2	6	3843321	3843326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048731
68071	NC_008322	AGG	2	6	3843351	3843356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114048731
68072	NC_008322	TGA	2	6	3843360	3843365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048732
68073	NC_008322	GAT	2	6	3843425	3843430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048732
68074	NC_008322	GAG	2	6	3843437	3843442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114048732
68075	NC_008322	CCG	2	6	3843452	3843457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048732
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68077	NC_008322	GCCA	2	8	3843497	3843504	25 %	0 %	25 %	50 %	114048732
68078	NC_008322	TCT	2	6	3843552	3843557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048732
68079	NC_008322	GGC	2	6	3843577	3843582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048732
68080	NC_008322	GCC	2	6	3843590	3843595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048732
68081	NC_008322	TTA	2	6	3843610	3843615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114048732
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68083	NC_008322	AAT	2	6	3843848	3843853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048732
68084	NC_008322	CAT	2	6	3843890	3843895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68085	NC_008322	A	7	7	3843903	3843909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68086	NC_008322	TAA	2	6	3843940	3843945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68087	NC_008322	CGCA	2	8	3844092	3844099	25 %	0 %	25 %	50 %	114048733
68088	NC_008322	GCC	2	6	3844216	3844221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048733
68089	NC_008322	CGG	2	6	3844459	3844464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048733
68090	NC_008322	T	6	6	3844471	3844476	0 %	100 %	0 %	0 %	114048733
68091	NC_008322	TCA	2	6	3844523	3844528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048734
68092	NC_008322	CAT	2	6	3844555	3844560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048734
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68099	NC_008322	GGCGT	2	10	3844937	3844946	0 %	20 %	60 %	20 %	114048734
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68104	NC_008322	AAT	2	6	3845331	3845336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68105	NC_008322	GTT	2	6	3845398	3845403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68106	NC_008322	GCA	2	6	3845415	3845420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048735
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68112	NC_008322	CAC	2	6	3845777	3845782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048735
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68115	NC_008322	GTT	2	6	3845860	3845865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048735
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68118	NC_008322	TCA	2	6	3845977	3845982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048735
68119	NC_008322	AAAG	2	8	3846005	3846012	75 %	0 %	25 %	0 %	114048735
68120	NC_008322	CA	3	6	3846019	3846024	50 %	0 %	0 %	50 %	114048735
68121	NC_008322	CAG	2	6	3846041	3846046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048735
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68143	NC_008322	ATCA	2	8	3847101	3847108	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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68179	NC_008322	T	6	6	3849183	3849188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68180	NC_008322	T	7	7	3849193	3849199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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68229	NC_008322	GCAGCT	2	12	3851995	3852006	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114048740
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68232	NC_008322	GAC	2	6	3852173	3852178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048740
68233	NC_008322	CAG	2	6	3852212	3852217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048740
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68235	NC_008322	CAT	2	6	3852396	3852401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048740
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68262	NC_008322	TGG	2	6	3853811	3853816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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68267	NC_008322	AC	3	6	3854071	3854076	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68268	NC_008322	TTTAG	2	10	3854082	3854091	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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68346	NC_008322	GC	3	6	3858972	3858977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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68350	NC_008322	T	7	7	3859030	3859036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68351	NC_008322	TGT	2	6	3859061	3859066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68352	NC_008322	T	6	6	3859086	3859091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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68354	NC_008322	CTA	2	6	3859210	3859215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048746
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68473	NC_008322	CGC	2	6	3865693	3865698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048753
68474	NC_008322	T	6	6	3865731	3865736	0 %	100 %	0 %	0 %	114048753
68475	NC_008322	GCC	2	6	3865771	3865776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048753
68476	NC_008322	ACC	2	6	3865859	3865864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048753
68477	NC_008322	CGC	2	6	3865990	3865995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048753
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68481	NC_008322	GCC	2	6	3866234	3866239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048753
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68497	NC_008322	GCAA	2	8	3866972	3866979	50 %	0 %	25 %	25 %	114048753
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